MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 1504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021738	CATTG	2	10	1715261	1715270	20 %	40 %	20 %	20 %	525657220
1002	NC_021738	CCAAG	2	10	1715569	1715578	40 %	0 %	20 %	40 %	525657220
1003	NC_021738	TGCCT	2	10	1720911	1720920	0 %	40 %	20 %	40 %	525657227
1004	NC_021738	CGGTA	2	10	1722223	1722232	20 %	20 %	40 %	20 %	525657229
1005	NC_021738	TTTAT	2	10	1727574	1727583	20 %	80 %	0 %	0 %	525657233
1006	NC_021738	ATCTG	2	10	1730294	1730303	20 %	40 %	20 %	20 %	525657237
1007	NC_021738	AATGG	2	10	1733343	1733352	40 %	20 %	40 %	0 %	525657238
1008	NC_021738	ATTCA	2	10	1737399	1737408	40 %	40 %	0 %	20 %	525657239
1009	NC_021738	AAGGT	2	10	1740692	1740701	40 %	20 %	40 %	0 %	525657242
1010	NC_021738	AGGCG	2	10	1740909	1740918	20 %	0 %	60 %	20 %	525657242
1011	NC_021738	GCTAC	2	10	1741133	1741142	20 %	20 %	20 %	40 %	525657242
1012	NC_021738	ACAGA	2	10	1743079	1743088	60 %	0 %	20 %	20 %	525657243
1013	NC_021738	ACACC	2	10	1746728	1746737	40 %	0 %	0 %	60 %	525657246
1014	NC_021738	AAAAC	2	10	1746752	1746761	80 %	0 %	0 %	20 %	525657246
1015	NC_021738	TTGTG	2	10	1749149	1749158	0 %	60 %	40 %	0 %	525657250
1016	NC_021738	AATAT	2	10	1749654	1749663	60 %	40 %	0 %	0 %	525657250
1017	NC_021738	GAGTT	2	10	1753318	1753327	20 %	40 %	40 %	0 %	525657257
1018	NC_021738	AATTA	2	10	1758124	1758133	60 %	40 %	0 %	0 %	525657260
1019	NC_021738	AACCC	2	10	1759363	1759372	40 %	0 %	0 %	60 %	525657261
1020	NC_021738	AAGCC	2	10	1759426	1759435	40 %	0 %	20 %	40 %	525657261
1021	NC_021738	ATGCA	2	10	1759763	1759772	40 %	20 %	20 %	20 %	525657261
1022	NC_021738	AGTTG	2	10	1761734	1761743	20 %	40 %	40 %	0 %	525657263
1023	NC_021738	CGGAA	2	10	1762389	1762398	40 %	0 %	40 %	20 %	525657264
1024	NC_021738	TGAGA	2	10	1762422	1762431	40 %	20 %	40 %	0 %	525657264
1025	NC_021738	ATCGA	2	10	1762764	1762773	40 %	20 %	20 %	20 %	525657265
1026	NC_021738	TTATC	2	10	1767137	1767146	20 %	60 %	0 %	20 %	525657268
1027	NC_021738	CAATT	2	10	1768488	1768497	40 %	40 %	0 %	20 %	525657271
1028	NC_021738	AATCA	2	10	1769037	1769046	60 %	20 %	0 %	20 %	525657271
1029	NC_021738	CCAAG	2	10	1770274	1770283	40 %	0 %	20 %	40 %	525657273
1030	NC_021738	GTTGA	2	10	1770409	1770418	20 %	40 %	40 %	0 %	525657273
1031	NC_021738	CGGCA	2	10	1771452	1771461	20 %	0 %	40 %	40 %	525657274
1032	NC_021738	TATCG	2	10	1776595	1776604	20 %	40 %	20 %	20 %	525657277
1033	NC_021738	AAATT	2	10	1777075	1777084	60 %	40 %	0 %	0 %	525657277
1034	NC_021738	GCCAA	2	10	1779059	1779068	40 %	0 %	20 %	40 %	525657281
1035	NC_021738	TATTT	2	10	1780865	1780874	20 %	80 %	0 %	0 %	525657283
1036	NC_021738	TGCAT	2	10	1781655	1781664	20 %	40 %	20 %	20 %	525657283
1037	NC_021738	GGAAA	2	10	1786247	1786256	60 %	0 %	40 %	0 %	525657288
1038	NC_021738	CATTT	2	10	1787388	1787397	20 %	60 %	0 %	20 %	525657289
1039	NC_021738	AGAAT	2	10	1787678	1787687	60 %	20 %	20 %	0 %	525657289
1040	NC_021738	ATTAC	2	10	1789520	1789529	40 %	40 %	0 %	20 %	525657290
