MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 1961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021883	TTCGC	2	10	2033413	2033422	0 %	40 %	20 %	40 %	526469345
1502	NC_021883	AACGC	2	10	2035173	2035182	40 %	0 %	20 %	40 %	526469346
1503	NC_021883	TGCCG	2	10	2035402	2035411	0 %	20 %	40 %	40 %	526469346
1504	NC_021883	ATACC	2	10	2036689	2036698	40 %	20 %	0 %	40 %	526469347
1505	NC_021883	AGCTG	2	10	2038144	2038153	20 %	20 %	40 %	20 %	526469348
1506	NC_021883	ATTTA	2	10	2038462	2038471	40 %	60 %	0 %	0 %	526469348
1507	NC_021883	AATTT	2	10	2038796	2038805	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021883	GCTAT	2	10	2039309	2039318	20 %	40 %	20 %	20 %	526469349
1509	NC_021883	CAGCA	2	10	2039485	2039494	40 %	0 %	20 %	40 %	526469349
1510	NC_021883	GAAAA	2	10	2041083	2041092	80 %	0 %	20 %	0 %	526469349
1511	NC_021883	AAGCC	2	10	2043056	2043065	40 %	0 %	20 %	40 %	526469350
1512	NC_021883	GTTTT	2	10	2044783	2044792	0 %	80 %	20 %	0 %	526469352
1513	NC_021883	TAATT	2	10	2045168	2045177	40 %	60 %	0 %	0 %	526469352
1514	NC_021883	GATTT	2	10	2045767	2045776	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021883	AAAAT	2	10	2049335	2049344	80 %	20 %	0 %	0 %	526469355
1516	NC_021883	GGTTA	2	10	2049824	2049833	20 %	40 %	40 %	0 %	526469355
1517	NC_021883	GTGCA	2	10	2053028	2053037	20 %	20 %	40 %	20 %	526469357
1518	NC_021883	AATTA	2	10	2053980	2053989	60 %	40 %	0 %	0 %	526469358
1519	NC_021883	CAATC	2	10	2054177	2054186	40 %	20 %	0 %	40 %	526469358
1520	NC_021883	TCAAT	2	10	2054789	2054798	40 %	40 %	0 %	20 %	526469358
1521	NC_021883	AATGC	2	10	2055899	2055908	40 %	20 %	20 %	20 %	526469358
1522	NC_021883	CATAC	2	10	2056225	2056234	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1523	NC_021883	ATTAC	2	10	2059057	2059066	40 %	40 %	0 %	20 %	526469360
1524	NC_021883	GCTTT	2	10	2059556	2059565	0 %	60 %	20 %	20 %	526469360
1525	NC_021883	TTAAT	2	10	2060816	2060825	40 %	60 %	0 %	0 %	526469360
1526	NC_021883	GTGAT	2	10	2063812	2063821	20 %	40 %	40 %	0 %	526469362
1527	NC_021883	CAAAA	2	10	2064629	2064638	80 %	0 %	0 %	20 %	526469363
1528	NC_021883	ATTTA	2	10	2067440	2067449	40 %	60 %	0 %	0 %	526469367
1529	NC_021883	ATTAT	2	10	2068025	2068034	40 %	60 %	0 %	0 %	526469368
1530	NC_021883	AAGTG	2	10	2070324	2070333	40 %	20 %	40 %	0 %	526469370
1531	NC_021883	GTTCA	2	10	2071392	2071401	20 %	40 %	20 %	20 %	526469372
1532	NC_021883	GCCAA	2	10	2072494	2072503	40 %	0 %	20 %	40 %	526469373
1533	NC_021883	ATTGA	2	10	2072980	2072989	40 %	40 %	20 %	0 %	526469374
1534	NC_021883	GTGCG	2	10	2073136	2073145	0 %	20 %	60 %	20 %	526469374
1535	NC_021883	TTTTG	2	10	2073204	2073213	0 %	80 %	20 %	0 %	526469374
1536	NC_021883	GCATC	2	10	2073270	2073279	20 %	20 %	20 %	40 %	526469374
1537	NC_021883	CCAAG	2	10	2074328	2074337	40 %	0 %	20 %	40 %	526469374
1538	NC_021883	TAAAA	2	10	2075063	2075072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_021883	AGTTT	2	10	2075910	2075919	20 %	60 %	20 %	0 %	526469377
1540	NC_021883	CTCTC	2	10	2078312	2078321	0 %	40 %	0 %	60 %	526469379
1541	NC_021883	TACTC	2	10	2079350	2079359	20 %	40 %	0 %	40 %	526469380
1542	NC_021883	CGGCT	2	10	2080259	2080268	0 %	20 %	40 %	40 %	526469381
1543	NC_021883	ATCGG	2	10	2080727	2080736	20 %	20 %	40 %	20 %	526469381
