MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 1961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021883	TGATT	2	10	1350126	1350135	20 %	60 %	20 %	0 %	526468638
1002	NC_021883	GTGAT	2	10	1350413	1350422	20 %	40 %	40 %	0 %	526468638
1003	NC_021883	GAAGA	2	10	1352289	1352298	60 %	0 %	40 %	0 %	526468640
1004	NC_021883	TATAA	2	10	1355071	1355080	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021883	AAAAT	2	10	1357018	1357027	80 %	20 %	0 %	0 %	526468646
1006	NC_021883	CCAAG	2	10	1357260	1357269	40 %	0 %	20 %	40 %	526468646
1007	NC_021883	AGCCA	2	10	1359967	1359976	40 %	0 %	20 %	40 %	526468650
1008	NC_021883	CGGAA	2	10	1360076	1360085	40 %	0 %	40 %	20 %	526468650
1009	NC_021883	CATCG	2	10	1361293	1361302	20 %	20 %	20 %	40 %	526468651
1010	NC_021883	CTTGG	2	10	1361535	1361544	0 %	40 %	40 %	20 %	526468651
1011	NC_021883	CGAGC	2	10	1364532	1364541	20 %	0 %	40 %	40 %	526468653
1012	NC_021883	TTTTC	2	10	1365168	1365177	0 %	80 %	0 %	20 %	526468654
1013	NC_021883	CATTC	2	10	1365988	1365997	20 %	40 %	0 %	40 %	526468655
1014	NC_021883	TAAAT	2	10	1366417	1366426	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021883	AAAAT	2	10	1367593	1367602	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021883	TAATT	2	10	1367642	1367651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021883	TCGCC	2	10	1369018	1369027	0 %	20 %	20 %	60 %	526468658
1018	NC_021883	CTGCC	2	10	1369650	1369659	0 %	20 %	20 %	60 %	526468658
1019	NC_021883	CAAAG	2	10	1378019	1378028	60 %	0 %	20 %	20 %	526468666
1020	NC_021883	TAAAC	2	10	1381082	1381091	60 %	20 %	0 %	20 %	526468668
1021	NC_021883	ACAAA	2	10	1383362	1383371	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1022	NC_021883	CTTTT	2	10	1384881	1384890	0 %	80 %	0 %	20 %	526468673
1023	NC_021883	GCTAC	2	10	1386296	1386305	20 %	20 %	20 %	40 %	526468675
1024	NC_021883	TTAAT	2	10	1387102	1387111	40 %	60 %	0 %	0 %	526468675
1025	NC_021883	TTTCT	2	10	1388888	1388897	0 %	80 %	0 %	20 %	526468677
1026	NC_021883	CAAAA	2	10	1390535	1390544	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1027	NC_021883	AAATG	2	10	1392045	1392054	60 %	20 %	20 %	0 %	526468680
1028	NC_021883	ATTTA	2	10	1392654	1392663	40 %	60 %	0 %	0 %	526468680
1029	NC_021883	GAAAT	2	10	1392672	1392681	60 %	20 %	20 %	0 %	526468681
1030	NC_021883	TAGCG	2	10	1393574	1393583	20 %	20 %	40 %	20 %	526468683
1031	NC_021883	ATCGT	2	10	1394027	1394036	20 %	40 %	20 %	20 %	526468683
1032	NC_021883	GCTCG	2	10	1395040	1395049	0 %	20 %	40 %	40 %	526468685
1033	NC_021883	CATCG	2	10	1395764	1395773	20 %	20 %	20 %	40 %	526468685
1034	NC_021883	TCATC	2	10	1395982	1395991	20 %	40 %	0 %	40 %	526468685
1035	NC_021883	TAAAA	2	10	1396402	1396411	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021883	AAAAT	2	10	1397939	1397948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021883	CTACA	2	10	1398448	1398457	40 %	20 %	0 %	40 %	526468690
1038	NC_021883	TTGAG	2	10	1398679	1398688	20 %	40 %	40 %	0 %	526468690
1039	NC_021883	GATAA	2	10	1399049	1399058	60 %	20 %	20 %	0 %	526468691
1040	NC_021883	TACCA	2	10	1399968	1399977	40 %	20 %	0 %	40 %	526467337
1041	NC_021883	TTGTA	2	10	1401836	1401845	20 %	60 %	20 %	0 %	526467337
1042	NC_021883	TCGGG	2	10	1405923	1405932	0 %	20 %	60 %	20 %	526467337
