MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 2319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021081	ATGGC	2	10	1334783	1334792	20 %	20 %	40 %	20 %	482882919
1002	NC_021081	CGGGT	2	10	1335736	1335745	0 %	20 %	60 %	20 %	482882919
1003	NC_021081	CCGAA	2	10	1337909	1337918	40 %	0 %	20 %	40 %	482882921
1004	NC_021081	GAAGT	2	10	1339178	1339187	40 %	20 %	40 %	0 %	482882923
1005	NC_021081	AGGGC	2	10	1340869	1340878	20 %	0 %	60 %	20 %	482882925
1006	NC_021081	GGCCC	2	10	1341113	1341122	0 %	0 %	40 %	60 %	482882925
1007	NC_021081	TGGCC	2	10	1344214	1344223	0 %	20 %	40 %	40 %	482882928
1008	NC_021081	TGGTC	2	10	1344241	1344250	0 %	40 %	40 %	20 %	482882928
1009	NC_021081	TCCAG	2	10	1345269	1345278	20 %	20 %	20 %	40 %	482882929
1010	NC_021081	GGCCC	2	10	1345722	1345731	0 %	0 %	40 %	60 %	482882929
1011	NC_021081	GCAGC	2	10	1352992	1353001	20 %	0 %	40 %	40 %	482882934
1012	NC_021081	CGCTG	2	10	1355523	1355532	0 %	20 %	40 %	40 %	482882937
1013	NC_021081	ACCCC	2	10	1356269	1356278	20 %	0 %	0 %	80 %	482882938
1014	NC_021081	GCGCT	2	10	1357101	1357110	0 %	20 %	40 %	40 %	482882939
1015	NC_021081	CACCC	2	10	1360689	1360698	20 %	0 %	0 %	80 %	482882942
1016	NC_021081	GCCCA	2	10	1361869	1361878	20 %	0 %	20 %	60 %	482882944
1017	NC_021081	AGCGA	2	10	1362073	1362082	40 %	0 %	40 %	20 %	482882944
1018	NC_021081	TGGCC	2	10	1363228	1363237	0 %	20 %	40 %	40 %	482882945
1019	NC_021081	GCCGG	2	10	1363471	1363480	0 %	0 %	60 %	40 %	482882946
1020	NC_021081	AGCCC	2	10	1363610	1363619	20 %	0 %	20 %	60 %	482882946
1021	NC_021081	GTCGC	2	10	1363818	1363827	0 %	20 %	40 %	40 %	482882946
1022	NC_021081	GCGCC	2	10	1364972	1364981	0 %	0 %	40 %	60 %	482882947
1023	NC_021081	CGGCC	2	10	1365122	1365131	0 %	0 %	40 %	60 %	482882947
1024	NC_021081	GCACC	2	10	1366252	1366261	20 %	0 %	20 %	60 %	482882948
1025	NC_021081	GCCCG	2	10	1366671	1366680	0 %	0 %	40 %	60 %	482882948
1026	NC_021081	AGCGG	2	10	1368185	1368194	20 %	0 %	60 %	20 %	482882949
1027	NC_021081	CCTGG	2	10	1368275	1368284	0 %	20 %	40 %	40 %	482882949
1028	NC_021081	GGGCC	2	10	1368607	1368616	0 %	0 %	60 %	40 %	482882950
1029	NC_021081	ACCGC	2	10	1373451	1373460	20 %	0 %	20 %	60 %	482882955
1030	NC_021081	CCGCA	2	10	1374960	1374969	20 %	0 %	20 %	60 %	482882957
1031	NC_021081	GGGTA	2	10	1375594	1375603	20 %	20 %	60 %	0 %	482882957
1032	NC_021081	GGCCG	2	10	1375911	1375920	0 %	0 %	60 %	40 %	482882957
1033	NC_021081	GCTTG	2	10	1378478	1378487	0 %	40 %	40 %	20 %	482882959
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1035	NC_021081	AGGGC	2	10	1379582	1379591	20 %	0 %	60 %	20 %	482882961
1036	NC_021081	AGGGA	2	10	1381280	1381289	40 %	0 %	60 %	0 %	482882965
1037	NC_021081	GGTGC	2	10	1383648	1383657	0 %	20 %	60 %	20 %	482882970
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1039	NC_021081	CTGGC	2	10	1388016	1388025	0 %	20 %	40 %	40 %	482882978
1040	NC_021081	GCGTA	2	10	1388219	1388228	20 %	20 %	40 %	20 %	482882979
1041	NC_021081	CAGGC	2	10	1388827	1388836	20 %	0 %	40 %	40 %	482882980
