MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 9856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022784	CAG	2	6	235	240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625307
2	NC_022784	ACA	2	6	305	310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625307
3	NC_022784	CGA	2	6	378	383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625307
4	NC_022784	CAT	2	6	508	513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625307
5	NC_022784	AGG	2	6	763	768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625307
6	NC_022784	TGA	2	6	794	799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625307
7	NC_022784	AAC	2	6	896	901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625307
8	NC_022784	GCA	2	6	912	917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625307
9	NC_022784	GAC	2	6	946	951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625307
10	NC_022784	CGG	2	6	1000	1005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625307
11	NC_022784	TTG	2	6	1016	1021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625307
12	NC_022784	CGA	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625307
13	NC_022784	TTG	2	6	1199	1204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625307
14	NC_022784	GAA	2	6	1215	1220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625307
15	NC_022784	TGC	2	6	1235	1240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625307
16	NC_022784	AGA	2	6	1280	1285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625307
17	NC_022784	AGT	2	6	1309	1314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625307
18	NC_022784	TGC	2	6	1420	1425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625307
19	NC_022784	CTA	2	6	1426	1431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625307
20	NC_022784	GCT	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625307
21	NC_022784	ATA	2	6	1633	1638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625307
22	NC_022784	AGC	2	6	1643	1648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625307
23	NC_022784	GCA	2	6	1768	1773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625307
24	NC_022784	GAA	2	6	1833	1838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625307
25	NC_022784	TGC	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625308
26	NC_022784	CGG	2	6	2188	2193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625308
27	NC_022784	GCC	2	6	2199	2204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625308
28	NC_022784	GCT	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625308
29	NC_022784	TAG	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625308
30	NC_022784	ACA	2	6	2263	2268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625308
31	NC_022784	GCC	2	6	2358	2363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625308
32	NC_022784	TAT	2	6	2378	2383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625308
33	NC_022784	TGG	2	6	2512	2517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625308
34	NC_022784	TGC	2	6	2530	2535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625308
35	NC_022784	CAC	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625308
36	NC_022784	CCG	2	6	2656	2661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625309
37	NC_022784	ACA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625309
38	NC_022784	TTG	2	6	2809	2814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625309
39	NC_022784	AAT	2	6	2859	2864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625309
40	NC_022784	TCT	2	6	2882	2887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625309
41	NC_022784	TGC	2	6	2897	2902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625309
42	NC_022784	TTG	2	6	3094	3099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625309
43	NC_022784	AGG	2	6	3167	3172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625309
44	NC_022784	CTG	2	6	3365	3370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625310
45	NC_022784	TCG	2	6	3372	3377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625310
46	NC_022784	CTC	2	6	3394	3399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625310
47	NC_022784	CAC	2	6	3431	3436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625310
48	NC_022784	GCG	2	6	3473	3478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625310
49	NC_022784	TTG	2	6	3545	3550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625310
50	NC_022784	CTC	2	6	3794	3799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625310
51	NC_022784	ATG	2	6	3812	3817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625310
52	NC_022784	CTG	2	6	3863	3868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625310
53	NC_022784	TGC	2	6	3897	3902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625310
54	NC_022784	GCT	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625310
55	NC_022784	CTT	2	6	3931	3936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625310
56	NC_022784	GAG	2	6	4100	4105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625310
57	NC_022784	TCA	2	6	4248	4253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625310
58	NC_022784	GTC	2	6	4578	4583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625311
59	NC_022784	GAA	2	6	4753	4758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625311
60	NC_022784	AGG	2	6	4840	4845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557626111
61	NC_022784	GCG	2	6	4910	4915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557626111
62	NC_022784	GAA	2	6	4918	4923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557626111
63	NC_022784	ATG	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625312
64	NC_022784	ACT	2	6	5470	5475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625312
65	NC_022784	TTC	2	6	5487	5492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625312
66	NC_022784	TTC	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625312
67	NC_022784	TCA	2	6	5615	5620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625312
68	NC_022784	CTG	2	6	5661	5666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625312
69	NC_022784	GTT	2	6	5705	5710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625312
70	NC_022784	TGT	2	6	5738	5743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625312
71	NC_022784	CAA	2	6	5808	5813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625312
72	NC_022784	TCA	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625312
73	NC_022784	TCA	2	6	5879	5884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625312
74	NC_022784	GCT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625312
75	NC_022784	CCA	2	6	5963	5968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625312
76	NC_022784	AAC	2	6	5974	5979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625312
77	NC_022784	CAA	2	6	6013	6018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625312
78	NC_022784	CAA	2	6	6043	6048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625312
79	NC_022784	TCA	2	6	6233	6238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625312
80	NC_022784	CGT	2	6	6309	6314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625312
81	NC_022784	TCG	2	6	6442	6447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625313
82	NC_022784	TCA	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625313
83	NC_022784	TAC	2	6	6642	6647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625313
84	NC_022784	CGT	2	6	6782	6787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625313
85	NC_022784	TGC	2	6	7133	7138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625314
86	NC_022784	TAC	2	6	7190	7195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625314
87	NC_022784	CGT	2	6	7368	7373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625314
88	NC_022784	GAC	2	6	7396	7401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625314
89	NC_022784	TGC	2	6	7425	7430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625314
90	NC_022784	GCT	2	6	7458	7463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625314
91	NC_022784	GCA	2	6	7853	7858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625314
92	NC_022784	GGT	2	6	7879	7884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625314
93	NC_022784	TGT	2	6	7963	7968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625314
94	NC_022784	TGA	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625314
