MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 1504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021738	GCAGA	2	10	2994	3003	40 %	0 %	40 %	20 %	525655725
2	NC_021738	ATTTT	2	10	3239	3248	20 %	80 %	0 %	0 %	525655725
3	NC_021738	TTTGC	2	10	4022	4031	0 %	60 %	20 %	20 %	525655725
4	NC_021738	AATTG	2	10	5469	5478	40 %	40 %	20 %	0 %	525655725
5	NC_021738	TCATA	2	10	5631	5640	40 %	40 %	0 %	20 %	525655725
6	NC_021738	ATTCA	2	10	9780	9789	40 %	40 %	0 %	20 %	525655727
7	NC_021738	CTGTA	2	10	9971	9980	20 %	40 %	20 %	20 %	525655727
8	NC_021738	AATAC	2	10	11515	11524	60 %	20 %	0 %	20 %	525655614
9	NC_021738	TGAAT	2	10	14809	14818	40 %	40 %	20 %	0 %	525655730
10	NC_021738	ATACC	2	10	15732	15741	40 %	20 %	0 %	40 %	525655730
11	NC_021738	TTGGC	2	10	17425	17434	0 %	40 %	40 %	20 %	525655731
12	NC_021738	AGCTG	2	10	19633	19642	20 %	20 %	40 %	20 %	525655735
13	NC_021738	AAGTG	2	10	19936	19945	40 %	20 %	40 %	0 %	525655735
14	NC_021738	TTCAC	2	10	20606	20615	20 %	40 %	0 %	40 %	525655735
15	NC_021738	CTTAT	2	10	21078	21087	20 %	60 %	0 %	20 %	525655736
16	NC_021738	TTTTA	2	10	22325	22334	20 %	80 %	0 %	0 %	525655738
17	NC_021738	GTTTC	2	10	22654	22663	0 %	60 %	20 %	20 %	525655738
18	NC_021738	AATCC	2	10	24187	24196	40 %	20 %	0 %	40 %	525655739
19	NC_021738	GTTTC	2	10	24340	24349	0 %	60 %	20 %	20 %	525655739
20	NC_021738	GCAAC	2	10	25472	25481	40 %	0 %	20 %	40 %	525655741
21	NC_021738	GTGGC	2	10	27989	27998	0 %	20 %	60 %	20 %	525655743
22	NC_021738	TTAAA	2	10	33323	33332	60 %	40 %	0 %	0 %	525655745
23	NC_021738	CATTT	2	10	34670	34679	20 %	60 %	0 %	20 %	525655746
24	NC_021738	TTGCA	2	10	37973	37982	20 %	40 %	20 %	20 %	525655749
25	NC_021738	TAAAT	2	10	38070	38079	60 %	40 %	0 %	0 %	525655749
26	NC_021738	CCAAG	2	10	40769	40778	40 %	0 %	20 %	40 %	525655752
27	NC_021738	CGTTT	2	10	42354	42363	0 %	60 %	20 %	20 %	525655753
28	NC_021738	AATGA	2	10	42551	42560	60 %	20 %	20 %	0 %	525655753
29	NC_021738	ACCCA	2	10	42839	42848	40 %	0 %	0 %	60 %	525655753
30	NC_021738	AATCA	2	10	44006	44015	60 %	20 %	0 %	20 %	525655754
31	NC_021738	AGCAC	2	10	46952	46961	40 %	0 %	20 %	40 %	525655757
32	NC_021738	TAAGT	2	10	47011	47020	40 %	40 %	20 %	0 %	525655757
33	NC_021738	TAAAA	2	10	47590	47599	80 %	20 %	0 %	0 %	525655757
34	NC_021738	ACATC	2	10	48281	48290	40 %	20 %	0 %	40 %	525655758
35	NC_021738	GTAAT	2	10	48332	48341	40 %	40 %	20 %	0 %	525655758
36	NC_021738	CCGGC	2	10	49226	49235	0 %	0 %	40 %	60 %	525655759
37	NC_021738	ACCCA	2	10	52455	52464	40 %	0 %	0 %	60 %	525655761
38	NC_021738	AAATC	2	10	54558	54567	60 %	20 %	0 %	20 %	525655762
39	NC_021738	TCCAA	2	10	55353	55362	40 %	20 %	0 %	40 %	525655763
40	NC_021738	ATACC	2	10	56652	56661	40 %	20 %	0 %	40 %	525655764
41	NC_021738	TTTGG	2	10	57346	57355	0 %	60 %	40 %	0 %	525655765
