MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 1600

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 2 34Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020834	GCTTC	2	10	2379101	2379110	0 %	40 %	20 %	40 %	472337610
1502	NC_020834	CGCAC	2	10	2380696	2380705	20 %	0 %	20 %	60 %	472337610
1503	NC_020834	ACCAA	2	10	2380717	2380726	60 %	0 %	0 %	40 %	472337610
1504	NC_020834	TACCG	2	10	2381781	2381790	20 %	20 %	20 %	40 %	472337610
1505	NC_020834	CATCA	2	10	2384693	2384702	40 %	20 %	0 %	40 %	472337616
1506	NC_020834	ATTAA	2	10	2387604	2387613	60 %	40 %	0 %	0 %	472337620
1507	NC_020834	TAATT	2	10	2387867	2387876	40 %	60 %	0 %	0 %	472337620
1508	NC_020834	ATTGA	2	10	2388693	2388702	40 %	40 %	20 %	0 %	472337621
1509	NC_020834	AACCA	2	10	2391056	2391065	60 %	0 %	0 %	40 %	472337622
1510	NC_020834	ATAAG	2	10	2391310	2391319	60 %	20 %	20 %	0 %	472337622
1511	NC_020834	TGCCC	2	10	2392635	2392644	0 %	20 %	20 %	60 %	472337624
1512	NC_020834	AATCA	2	10	2392869	2392878	60 %	20 %	0 %	20 %	472337625
1513	NC_020834	TTTGC	2	10	2393238	2393247	0 %	60 %	20 %	20 %	472337625
1514	NC_020834	GCCGT	2	10	2399274	2399283	0 %	20 %	40 %	40 %	472337634
1515	NC_020834	GCGTG	2	10	2399525	2399534	0 %	20 %	60 %	20 %	472337634
1516	NC_020834	CACGC	2	10	2399871	2399880	20 %	0 %	20 %	60 %	472337634
1517	NC_020834	TCATT	2	10	2401057	2401066	20 %	60 %	0 %	20 %	472337636
1518	NC_020834	CACCG	2	10	2403080	2403089	20 %	0 %	20 %	60 %	472337638
1519	NC_020834	GTGAG	2	10	2403295	2403304	20 %	20 %	60 %	0 %	472337638
1520	NC_020834	AGAGA	2	10	2403658	2403667	60 %	0 %	40 %	0 %	472337638
1521	NC_020834	GTTCG	2	10	2406720	2406729	0 %	40 %	40 %	20 %	472337644
1522	NC_020834	CAATC	2	10	2407553	2407562	40 %	20 %	0 %	40 %	472337645
1523	NC_020834	GCCCA	2	10	2410838	2410847	20 %	0 %	20 %	60 %	472337649
1524	NC_020834	AGTTC	2	10	2415406	2415415	20 %	40 %	20 %	20 %	472337654
1525	NC_020834	CTTTT	2	10	2417775	2417784	0 %	80 %	0 %	20 %	472337657
1526	NC_020834	CGCTC	2	10	2418264	2418273	0 %	20 %	20 %	60 %	472337657
1527	NC_020834	TCCAA	2	10	2419058	2419067	40 %	20 %	0 %	40 %	472337657
1528	NC_020834	TGCCT	2	10	2419380	2419389	0 %	40 %	20 %	40 %	472337657
1529	NC_020834	CAAGC	2	10	2419850	2419859	40 %	0 %	20 %	40 %	472337657
1530	NC_020834	AAATT	2	10	2420323	2420332	60 %	40 %	0 %	0 %	472337657
1531	NC_020834	GATTG	2	10	2420881	2420890	20 %	40 %	40 %	0 %	472337658
1532	NC_020834	TTGGT	2	10	2423830	2423839	0 %	60 %	40 %	0 %	472337661
