MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 1600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020834	CTTGT	2	10	779537	779546	0 %	60 %	20 %	20 %	472336011
502	NC_020834	AGTAG	2	10	780972	780981	40 %	20 %	40 %	0 %	472336012
503	NC_020834	AGATA	2	10	785306	785315	60 %	20 %	20 %	0 %	472336016
504	NC_020834	TTTGG	2	10	786807	786816	0 %	60 %	40 %	0 %	472336019
505	NC_020834	CTGAA	2	10	788981	788990	40 %	20 %	20 %	20 %	472336020
506	NC_020834	GGGCA	2	10	790780	790789	20 %	0 %	60 %	20 %	472336022
507	NC_020834	TCGGC	2	10	790852	790861	0 %	20 %	40 %	40 %	472336022
508	NC_020834	GGTGT	2	10	791754	791763	0 %	40 %	60 %	0 %	472336022
509	NC_020834	TTGGT	2	10	792203	792212	0 %	60 %	40 %	0 %	472336023
510	NC_020834	GCCTT	2	10	792797	792806	0 %	40 %	20 %	40 %	472336023
511	NC_020834	GCAGA	2	10	795825	795834	40 %	0 %	40 %	20 %	472336027
512	NC_020834	AGGAC	2	10	797293	797302	40 %	0 %	40 %	20 %	472336027
513	NC_020834	GAGCA	2	10	797447	797456	40 %	0 %	40 %	20 %	472336027
514	NC_020834	TTCCG	2	10	799537	799546	0 %	40 %	20 %	40 %	472336031
515	NC_020834	GTGGA	2	10	800912	800921	20 %	20 %	60 %	0 %	472336032
516	NC_020834	TAAAT	2	10	800933	800942	60 %	40 %	0 %	0 %	472336032
517	NC_020834	ACCGG	2	10	804427	804436	20 %	0 %	40 %	40 %	472336038
518	NC_020834	AAATA	2	10	804648	804657	80 %	20 %	0 %	0 %	472336038
519	NC_020834	ATCCC	2	10	804704	804713	20 %	20 %	0 %	60 %	472336038
520	NC_020834	GCTTT	2	10	809491	809500	0 %	60 %	20 %	20 %	472336042
521	NC_020834	ATTTG	2	10	809843	809852	20 %	60 %	20 %	0 %	472336042
522	NC_020834	CTGAT	2	10	812321	812330	20 %	40 %	20 %	20 %	472336045
523	NC_020834	AGCCA	2	10	813806	813815	40 %	0 %	20 %	40 %	472336046
524	NC_020834	AGCAG	2	10	815383	815392	40 %	0 %	40 %	20 %	472336047
525	NC_020834	CAAAC	2	10	817634	817643	60 %	0 %	0 %	40 %	472336048
526	NC_020834	ATCCA	2	10	821569	821578	40 %	20 %	0 %	40 %	472336052
527	NC_020834	TGATT	2	10	821789	821798	20 %	60 %	20 %	0 %	472336052
528	NC_020834	ACCAA	2	10	822476	822485	60 %	0 %	0 %	40 %	472336052
529	NC_020834	TGAAA	2	10	823703	823712	60 %	20 %	20 %	0 %	472336054
530	NC_020834	ATAAA	2	10	824307	824316	80 %	20 %	0 %	0 %	472336054
531	NC_020834	GGTGG	2	10	825470	825479	0 %	20 %	80 %	0 %	472336057
532	NC_020834	CAAAT	2	10	826528	826537	60 %	20 %	0 %	20 %	472336058
533	NC_020834	AAAAT	2	10	827183	827192	80 %	20 %	0 %	0 %	472336059
534	NC_020834	ATTGG	2	10	829900	829909	20 %	40 %	40 %	0 %	472336063
535	NC_020834	ATGCT	2	10	830152	830161	20 %	40 %	20 %	20 %	472336063
536	NC_020834	AAATT	2	10	832381	832390	60 %	40 %	0 %	0 %	472336064
537	NC_020834	AGCTC	2	10	832830	832839	20 %	20 %	20 %	40 %	472336064
538	NC_020834	CGGCT	2	10	834614	834623	0 %	20 %	40 %	40 %	472336065
539	NC_020834	AAAAT	2	10	836867	836876	80 %	20 %	0 %	0 %	472336066
540	NC_020834	ACGCC	2	10	837676	837685	20 %	0 %	20 %	60 %	472336067
541	NC_020834	GATTG	2	10	841774	841783	20 %	40 %	40 %	0 %	472336071
542	NC_020834	CCAAA	2	10	842453	842462	60 %	0 %	0 %	40 %	472336072
