MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 1504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021738	CTCTC	2	10	834051	834060	0 %	40 %	0 %	60 %	525656423
502	NC_021738	TACTC	2	10	835089	835098	20 %	40 %	0 %	40 %	525656424
503	NC_021738	CGGCT	2	10	835998	836007	0 %	20 %	40 %	40 %	525656425
504	NC_021738	ATCGG	2	10	836466	836475	20 %	20 %	40 %	20 %	525656425
505	NC_021738	AATCA	2	10	837320	837329	60 %	20 %	0 %	20 %	525656425
506	NC_021738	AGCAA	2	10	837531	837540	60 %	0 %	20 %	20 %	525656425
507	NC_021738	GTTTA	2	10	839702	839711	20 %	60 %	20 %	0 %	525656427
508	NC_021738	AAGTG	2	10	840590	840599	40 %	20 %	40 %	0 %	525656428
509	NC_021738	TGTTT	2	10	842827	842836	0 %	80 %	20 %	0 %	525656430
510	NC_021738	GAAAA	2	10	843336	843345	80 %	0 %	20 %	0 %	525656431
511	NC_021738	AATTG	2	10	844289	844298	40 %	40 %	20 %	0 %	525656431
512	NC_021738	TTATT	2	10	848207	848216	20 %	80 %	0 %	0 %	525656434
513	NC_021738	TAGTT	2	10	849265	849274	20 %	60 %	20 %	0 %	525656435
514	NC_021738	ATGAA	2	10	850148	850157	60 %	20 %	20 %	0 %	525656436
515	NC_021738	CAATT	2	10	853841	853850	40 %	40 %	0 %	20 %	525656437
516	NC_021738	CTCTT	2	10	855637	855646	0 %	60 %	0 %	40 %	525656439
517	NC_021738	ACTCA	2	10	856307	856316	40 %	20 %	0 %	40 %	525656441
518	NC_021738	GTAAT	2	10	858335	858344	40 %	40 %	20 %	0 %	525655653
519	NC_021738	TTACC	2	10	858719	858728	20 %	40 %	0 %	40 %	525655653
520	NC_021738	TTGTA	2	10	860495	860504	20 %	60 %	20 %	0 %	525655653
521	NC_021738	CTCAA	2	10	863311	863320	40 %	20 %	0 %	40 %	525655653
522	NC_021738	TCGGG	2	10	864582	864591	0 %	20 %	60 %	20 %	525655653
523	NC_021738	GCATT	2	10	867524	867533	20 %	40 %	20 %	20 %	525655656
524	NC_021738	ATTGC	2	10	868797	868806	20 %	40 %	20 %	20 %	525656445
525	NC_021738	GCGGT	2	10	871959	871968	0 %	20 %	60 %	20 %	525656447
526	NC_021738	CGATT	2	10	873869	873878	20 %	40 %	20 %	20 %	525656451
527	NC_021738	CCGTG	2	10	874290	874299	0 %	20 %	40 %	40 %	525656452
528	NC_021738	GCACC	2	10	874570	874579	20 %	0 %	20 %	60 %	525656453
529	NC_021738	ATCAC	2	10	874698	874707	40 %	20 %	0 %	40 %	525656453
530	NC_021738	CCACG	2	10	875938	875947	20 %	0 %	20 %	60 %	525655657
531	NC_021738	CATTG	2	10	875984	875993	20 %	40 %	20 %	20 %	525655657
532	NC_021738	CATCG	2	10	876275	876284	20 %	20 %	20 %	40 %	525655657
533	NC_021738	GATTT	2	10	878165	878174	20 %	60 %	20 %	0 %	525656455
534	NC_021738	TTTTC	2	10	878369	878378	0 %	80 %	0 %	20 %	525656455
535	NC_021738	CCACA	2	10	884165	884174	40 %	0 %	0 %	60 %	525655662
536	NC_021738	TTTTG	2	10	884202	884211	0 %	80 %	20 %	0 %	525655662
537	NC_021738	ACCGC	2	10	886311	886320	20 %	0 %	20 %	60 %	525656463
538	NC_021738	CCACT	2	10	889387	889396	20 %	20 %	0 %	60 %	525656466
539	NC_021738	TTCTG	2	10	890236	890245	0 %	60 %	20 %	20 %	525655665
540	NC_021738	TAGAT	2	10	892563	892572	40 %	40 %	20 %	0 %	525656472
541	NC_021738	AAATG	2	10	893286	893295	60 %	20 %	20 %	0 %	525655666
542	NC_021738	AACCG	2	10	896326	896335	40 %	0 %	20 %	40 %	525655667