1533	NC_020834	GGTTT	2	10	2424017	2424026	0 %	60 %	40 %	0 %	472337661
1534	NC_020834	CGGTT	2	10	2424589	2424598	0 %	40 %	40 %	20 %	472337662
1535	NC_020834	AAAAG	2	10	2426049	2426058	80 %	0 %	20 %	0 %	472337663
1536	NC_020834	TCGGC	2	10	2427414	2427423	0 %	20 %	40 %	40 %	472337664
1537	NC_020834	TTAAC	2	10	2430708	2430717	40 %	40 %	0 %	20 %	472337666
1538	NC_020834	CATCG	2	10	2432177	2432186	20 %	20 %	20 %	40 %	472337667
1539	NC_020834	GCGAT	2	10	2437671	2437680	20 %	20 %	40 %	20 %	472337672
1540	NC_020834	ACCGC	2	10	2438233	2438242	20 %	0 %	20 %	60 %	472337672
1541	NC_020834	GTTCG	2	10	2444374	2444383	0 %	40 %	40 %	20 %	472337680
1542	NC_020834	TTTCT	2	10	2444697	2444706	0 %	80 %	0 %	20 %	472337680
1543	NC_020834	ATTTA	2	10	2448067	2448076	40 %	60 %	0 %	0 %	472337684
1544	NC_020834	AGCAA	2	10	2448876	2448885	60 %	0 %	20 %	20 %	472337684
1545	NC_020834	TGTAC	2	10	2449306	2449315	20 %	40 %	20 %	20 %	472337685
1546	NC_020834	TGCGT	2	10	2450384	2450393	0 %	40 %	40 %	20 %	472337688
1547	NC_020834	AATTA	2	10	2451315	2451324	60 %	40 %	0 %	0 %	472337691
1548	NC_020834	GTAAA	2	10	2456247	2456256	60 %	20 %	20 %	0 %	472337697
1549	NC_020834	CCCAA	2	10	2456257	2456266	40 %	0 %	0 %	60 %	472337697
1550	NC_020834	TTTGC	2	10	2457179	2457188	0 %	60 %	20 %	20 %	472337698
1551	NC_020834	ACGGT	2	10	2459875	2459884	20 %	20 %	40 %	20 %	472337700
1552	NC_020834	ATGTT	2	10	2460871	2460880	20 %	60 %	20 %	0 %	472337701
1553	NC_020834	CATAA	2	10	2468649	2468658	60 %	20 %	0 %	20 %	472337704
1554	NC_020834	GTAGC	2	10	2469073	2469082	20 %	20 %	40 %	20 %	472337704
1555	NC_020834	TTCAC	2	10	2470595	2470604	20 %	40 %	0 %	40 %	472337705
1556	NC_020834	TGGGG	2	10	2473169	2473178	0 %	20 %	80 %	0 %	472337707
1557	NC_020834	TGGCT	2	10	2475997	2476006	0 %	40 %	40 %	20 %	472337712
1558	NC_020834	GCCAA	2	10	2477471	2477480	40 %	0 %	20 %	40 %	472337714
1559	NC_020834	TTCCA	2	10	2480597	2480606	20 %	40 %	0 %	40 %	472337718
1560	NC_020834	ATGCA	2	10	2481125	2481134	40 %	20 %	20 %	20 %	472337718
1561	NC_020834	ATGAG	2	10	2482047	2482056	40 %	20 %	40 %	0 %	472337719
1562	NC_020834	CTGAA	2	10	2482845	2482854	40 %	20 %	20 %	20 %	472337720
1563	NC_020834	ATTGG	2	10	2483260	2483269	20 %	40 %	40 %	0 %	472337720
1564	NC_020834	AATGG	2	10	2484724	2484733	40 %	20 %	40 %	0 %	472337721
1565	NC_020834	GGTGT	2	10	2485205	2485214	0 %	40 %	60 %	0 %	472337722
1566	NC_020834	TTAAC	2	10	2486485	2486494	40 %	40 %	0 %	20 %	472337723
