MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 3065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011984	AGC	2	6	106007	106012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083231
1502	NC_011984	CGC	2	6	106053	106058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083231
1503	NC_011984	CCG	2	6	106164	106169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083231
1504	NC_011984	GAG	2	6	106300	106305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083231
1505	NC_011984	GAT	2	6	106358	106363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083231
1506	NC_011984	CGA	2	6	106527	106532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083231
1507	NC_011984	AAC	2	6	106594	106599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083231
1508	NC_011984	CAG	2	6	106651	106656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083231
1509	NC_011984	AAG	2	6	106741	106746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083231
1510	NC_011984	GAA	2	6	106821	106826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083231
1511	NC_011984	AGG	2	6	106964	106969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011984	CAA	2	6	106977	106982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_011984	GAG	2	6	107061	107066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083232
1514	NC_011984	ATG	3	9	107089	107097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083232
1515	NC_011984	ACC	2	6	107101	107106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083232
1516	NC_011984	AGA	2	6	107130	107135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083232
1517	NC_011984	ACG	2	6	107144	107149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083232
1518	NC_011984	GCC	2	6	107190	107195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083232
1519	NC_011984	CCA	2	6	107203	107208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083232
1520	NC_011984	GAC	2	6	107253	107258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083232
1521	NC_011984	ATC	2	6	107266	107271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083232
1522	NC_011984	TCG	2	6	107363	107368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083232
1523	NC_011984	GCC	2	6	107451	107456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083232
1524	NC_011984	GCC	2	6	107468	107473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083232
1525	NC_011984	TTG	2	6	107757	107762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083232
1526	NC_011984	GGC	2	6	107799	107804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083232
1527	NC_011984	AAG	2	6	107841	107846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083232
1528	NC_011984	GAT	2	6	107877	107882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083232
1529	NC_011984	GAC	2	6	107889	107894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083232
1530	NC_011984	CAG	2	6	107913	107918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083232
1531	NC_011984	TTC	2	6	108084	108089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083233
1532	NC_011984	GAA	2	6	108094	108099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083233
1533	NC_011984	GTT	2	6	108118	108123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083233
1534	NC_011984	TCG	2	6	108332	108337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083233
1535	NC_011984	TTG	2	6	108365	108370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083233
1536	NC_011984	TTG	2	6	108410	108415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083233
1537	NC_011984	GCC	2	6	108473	108478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083233
1538	NC_011984	GCC	2	6	108695	108700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083233
1539	NC_011984	CCA	2	6	108856	108861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083233
1540	NC_011984	GTT	2	6	109054	109059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083233
1541	NC_011984	TCG	2	6	109065	109070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083233
1542	NC_011984	TAG	2	6	109094	109099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083233
1543	NC_011984	ATG	2	6	109139	109144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083233
1544	NC_011984	TCT	2	6	109256	109261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083233
1545	NC_011984	CGT	2	6	109278	109283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083233
1546	NC_011984	TTG	2	6	109319	109324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083233
1547	NC_011984	CGG	3	9	109419	109427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083233
1548	NC_011984	TTG	2	6	109466	109471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083233
1549	NC_011984	GGC	2	6	109519	109524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083233
1550	NC_011984	ACG	2	6	109567	109572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083233
1551	NC_011984	CTT	2	6	109597	109602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_011984	GAC	2	6	110000	110005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083234
1553	NC_011984	GAA	2	6	110314	110319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083234
1554	NC_011984	CGT	2	6	110326	110331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083234
1555	NC_011984	TCC	2	6	110334	110339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083234
1556	NC_011984	CCG	2	6	110502	110507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083234
1557	NC_011984	CTG	2	6	110697	110702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083234
1558	NC_011984	CGT	2	6	110705	110710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083234
1559	NC_011984	TGC	2	6	110717	110722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083234
1560	NC_011984	TGC	2	6	110762	110767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083234
1561	NC_011984	TCC	2	6	110981	110986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083235
1562	NC_011984	TCG	2	6	111042	111047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083235
1563	NC_011984	CGT	2	6	111181	111186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083235
1564	NC_011984	AGC	2	6	111226	111231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083235
1565	NC_011984	GCT	2	6	111233	111238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083235
1566	NC_011984	AGA	2	6	111246	111251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083235
1567	NC_011984	CGC	2	6	111336	111341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083235
1568	NC_011984	ATC	2	6	111371	111376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083235
1569	NC_011984	GGC	2	6	111424	111429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083235
1570	NC_011984	GGA	2	6	111493	111498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083235
1571	NC_011984	CAA	2	6	111520	111525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083235