42	NC_021738	TACCG	2	10	57589	57598	20 %	20 %	20 %	40 %	525655765
43	NC_021738	TAAGA	2	10	57627	57636	60 %	20 %	20 %	0 %	525655765
44	NC_021738	TTTAA	2	10	59622	59631	40 %	60 %	0 %	0 %	525655767
45	NC_021738	TCAAA	2	10	60380	60389	60 %	20 %	0 %	20 %	525655769
46	NC_021738	AAATG	2	10	62222	62231	60 %	20 %	20 %	0 %	525655771
47	NC_021738	GTTTT	2	10	62674	62683	0 %	80 %	20 %	0 %	525655771
48	NC_021738	CATAA	2	10	63464	63473	60 %	20 %	0 %	20 %	525655771
49	NC_021738	ATCTC	2	10	63732	63741	20 %	40 %	0 %	40 %	525655771
50	NC_021738	AAATC	2	10	63987	63996	60 %	20 %	0 %	20 %	525655771
51	NC_021738	ATTTA	2	10	64673	64682	40 %	60 %	0 %	0 %	525655771
52	NC_021738	ATTGC	2	10	65440	65449	20 %	40 %	20 %	20 %	525655771
53	NC_021738	ATTGT	2	10	65513	65522	20 %	60 %	20 %	0 %	525655771
54	NC_021738	TGTAA	2	10	71099	71108	40 %	40 %	20 %	0 %	525655776
55	NC_021738	GGATA	2	10	73741	73750	40 %	20 %	40 %	0 %	525655778
56	NC_021738	GGCAA	2	10	74306	74315	40 %	0 %	40 %	20 %	525655778
57	NC_021738	GCTTT	2	10	77129	77138	0 %	60 %	20 %	20 %	525655781
58	NC_021738	TAGAA	2	10	82048	82057	60 %	20 %	20 %	0 %	525655786
59	NC_021738	TTTGC	2	10	82191	82200	0 %	60 %	20 %	20 %	525655787
60	NC_021738	CGGTA	2	10	82513	82522	20 %	20 %	40 %	20 %	525655788
61	NC_021738	CTTCA	2	10	83179	83188	20 %	40 %	0 %	40 %	525655788
62	NC_021738	ACCGA	2	10	83417	83426	40 %	0 %	20 %	40 %	525655788
63	NC_021738	GATTG	2	10	85825	85834	20 %	40 %	40 %	0 %	525655790
64	NC_021738	TAAGC	2	10	87519	87528	40 %	20 %	20 %	20 %	525655793
65	NC_021738	AATTA	2	10	87661	87670	60 %	40 %	0 %	0 %	525655794
66	NC_021738	ACCAT	2	10	92169	92178	40 %	20 %	0 %	40 %	525655797
67	NC_021738	TATAA	2	10	92447	92456	60 %	40 %	0 %	0 %	525655797
68	NC_021738	AATAA	2	10	93700	93709	80 %	20 %	0 %	0 %	525655798
69	NC_021738	AATAG	2	10	94447	94456	60 %	20 %	20 %	0 %	525655799
70	NC_021738	TTGGT	2	10	95706	95715	0 %	60 %	40 %	0 %	525655801
71	NC_021738	AACTG	2	10	96959	96968	40 %	20 %	20 %	20 %	525655803
72	NC_021738	AAGCC	2	10	105340	105349	40 %	0 %	20 %	40 %	525655807
73	NC_021738	TTAGA	2	10	106898	106907	40 %	40 %	20 %	0 %	525655809
74	NC_021738	ACGCT	2	10	106908	106917	20 %	20 %	20 %	40 %	525655809
75	NC_021738	AGTTA	2	10	106933	106942	40 %	40 %	20 %	0 %	525655809
76	NC_021738	GCACG	2	10	110437	110446	20 %	0 %	40 %	40 %	525655812
77	NC_021738	TCAAA	2	10	112234	112243	60 %	20 %	0 %	20 %	525655815
78	NC_021738	CGATG	2	10	115650	115659	20 %	20 %	40 %	20 %	525655817
79	NC_021738	CGAGC	2	10	116374	116383	20 %	0 %	40 %	40 %	525655817
80	NC_021738	AGCAG	2	10	116427	116436	40 %	0 %	40 %	20 %	525655817
81	NC_021738	ACGAT	2	10	117387	117396	40 %	20 %	20 %	20 %	525655819
82	NC_021738	CGCTA	2	10	117840	117849	20 %	20 %	20 %	40 %	525655819
83	NC_021738	ATTTC	2	10	118743	118752	20 %	60 %	0 %	20 %	525655821