543	NC_020834	GTAAT	2	10	846011	846020	40 %	40 %	20 %	0 %	472336073
544	NC_020834	AAAAT	2	10	849409	849418	80 %	20 %	0 %	0 %	472336077
545	NC_020834	AACTT	2	10	849964	849973	40 %	40 %	0 %	20 %	472336078
546	NC_020834	TAAGT	2	10	850150	850159	40 %	40 %	20 %	0 %	472336078
547	NC_020834	CGAAC	2	10	850528	850537	40 %	0 %	20 %	40 %	472336078
548	NC_020834	GTAAT	2	10	850585	850594	40 %	40 %	20 %	0 %	472336078
549	NC_020834	TGATG	2	10	852188	852197	20 %	40 %	40 %	0 %	472336080
550	NC_020834	ATTTA	2	10	853894	853903	40 %	60 %	0 %	0 %	472336081
551	NC_020834	GATTG	2	10	857408	857417	20 %	40 %	40 %	0 %	472336085
552	NC_020834	AGTTG	2	10	859645	859654	20 %	40 %	40 %	0 %	472336087
553	NC_020834	TTTGG	2	10	860225	860234	0 %	60 %	40 %	0 %	472336088
554	NC_020834	TTGGG	2	10	864943	864952	0 %	40 %	60 %	0 %	472336092
555	NC_020834	TAGCT	2	10	864980	864989	20 %	40 %	20 %	20 %	472336092
556	NC_020834	TGCTT	2	10	865132	865141	0 %	60 %	20 %	20 %	472336092
557	NC_020834	TTAAA	2	10	869647	869656	60 %	40 %	0 %	0 %	472336094
558	NC_020834	TAAGG	2	10	870027	870036	40 %	20 %	40 %	0 %	472336095
559	NC_020834	ATCTT	2	10	871954	871963	20 %	60 %	0 %	20 %	472336096
560	NC_020834	AGATA	2	10	875131	875140	60 %	20 %	20 %	0 %	472336098
561	NC_020834	CATAC	2	10	875612	875621	40 %	20 %	0 %	40 %	472336098
562	NC_020834	ACCAA	2	10	879349	879358	60 %	0 %	0 %	40 %	472336101
563	NC_020834	TAGTT	2	10	881839	881848	20 %	60 %	20 %	0 %	472336105
564	NC_020834	AACCA	2	10	882171	882180	60 %	0 %	0 %	40 %	472336106
565	NC_020834	GAGCG	2	10	882783	882792	20 %	0 %	60 %	20 %	472336107
566	NC_020834	GCAAA	2	10	882879	882888	60 %	0 %	20 %	20 %	472336107
567	NC_020834	TTGCT	2	10	882990	882999	0 %	60 %	20 %	20 %	472336108
568	NC_020834	TTTAA	2	10	883667	883676	40 %	60 %	0 %	0 %	472336108
569	NC_020834	AATTA	2	10	884356	884365	60 %	40 %	0 %	0 %	472336109
570	NC_020834	AATAT	2	10	884429	884438	60 %	40 %	0 %	0 %	472336109
571	NC_020834	GGCGA	2	10	887920	887929	20 %	0 %	60 %	20 %	472336113
572	NC_020834	CCGTG	2	10	888915	888924	0 %	20 %	40 %	40 %	472336115
573	NC_020834	GCAAT	2	10	889119	889128	40 %	20 %	20 %	20 %	472336115
574	NC_020834	GAAAT	2	10	889676	889685	60 %	20 %	20 %	0 %	472336117
575	NC_020834	TACAG	2	10	892119	892128	40 %	20 %	20 %	20 %	472336120
576	NC_020834	TGAAT	2	10	892310	892319	40 %	40 %	20 %	0 %	472336120
577	NC_020834	GAACC	2	10	895316	895325	40 %	0 %	20 %	40 %	472336122
578	NC_020834	TATGA	2	10	896441	896450	40 %	40 %	20 %	0 %	472336123
579	NC_020834	CAATT	2	10	896603	896612	40 %	40 %	0 %	20 %	472336123
580	NC_020834	GCAAA	2	10	898050	898059	60 %	0 %	20 %	20 %	472336123
581	NC_020834	AAAAT	2	10	898833	898842	80 %	20 %	0 %	0 %	472336123
582	NC_020834	TCTGC	2	10	899078	899087	0 %	40 %	20 %	40 %	472336123
583	NC_020834	CAACT	2	10	902002	902011	40 %	20 %	0 %	40 %	472336126
584	NC_020834	CAAAT	2	10	908169	908178	60 %	20 %	0 %	20 %	472336139
585	NC_020834	TTGTT	2	10	908596	908605	0 %	80 %	20 %	0 %	472336139