1041	NC_021738	TAAGT	2	10	1794462	1794471	40 %	40 %	20 %	0 %	525657294
1042	NC_021738	TAACT	2	10	1795209	1795218	40 %	40 %	0 %	20 %	525657294
1043	NC_021738	GGTGA	2	10	1795531	1795540	20 %	20 %	60 %	0 %	525657294
1044	NC_021738	CAAAA	2	10	1800570	1800579	80 %	0 %	0 %	20 %	525657300
1045	NC_021738	AGAAA	2	10	1800781	1800790	80 %	0 %	20 %	0 %	525657300
1046	NC_021738	TAACG	2	10	1802438	1802447	40 %	20 %	20 %	20 %	525657301
1047	NC_021738	GCAAC	2	10	1802690	1802699	40 %	0 %	20 %	40 %	525657301
1048	NC_021738	TTCAT	2	10	1803729	1803738	20 %	60 %	0 %	20 %	525657302
1049	NC_021738	CGGCA	2	10	1804397	1804406	20 %	0 %	40 %	40 %	525657303
1050	NC_021738	CCTGC	2	10	1804495	1804504	0 %	20 %	20 %	60 %	525657303
1051	NC_021738	TTAAC	2	10	1805861	1805870	40 %	40 %	0 %	20 %	525657304
1052	NC_021738	ATGAA	2	10	1806776	1806785	60 %	20 %	20 %	0 %	525657304
1053	NC_021738	CGGTT	2	10	1808847	1808856	0 %	40 %	40 %	20 %	525657306
1054	NC_021738	GGTTT	2	10	1811946	1811955	0 %	60 %	40 %	0 %	525657310
1055	NC_021738	CTTTA	2	10	1813193	1813202	20 %	60 %	0 %	20 %	525657311
1056	NC_021738	GCTTG	2	10	1813311	1813320	0 %	40 %	40 %	20 %	525657311
1057	NC_021738	GTAGT	2	10	1814089	1814098	20 %	40 %	40 %	0 %	525657312
1058	NC_021738	GGAAT	2	10	1814739	1814748	40 %	20 %	40 %	0 %	525657312
1059	NC_021738	TGATG	2	10	1816353	1816362	20 %	40 %	40 %	0 %	525657313
1060	NC_021738	GGTGG	2	10	1817603	1817612	0 %	20 %	80 %	0 %	525657316
1061	NC_021738	CTTTT	2	10	1820180	1820189	0 %	80 %	0 %	20 %	525657319
1062	NC_021738	CGTTT	2	10	1822677	1822686	0 %	60 %	20 %	20 %	525657321
1063	NC_021738	GTATT	2	10	1823136	1823145	20 %	60 %	20 %	0 %	525657321
1064	NC_021738	TCGTT	2	10	1824418	1824427	0 %	60 %	20 %	20 %	525657322
1065	NC_021738	ATTGC	2	10	1824863	1824872	20 %	40 %	20 %	20 %	525657323
1066	NC_021738	TTGGT	2	10	1824994	1825003	0 %	60 %	40 %	0 %	525657323
1067	NC_021738	TGCAT	2	10	1825186	1825195	20 %	40 %	20 %	20 %	525657323
1068	NC_021738	TTTGG	2	10	1825940	1825949	0 %	60 %	40 %	0 %	525657324
1069	NC_021738	ACGGC	2	10	1828453	1828462	20 %	0 %	40 %	40 %	525657327
1070	NC_021738	TCGGC	2	10	1830045	1830054	0 %	20 %	40 %	40 %	525657328
1071	NC_021738	TAAAT	2	10	1831738	1831747	60 %	40 %	0 %	0 %	525657329
1072	NC_021738	TTGAT	2	10	1832611	1832620	20 %	60 %	20 %	0 %	525657330
1073	NC_021738	CAAAA	2	10	1834592	1834601	80 %	0 %	0 %	20 %	525657332
1074	NC_021738	TAAAT	2	10	1835007	1835016	60 %	40 %	0 %	0 %	525657332
1075	NC_021738	GCAAT	2	10	1836394	1836403	40 %	20 %	20 %	20 %	525657333
1076	NC_021738	ATGAG	2	10	1836820	1836829	40 %	20 %	40 %	0 %	525657334
1077	NC_021738	GCAAA	2	10	1837651	1837660	60 %	0 %	20 %	20 %	525657334
1078	NC_021738	AAGAT	2	10	1838193	1838202	60 %	20 %	20 %	0 %	525657335
1079	NC_021738	ACCTT	2	10	1838362	1838371	20 %	40 %	0 %	40 %	525657335
1080	NC_021738	ATTTT	2	10	1841251	1841260	20 %	80 %	0 %	0 %	525657338
1081	NC_021738	CAAAG	2	10	1844457	1844466	60 %	0 %	20 %	20 %	525657340
1082	NC_021738	ATTAT	2	10	1844695	1844704	40 %	60 %	0 %	0 %	525657341