1544	NC_021883	AATCA	2	10	2081581	2081590	60 %	20 %	0 %	20 %	526469381
1545	NC_021883	AGCAA	2	10	2081792	2081801	60 %	0 %	20 %	20 %	526469381
1546	NC_021883	CTTTT	2	10	2082355	2082364	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1547	NC_021883	GTTTA	2	10	2083963	2083972	20 %	60 %	20 %	0 %	526469383
1548	NC_021883	AAGTG	2	10	2084851	2084860	40 %	20 %	40 %	0 %	526469384
1549	NC_021883	TGTTT	2	10	2087098	2087107	0 %	80 %	20 %	0 %	526469386
1550	NC_021883	GAAAA	2	10	2087607	2087616	80 %	0 %	20 %	0 %	526469387
1551	NC_021883	AATTG	2	10	2088560	2088569	40 %	40 %	20 %	0 %	526469387
1552	NC_021883	TTATT	2	10	2092467	2092476	20 %	80 %	0 %	0 %	526469390
1553	NC_021883	GTTTG	2	10	2093527	2093536	0 %	60 %	40 %	0 %	526469391
1554	NC_021883	ATGAA	2	10	2094408	2094417	60 %	20 %	20 %	0 %	526469392
1555	NC_021883	GTGCT	2	10	2095678	2095687	0 %	40 %	40 %	20 %	526469393
1556	NC_021883	TCAAA	2	10	2096420	2096429	60 %	20 %	0 %	20 %	526469394
1557	NC_021883	CAATC	2	10	2096534	2096543	40 %	20 %	0 %	40 %	526469394
1558	NC_021883	TGCAT	2	10	2097250	2097259	20 %	40 %	20 %	20 %	526469394
1559	NC_021883	CAATT	2	10	2098061	2098070	40 %	40 %	0 %	20 %	526469395
1560	NC_021883	TAACA	2	10	2098292	2098301	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1561	NC_021883	TTATG	2	10	2098330	2098339	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021883	CCTGC	2	10	2101582	2101591	0 %	20 %	20 %	60 %	526469399
1563	NC_021883	TTGGG	2	10	2102954	2102963	0 %	40 %	60 %	0 %	526469400
1564	NC_021883	TTAAT	2	10	2105455	2105464	40 %	60 %	0 %	0 %	526469402
1565	NC_021883	CCCTT	2	10	2105809	2105818	0 %	40 %	0 %	60 %	526469403
1566	NC_021883	TGCAT	2	10	2105997	2106006	20 %	40 %	20 %	20 %	526469403
1567	NC_021883	TGCTT	2	10	2107029	2107038	0 %	60 %	20 %	20 %	526469403
1568	NC_021883	TACTT	2	10	2107584	2107593	20 %	60 %	0 %	20 %	526469404
1569	NC_021883	GGTAT	2	10	2108238	2108247	20 %	40 %	40 %	0 %	526469404
1570	NC_021883	GTTAT	2	10	2108880	2108889	20 %	60 %	20 %	0 %	526469404
1571	NC_021883	ATTCA	2	10	2110445	2110454	40 %	40 %	0 %	20 %	526469406
1572	NC_021883	TATCT	2	10	2112061	2112070	20 %	60 %	0 %	20 %	526469408
1573	NC_021883	TGGCG	2	10	2113719	2113728	0 %	20 %	60 %	20 %	526469409
1574	NC_021883	AAAAT	2	10	2113735	2113744	80 %	20 %	0 %	0 %	526469409
1575	NC_021883	CCCAA	2	10	2114717	2114726	40 %	0 %	0 %	60 %	526469409
1576	NC_021883	CCATA	2	10	2115387	2115396	40 %	20 %	0 %	40 %	526469410
1577	NC_021883	GGGCT	2	10	2115812	2115821	0 %	20 %	60 %	20 %	526469410
1578	NC_021883	GAAAC	2	10	2116168	2116177	60 %	0 %	20 %	20 %	526469410
1579	NC_021883	CTTGC	2	10	2118534	2118543	0 %	40 %	20 %	40 %	526469413
1580	NC_021883	AGCGA	2	10	2119375	2119384	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1581	NC_021883	TTTAC	2	10	2122478	2122487	20 %	60 %	0 %	20 %	526469417
1582	NC_021883	CAGAT	2	10	2123326	2123335	40 %	20 %	20 %	20 %	526469418
1583	NC_021883	AGCAA	2	10	2126794	2126803	60 %	0 %	20 %	20 %	526469421
1584	NC_021883	AAAGC	2	10	2129662	2129671	60 %	0 %	20 %	20 %	526469423
1585	NC_021883	AACCA	2	10	2129859	2129868	60 %	0 %	0 %	40 %	526469424
1586	NC_021883	TTTAA	2	10	2131710	2131719	40 %	60 %	0 %	0 %	526469427
1587	NC_021883	TTGCA	2	10	2136893	2136902	20 %	40 %	20 %	20 %	526469431
1588	NC_021883	AAGCA	2	10	2140606	2140615	60 %	0 %	20 %	20 %	526469437
