MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 9856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022784	GCA	2	6	583229	583234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625683
4502	NC_022784	CAA	2	6	583274	583279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625683
4503	NC_022784	ATC	2	6	583354	583359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625683
4504	NC_022784	ATG	2	6	583420	583425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625683
4505	NC_022784	AGA	2	6	583443	583448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625683
4506	NC_022784	GAA	2	6	583599	583604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625683
4507	NC_022784	CAA	2	6	583694	583699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625683
4508	NC_022784	CGA	2	6	583809	583814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625683
4509	NC_022784	GAC	2	6	583819	583824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625683
4510	NC_022784	GGA	2	6	583847	583852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625683
4511	NC_022784	CAG	2	6	583862	583867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625683
4512	NC_022784	GAA	2	6	583879	583884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625683
4513	NC_022784	GCA	2	6	584021	584026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625684
4514	NC_022784	TTC	2	6	584044	584049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625684
4515	NC_022784	ATC	2	6	584147	584152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625684
4516	NC_022784	TCC	2	6	584156	584161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625684
4517	NC_022784	GCA	2	6	584249	584254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625684
4518	NC_022784	ACA	2	6	584264	584269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625684
4519	NC_022784	CAC	2	6	584283	584288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625684
4520	NC_022784	ATG	2	6	584296	584301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625684
4521	NC_022784	CCT	2	6	584576	584581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625684
4522	NC_022784	ATC	2	6	584615	584620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625684
4523	NC_022784	CAT	2	6	584664	584669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625684
4524	NC_022784	CAG	2	6	584742	584747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625684
4525	NC_022784	GCC	3	9	584758	584766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625684
4526	NC_022784	TAT	2	6	584794	584799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625684
4527	NC_022784	CAG	2	6	584830	584835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625684
4528	NC_022784	GGC	2	6	584900	584905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625684
4529	NC_022784	GTG	2	6	584947	584952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625684
4530	NC_022784	CAA	2	6	584968	584973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625684
4531	NC_022784	GGC	2	6	585026	585031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625684
4532	NC_022784	TGC	2	6	585249	585254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625684
4533	NC_022784	TAT	2	6	585358	585363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625684
4534	NC_022784	TCA	2	6	585563	585568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625684
4535	NC_022784	GAT	2	6	585654	585659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625684
4536	NC_022784	AGT	2	6	585665	585670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625684
4537	NC_022784	CCA	2	6	585786	585791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625684
4538	NC_022784	GGA	2	6	585876	585881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625684
4539	NC_022784	TAC	2	6	585919	585924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625684
4540	NC_022784	CGT	2	6	585997	586002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625684
4541	NC_022784	GCC	2	6	586011	586016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625684
4542	NC_022784	ATT	2	6	586115	586120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625685
4543	NC_022784	CCT	2	6	586165	586170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625685
4544	NC_022784	CAA	3	9	586209	586217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625685
4545	NC_022784	GTA	2	6	586494	586499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625686
4546	NC_022784	CCA	2	6	586573	586578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625686
4547	NC_022784	CTG	2	6	586581	586586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625686
4548	NC_022784	CGT	2	6	586637	586642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625686
4549	NC_022784	TCT	2	6	586659	586664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625686
4550	NC_022784	GGC	2	6	586832	586837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625686
4551	NC_022784	CTT	2	6	586897	586902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625686
4552	NC_022784	ATC	2	6	586908	586913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625686
4553	NC_022784	CGG	2	6	587102	587107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625686
4554	NC_022784	TTA	2	6	587134	587139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625686
4555	NC_022784	AGC	2	6	587169	587174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625686
4556	NC_022784	ATG	2	6	587217	587222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625686
4557	NC_022784	TGA	2	6	587287	587292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625686
4558	NC_022784	GAA	2	6	587310	587315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625686
4559	NC_022784	ACC	2	6	587411	587416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625686
4560	NC_022784	TGC	2	6	587495	587500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625686
4561	NC_022784	TGA	2	6	587524	587529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625686
4562	NC_022784	GAA	2	6	587625	587630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625686
4563	NC_022784	ACC	2	6	587655	587660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625686
4564	NC_022784	ATG	2	6	587769	587774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625686
4565	NC_022784	TTC	2	6	587787	587792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625686
4566	NC_022784	TAG	2	6	587806	587811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625686
4567	NC_022784	TTG	2	6	587817	587822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625686