1083	NC_021738	TGAAA	2	10	1845083	1845092	60 %	20 %	20 %	0 %	525657341
1084	NC_021738	CAACG	2	10	1846360	1846369	40 %	0 %	20 %	40 %	525657343
1085	NC_021738	GCTAT	2	10	1846505	1846514	20 %	40 %	20 %	20 %	525657344
1086	NC_021738	TAAAT	2	10	1850704	1850713	60 %	40 %	0 %	0 %	525657349
1087	NC_021738	CGTTT	2	10	1852073	1852082	0 %	60 %	20 %	20 %	525657350
1088	NC_021738	AAAGG	2	10	1853367	1853376	60 %	0 %	40 %	0 %	525657352
1089	NC_021738	CTATT	2	10	1853452	1853461	20 %	60 %	0 %	20 %	525657352
1090	NC_021738	TTTCT	2	10	1853462	1853471	0 %	80 %	0 %	20 %	525657352
1091	NC_021738	AAAAT	2	10	1853787	1853796	80 %	20 %	0 %	0 %	525657353
1092	NC_021738	ATTTT	2	10	1853821	1853830	20 %	80 %	0 %	0 %	525657353
1093	NC_021738	AAGCG	2	10	1858224	1858233	40 %	0 %	40 %	20 %	525657357
1094	NC_021738	GCAGT	2	10	1863144	1863153	20 %	20 %	40 %	20 %	525657362
1095	NC_021738	CCATT	2	10	1867388	1867397	20 %	40 %	0 %	40 %	525657366
1096	NC_021738	TCGAC	2	10	1869314	1869323	20 %	20 %	20 %	40 %	525657368
1097	NC_021738	ATATT	2	10	1872099	1872108	40 %	60 %	0 %	0 %	525657373
1098	NC_021738	CCTTC	2	10	1872382	1872391	0 %	40 %	0 %	60 %	525657373
1099	NC_021738	ATTGC	2	10	1872517	1872526	20 %	40 %	20 %	20 %	525657373
1100	NC_021738	GACCA	2	10	1872880	1872889	40 %	0 %	20 %	40 %	525657373
1101	NC_021738	AAATC	2	10	1875957	1875966	60 %	20 %	0 %	20 %	525657375
1102	NC_021738	AAGTG	2	10	1876486	1876495	40 %	20 %	40 %	0 %	525657375
1103	NC_021738	GCCGA	2	10	1878665	1878674	20 %	0 %	40 %	40 %	525657376
1104	NC_021738	AAGCG	2	10	1879420	1879429	40 %	0 %	40 %	20 %	525657377
1105	NC_021738	ACGAT	2	10	1879645	1879654	40 %	20 %	20 %	20 %	525657377
1106	NC_021738	CGGCA	2	10	1881143	1881152	20 %	0 %	40 %	40 %	525657378
1107	NC_021738	AAAGG	2	10	1882004	1882013	60 %	0 %	40 %	0 %	525657379
1108	NC_021738	GCCCA	2	10	1882460	1882469	20 %	0 %	20 %	60 %	525657379
1109	NC_021738	GCTTT	2	10	1882485	1882494	0 %	60 %	20 %	20 %	525657379
1110	NC_021738	TTGGA	2	10	1883606	1883615	20 %	40 %	40 %	0 %	525657380
1111	NC_021738	CGGCA	2	10	1883976	1883985	20 %	0 %	40 %	40 %	525657381
1112	NC_021738	CAGAC	2	10	1884398	1884407	40 %	0 %	20 %	40 %	525657381
1113	NC_021738	TAAAT	2	10	1884435	1884444	60 %	40 %	0 %	0 %	525657381
1114	NC_021738	TAAAT	2	10	1885722	1885731	60 %	40 %	0 %	0 %	525657382
1115	NC_021738	ATTTT	2	10	1886473	1886482	20 %	80 %	0 %	0 %	525657382
1116	NC_021738	GCACC	2	10	1887046	1887055	20 %	0 %	20 %	60 %	525657383
1117	NC_021738	CAGTG	2	10	1887542	1887551	20 %	20 %	40 %	20 %	525657383
1118	NC_021738	TTAAT	2	10	1887943	1887952	40 %	60 %	0 %	0 %	525657383
1119	NC_021738	AAATT	2	10	1889500	1889509	60 %	40 %	0 %	0 %	525657386
1120	NC_021738	ACTTA	2	10	1891094	1891103	40 %	40 %	0 %	20 %	525657387
1121	NC_021738	TTGGT	2	10	1892133	1892142	0 %	60 %	40 %	0 %	525657388
1122	NC_021738	TTGCA	2	10	1893059	1893068	20 %	40 %	20 %	20 %	525657388
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1124	NC_021738	ATTTA	2	10	1896925	1896934	40 %	60 %	0 %	0 %	525657392
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