1589	NC_021883	ATAAA	2	10	2140816	2140825	80 %	20 %	0 %	0 %	526469438
1590	NC_021883	GCCGG	2	10	2141194	2141203	0 %	0 %	60 %	40 %	526469438
1591	NC_021883	TTTGC	2	10	2142097	2142106	0 %	60 %	20 %	20 %	526469439
1592	NC_021883	ACGCA	2	10	2142191	2142200	40 %	0 %	20 %	40 %	526469439
1593	NC_021883	GGAAT	2	10	2146214	2146223	40 %	20 %	40 %	0 %	526469444
1594	NC_021883	CGATT	2	10	2146525	2146534	20 %	40 %	20 %	20 %	526469445
1595	NC_021883	ATTAC	2	10	2148556	2148565	40 %	40 %	0 %	20 %	526469445
1596	NC_021883	AAATG	2	10	2149686	2149695	60 %	20 %	20 %	0 %	526469447
1597	NC_021883	TTTAT	2	10	2150206	2150215	20 %	80 %	0 %	0 %	526469447
1598	NC_021883	GGTAC	2	10	2150632	2150641	20 %	20 %	40 %	20 %	526469447
1599	NC_021883	AAATT	2	10	2150723	2150732	60 %	40 %	0 %	0 %	526469447
1600	NC_021883	TTTAG	2	10	2153356	2153365	20 %	60 %	20 %	0 %	526469449
1601	NC_021883	TCTGC	2	10	2155058	2155067	0 %	40 %	20 %	40 %	526469451
1602	NC_021883	TCGGA	2	10	2156825	2156834	20 %	20 %	40 %	20 %	526469452
1603	NC_021883	CCACC	2	10	2161035	2161044	20 %	0 %	0 %	80 %	526469455
1604	NC_021883	TGCTT	2	10	2163007	2163016	0 %	60 %	20 %	20 %	526469459
1605	NC_021883	TAAAT	2	10	2164082	2164091	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_021883	ACGAA	2	10	2165169	2165178	60 %	0 %	20 %	20 %	526469462
1607	NC_021883	AAAAT	2	10	2165354	2165363	80 %	20 %	0 %	0 %	526469462
1608	NC_021883	GTTTT	2	10	2169608	2169617	0 %	80 %	20 %	0 %	526469467
1609	NC_021883	CCACG	2	10	2171744	2171753	20 %	0 %	20 %	60 %	526469469
1610	NC_021883	AACCG	2	10	2173822	2173831	40 %	0 %	20 %	40 %	526469470
1611	NC_021883	ATATT	2	10	2174698	2174707	40 %	60 %	0 %	0 %	526469471
1612	NC_021883	TTTAC	2	10	2176179	2176188	20 %	60 %	0 %	20 %	526469473
1613	NC_021883	ACTAG	2	10	2177673	2177682	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1614	NC_021883	GCCGA	2	10	2179181	2179190	20 %	0 %	40 %	40 %	526469476
1615	NC_021883	GCACA	2	10	2179442	2179451	40 %	0 %	20 %	40 %	526469476
1616	NC_021883	CTGCT	2	10	2180325	2180334	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1617	NC_021883	AGCTC	2	10	2180602	2180611	20 %	20 %	20 %	40 %	526469479
1618	NC_021883	TACGC	2	10	2182150	2182159	20 %	20 %	20 %	40 %	526469481
1619	NC_021883	GCCAA	2	10	2186714	2186723	40 %	0 %	20 %	40 %	526469484
1620	NC_021883	TGGTT	2	10	2188616	2188625	0 %	60 %	40 %	0 %	526467381
1621	NC_021883	TATTT	2	10	2190349	2190358	20 %	80 %	0 %	0 %	526469487
1622	NC_021883	GAAAT	2	10	2192037	2192046	60 %	20 %	20 %	0 %	526469488
1623	NC_021883	TTTTG	2	10	2196764	2196773	0 %	80 %	20 %	0 %	526469494
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1878	NC_021883	TGCGT	2	10	2549458	2549467	0 %	40 %	40 %	20 %	526467394
1879	NC_021883	AAGGA	2	10	2550333	2550342	60 %	0 %	40 %	0 %	526469835
1880	NC_021883	AATTA	2	10	2550389	2550398	60 %	40 %	0 %	0 %	526469836
1881	NC_021883	GTAAA	2	10	2555321	2555330	60 %	20 %	20 %	0 %	526469841
1882	NC_021883	CCCAA	2	10	2555331	2555340	40 %	0 %	0 %	60 %	526469841
1883	NC_021883	TTTGC	2	10	2556253	2556262	0 %	60 %	20 %	20 %	526469843