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1043	NC_021081	CCCGG	2	10	1391383	1391392	0 %	0 %	40 %	60 %	482882986
1044	NC_021081	GCCCT	2	10	1394810	1394819	0 %	20 %	20 %	60 %	482882989
1045	NC_021081	CCTCC	2	10	1397024	1397033	0 %	20 %	0 %	80 %	482882992
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1047	NC_021081	CGCCA	2	10	1397151	1397160	20 %	0 %	20 %	60 %	482882992
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1051	NC_021081	TGCAG	2	10	1401519	1401528	20 %	20 %	40 %	20 %	482883000
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1054	NC_021081	GCCCC	2	10	1403721	1403730	0 %	0 %	20 %	80 %	482883003
1055	NC_021081	GGCCA	2	10	1404064	1404073	20 %	0 %	40 %	40 %	482883004
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1060	NC_021081	CCGCC	2	10	1409411	1409420	0 %	0 %	20 %	80 %	482883008
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1065	NC_021081	CCGCC	2	10	1413210	1413219	0 %	0 %	20 %	80 %	482883013
1066	NC_021081	GTGGC	2	10	1415571	1415580	0 %	20 %	60 %	20 %	482883017
1067	NC_021081	GGTCA	2	10	1417904	1417913	20 %	20 %	40 %	20 %	482883020
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1070	NC_021081	TGGCC	2	10	1422729	1422738	0 %	20 %	40 %	40 %	482883024
1071	NC_021081	GGGGT	2	10	1422862	1422871	0 %	20 %	80 %	0 %	482883024
1072	NC_021081	GGCCG	2	10	1424280	1424289	0 %	0 %	60 %	40 %	482883027
1073	NC_021081	CCCAG	2	10	1424390	1424399	20 %	0 %	20 %	60 %	482883027
1074	NC_021081	CCGGG	2	10	1427376	1427385	0 %	0 %	60 %	40 %	482883031
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1079	NC_021081	CCCGC	2	10	1432416	1432425	0 %	0 %	20 %	80 %	482883036
1080	NC_021081	CCTGG	2	10	1432845	1432854	0 %	20 %	40 %	40 %	482883036
1081	NC_021081	GGGCG	2	10	1432899	1432908	0 %	0 %	80 %	20 %	482883036
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1089	NC_021081	CCGCA	2	10	1447910	1447919	20 %	0 %	20 %	60 %	482883053
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1095	NC_021081	CTAAC	2	10	1455938	1455947	40 %	20 %	0 %	40 %	482883062
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1097	NC_021081	CAAGG	2	10	1461672	1461681	40 %	0 %	40 %	20 %	482883067
1098	NC_021081	ATCGC	2	10	1462335	1462344	20 %	20 %	20 %	40 %	482883067
1099	NC_021081	GCGGG	2	10	1462376	1462385	0 %	0 %	80 %	20 %	482883067
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1105	NC_021081	GGGGT	2	10	1465692	1465701	0 %	20 %	80 %	0 %	482883070
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1109	NC_021081	CGGGG	2	10	1469615	1469624	0 %	0 %	80 %	20 %	482883074
1110	NC_021081	GCCCC	2	10	1469702	1469711	0 %	0 %	20 %	80 %	482883074
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1125	NC_021081	TGGGG	2	10	1488236	1488245	0 %	20 %	80 %	0 %	482883095
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1127	NC_021081	ACCCC	2	10	1489659	1489668	20 %	0 %	0 %	80 %	482883096
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1498	NC_021081	GGCCC	2	10	1975054	1975063	0 %	0 %	40 %	60 %	482883586
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