543	NC_021738	GGTAA	2	10	896575	896584	40 %	20 %	40 %	0 %	525655668
544	NC_021738	CGCCA	2	10	896700	896709	20 %	0 %	20 %	60 %	525655668
545	NC_021738	CAACG	2	10	897046	897055	40 %	0 %	20 %	40 %	525655669
546	NC_021738	GCAAA	2	10	899270	899279	60 %	0 %	20 %	20 %	525656484
547	NC_021738	AAAAG	2	10	900666	900675	80 %	0 %	20 %	0 %	525656485
548	NC_021738	AGCAC	2	10	901104	901113	40 %	0 %	20 %	40 %	525655671
549	NC_021738	CCTGC	2	10	905170	905179	0 %	20 %	20 %	60 %	525656489
550	NC_021738	GACGA	2	10	906349	906358	40 %	0 %	40 %	20 %	525656490
551	NC_021738	TTGGG	2	10	906542	906551	0 %	40 %	60 %	0 %	525656490
552	NC_021738	TTAAT	2	10	909042	909051	40 %	60 %	0 %	0 %	525656491
553	NC_021738	CCCTT	2	10	909396	909405	0 %	40 %	0 %	60 %	525656492
554	NC_021738	TGCAT	2	10	909584	909593	20 %	40 %	20 %	20 %	525656492
555	NC_021738	TGCTT	2	10	910616	910625	0 %	60 %	20 %	20 %	525656492
556	NC_021738	GGTAT	2	10	911825	911834	20 %	40 %	40 %	0 %	525656493
557	NC_021738	GTTAT	2	10	912467	912476	20 %	60 %	20 %	0 %	525656493
558	NC_021738	ATTCA	2	10	914023	914032	40 %	40 %	0 %	20 %	525656495
559	NC_021738	TATCT	2	10	915643	915652	20 %	60 %	0 %	20 %	525656497
560	NC_021738	TGGCG	2	10	917301	917310	0 %	20 %	60 %	20 %	525656498
561	NC_021738	AAAAT	2	10	917317	917326	80 %	20 %	0 %	0 %	525656498
562	NC_021738	CCCAA	2	10	918299	918308	40 %	0 %	0 %	60 %	525656498
563	NC_021738	CCATA	2	10	918969	918978	40 %	20 %	0 %	40 %	525656499
564	NC_021738	GGGCT	2	10	919394	919403	0 %	20 %	60 %	20 %	525656499
565	NC_021738	GAAAC	2	10	919750	919759	60 %	0 %	20 %	20 %	525656499
566	NC_021738	CTTGC	2	10	922309	922318	0 %	40 %	20 %	40 %	525656502
567	NC_021738	TGAAC	2	10	925425	925434	40 %	20 %	20 %	20 %	525656505
568	NC_021738	CCGCA	2	10	926796	926805	20 %	0 %	20 %	60 %	525656506
569	NC_021738	CAGAT	2	10	926865	926874	40 %	20 %	20 %	20 %	525656506
570	NC_021738	AGCAA	2	10	930409	930418	60 %	0 %	20 %	20 %	525656509
571	NC_021738	AAAGC	2	10	933277	933286	60 %	0 %	20 %	20 %	525656511
572	NC_021738	AACCA	2	10	933474	933483	60 %	0 %	0 %	40 %	525656512
573	NC_021738	TTTAA	2	10	935325	935334	40 %	60 %	0 %	0 %	525656515
574	NC_021738	TTGCA	2	10	940514	940523	20 %	40 %	20 %	20 %	525656519
575	NC_021738	AAGCA	2	10	944228	944237	60 %	0 %	20 %	20 %	525656525
576	NC_021738	ATAAA	2	10	944438	944447	80 %	20 %	0 %	0 %	525656526
577	NC_021738	GCCGG	2	10	944816	944825	0 %	0 %	60 %	40 %	525656526
578	NC_021738	TTTGC	2	10	945719	945728	0 %	60 %	20 %	20 %	525656527
579	NC_021738	ACGCA	2	10	945813	945822	40 %	0 %	20 %	40 %	525656527
580	NC_021738	GGAAT	2	10	949835	949844	40 %	20 %	40 %	0 %	525656532
581	NC_021738	CGATT	2	10	950146	950155	20 %	40 %	20 %	20 %	525656533
582	NC_021738	ATTAC	2	10	952177	952186	40 %	40 %	0 %	20 %	525656533
583	NC_021738	TTTAT	2	10	953826	953835	20 %	80 %	0 %	0 %	525656535
584	NC_021738	GGTAC	2	10	954252	954261	20 %	20 %	40 %	20 %	525656535
585	NC_021738	AAATT	2	10	954343	954352	60 %	40 %	0 %	0 %	525656535
