MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 1961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021883	TATAT	2	10	309	318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021883	CGATG	2	10	621	630	20 %	20 %	40 %	20 %	526467398
3	NC_021883	TGCGT	2	10	2977	2986	0 %	40 %	40 %	20 %	526467400
4	NC_021883	ATGAT	2	10	3087	3096	40 %	40 %	20 %	0 %	526467400
5	NC_021883	CTTTC	2	10	3897	3906	0 %	60 %	0 %	40 %	526467401
6	NC_021883	AAATG	2	10	7627	7636	60 %	20 %	20 %	0 %	526467402
7	NC_021883	AGGCC	2	10	11648	11657	20 %	0 %	40 %	40 %	526467405
8	NC_021883	ATTTT	2	10	12167	12176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021883	CCAAG	2	10	12966	12975	40 %	0 %	20 %	40 %	526467406
10	NC_021883	TTTAA	2	10	15089	15098	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021883	TAAAT	2	10	15119	15128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021883	TAAGT	2	10	17917	17926	40 %	40 %	20 %	0 %	526467412
13	NC_021883	CACAA	2	10	19616	19625	60 %	0 %	0 %	40 %	526467413
14	NC_021883	TTGAT	2	10	19878	19887	20 %	60 %	20 %	0 %	526467413
15	NC_021883	CCTGC	2	10	20723	20732	0 %	20 %	20 %	60 %	526467414
16	NC_021883	CAGTG	2	10	22099	22108	20 %	20 %	40 %	20 %	526467415
17	NC_021883	TTAAA	2	10	22677	22686	60 %	40 %	0 %	0 %	526467415
18	NC_021883	TAATT	2	10	23570	23579	40 %	60 %	0 %	0 %	526467416
19	NC_021883	TAAAT	2	10	23738	23747	60 %	40 %	0 %	0 %	526467416
20	NC_021883	AAATG	2	10	24497	24506	60 %	20 %	20 %	0 %	526467417
21	NC_021883	GGGTT	2	10	26549	26558	0 %	40 %	60 %	0 %	526467420
22	NC_021883	GTGAA	2	10	27608	27617	40 %	20 %	40 %	0 %	526467421
23	NC_021883	TTTAG	2	10	28015	28024	20 %	60 %	20 %	0 %	526467421
24	NC_021883	ATTTT	2	10	33981	33990	20 %	80 %	0 %	0 %	526467425
25	NC_021883	AAACT	2	10	36947	36956	60 %	20 %	0 %	20 %	526467429
26	NC_021883	ATGGT	2	10	37830	37839	20 %	40 %	40 %	0 %	526467430
27	NC_021883	CTAAA	2	10	39638	39647	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021883	GTTTT	2	10	40103	40112	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021883	TAAAA	2	10	41173	41182	80 %	20 %	0 %	0 %	526467433
30	NC_021883	GTTTT	2	10	41916	41925	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021883	CTTTT	2	10	44381	44390	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021883	ATTTG	2	10	45049	45058	20 %	60 %	20 %	0 %	526467439
33	NC_021883	GGCTC	2	10	48218	48227	0 %	20 %	40 %	40 %	526467441
34	NC_021883	GTTGA	2	10	49123	49132	20 %	40 %	40 %	0 %	526467444
35	NC_021883	GCACG	2	10	50178	50187	20 %	0 %	40 %	40 %	526467446
36	NC_021883	GCCCA	2	10	50867	50876	20 %	0 %	20 %	60 %	526467447
37	NC_021883	AAAAG	2	10	52724	52733	80 %	0 %	20 %	0 %	526467449
38	NC_021883	AATTA	2	10	54209	54218	60 %	40 %	0 %	0 %	526467452
39	NC_021883	TCCGT	2	10	56198	56207	0 %	40 %	20 %	40 %	526467454
40	NC_021883	CGGAG	2	10	56385	56394	20 %	0 %	60 %	20 %	526467454
41	NC_021883	CAAGG	2	10	56455	56464	40 %	0 %	40 %	20 %	526467454
42	NC_021883	ACCTT	2	10	57166	57175	20 %	40 %	0 %	40 %	526467454
43	NC_021883	AAGTG	2	10	58405	58414	40 %	20 %	40 %	0 %	526467457
44	NC_021883	CCGTT	2	10	59093	59102	0 %	40 %	20 %	40 %	526467458
45	NC_021883	CGGAG	2	10	59590	59599	20 %	0 %	60 %	20 %	526467458
46	NC_021883	ATCGA	2	10	60036	60045	40 %	20 %	20 %	20 %	526467458