586	NC_020834	GGTTA	2	10	908916	908925	20 %	40 %	40 %	0 %	472336139
587	NC_020834	ACCAT	2	10	909908	909917	40 %	20 %	0 %	40 %	472336141
588	NC_020834	TCACT	2	10	910788	910797	20 %	40 %	0 %	40 %	472336141
589	NC_020834	AAATC	2	10	916365	916374	60 %	20 %	0 %	20 %	472336147
590	NC_020834	AATCA	2	10	917439	917448	60 %	20 %	0 %	20 %	472336148
591	NC_020834	GATGA	2	10	919655	919664	40 %	20 %	40 %	0 %	472336151
592	NC_020834	ACATC	2	10	920064	920073	40 %	20 %	0 %	40 %	472336151
593	NC_020834	CCTTG	2	10	923036	923045	0 %	40 %	20 %	40 %	472336155
594	NC_020834	GATGG	2	10	925408	925417	20 %	20 %	60 %	0 %	472336157
595	NC_020834	AAAAG	2	10	934897	934906	80 %	0 %	20 %	0 %	472336168
596	NC_020834	ATGAT	2	10	946625	946634	40 %	40 %	20 %	0 %	472336185
597	NC_020834	ATGGG	2	10	951862	951871	20 %	20 %	60 %	0 %	472336189
598	NC_020834	TATGA	2	10	952099	952108	40 %	40 %	20 %	0 %	472336189
599	NC_020834	GATTT	2	10	952598	952607	20 %	60 %	20 %	0 %	472336190
600	NC_020834	TGGTT	2	10	954488	954497	0 %	60 %	40 %	0 %	472336191
601	NC_020834	GAATT	2	10	955500	955509	40 %	40 %	20 %	0 %	472336192
602	NC_020834	TGAAG	2	10	955597	955606	40 %	20 %	40 %	0 %	472336192
603	NC_020834	TCGCA	2	10	957103	957112	20 %	20 %	20 %	40 %	472336193
604	NC_020834	GGAAA	2	10	957331	957340	60 %	0 %	40 %	0 %	472336193
605	NC_020834	TGGTT	2	10	958266	958275	0 %	60 %	40 %	0 %	472336194
606	NC_020834	GCTGA	2	10	958955	958964	20 %	20 %	40 %	20 %	472336194
607	NC_020834	TTAGC	2	10	959437	959446	20 %	40 %	20 %	20 %	472336195
608	NC_020834	TACCG	2	10	964513	964522	20 %	20 %	20 %	40 %	472336203
609	NC_020834	TTCAA	2	10	965530	965539	40 %	40 %	0 %	20 %	472336203
610	NC_020834	TATGA	2	10	966679	966688	40 %	40 %	20 %	0 %	472336206
611	NC_020834	TTTTA	2	10	967676	967685	20 %	80 %	0 %	0 %	472336207
612	NC_020834	GGTTT	2	10	968238	968247	0 %	60 %	40 %	0 %	472336209
613	NC_020834	TGCTC	2	10	976856	976865	0 %	40 %	20 %	40 %	472336220
614	NC_020834	GGTTG	2	10	978377	978386	0 %	40 %	60 %	0 %	472336223
615	NC_020834	GTTGC	2	10	981819	981828	0 %	40 %	40 %	20 %	472336225
616	NC_020834	TAAAA	2	10	984491	984500	80 %	20 %	0 %	0 %	472336228
617	NC_020834	TAGAA	2	10	985478	985487	60 %	20 %	20 %	0 %	472336230
618	NC_020834	TCATT	2	10	985531	985540	20 %	60 %	0 %	20 %	472336230
619	NC_020834	AGTTT	2	10	985551	985560	20 %	60 %	20 %	0 %	472336230
620	NC_020834	ATTTC	2	10	986558	986567	20 %	60 %	0 %	20 %	472336232
621	NC_020834	GGATG	2	10	988103	988112	20 %	20 %	60 %	0 %	472336233
622	NC_020834	TTGCA	2	10	989694	989703	20 %	40 %	20 %	20 %	472336236
623	NC_020834	TTGGG	2	10	990132	990141	0 %	40 %	60 %	0 %	472336237
624	NC_020834	AACCA	2	10	990388	990397	60 %	0 %	0 %	40 %	472336238
625	NC_020834	CTCGC	2	10	991274	991283	0 %	20 %	20 %	60 %	472336238
626	NC_020834	GCATT	2	10	993553	993562	20 %	40 %	20 %	20 %	472336239
627	NC_020834	AGTTT	2	10	993597	993606	20 %	60 %	20 %	0 %	472336239
628	NC_020834	GTACC	2	10	994538	994547	20 %	20 %	20 %	40 %	472336240
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