84	NC_021738	TAAAT	2	10	118761	118770	60 %	40 %	0 %	0 %	525655822
85	NC_021738	CATTT	2	10	119370	119379	20 %	60 %	0 %	20 %	525655822
86	NC_021738	ATTAA	2	10	124311	124320	60 %	40 %	0 %	0 %	525655827
87	NC_021738	GCGTA	2	10	125115	125124	20 %	20 %	40 %	20 %	525655827
88	NC_021738	AAAAG	2	10	126532	126541	80 %	0 %	20 %	0 %	525655829
89	NC_021738	TCCAA	2	10	128954	128963	40 %	20 %	0 %	40 %	525655832
90	NC_021738	GTTTA	2	10	130331	130340	20 %	60 %	20 %	0 %	525655834
91	NC_021738	GCTTT	2	10	133393	133402	0 %	60 %	20 %	20 %	525655836
92	NC_021738	GGCGA	2	10	142394	142403	20 %	0 %	60 %	20 %	525655843
93	NC_021738	GAATG	2	10	145420	145429	40 %	20 %	40 %	0 %	525655846
94	NC_021738	AGAAA	2	10	146225	146234	80 %	0 %	20 %	0 %	525655847
95	NC_021738	ATTTT	2	10	146728	146737	20 %	80 %	0 %	0 %	525655848
96	NC_021738	CTTTC	2	10	148880	148889	0 %	60 %	0 %	40 %	525655849
97	NC_021738	TTGTG	2	10	148965	148974	0 %	60 %	40 %	0 %	525655849
98	NC_021738	CCAAG	2	10	149804	149813	40 %	0 %	20 %	40 %	525655850
99	NC_021738	GTTTC	2	10	149980	149989	0 %	60 %	20 %	20 %	525655850
100	NC_021738	GCGAT	2	10	150045	150054	20 %	20 %	40 %	20 %	525655850
101	NC_021738	TTCCG	2	10	151263	151272	0 %	40 %	20 %	40 %	525655851
102	NC_021738	TGGCT	2	10	151372	151381	0 %	40 %	40 %	20 %	525655851
103	NC_021738	AATGA	2	10	153678	153687	60 %	20 %	20 %	0 %	525655853
104	NC_021738	CTTGG	2	10	154080	154089	0 %	40 %	40 %	20 %	525655854
105	NC_021738	ATTTT	2	10	154214	154223	20 %	80 %	0 %	0 %	525655854
106	NC_021738	ATTTT	2	10	154322	154331	20 %	80 %	0 %	0 %	525655854
107	NC_021738	TGGTG	2	10	157304	157313	0 %	40 %	60 %	0 %	525655857
108	NC_021738	AATGC	2	10	159621	159630	40 %	20 %	20 %	20 %	525655860
109	NC_021738	ATCAC	2	10	159722	159731	40 %	20 %	0 %	40 %	525655860
110	NC_021738	AAATC	2	10	160008	160017	60 %	20 %	0 %	20 %	525655860
111	NC_021738	TGCAT	2	10	160025	160034	20 %	40 %	20 %	20 %	525655860
112	NC_021738	AGTGC	2	10	166995	167004	20 %	20 %	40 %	20 %	525655864
113	NC_021738	ATTAA	2	10	171983	171992	60 %	40 %	0 %	0 %	525655869
114	NC_021738	ATAGA	2	10	175329	175338	60 %	20 %	20 %	0 %	525655873
115	NC_021738	TAATT	2	10	175429	175438	40 %	60 %	0 %	0 %	525655873
116	NC_021738	TTTTA	2	10	176158	176167	20 %	80 %	0 %	0 %	525655874
117	NC_021738	TCAAT	2	10	177158	177167	40 %	40 %	0 %	20 %	525655874
118	NC_021738	GATAA	2	10	178523	178532	60 %	20 %	20 %	0 %	525655875
119	NC_021738	TGCCC	2	10	182693	182702	0 %	20 %	20 %	60 %	525655881
120	NC_021738	TGCCC	2	10	183750	183759	0 %	20 %	20 %	60 %	525655882
121	NC_021738	CGGCT	2	10	184099	184108	0 %	20 %	40 %	40 %	525655882
122	NC_021738	CCATT	2	10	184402	184411	20 %	40 %	0 %	40 %	525655882
123	NC_021738	CAATA	2	10	184594	184603	60 %	20 %	0 %	20 %	525655882
124	NC_021738	GTAAT	2	10	184747	184756	40 %	40 %	20 %	0 %	525655882