1572	NC_011984	CGA	2	6	111534	111539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083235
1573	NC_011984	CTT	2	6	111695	111700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083235
1574	NC_011984	GCC	2	6	111785	111790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083235
1575	NC_011984	CTT	2	6	112135	112140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083236
1576	NC_011984	ACA	2	6	112151	112156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083236
1577	NC_011984	CGC	2	6	112215	112220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083236
1578	NC_011984	GCC	2	6	112225	112230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083236
1579	NC_011984	AGA	2	6	112308	112313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083236
1580	NC_011984	CCG	2	6	112389	112394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083236
1581	NC_011984	GAC	3	9	112441	112449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083236
1582	NC_011984	GAT	2	6	112504	112509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083236
1583	NC_011984	ATC	2	6	112586	112591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083236
1584	NC_011984	CGA	2	6	112641	112646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083236
1585	NC_011984	TCG	2	6	112805	112810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083236
1586	NC_011984	TGG	2	6	112820	112825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083236
1587	NC_011984	TGC	3	9	112878	112886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083236
1588	NC_011984	GCC	2	6	112950	112955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083236
1589	NC_011984	GCC	2	6	112966	112971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083236
1590	NC_011984	GGC	2	6	113053	113058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_011984	CGG	2	6	113111	113116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083237
1592	NC_011984	GAT	2	6	113190	113195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083237
1593	NC_011984	ATC	2	6	113208	113213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083237
1594	NC_011984	CAA	2	6	113293	113298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083237
1595	NC_011984	GAG	2	6	113317	113322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083237
1596	NC_011984	ACG	2	6	113340	113345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083237
1597	NC_011984	GGC	2	6	113374	113379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083237
1598	NC_011984	CAT	2	6	113465	113470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083237
1599	NC_011984	CAC	2	6	113696	113701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083237
1600	NC_011984	GTC	2	6	113706	113711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083237
1601	NC_011984	GCG	2	6	113812	113817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083237
1602	NC_011984	TCG	2	6	113887	113892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083237
1603	NC_011984	CGG	2	6	113948	113953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083237
1604	NC_011984	GAT	2	6	114041	114046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083237
1605	NC_011984	GCC	2	6	114208	114213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083237
1606	NC_011984	AGC	2	6	114558	114563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083237
1607	NC_011984	GAT	2	6	114579	114584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083237
1608	NC_011984	CGA	2	6	114632	114637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083237
1609	NC_011984	GCA	2	6	114804	114809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083237
1610	NC_011984	CGC	2	6	114930	114935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083237
1611	NC_011984	CAG	2	6	115042	115047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083237
1612	NC_011984	CCA	2	6	115066	115071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083237
1613	NC_011984	AGA	2	6	115238	115243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083238
1614	NC_011984	GCC	2	6	115307	115312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083238
1615	NC_011984	GTC	2	6	115378	115383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083238
1616	NC_011984	TCG	2	6	115421	115426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083238
1617	NC_011984	CGC	2	6	115440	115445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083238
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1619	NC_011984	CGG	2	6	115545	115550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083238
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1852	NC_011984	CGC	2	6	130992	130997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1977	NC_011984	CTT	2	6	138081	138086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083256
1978	NC_011984	ACA	2	6	138089	138094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083256
1979	NC_011984	GTC	2	6	138103	138108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083256
1980	NC_011984	CGG	2	6	138114	138119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083256
1981	NC_011984	TAT	2	6	138130	138135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222083256
1982	NC_011984	CCG	2	6	138282	138287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083256
1983	NC_011984	GAA	2	6	138301	138306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083256
1984	NC_011984	GCC	2	6	138385	138390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083256
1985	NC_011984	GCG	3	9	138445	138453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083256
1986	NC_011984	CCG	2	6	138503	138508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083256
1987	NC_011984	AGG	2	6	138512	138517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083256
1988	NC_011984	GGA	2	6	138551	138556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083257
1989	NC_011984	TCC	2	6	138561	138566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083257
1990	NC_011984	CCA	3	9	138610	138618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083257
1991	NC_011984	TCG	2	6	138901	138906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083257
1992	NC_011984	ATG	2	6	138951	138956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083257
1993	NC_011984	TTG	2	6	139014	139019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222083257
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1995	NC_011984	TGG	2	6	139528	139533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1996	NC_011984	GCA	2	6	139635	139640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1997	NC_011984	GAG	2	6	139664	139669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1998	NC_011984	CTG	2	6	139693	139698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1999	NC_011984	GTG	2	6	139770	139775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2000	NC_011984	GCG	2	6	139805	139810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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