MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 9856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022784	TTA	2	6	667060	667065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625724
5002	NC_022784	ACA	2	6	667167	667172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625724
5003	NC_022784	CTT	2	6	667189	667194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625724
5004	NC_022784	ACC	2	6	667346	667351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625725
5005	NC_022784	ACC	2	6	667388	667393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625725
5006	NC_022784	TCT	2	6	667428	667433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625725
5007	NC_022784	GTG	2	6	667523	667528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625725
5008	NC_022784	ACA	2	6	667538	667543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625725
5009	NC_022784	ATT	2	6	667595	667600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625725
5010	NC_022784	CTA	2	6	667622	667627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625725
5011	NC_022784	AAC	2	6	667652	667657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625725
5012	NC_022784	GCC	2	6	667696	667701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625725
5013	NC_022784	ATC	2	6	667736	667741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625725
5014	NC_022784	CAG	2	6	667858	667863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625725
5015	NC_022784	TGG	2	6	667883	667888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625725
5016	NC_022784	GCA	2	6	667940	667945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625725
5017	NC_022784	TCT	2	6	667976	667981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625725
5018	NC_022784	TTC	2	6	667985	667990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625725
5019	NC_022784	AAT	2	6	668047	668052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625725
5020	NC_022784	GCA	2	6	668151	668156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625725
5021	NC_022784	GCA	2	6	668189	668194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625725
5022	NC_022784	ATA	2	6	668239	668244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625725
5023	NC_022784	TTC	2	6	668290	668295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625725
5024	NC_022784	CTC	2	6	668315	668320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625725
5025	NC_022784	TAT	2	6	668349	668354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625725
5026	NC_022784	CAG	2	6	668413	668418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625725
5027	NC_022784	AAT	2	6	668461	668466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625725
5028	NC_022784	TCA	2	6	668477	668482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625725
5029	NC_022784	TTC	2	6	668498	668503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625725
5030	NC_022784	CGA	2	6	668637	668642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625725
5031	NC_022784	GTT	2	6	668707	668712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625725
5032	NC_022784	GCA	2	6	668724	668729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625725
5033	NC_022784	TTC	2	6	668789	668794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625725
5034	NC_022784	CAC	2	6	669109	669114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625725
5035	NC_022784	AAG	2	6	669185	669190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625725
5036	NC_022784	TCA	2	6	669260	669265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625725
5037	NC_022784	TAG	2	6	669274	669279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625725
5038	NC_022784	TAC	2	6	669464	669469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625725
5039	NC_022784	TTG	2	6	669534	669539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625725
5040	NC_022784	GAT	2	6	669565	669570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625725
5041	NC_022784	CGG	2	6	669781	669786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625726
5042	NC_022784	ATT	2	6	669893	669898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625726
5043	NC_022784	ATA	2	6	669974	669979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625726
5044	NC_022784	TTG	2	6	669996	670001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625726
5045	NC_022784	GTT	3	9	670066	670074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625726
5046	NC_022784	GCT	2	6	670093	670098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625726
5047	NC_022784	ATA	2	6	670163	670168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625726
5048	NC_022784	CTG	2	6	670183	670188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625726
5049	NC_022784	TGC	2	6	670679	670684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625727
5050	NC_022784	ACT	2	6	670791	670796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625727
5051	NC_022784	CTA	2	6	670807	670812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625727
5052	NC_022784	CAC	2	6	670870	670875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625727
5053	NC_022784	CTT	2	6	670894	670899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625727
5054	NC_022784	CAT	2	6	670954	670959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625727
5055	NC_022784	CTA	2	6	670986	670991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625727
5056	NC_022784	AAC	2	6	671011	671016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625728
5057	NC_022784	ACA	2	6	671112	671117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625728
5058	NC_022784	CAT	2	6	671125	671130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625728
5059	NC_022784	GAT	2	6	671152	671157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625728
5060	NC_022784	CCT	2	6	671311	671316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625728
5061	NC_022784	CTT	2	6	671596	671601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625728
5062	NC_022784	TAT	2	6	671608	671613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625728
5063	NC_022784	TCA	2	6	671619	671624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625728
5064	NC_022784	CTA	3	9	671662	671670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625728
5065	NC_022784	CGC	2	6	671719	671724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625728
5066	NC_022784	CAC	2	6	671897	671902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625728
5067	NC_022784	ACC	2	6	671973	671978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625728
5068	NC_022784	CCG	2	6	671989	671994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625728
5069	NC_022784	CAT	2	6	672037	672042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625728
5070	NC_022784	CCA	3	9	672049	672057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625728
5071	NC_022784	TGC	2	6	672177	672182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625728
5072	NC_022784	GGC	2	6	672282	672287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625728
5073	NC_022784	AAC	2	6	672353	672358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625728
5074	NC_022784	TCA	2	6	672513	672518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625728
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5076	NC_022784	CGC	2	6	672679	672684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625728
5077	NC_022784	GTC	2	6	672746	672751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625728
5078	NC_022784	CTT	2	6	672910	672915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625728
5079	NC_022784	AGC	2	6	672935	672940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625728
5080	NC_022784	GCT	2	6	672994	672999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625728
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5087	NC_022784	TCA	2	6	673273	673278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625728
5088	NC_022784	ATG	2	6	673332	673337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625728
5089	NC_022784	TCC	2	6	673413	673418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625728
5090	NC_022784	CTT	2	6	673422	673427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625728
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5092	NC_022784	TCT	2	6	673455	673460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625728
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5099	NC_022784	ATG	2	6	673893	673898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625729
5100	NC_022784	CAG	2	6	673912	673917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625729
5101	NC_022784	CAC	2	6	673931	673936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625729
5102	NC_022784	TGA	2	6	673952	673957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625729
5103	NC_022784	ACA	2	6	673960	673965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625729
5104	NC_022784	TCT	2	6	673975	673980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625729
5105	NC_022784	GAG	2	6	674064	674069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625729
5106	NC_022784	CTT	2	6	674221	674226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625729
5107	NC_022784	ACC	2	6	674331	674336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625729
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5109	NC_022784	GAC	2	6	674360	674365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625729
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5119	NC_022784	TCC	2	6	675353	675358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625730
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5475	NC_022784	GAA	2	6	705199	705204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625754
5476	NC_022784	CCG	2	6	705370	705375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625754
5477	NC_022784	GTA	2	6	705478	705483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557626142
5478	NC_022784	ACC	2	6	705494	705499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557626142
5479	NC_022784	TAT	2	6	707165	707170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625755
5480	NC_022784	TTA	2	6	707282	707287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625755
5481	NC_022784	GAT	2	6	707304	707309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625755
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