1043	NC_021883	GCATT	2	10	1408920	1408929	20 %	40 %	20 %	20 %	526467339
1044	NC_021883	TTGCC	2	10	1409274	1409283	0 %	40 %	20 %	40 %	526468695
1045	NC_021883	TTGAT	2	10	1409856	1409865	20 %	60 %	20 %	0 %	526468697
1046	NC_021883	CCAAG	2	10	1414591	1414600	40 %	0 %	20 %	40 %	526468702
1047	NC_021883	CGTAC	2	10	1415573	1415582	20 %	20 %	20 %	40 %	526468704
1048	NC_021883	GGCTT	2	10	1415925	1415934	0 %	40 %	40 %	20 %	526468705
1049	NC_021883	ATCGG	2	10	1416492	1416501	20 %	20 %	40 %	20 %	526468706
1050	NC_021883	AACCG	2	10	1418120	1418129	40 %	0 %	20 %	40 %	526468709
1051	NC_021883	AAACG	2	10	1418615	1418624	60 %	0 %	20 %	20 %	526468710
1052	NC_021883	ATTAC	2	10	1418828	1418837	40 %	40 %	0 %	20 %	526468710
1053	NC_021883	CCAAC	2	10	1420241	1420250	40 %	0 %	0 %	60 %	526468711
1054	NC_021883	TTCGC	2	10	1420526	1420535	0 %	40 %	20 %	40 %	526468711
1055	NC_021883	GCGTA	2	10	1422505	1422514	20 %	20 %	40 %	20 %	526467342
1056	NC_021883	TTCTC	2	10	1424021	1424030	0 %	60 %	0 %	40 %	526467343
1057	NC_021883	GTTTT	2	10	1424418	1424427	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021883	ATCAC	2	10	1424434	1424443	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1059	NC_021883	CAAAA	2	10	1424517	1424526	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1060	NC_021883	GTTTG	2	10	1424590	1424599	0 %	60 %	40 %	0 %	526467344
1061	NC_021883	AATCC	2	10	1427096	1427105	40 %	20 %	0 %	40 %	526468717
1062	NC_021883	TCAAC	2	10	1429263	1429272	40 %	20 %	0 %	40 %	526467349
1063	NC_021883	AGAAT	2	10	1429553	1429562	60 %	20 %	20 %	0 %	526467349
1064	NC_021883	CATTG	2	10	1429720	1429729	20 %	40 %	20 %	20 %	526467349
1065	NC_021883	AAAAT	2	10	1431167	1431176	80 %	20 %	0 %	0 %	526468722
1066	NC_021883	CCGGA	2	10	1433233	1433242	20 %	0 %	40 %	40 %	526468726
1067	NC_021883	TTTTC	2	10	1435682	1435691	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1068	NC_021883	ATTGA	2	10	1436527	1436536	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021883	TGAAA	2	10	1438886	1438895	60 %	20 %	20 %	0 %	526468735
1070	NC_021883	CTTCA	2	10	1439531	1439540	20 %	40 %	0 %	40 %	526468737
1071	NC_021883	GAACA	2	10	1439686	1439695	60 %	0 %	20 %	20 %	526468737
1072	NC_021883	AATTT	2	10	1444318	1444327	40 %	60 %	0 %	0 %	526468745
1073	NC_021883	TCGTG	2	10	1445472	1445481	0 %	40 %	40 %	20 %	526467352
1074	NC_021883	CTTTT	2	10	1445506	1445515	0 %	80 %	0 %	20 %	526467352
1075	NC_021883	AAATA	2	10	1446154	1446163	80 %	20 %	0 %	0 %	526467352
1076	NC_021883	TTTGA	2	10	1449269	1449278	20 %	60 %	20 %	0 %	526468749
1077	NC_021883	GGGTT	2	10	1450023	1450032	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021883	CGTGC	2	10	1451066	1451075	0 %	20 %	40 %	40 %	526468752
1079	NC_021883	TAACT	2	10	1454570	1454579	40 %	40 %	0 %	20 %	526468755
1080	NC_021883	AGCGT	2	10	1454595	1454604	20 %	20 %	40 %	20 %	526468755
1081	NC_021883	TCTAA	2	10	1454605	1454614	40 %	40 %	0 %	20 %	526468755
1082	NC_021883	TAATC	2	10	1455003	1455012	40 %	40 %	0 %	20 %	526468756
1083	NC_021883	AGCTA	2	10	1455746	1455755	40 %	20 %	20 %	20 %	526468756
1084	NC_021883	TAAAA	2	10	1455944	1455953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021883	TCAGT	2	10	1458468	1458477	20 %	40 %	20 %	20 %	526468759