586	NC_021738	TTGGT	2	10	954574	954583	0 %	60 %	40 %	0 %	525656535
587	NC_021738	TTTAG	2	10	956976	956985	20 %	60 %	20 %	0 %	525656537
588	NC_021738	TCTGC	2	10	958678	958687	0 %	40 %	20 %	40 %	525656539
589	NC_021738	TCGGA	2	10	960451	960460	20 %	20 %	40 %	20 %	525656540
590	NC_021738	CCACC	2	10	964663	964672	20 %	0 %	0 %	80 %	525656543
591	NC_021738	GGTGG	2	10	965647	965656	0 %	20 %	80 %	0 %	525656545
592	NC_021738	TGCTT	2	10	968782	968791	0 %	60 %	20 %	20 %	525656550
593	NC_021738	ACGAA	2	10	970944	970953	60 %	0 %	20 %	20 %	525656553
594	NC_021738	AAAAT	2	10	971129	971138	80 %	20 %	0 %	0 %	525656553
595	NC_021738	GTTTT	2	10	975383	975392	0 %	80 %	20 %	0 %	525656558
596	NC_021738	CCACG	2	10	977520	977529	20 %	0 %	20 %	60 %	525656560
597	NC_021738	AACCG	2	10	979598	979607	40 %	0 %	20 %	40 %	525656561
598	NC_021738	ATATT	2	10	980474	980483	40 %	60 %	0 %	0 %	525656562
599	NC_021738	TTTAC	2	10	981955	981964	20 %	60 %	0 %	20 %	525656564
600	NC_021738	GCCGA	2	10	984957	984966	20 %	0 %	40 %	40 %	525656567
601	NC_021738	GCACA	2	10	985218	985227	40 %	0 %	20 %	40 %	525656567
602	NC_021738	AGCTC	2	10	986378	986387	20 %	20 %	20 %	40 %	525656570
603	NC_021738	TACGC	2	10	987926	987935	20 %	20 %	20 %	40 %	525656572
604	NC_021738	GCCAA	2	10	992487	992496	40 %	0 %	20 %	40 %	525656575
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606	NC_021738	AGATC	2	10	994708	994717	40 %	20 %	20 %	20 %	525655675
607	NC_021738	TATTT	2	10	996122	996131	20 %	80 %	0 %	0 %	525656578
608	NC_021738	GAAAT	2	10	997810	997819	60 %	20 %	20 %	0 %	525656579
609	NC_021738	TTTTG	2	10	1002536	1002545	0 %	80 %	20 %	0 %	525656584
610	NC_021738	GCCGA	2	10	1004819	1004828	20 %	0 %	40 %	40 %	525656586
611	NC_021738	AACCA	2	10	1004930	1004939	60 %	0 %	0 %	40 %	525656586
612	NC_021738	CAGCT	2	10	1006168	1006177	20 %	20 %	20 %	40 %	525656587
613	NC_021738	AAGCA	2	10	1009320	1009329	60 %	0 %	20 %	20 %	525656591
614	NC_021738	GTTGC	2	10	1009696	1009705	0 %	40 %	40 %	20 %	525656591
615	NC_021738	CGATT	2	10	1015217	1015226	20 %	40 %	20 %	20 %	525656595
616	NC_021738	TTTTA	2	10	1017604	1017613	20 %	80 %	0 %	0 %	525656597
617	NC_021738	CGCCT	2	10	1018849	1018858	0 %	20 %	20 %	60 %	525656598
618	NC_021738	TTAAA	2	10	1026083	1026092	60 %	40 %	0 %	0 %	525656606
619	NC_021738	GAAAA	2	10	1026502	1026511	80 %	0 %	20 %	0 %	525656606
620	NC_021738	ATGTT	2	10	1027067	1027076	20 %	60 %	20 %	0 %	525656606
621	NC_021738	AAATT	2	10	1028102	1028111	60 %	40 %	0 %	0 %	525656606
622	NC_021738	AAGCT	2	10	1030382	1030391	40 %	20 %	20 %	20 %	525656608
623	NC_021738	TTTAT	2	10	1032029	1032038	20 %	80 %	0 %	0 %	525656609
624	NC_021738	AAAAC	2	10	1032673	1032682	80 %	0 %	0 %	20 %	525656610
625	NC_021738	CGATT	2	10	1033223	1033232	20 %	40 %	20 %	20 %	525656610
626	NC_021738	ATTTT	2	10	1034125	1034134	20 %	80 %	0 %	0 %	525656611
627	NC_021738	GTCCG	2	10	1035563	1035572	0 %	20 %	40 %	40 %	525656612
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