47	NC_021883	GATTG	2	10	62321	62330	20 %	40 %	40 %	0 %	526467460
48	NC_021883	CGGTG	2	10	62662	62671	0 %	20 %	60 %	20 %	526467460
49	NC_021883	AACGG	2	10	67838	67847	40 %	0 %	40 %	20 %	526467464
50	NC_021883	AATTT	2	10	68068	68077	40 %	60 %	0 %	0 %	526467464
51	NC_021883	TTGTG	2	10	68510	68519	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021883	ACCCC	2	10	72014	72023	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
53	NC_021883	GGTTT	2	10	72374	72383	0 %	60 %	40 %	0 %	526467468
54	NC_021883	TTGCT	2	10	75801	75810	0 %	60 %	20 %	20 %	526467471
55	NC_021883	AAGCG	2	10	76406	76415	40 %	0 %	40 %	20 %	526467472
56	NC_021883	AGATG	2	10	77759	77768	40 %	20 %	40 %	0 %	526467473
57	NC_021883	ATTTC	2	10	81301	81310	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_021883	AAGCC	2	10	84812	84821	40 %	0 %	20 %	40 %	526467478
59	NC_021883	TTGCT	2	10	86488	86497	0 %	60 %	20 %	20 %	526467478
60	NC_021883	CTCGC	2	10	86515	86524	0 %	20 %	20 %	60 %	526467478
61	NC_021883	CAACC	2	10	88064	88073	40 %	0 %	0 %	60 %	526467478
62	NC_021883	TATAA	2	10	91396	91405	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021883	AATTT	2	10	91693	91702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021883	TGTAA	2	10	92089	92098	40 %	40 %	20 %	0 %	526467483
65	NC_021883	ATCGG	2	10	94156	94165	20 %	20 %	40 %	20 %	526467487
66	NC_021883	TGGCG	2	10	98540	98549	0 %	20 %	60 %	20 %	526467493
67	NC_021883	TGGTT	2	10	99262	99271	0 %	60 %	40 %	0 %	526467495
68	NC_021883	GAAAC	2	10	99308	99317	60 %	0 %	20 %	20 %	526467495
69	NC_021883	TTTTG	2	10	99615	99624	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021883	TAAAA	2	10	99691	99700	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021883	ATTTT	2	10	99746	99755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021883	GTGAT	2	10	100989	100998	20 %	40 %	40 %	0 %	526467497
73	NC_021883	ATTTT	2	10	106343	106352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021883	GCCGA	2	10	109034	109043	20 %	0 %	40 %	40 %	526467507
75	NC_021883	GGAAT	2	10	109136	109145	40 %	20 %	40 %	0 %	526467507
76	NC_021883	GTGCT	2	10	109311	109320	0 %	40 %	40 %	20 %	526467507
77	NC_021883	TTGGG	2	10	109898	109907	0 %	40 %	60 %	0 %	526467508
78	NC_021883	AGCAA	2	10	110991	111000	60 %	0 %	20 %	20 %	526467509
79	NC_021883	AAGCC	2	10	111625	111634	40 %	0 %	20 %	40 %	526467509
80	NC_021883	GATTC	2	10	111767	111776	20 %	40 %	20 %	20 %	526467509
81	NC_021883	ATGCA	2	10	111873	111882	40 %	20 %	20 %	20 %	526467509
82	NC_021883	TACTG	2	10	112156	112165	20 %	40 %	20 %	20 %	526467509
83	NC_021883	GTTGC	2	10	112530	112539	0 %	40 %	40 %	20 %	526467510
84	NC_021883	AGGTT	2	10	112583	112592	20 %	40 %	40 %	0 %	526467510
85	NC_021883	CTTGG	2	10	112685	112694	0 %	40 %	40 %	20 %	526467510
86	NC_021883	AAGCC	2	10	113940	113949	40 %	0 %	20 %	40 %	526467513
87	NC_021883	AGCAA	2	10	114369	114378	60 %	0 %	20 %	20 %	526467514
88	NC_021883	TCATT	2	10	114931	114940	20 %	60 %	0 %	20 %	526467514
89	NC_021883	ATACC	2	10	115213	115222	40 %	20 %	0 %	40 %	526467514
90	NC_021883	CAAAA	2	10	115789	115798	80 %	0 %	0 %	20 %	526467515
91	NC_021883	AATCA	2	10	120299	120308	60 %	20 %	0 %	20 %	526467518
92	NC_021883	GGTAA	2	10	123099	123108	40 %	20 %	40 %	0 %	526467521