1567	NC_020834	TACTT	2	10	2486885	2486894	20 %	60 %	0 %	20 %	472337724
1568	NC_020834	TTATT	2	10	2487076	2487085	20 %	80 %	0 %	0 %	472337724
1569	NC_020834	CGCAA	2	10	2490040	2490049	40 %	0 %	20 %	40 %	472337727
1570	NC_020834	CAATC	2	10	2491174	2491183	40 %	20 %	0 %	40 %	472337728
1571	NC_020834	TTCAT	2	10	2491872	2491881	20 %	60 %	0 %	20 %	472337729
1572	NC_020834	AAAAT	2	10	2493425	2493434	80 %	20 %	0 %	0 %	472337731
1573	NC_020834	ACACC	2	10	2493651	2493660	40 %	0 %	0 %	60 %	472337731
1574	NC_020834	GTATG	2	10	2501739	2501748	20 %	40 %	40 %	0 %	472337739
1575	NC_020834	ATTTA	2	10	2504524	2504533	40 %	60 %	0 %	0 %	472337742
1576	NC_020834	AATTA	2	10	2506193	2506202	60 %	40 %	0 %	0 %	472337744
1577	NC_020834	AAACA	2	10	2507203	2507212	80 %	0 %	0 %	20 %	472337745
1578	NC_020834	CAAAA	2	10	2507252	2507261	80 %	0 %	0 %	20 %	472337745
1579	NC_020834	CAAAA	2	10	2507741	2507750	80 %	0 %	0 %	20 %	472337745
1580	NC_020834	GTTTG	2	10	2508578	2508587	0 %	60 %	40 %	0 %	472337746
1581	NC_020834	TGCGT	2	10	2510246	2510255	0 %	40 %	40 %	20 %	472337746
1582	NC_020834	CTCCG	2	10	2513447	2513456	0 %	20 %	20 %	60 %	472337751
1583	NC_020834	CGAAA	2	10	2514374	2514383	60 %	0 %	20 %	20 %	472337753
1584	NC_020834	CCCAA	2	10	2514646	2514655	40 %	0 %	0 %	60 %	472337753
1585	NC_020834	CCAAA	2	10	2516947	2516956	60 %	0 %	0 %	40 %	472337755
1586	NC_020834	GGTGG	2	10	2517314	2517323	0 %	20 %	80 %	0 %	472337756
1587	NC_020834	TCAAG	2	10	2517927	2517936	40 %	20 %	20 %	20 %	472337756
1588	NC_020834	GCCAA	2	10	2518042	2518051	40 %	0 %	20 %	40 %	472337756
1589	NC_020834	TTGTT	2	10	2525429	2525438	0 %	80 %	20 %	0 %	472337759
1590	NC_020834	GATTT	2	10	2528138	2528147	20 %	60 %	20 %	0 %	472337762
1591	NC_020834	TAACC	2	10	2529034	2529043	40 %	20 %	0 %	40 %	472337763
1592	NC_020834	ATTAA	2	10	2529721	2529730	60 %	40 %	0 %	0 %	472337764
1593	NC_020834	TGTTC	2	10	2530216	2530225	0 %	60 %	20 %	20 %	472337765
1594	NC_020834	TTTGA	2	10	2531769	2531778	20 %	60 %	20 %	0 %	472337766
1595	NC_020834	ACATC	2	10	2532449	2532458	40 %	20 %	0 %	40 %	472337766
1596	NC_020834	CAATC	2	10	2533471	2533480	40 %	20 %	0 %	40 %	472337768
1597	NC_020834	AAGGC	2	10	2537211	2537220	40 %	0 %	40 %	20 %	472337771
1598	NC_020834	ATCAA	2	10	2538846	2538855	60 %	20 %	0 %	20 %	472337772
1599	NC_020834	AATTT	2	10	2539348	2539357	40 %	60 %	0 %	0 %	472337773
1600	NC_020834	GTTTC	2	10	2543533	2543542	0 %	60 %	20 %	20 %	472337776

< Previous 1 2 34Next >