125	NC_021738	GCACC	2	10	185532	185541	20 %	0 %	20 %	60 %	525655882
126	NC_021738	CAACC	2	10	188917	188926	40 %	0 %	0 %	60 %	525655884
127	NC_021738	CCAAT	2	10	190410	190419	40 %	20 %	0 %	40 %	525655885
128	NC_021738	TTTTC	2	10	193259	193268	0 %	80 %	0 %	20 %	525655889
129	NC_021738	TAAGT	2	10	194275	194284	40 %	40 %	20 %	0 %	525655891
130	NC_021738	CTTTT	2	10	194365	194374	0 %	80 %	0 %	20 %	525655891
131	NC_021738	GAAAT	2	10	194389	194398	60 %	20 %	20 %	0 %	525655891
132	NC_021738	AGCTG	2	10	194712	194721	20 %	20 %	40 %	20 %	525655892
133	NC_021738	GCGTA	2	10	196843	196852	20 %	20 %	40 %	20 %	525655893
134	NC_021738	TTTCA	2	10	197128	197137	20 %	60 %	0 %	20 %	525655893
135	NC_021738	CTTTG	2	10	198076	198085	0 %	60 %	20 %	20 %	525655894
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248	NC_021738	CCACT	2	10	393873	393882	20 %	20 %	0 %	60 %	525656045
249	NC_021738	TTCTG	2	10	394722	394731	0 %	60 %	20 %	20 %	525655640
250	NC_021738	TTTGG	2	10	395140	395149	0 %	60 %	40 %	0 %	525656046
251	NC_021738	ATCGA	2	10	396215	396224	40 %	20 %	20 %	20 %	525656047
252	NC_021738	GTAAA	2	10	397760	397769	60 %	20 %	20 %	0 %	525656049
253	NC_021738	AATAA	2	10	398279	398288	80 %	20 %	0 %	0 %	525656050
254	NC_021738	TGAAA	2	10	403385	403394	60 %	20 %	20 %	0 %	525656056
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256	NC_021738	GAACA	2	10	404185	404194	60 %	0 %	20 %	20 %	525656058
257	NC_021738	TTAAG	2	10	405345	405354	40 %	40 %	20 %	0 %	525656059
258	NC_021738	TCAAT	2	10	406786	406795	40 %	40 %	0 %	20 %	525656062
259	NC_021738	ACACT	2	10	408815	408824	40 %	20 %	0 %	40 %	525655644
260	NC_021738	ATTCG	2	10	414692	414701	20 %	40 %	20 %	20 %	525656070
261	NC_021738	CAAAC	2	10	414988	414997	60 %	0 %	0 %	40 %	525656071
262	NC_021738	AACCA	2	10	416197	416206	60 %	0 %	0 %	40 %	525656072
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379	NC_021738	AGCAG	2	10	620305	620314	40 %	0 %	40 %	20 %	525656241
380	NC_021738	GATTT	2	10	623389	623398	20 %	60 %	20 %	0 %	525656243
381	NC_021738	TCTGC	2	10	625351	625360	0 %	40 %	20 %	40 %	525656245
382	NC_021738	ATCTT	2	10	627902	627911	20 %	60 %	0 %	20 %	525656247
383	NC_021738	TCAAT	2	10	631252	631261	40 %	40 %	0 %	20 %	525656249
384	NC_021738	CGCTC	2	10	633980	633989	0 %	20 %	20 %	60 %	525656251
385	NC_021738	CCACC	2	10	636090	636099	20 %	0 %	0 %	80 %	525656253
386	NC_021738	AAATT	2	10	638618	638627	60 %	40 %	0 %	0 %	525656256
387	NC_021738	TTTAC	2	10	639986	639995	20 %	60 %	0 %	20 %	525656258
388	NC_021738	TCACC	2	10	640227	640236	20 %	20 %	0 %	60 %	525656258
389	NC_021738	CAAAT	2	10	644935	644944	60 %	20 %	0 %	20 %	525656261
390	NC_021738	AACGA	2	10	646069	646078	60 %	0 %	20 %	20 %	525656261
391	NC_021738	CTGTT	2	10	649064	649073	0 %	60 %	20 %	20 %	525656264
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