93	NC_021883	TTCTT	2	10	125322	125331	0 %	80 %	0 %	20 %	526467524
94	NC_021883	AAGTG	2	10	126474	126483	40 %	20 %	40 %	0 %	526467525
95	NC_021883	AAATA	2	10	129504	129513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021883	TAAAA	2	10	129712	129721	80 %	20 %	0 %	0 %	526467528
97	NC_021883	CAACC	2	10	130408	130417	40 %	0 %	0 %	60 %	526467529
98	NC_021883	TGAAT	2	10	131076	131085	40 %	40 %	20 %	0 %	526467529
99	NC_021883	AATGA	2	10	131425	131434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021883	AAAAG	2	10	131455	131464	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021883	CTTGC	2	10	133108	133117	0 %	40 %	20 %	40 %	526467531
102	NC_021883	TAAAA	2	10	135183	135192	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021883	GAAGA	2	10	135263	135272	60 %	0 %	40 %	0 %	526467532
104	NC_021883	AAATT	2	10	138133	138142	60 %	40 %	0 %	0 %	526467533
105	NC_021883	CTTTT	2	10	138851	138860	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021883	TCAAT	2	10	139665	139674	40 %	40 %	0 %	20 %	526467534
107	NC_021883	TTCGG	2	10	141059	141068	0 %	40 %	40 %	20 %	526467536
108	NC_021883	ACCAT	2	10	141212	141221	40 %	20 %	0 %	40 %	526467536
109	NC_021883	ATTTT	2	10	141734	141743	20 %	80 %	0 %	0 %	526467536
110	NC_021883	CCCAA	2	10	143738	143747	40 %	0 %	0 %	60 %	526467539
111	NC_021883	AATGC	2	10	145675	145684	40 %	20 %	20 %	20 %	526467541
112	NC_021883	GGCAG	2	10	146581	146590	20 %	0 %	60 %	20 %	526467543
113	NC_021883	TTTTC	2	10	148183	148192	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021883	TCACT	2	10	148270	148279	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_021883	ATTTT	2	10	150210	150219	20 %	80 %	0 %	0 %	526467545
116	NC_021883	TACCT	2	10	150629	150638	20 %	40 %	0 %	40 %	526467545
117	NC_021883	AAAAT	2	10	153720	153729	80 %	20 %	0 %	0 %	526467548
118	NC_021883	AAATG	2	10	154562	154571	60 %	20 %	20 %	0 %	526467550
119	NC_021883	CCAAA	2	10	158817	158826	60 %	0 %	0 %	40 %	526467553
120	NC_021883	AATTT	2	10	161144	161153	40 %	60 %	0 %	0 %	526467555
121	NC_021883	CAAAA	2	10	161244	161253	80 %	0 %	0 %	20 %	526467555
122	NC_021883	AAAAT	2	10	161494	161503	80 %	20 %	0 %	0 %	526467556
123	NC_021883	ACCCA	2	10	161827	161836	40 %	0 %	0 %	60 %	526467556
124	NC_021883	AATAT	2	10	164329	164338	60 %	40 %	0 %	0 %	526467559
125	NC_021883	TCCCA	2	10	167959	167968	20 %	20 %	0 %	60 %	526467561
126	NC_021883	TGGCT	2	10	173486	173495	0 %	40 %	40 %	20 %	526467567
127	NC_021883	GTTTT	2	10	173734	173743	0 %	80 %	20 %	0 %	526467568
128	NC_021883	AAAAT	2	10	174030	174039	80 %	20 %	0 %	0 %	526467568
129	NC_021883	GAGCA	2	10	174517	174526	40 %	0 %	40 %	20 %	526467569
130	NC_021883	TATTG	2	10	175827	175836	20 %	60 %	20 %	0 %	526467571
131	NC_021883	GGCAC	2	10	177245	177254	20 %	0 %	40 %	40 %	526467574
132	NC_021883	GCCGG	2	10	177497	177506	0 %	0 %	60 %	40 %	526467574
133	NC_021883	TTGAG	2	10	178075	178084	20 %	40 %	40 %	0 %	526467575
134	NC_021883	ACGCC	2	10	178610	178619	20 %	0 %	20 %	60 %	526467575
135	NC_021883	CATAA	2	10	178830	178839	60 %	20 %	0 %	20 %	526467576
136	NC_021883	ATAAA	2	10	179466	179475	80 %	20 %	0 %	0 %	526467577
137	NC_021883	CATAT	2	10	183811	183820	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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