MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 3065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011984	CCG	2	6	207527	207532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083319
3002	NC_011984	CGC	2	6	207546	207551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083319
3003	NC_011984	TCG	2	6	207701	207706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083319
3004	NC_011984	GCG	3	9	207756	207764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083319
3005	NC_011984	CGG	2	6	207769	207774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083319
3006	NC_011984	TCG	2	6	208007	208012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083319
3007	NC_011984	TAA	2	6	208034	208039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222083319
3008	NC_011984	CGA	2	6	208047	208052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083319
3009	NC_011984	CGC	2	6	208060	208065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083319
3010	NC_011984	CAT	3	9	208096	208104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083319
3011	NC_011984	GAA	2	6	208150	208155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083319
3012	NC_011984	CTG	2	6	208168	208173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083319
3013	NC_011984	TCG	2	6	208217	208222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083319
3014	NC_011984	CCG	2	6	208299	208304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083319
3015	NC_011984	CGA	2	6	208320	208325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083319
3016	NC_011984	CGG	2	6	208526	208531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083319
3017	NC_011984	CGT	2	6	208594	208599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083319
3018	NC_011984	CCG	2	6	208660	208665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083319
3019	NC_011984	GGC	2	6	208673	208678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083319
3020	NC_011984	GAT	2	6	208840	208845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083319
3021	NC_011984	CAG	2	6	208972	208977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083319
3022	NC_011984	CGA	2	6	208992	208997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083319
3023	NC_011984	CAT	2	6	209171	209176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083320
3024	NC_011984	GCG	2	6	209184	209189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083320
3025	NC_011984	CAC	2	6	209240	209245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083320
3026	NC_011984	CGG	2	6	209260	209265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083320
3027	NC_011984	AGC	2	6	209277	209282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083320
3028	NC_011984	CAG	2	6	209306	209311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083320
3029	NC_011984	CGA	2	6	209480	209485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083321
3030	NC_011984	CGC	2	6	209507	209512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083321
3031	NC_011984	GCC	2	6	209534	209539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083321
3032	NC_011984	ACC	2	6	209577	209582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083321
3033	NC_011984	CCG	2	6	209594	209599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083321
3034	NC_011984	CTG	2	6	209637	209642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083321
3035	NC_011984	CTG	2	6	209646	209651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083321
3036	NC_011984	GGC	2	6	209724	209729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083321
3037	NC_011984	CCT	2	6	209913	209918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083322
3038	NC_011984	GCT	2	6	209925	209930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083322
3039	NC_011984	AGC	2	6	210035	210040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083322
3040	NC_011984	CGA	2	6	210069	210074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083322
3041	NC_011984	GCG	2	6	210164	210169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083322
3042	NC_011984	CGG	2	6	210180	210185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083322
3043	NC_011984	TCC	2	6	210188	210193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083322
3044	NC_011984	GTC	2	6	210208	210213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083322
3045	NC_011984	CGA	2	6	210225	210230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083322
3046	NC_011984	CGT	2	6	210256	210261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083322
3047	NC_011984	GTC	2	6	210367	210372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083322
3048	NC_011984	CGG	2	6	210398	210403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083322
3049	NC_011984	CGG	2	6	210430	210435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083322
3050	NC_011984	CAG	2	6	210436	210441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083322
3051	NC_011984	CCG	2	6	210458	210463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083322
3052	NC_011984	GAT	2	6	210481	210486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083322
3053	NC_011984	TCG	3	9	210494	210502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083322
3054	NC_011984	ATG	2	6	210536	210541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083322
3055	NC_011984	CGA	2	6	210636	210641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083322
3056	NC_011984	CCG	2	6	210815	210820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083323
3057	NC_011984	GAT	2	6	210969	210974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083323
3058	NC_011984	CGA	2	6	211082	211087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083323
3059	NC_011984	AGC	2	6	211102	211107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083323
3060	NC_011984	TCG	2	6	211130	211135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083323
3061	NC_011984	GAA	2	6	211148	211153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083323
3062	NC_011984	CTG	2	6	211241	211246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083323
3063	NC_011984	CAT	2	6	211362	211367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083323
3064	NC_011984	ATC	2	6	211400	211405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_011984	CGA	2	6	211607	211612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.