MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 2319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021081	GGGCC	2	10	642375	642384	0 %	0 %	60 %	40 %	482882286
502	NC_021081	GATGG	2	10	643337	643346	20 %	20 %	60 %	0 %	482882287
503	NC_021081	TGCCG	2	10	644828	644837	0 %	20 %	40 %	40 %	482882288
504	NC_021081	GCCGT	2	10	646262	646271	0 %	20 %	40 %	40 %	482882290
505	NC_021081	GGCCC	2	10	646557	646566	0 %	0 %	40 %	60 %	482882290
506	NC_021081	GCCCG	2	10	648626	648635	0 %	0 %	40 %	60 %	482882293
507	NC_021081	CCGGG	2	10	652382	652391	0 %	0 %	60 %	40 %	482882296
508	NC_021081	CGGGC	2	10	652599	652608	0 %	0 %	60 %	40 %	482882296
509	NC_021081	CCAGG	2	10	654708	654717	20 %	0 %	40 %	40 %	482882298
510	NC_021081	TGTCC	2	10	656585	656594	0 %	40 %	20 %	40 %	482882298
511	NC_021081	GGCCA	2	10	658238	658247	20 %	0 %	40 %	40 %	482882299
512	NC_021081	AGCCC	2	10	658639	658648	20 %	0 %	20 %	60 %	482882299
513	NC_021081	CTCGA	2	10	658809	658818	20 %	20 %	20 %	40 %	482882299
514	NC_021081	GCCCA	2	10	658958	658967	20 %	0 %	20 %	60 %	482882299
515	NC_021081	GCCCA	2	10	659651	659660	20 %	0 %	20 %	60 %	482882299
516	NC_021081	AGGCC	2	10	659929	659938	20 %	0 %	40 %	40 %	482882299
517	NC_021081	TGGCC	2	10	660154	660163	0 %	20 %	40 %	40 %	482882299
518	NC_021081	TGGGC	2	10	660313	660322	0 %	20 %	60 %	20 %	482882299
519	NC_021081	CCCGG	2	10	660928	660937	0 %	0 %	40 %	60 %	482882299
520	NC_021081	CGTAG	2	10	661839	661848	20 %	20 %	40 %	20 %	482882299
521	NC_021081	GGCCC	2	10	662006	662015	0 %	0 %	40 %	60 %	482882299
522	NC_021081	CCCAG	2	10	663088	663097	20 %	0 %	20 %	60 %	482882299
523	NC_021081	CACCC	2	10	663637	663646	20 %	0 %	0 %	80 %	482882300
524	NC_021081	CCAGG	2	10	665833	665842	20 %	0 %	40 %	40 %	482882300
525	NC_021081	AGCGC	2	10	667359	667368	20 %	0 %	40 %	40 %	482882301
526	NC_021081	GATGG	2	10	668700	668709	20 %	20 %	60 %	0 %	482882301
527	NC_021081	ACCTG	2	10	669074	669083	20 %	20 %	20 %	40 %	482882302
528	NC_021081	ACGGT	2	10	669116	669125	20 %	20 %	40 %	20 %	482882302
529	NC_021081	GCCCA	2	10	671610	671619	20 %	0 %	20 %	60 %	482882305
530	NC_021081	GGCCG	2	10	671792	671801	0 %	0 %	60 %	40 %	482882305
531	NC_021081	GTGCG	2	10	672585	672594	0 %	20 %	60 %	20 %	482882306
532	NC_021081	GGCCC	2	10	674930	674939	0 %	0 %	40 %	60 %	482882308
533	NC_021081	CCGGG	2	10	675184	675193	0 %	0 %	60 %	40 %	482882308
534	NC_021081	CCGCA	2	10	678355	678364	20 %	0 %	20 %	60 %	482882312
535	NC_021081	CGGTG	2	10	679694	679703	0 %	20 %	60 %	20 %	482882313
536	NC_021081	CGCAG	2	10	682773	682782	20 %	0 %	40 %	40 %	482882315
537	NC_021081	CCTGG	2	10	683329	683338	0 %	20 %	40 %	40 %	482882316
538	NC_021081	CAGGG	2	10	686686	686695	20 %	0 %	60 %	20 %	482882318
539	NC_021081	GGGGC	2	10	690773	690782	0 %	0 %	80 %	20 %	482882322
540	NC_021081	CTCCA	2	10	692272	692281	20 %	20 %	0 %	60 %	482882323
541	NC_021081	CGGCG	2	10	692475	692484	0 %	0 %	60 %	40 %	482882323
542	NC_021081	GCCCC	2	10	693258	693267	0 %	0 %	20 %	80 %	482882323
543	NC_021081	CCCGG	2	10	694302	694311	0 %	0 %	40 %	60 %	482882324
544	NC_021081	CCCGC	2	10	694318	694327	0 %	0 %	20 %	80 %	482882324