1086	NC_021883	AACCA	2	10	1459721	1459730	60 %	0 %	0 %	40 %	526468761
1087	NC_021883	AAATT	2	10	1461253	1461262	60 %	40 %	0 %	0 %	526468762
1088	NC_021883	AACAA	2	10	1461407	1461416	80 %	0 %	0 %	20 %	526468762
1089	NC_021883	TTATT	2	10	1463175	1463184	20 %	80 %	0 %	0 %	526468765
1090	NC_021883	CAAAT	2	10	1464360	1464369	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1091	NC_021883	CTCAC	2	10	1465284	1465293	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1092	NC_021883	AACCA	2	10	1465342	1465351	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1093	NC_021883	TTTAT	2	10	1469532	1469541	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021883	TCAAA	2	10	1469858	1469867	60 %	20 %	0 %	20 %	526468776
1095	NC_021883	TAGCG	2	10	1470444	1470453	20 %	20 %	40 %	20 %	526468777
1096	NC_021883	AATCA	2	10	1472055	1472064	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1097	NC_021883	ATTAA	2	10	1473508	1473517	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021883	CTATT	2	10	1473684	1473693	20 %	60 %	0 %	20 %	526468782
1099	NC_021883	TTATT	2	10	1474432	1474441	20 %	80 %	0 %	0 %	526468783
1100	NC_021883	AAAAT	2	10	1474804	1474813	80 %	20 %	0 %	0 %	526468784
1101	NC_021883	ATTAT	2	10	1475683	1475692	40 %	60 %	0 %	0 %	526468785
1102	NC_021883	TAATT	2	10	1480470	1480479	40 %	60 %	0 %	0 %	526468788
1103	NC_021883	GCTTA	2	10	1480612	1480621	20 %	40 %	20 %	20 %	526468789
1104	NC_021883	CAATC	2	10	1482306	1482315	40 %	20 %	0 %	40 %	526468792
1105	NC_021883	ATTTT	2	10	1483647	1483656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021883	TCGGT	2	10	1484714	1484723	0 %	40 %	40 %	20 %	526468795
1107	NC_021883	AAGTG	2	10	1484949	1484958	40 %	20 %	40 %	0 %	526468795
1108	NC_021883	TACCG	2	10	1485618	1485627	20 %	20 %	20 %	40 %	526468795
1109	NC_021883	TTCTA	2	10	1486084	1486093	20 %	60 %	0 %	20 %	526468796
1110	NC_021883	GGTGT	2	10	1489808	1489817	0 %	40 %	60 %	0 %	526468802
1111	NC_021883	AAAGC	2	10	1492363	1492372	60 %	0 %	20 %	20 %	526468805
1112	NC_021883	ACTTT	2	10	1493888	1493897	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1113	NC_021883	TAAAT	2	10	1494771	1494780	60 %	40 %	0 %	0 %	526468807
1114	NC_021883	TTACA	2	10	1498395	1498404	40 %	40 %	0 %	20 %	526468810
1115	NC_021883	ACAAT	2	10	1503982	1503991	60 %	20 %	0 %	20 %	526468817
1116	NC_021883	TGCAA	2	10	1504054	1504063	40 %	20 %	20 %	20 %	526468817
1117	NC_021883	ACTTA	2	10	1504219	1504228	40 %	40 %	0 %	20 %	526468817
1118	NC_021883	GATTT	2	10	1505508	1505517	20 %	60 %	20 %	0 %	526468817
1119	NC_021883	TTATG	2	10	1506031	1506040	20 %	60 %	20 %	0 %	526468817
1120	NC_021883	AAAAC	2	10	1506821	1506830	80 %	0 %	0 %	20 %	526468817
1121	NC_021883	CATTT	2	10	1507273	1507282	20 %	60 %	0 %	20 %	526468817
1122	NC_021883	ATTTG	2	10	1508386	1508395	20 %	60 %	20 %	0 %	526468819
1123	NC_021883	TTAAA	2	10	1509145	1509154	60 %	40 %	0 %	0 %	526468821
1124	NC_021883	TCTTA	2	10	1511144	1511153	20 %	60 %	0 %	20 %	526468822
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1126	NC_021883	ACCAA	2	10	1511424	1511433	60 %	0 %	0 %	40 %	526468822
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1500	NC_021883	CAATA	2	10	2032180	2032189	60 %	20 %	0 %	20 %	526469344

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