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1886	NC_021883	CTAAC	2	10	2562578	2562587	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1887	NC_021883	CGACT	2	10	2562907	2562916	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1888	NC_021883	TCGGT	2	10	2563282	2563291	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1889	NC_021883	TTCAA	2	10	2566040	2566049	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1890	NC_021883	CATAA	2	10	2567535	2567544	60 %	20 %	0 %	20 %	526469849
1891	NC_021883	GTAGC	2	10	2567959	2567968	20 %	20 %	40 %	20 %	526469849
1892	NC_021883	TTCAC	2	10	2569481	2569490	20 %	40 %	0 %	40 %	526469850
1893	NC_021883	AATTT	2	10	2570036	2570045	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1894	NC_021883	TGGGG	2	10	2572055	2572064	0 %	20 %	80 %	0 %	526469852
1895	NC_021883	TGGCT	2	10	2574883	2574892	0 %	40 %	40 %	20 %	526469856
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1897	NC_021883	CTTTC	2	10	2578641	2578650	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1898	NC_021883	TTCCA	2	10	2579484	2579493	20 %	40 %	0 %	40 %	526469862
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1903	NC_021883	AATGG	2	10	2583611	2583620	40 %	20 %	40 %	0 %	526469865
1904	NC_021883	GGTGT	2	10	2584092	2584101	0 %	40 %	60 %	0 %	526469866
1905	NC_021883	ACATT	2	10	2584620	2584629	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1906	NC_021883	TTAAC	2	10	2585372	2585381	40 %	40 %	0 %	20 %	526469867
1907	NC_021883	TACTT	2	10	2586980	2586989	20 %	60 %	0 %	20 %	526469869
1908	NC_021883	TTATT	2	10	2587171	2587180	20 %	80 %	0 %	0 %	526469869
1909	NC_021883	CGCAA	2	10	2590135	2590144	40 %	0 %	20 %	40 %	526469872
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1913	NC_021883	ACACC	2	10	2593746	2593755	40 %	0 %	0 %	60 %	526469875
1914	NC_021883	GTATG	2	10	2601834	2601843	20 %	40 %	40 %	0 %	526469883
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1916	NC_021883	ATTTA	2	10	2604619	2604628	40 %	60 %	0 %	0 %	526469886
1917	NC_021883	AATTA	2	10	2606288	2606297	60 %	40 %	0 %	0 %	526469888
1918	NC_021883	AAACA	2	10	2607298	2607307	80 %	0 %	0 %	20 %	526469889
1919	NC_021883	CAAAA	2	10	2607347	2607356	80 %	0 %	0 %	20 %	526469889
1920	NC_021883	CAAAA	2	10	2607836	2607845	80 %	0 %	0 %	20 %	526469889
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1926	NC_021883	CCAAA	2	10	2617042	2617051	60 %	0 %	0 %	40 %	526469898
1927	NC_021883	GGTGG	2	10	2617409	2617418	0 %	20 %	80 %	0 %	526469899
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1930	NC_021883	CTAAC	2	10	2621602	2621611	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1931	NC_021883	CGACT	2	10	2621931	2621940	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1932	NC_021883	TCGGT	2	10	2622306	2622315	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1933	NC_021883	TCGCT	2	10	2623468	2623477	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1934	NC_021883	TTCAA	2	10	2625180	2625189	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1935	NC_021883	TTGTT	2	10	2625524	2625533	0 %	80 %	20 %	0 %	526469901
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1958	NC_021883	AAAAT	2	10	2655311	2655320	80 %	20 %	0 %	0 %	526469926
1959	NC_021883	TTCGT	2	10	2656854	2656863	0 %	60 %	20 %	20 %	526469928
1960	NC_021883	TTCAA	2	10	2658007	2658016	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1961	NC_021883	AGCGT	2	10	2658441	2658450	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

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