MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 4316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009633	GTCCC	2	10	3359961	3359970	0 %	20 %	20 %	60 %	150391049
3002	NC_009633	AAATC	2	10	3360060	3360069	60 %	20 %	0 %	20 %	150391049
3003	NC_009633	TCCCT	2	10	3361188	3361197	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3004	NC_009633	ACTAA	2	10	3365327	3365336	60 %	20 %	0 %	20 %	150391054
3005	NC_009633	CATTC	2	10	3366717	3366726	20 %	40 %	0 %	40 %	150391055
3006	NC_009633	GTATT	2	10	3368613	3368622	20 %	60 %	20 %	0 %	150391057
3007	NC_009633	TCACT	2	10	3368756	3368765	20 %	40 %	0 %	40 %	150391057
3008	NC_009633	TAAAT	2	10	3368797	3368806	60 %	40 %	0 %	0 %	150391057
3009	NC_009633	GGATT	2	10	3371094	3371103	20 %	40 %	40 %	0 %	150391059
3010	NC_009633	ACGAA	2	10	3371390	3371399	60 %	0 %	20 %	20 %	150391059
3011	NC_009633	TTTAC	2	10	3371930	3371939	20 %	60 %	0 %	20 %	150391060
3012	NC_009633	TGCAG	2	10	3374191	3374200	20 %	20 %	40 %	20 %	150391061
3013	NC_009633	CCCTT	2	10	3375032	3375041	0 %	40 %	0 %	60 %	150391061
3014	NC_009633	GCTTT	2	10	3375781	3375790	0 %	60 %	20 %	20 %	150391062
3015	NC_009633	ATCGA	2	10	3376615	3376624	40 %	20 %	20 %	20 %	150391063
3016	NC_009633	AAAGG	2	10	3376956	3376965	60 %	0 %	40 %	0 %	150391063
3017	NC_009633	TTAGG	2	10	3379746	3379755	20 %	40 %	40 %	0 %	150391066
3018	NC_009633	ATCTA	2	10	3382275	3382284	40 %	40 %	0 %	20 %	150391068
3019	NC_009633	TAAAT	2	10	3383269	3383278	60 %	40 %	0 %	0 %	150391069
3020	NC_009633	TCTAC	2	10	3383948	3383957	20 %	40 %	0 %	40 %	150391069
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3023	NC_009633	TGCAT	2	10	3387151	3387160	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3024	NC_009633	TTAAT	2	10	3387161	3387170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3032	NC_009633	TTTAT	2	10	3392701	3392710	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_009633	AGGTA	2	10	3396904	3396913	40 %	20 %	40 %	0 %	150391082
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3035	NC_009633	GCAAT	2	10	3397978	3397987	40 %	20 %	20 %	20 %	150391083
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3039	NC_009633	CTTTC	2	10	3402299	3402308	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3040	NC_009633	AAAAC	2	10	3402403	3402412	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3041	NC_009633	CTAAT	2	10	3404562	3404571	40 %	40 %	0 %	20 %	150391089
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3043	NC_009633	ACCCC	2	10	3406141	3406150	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3044	NC_009633	TTTAG	2	10	3406319	3406328	20 %	60 %	20 %	0 %	150391091
3045	NC_009633	AACAA	2	10	3406374	3406383	80 %	0 %	0 %	20 %	150391091
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3047	NC_009633	TGATA	2	10	3407121	3407130	40 %	40 %	20 %	0 %	150391092
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3049	NC_009633	GCTCC	2	10	3407647	3407656	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3050	NC_009633	CCCTA	2	10	3408361	3408370	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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3056	NC_009633	CATTT	2	10	3414357	3414366	20 %	60 %	0 %	20 %	150391099
3057	NC_009633	AATAG	2	10	3414812	3414821	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3059	NC_009633	ATTTT	2	10	3418291	3418300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_009633	ATTTT	2	10	3419477	3419486	20 %	80 %	0 %	0 %	150391104
3061	NC_009633	CCTTT	2	10	3419914	3419923	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3064	NC_009633	TATAG	2	10	3422851	3422860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_009633	TGATT	2	10	3423175	3423184	20 %	60 %	20 %	0 %	150391109
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3069	NC_009633	TTGTT	3	15	3432160	3432174	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3095	NC_009633	TGCAT	2	10	3459646	3459655	20 %	40 %	20 %	20 %	150391135
3096	NC_009633	TGGTA	2	10	3459897	3459906	20 %	40 %	40 %	0 %	150391135
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3098	NC_009633	AATTA	2	10	3461754	3461763	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_009633	AAAAG	2	10	3462680	3462689	80 %	0 %	20 %	0 %	150391136
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3106	NC_009633	TCCAG	2	10	3473854	3473863	20 %	20 %	20 %	40 %	150391144
3107	NC_009633	TTTAT	2	10	3476723	3476732	20 %	80 %	0 %	0 %	150391146
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3109	NC_009633	TGAAA	2	10	3477936	3477945	60 %	20 %	20 %	0 %	150391147
3110	NC_009633	GCTTT	2	10	3478799	3478808	0 %	60 %	20 %	20 %	150391148
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3114	NC_009633	TTCTA	2	10	3488005	3488014	20 %	60 %	0 %	20 %	150391156
3115	NC_009633	TCATC	2	10	3489072	3489081	20 %	40 %	0 %	40 %	150391158
3116	NC_009633	ATTAT	2	10	3490375	3490384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_009633	ATATT	2	10	3491708	3491717	40 %	60 %	0 %	0 %	150391159
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3120	NC_009633	ATTAT	2	10	3495813	3495822	40 %	60 %	0 %	0 %	150391162
3121	NC_009633	CTTTC	2	10	3496327	3496336	0 %	60 %	0 %	40 %	150391163
3122	NC_009633	CATTT	2	10	3497423	3497432	20 %	60 %	0 %	20 %	150391163
3123	NC_009633	AAAAT	2	10	3499003	3499012	80 %	20 %	0 %	0 %	150391165
3124	NC_009633	ATTTA	2	10	3500004	3500013	40 %	60 %	0 %	0 %	150391166
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