4568	NC_022784	GTA	2	6	587912	587917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625686
4569	NC_022784	TCA	2	6	587965	587970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625686
4570	NC_022784	CGC	2	6	588032	588037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625686
4571	NC_022784	CTC	2	6	588053	588058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625686
4572	NC_022784	TAA	2	6	588115	588120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625686
4573	NC_022784	CTT	2	6	588233	588238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625686
4574	NC_022784	CCA	2	6	588253	588258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625686
4575	NC_022784	CAG	2	6	588274	588279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625686
4576	NC_022784	GCT	2	6	588453	588458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625686
4577	NC_022784	CTT	3	9	588466	588474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625686
4578	NC_022784	TTG	2	6	588552	588557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625686
4579	NC_022784	ACC	2	6	588740	588745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625686
4580	NC_022784	ATA	2	6	588751	588756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625686
4581	NC_022784	GTA	2	6	589193	589198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625687
4582	NC_022784	ATT	2	6	589269	589274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625687
4583	NC_022784	CTA	2	6	589406	589411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625687
4584	NC_022784	AAT	2	6	589528	589533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625687
4585	NC_022784	CAC	2	6	589559	589564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625687
4586	NC_022784	CAG	2	6	589628	589633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625687
4587	NC_022784	GCT	2	6	589751	589756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625687
4588	NC_022784	AGG	2	6	590104	590109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625688
4589	NC_022784	AGC	2	6	590151	590156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625688
4590	NC_022784	AAT	2	6	590187	590192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625688
4591	NC_022784	ACA	2	6	590197	590202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625688
4592	NC_022784	CAC	2	6	590227	590232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625688
4593	NC_022784	CAT	2	6	590253	590258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625688
4594	NC_022784	GTA	2	6	590286	590291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625688
4595	NC_022784	GCG	2	6	590634	590639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557626134
4596	NC_022784	CCT	2	6	590704	590709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557626134
4597	NC_022784	AGC	2	6	590819	590824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625689
4598	NC_022784	GAT	2	6	590849	590854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625689
4599	NC_022784	CAG	2	6	591059	591064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625689
4600	NC_022784	TCA	2	6	591351	591356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625689
4601	NC_022784	CCT	2	6	591388	591393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625689
4602	NC_022784	ACC	2	6	591530	591535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625689
4603	NC_022784	GCA	2	6	591634	591639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625689
4604	NC_022784	CAC	2	6	591718	591723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625689
4605	NC_022784	AGG	2	6	591792	591797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625689
4606	NC_022784	CAA	2	6	591812	591817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625689
4607	NC_022784	ATA	2	6	591846	591851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625689
4608	NC_022784	CTC	2	6	591882	591887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625689
4609	NC_022784	CAA	2	6	591959	591964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625689
4610	NC_022784	TCA	2	6	592027	592032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625689
4611	NC_022784	AAG	2	6	592158	592163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625690
4612	NC_022784	CTA	2	6	592255	592260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625690
4613	NC_022784	CAA	2	6	592299	592304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625690
4614	NC_022784	TCT	2	6	592338	592343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625690
4615	NC_022784	GCA	2	6	592401	592406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625691
4616	NC_022784	CAG	2	6	592444	592449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625691
4617	NC_022784	TCA	2	6	592508	592513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625691
4618	NC_022784	CAG	2	6	592630	592635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625691
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4973	NC_022784	AGA	2	6	660636	660641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557626140
4974	NC_022784	GAG	2	6	660661	660666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557626140
4975	NC_022784	CTG	2	6	663576	663581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625722
4976	NC_022784	GAT	2	6	663587	663592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625722
4977	NC_022784	CAT	2	6	663649	663654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625722
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4981	NC_022784	ACC	2	6	665402	665407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625724
4982	NC_022784	TTC	2	6	665740	665745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625724
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4985	NC_022784	GCC	2	6	665890	665895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625724
4986	NC_022784	TAT	2	6	666148	666153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625724
4987	NC_022784	TCA	2	6	666170	666175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625724
4988	NC_022784	CAG	2	6	666205	666210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625724
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4991	NC_022784	GCT	2	6	666501	666506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625724
4992	NC_022784	CTG	2	6	666566	666571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625724
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5000	NC_022784	GCA	2	6	667052	667057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625724

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