545	NC_021081	CTTCG	2	10	695278	695287	0 %	40 %	20 %	40 %	482882324
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549	NC_021081	GGGTT	2	10	707596	707605	0 %	40 %	60 %	0 %	482882339
550	NC_021081	CAGGG	2	10	707737	707746	20 %	0 %	60 %	20 %	482882339
551	NC_021081	GGGCC	2	10	707910	707919	0 %	0 %	60 %	40 %	482882339
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553	NC_021081	GCCGT	2	10	709297	709306	0 %	20 %	40 %	40 %	482882339
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557	NC_021081	TGCGG	2	10	712875	712884	0 %	20 %	60 %	20 %	482882341
558	NC_021081	CGGTG	2	10	716755	716764	0 %	20 %	60 %	20 %	482882345
559	NC_021081	GGTGG	2	10	717191	717200	0 %	20 %	80 %	0 %	482882345
560	NC_021081	GCCCA	2	10	720573	720582	20 %	0 %	20 %	60 %	482882347
561	NC_021081	CTGCT	2	10	725593	725602	0 %	40 %	20 %	40 %	482882350
562	NC_021081	CCAGC	2	10	727770	727779	20 %	0 %	20 %	60 %	482882351
563	NC_021081	TGGCG	2	10	728495	728504	0 %	20 %	60 %	20 %	482882351
564	NC_021081	TGGGC	2	10	729100	729109	0 %	20 %	60 %	20 %	482882352
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573	NC_021081	CCCGA	2	10	737033	737042	20 %	0 %	20 %	60 %	482882363
574	NC_021081	GCCCA	2	10	737719	737728	20 %	0 %	20 %	60 %	482882364
575	NC_021081	GACCT	2	10	738649	738658	20 %	20 %	20 %	40 %	482882364
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577	NC_021081	AGGGG	2	10	739874	739883	20 %	0 %	80 %	0 %	482882365
578	NC_021081	CGCAG	2	10	740015	740024	20 %	0 %	40 %	40 %	482882365
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587	NC_021081	GCCAG	2	10	750613	750622	20 %	0 %	40 %	40 %	482882379
588	NC_021081	GGGTC	2	10	752575	752584	0 %	20 %	60 %	20 %	482882380
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598	NC_021081	ACCCC	2	10	762123	762132	20 %	0 %	0 %	80 %	482882392
599	NC_021081	TCGGG	2	10	764616	764625	0 %	20 %	60 %	20 %	482882394
600	NC_021081	ACCGC	2	10	768014	768023	20 %	0 %	20 %	60 %	482882399
601	NC_021081	GGCCT	2	10	768671	768680	0 %	20 %	40 %	40 %	482882400
602	NC_021081	GCCGA	2	10	769073	769082	20 %	0 %	40 %	40 %	482882401
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611	NC_021081	CCCCA	2	10	783281	783290	20 %	0 %	0 %	80 %	482882418
612	NC_021081	ACCCC	2	10	784282	784291	20 %	0 %	0 %	80 %	482882419
613	NC_021081	GGCCC	2	10	786058	786067	0 %	0 %	40 %	60 %	482882420
614	NC_021081	GACGG	2	10	786742	786751	20 %	0 %	60 %	20 %	482882420
615	NC_021081	AAAGC	2	10	787387	787396	60 %	0 %	20 %	20 %	482882421
616	NC_021081	ACAGC	2	10	789635	789644	40 %	0 %	20 %	40 %	482882422
617	NC_021081	GGGAG	2	10	793585	793594	20 %	0 %	80 %	0 %	482882424
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624	NC_021081	GGCCG	2	10	802929	802938	0 %	0 %	60 %	40 %	482882432
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626	NC_021081	TGGCT	2	10	805053	805062	0 %	40 %	40 %	20 %	482882435
627	NC_021081	GAGCT	2	10	805611	805620	20 %	20 %	40 %	20 %	482882435
628	NC_021081	TTTGA	2	10	812754	812763	20 %	60 %	20 %	0 %	482882444
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