95	NC_022784	CAC	2	6	8155	8160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625314
96	NC_022784	GAG	2	6	8335	8340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625314
97	NC_022784	GTA	2	6	8470	8475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625314
98	NC_022784	GCA	2	6	8492	8497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625314
99	NC_022784	TCA	2	6	8538	8543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625314
100	NC_022784	AAC	2	6	8559	8564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625314
101	NC_022784	TAT	2	6	8688	8693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625315
102	NC_022784	CGC	2	6	8850	8855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625315
103	NC_022784	TGT	2	6	8928	8933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625315
104	NC_022784	TCA	5	15	8962	8976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625315
105	NC_022784	TCT	2	6	9020	9025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625315
106	NC_022784	GAA	2	6	9055	9060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625315
107	NC_022784	AAT	2	6	9089	9094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625315
108	NC_022784	TGC	2	6	9148	9153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625315
109	NC_022784	TCA	2	6	9160	9165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625315
110	NC_022784	GCC	2	6	9205	9210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625315
111	NC_022784	CAG	2	6	9325	9330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625315
112	NC_022784	ACC	2	6	9564	9569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625315
113	NC_022784	GCT	2	6	9788	9793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625316
114	NC_022784	TCG	2	6	9849	9854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625316
115	NC_022784	CAG	2	6	10054	10059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625316
116	NC_022784	TGC	2	6	10068	10073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625316
117	NC_022784	AAC	2	6	13452	13457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625317
118	NC_022784	GCA	2	6	13519	13524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625317
119	NC_022784	AGG	2	6	13559	13564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625317
120	NC_022784	CCA	2	6	13603	13608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625317
121	NC_022784	CAG	2	6	13650	13655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625317
122	NC_022784	CAG	2	6	13659	13664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625317
123	NC_022784	ACT	2	6	14078	14083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625318
124	NC_022784	AGA	2	6	14118	14123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625318
125	NC_022784	TGT	2	6	14190	14195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625319
126	NC_022784	AGT	2	6	14225	14230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625319
127	NC_022784	CAG	2	6	14335	14340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625319
128	NC_022784	AGG	2	6	14366	14371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625319
129	NC_022784	AAT	2	6	14416	14421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625319
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252	NC_022784	GGC	2	6	29305	29310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625330
253	NC_022784	AGA	2	6	29313	29318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625330
254	NC_022784	GGA	2	6	29947	29952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625331
255	NC_022784	ATG	2	6	29972	29977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625331
256	NC_022784	GGT	2	6	30127	30132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625331
257	NC_022784	AGG	2	6	30167	30172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625331
258	NC_022784	CAT	2	6	30315	30320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625331
259	NC_022784	ATT	2	6	30514	30519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625331
260	NC_022784	TGC	2	6	30576	30581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625331
261	NC_022784	ACA	2	6	30666	30671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625331
262	NC_022784	TGC	2	6	30756	30761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625331
263	NC_022784	ATG	2	6	30798	30803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625331
264	NC_022784	TAC	2	6	30924	30929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625331
265	NC_022784	CTG	2	6	31420	31425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625332
266	NC_022784	TGC	2	6	31426	31431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625332
267	NC_022784	GTT	2	6	31495	31500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625332
268	NC_022784	TGC	2	6	31598	31603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625332
269	NC_022784	TGA	2	6	31614	31619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625332
270	NC_022784	ATC	2	6	31781	31786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625332
271	NC_022784	TGA	2	6	31875	31880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625332
272	NC_022784	GCT	2	6	32160	32165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625332
273	NC_022784	CAA	2	6	32327	32332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625332
274	NC_022784	CTG	3	9	32414	32422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625332
275	NC_022784	AGC	2	6	32437	32442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625332
276	NC_022784	GGT	2	6	32488	32493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625332
277	NC_022784	GCC	2	6	32588	32593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625332
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279	NC_022784	TTG	2	6	37000	37005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625333
280	NC_022784	CTT	2	6	37092	37097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625333
281	NC_022784	ATT	2	6	37198	37203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625333
282	NC_022784	TTC	2	6	37227	37232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625333
283	NC_022784	ATG	2	6	37282	37287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625333
284	NC_022784	GAA	2	6	37326	37331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625333
285	NC_022784	CCA	2	6	37366	37371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625333
286	NC_022784	GAT	2	6	37387	37392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625333
287	NC_022784	TAG	2	6	37437	37442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625333
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291	NC_022784	GGT	2	6	37690	37695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625333
292	NC_022784	ATG	2	6	37735	37740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625333
293	NC_022784	CTT	2	6	37974	37979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625333
294	NC_022784	ATC	2	6	38004	38009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625333
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327	NC_022784	ACT	2	6	40781	40786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625337
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370	NC_022784	CAC	2	6	45713	45718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557626112
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374	NC_022784	ACC	2	6	45954	45959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557626112
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376	NC_022784	TCA	2	6	46114	46119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557626112
377	NC_022784	TTA	2	6	46129	46134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557626112
378	NC_022784	TCT	2	6	46157	46162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557626112
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380	NC_022784	GCA	2	6	46183	46188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557626112
381	NC_022784	AAT	2	6	46220	46225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557626112
382	NC_022784	TGC	2	6	46269	46274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557626112
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499	NC_022784	TGT	2	6	70399	70404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625352
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