MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 2319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021081	GGGTC	2	10	2661700	2661709	0 %	20 %	60 %	20 %	482884278
2002	NC_021081	CTGAT	2	10	2663343	2663352	20 %	40 %	20 %	20 %	482884279
2003	NC_021081	CTGGG	2	10	2663999	2664008	0 %	20 %	60 %	20 %	482884280
2004	NC_021081	CAGCG	2	10	2665957	2665966	20 %	0 %	40 %	40 %	482884282
2005	NC_021081	GTGGG	2	10	2666645	2666654	0 %	20 %	80 %	0 %	482884284
2006	NC_021081	TCCCC	2	10	2666823	2666832	0 %	20 %	0 %	80 %	482884284
2007	NC_021081	TCGGA	2	10	2667606	2667615	20 %	20 %	40 %	20 %	482884285
2008	NC_021081	AGACC	2	10	2667749	2667758	40 %	0 %	20 %	40 %	482884285
2009	NC_021081	CGGGC	2	10	2667910	2667919	0 %	0 %	60 %	40 %	482884285
2010	NC_021081	CGGGC	2	10	2669292	2669301	0 %	0 %	60 %	40 %	482884286
2011	NC_021081	CTGGA	2	10	2669383	2669392	20 %	20 %	40 %	20 %	482884286
2012	NC_021081	CAGCT	2	10	2670922	2670931	20 %	20 %	20 %	40 %	482884286
2013	NC_021081	TGGGC	2	10	2671418	2671427	0 %	20 %	60 %	20 %	482884286
2014	NC_021081	GCCCG	2	10	2671448	2671457	0 %	0 %	40 %	60 %	482884286
2015	NC_021081	ACCCA	2	10	2671942	2671951	40 %	0 %	0 %	60 %	482884286
2016	NC_021081	GGAAG	2	10	2672610	2672619	40 %	0 %	60 %	0 %	482884287
2017	NC_021081	GCCCA	2	10	2672965	2672974	20 %	0 %	20 %	60 %	482884287
2018	NC_021081	CCCAG	2	10	2673512	2673521	20 %	0 %	20 %	60 %	482884289
2019	NC_021081	CCCAG	2	10	2674334	2674343	20 %	0 %	20 %	60 %	482884289
2020	NC_021081	CCTGG	2	10	2676029	2676038	0 %	20 %	40 %	40 %	482884290
2021	NC_021081	GCACC	2	10	2677829	2677838	20 %	0 %	20 %	60 %	482884291
2022	NC_021081	GCCAG	2	10	2678054	2678063	20 %	0 %	40 %	40 %	482884291
2023	NC_021081	GCCCT	2	10	2681927	2681936	0 %	20 %	20 %	60 %	482884294
2024	NC_021081	CATTC	2	10	2682116	2682125	20 %	40 %	0 %	40 %	482884294
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2029	NC_021081	GCCTG	2	10	2689399	2689408	0 %	20 %	40 %	40 %	482884302
2030	NC_021081	AGACC	2	10	2693430	2693439	40 %	0 %	20 %	40 %	482884306
2031	NC_021081	TCTCC	2	10	2694660	2694669	0 %	40 %	0 %	60 %	482884308
2032	NC_021081	AGTGC	2	10	2698267	2698276	20 %	20 %	40 %	20 %	482884313
2033	NC_021081	GCGGG	2	10	2700490	2700499	0 %	0 %	80 %	20 %	482884314
2034	NC_021081	GGGCC	2	10	2700791	2700800	0 %	0 %	60 %	40 %	482884314
2035	NC_021081	GCCGG	2	10	2704310	2704319	0 %	0 %	60 %	40 %	482884316
2036	NC_021081	GCTGC	2	10	2711519	2711528	0 %	20 %	40 %	40 %	482884326
2037	NC_021081	GGGTC	2	10	2717604	2717613	0 %	20 %	60 %	20 %	482884332
2038	NC_021081	CTTTT	2	10	2717850	2717859	0 %	80 %	0 %	20 %	482884333
2039	NC_021081	CCCGG	2	10	2720302	2720311	0 %	0 %	40 %	60 %	482884336
2040	NC_021081	TAGGG	2	10	2724308	2724317	20 %	20 %	60 %	0 %	482884342
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2042	NC_021081	CCAGG	2	10	2725614	2725623	20 %	0 %	40 %	40 %	482884344
2043	NC_021081	GGCGT	2	10	2726952	2726961	0 %	20 %	60 %	20 %	482884346
2044	NC_021081	ACCCC	2	10	2728838	2728847	20 %	0 %	0 %	80 %	482884348
2045	NC_021081	ACCGC	2	10	2728981	2728990	20 %	0 %	20 %	60 %	482884348
2046	NC_021081	CCGGC	2	10	2729143	2729152	0 %	0 %	40 %	60 %	482884348
2047	NC_021081	CCGGC	2	10	2729229	2729238	0 %	0 %	40 %	60 %	482884348
2048	NC_021081	TGCGG	2	10	2729870	2729879	0 %	20 %	60 %	20 %	482884349
2049	NC_021081	CCTTT	2	10	2731183	2731192	0 %	60 %	0 %	40 %	482884351
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.