MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 1600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020834	ATTTT	2	10	1546485	1546494	20 %	80 %	0 %	0 %	472336777
1002	NC_020834	TAAAA	2	10	1546570	1546579	80 %	20 %	0 %	0 %	472336777
1003	NC_020834	TTTCT	2	10	1547783	1547792	0 %	80 %	0 %	20 %	472336777
1004	NC_020834	CATTT	2	10	1547951	1547960	20 %	60 %	0 %	20 %	472336777
1005	NC_020834	TTGCT	2	10	1549436	1549445	0 %	60 %	20 %	20 %	472336778
1006	NC_020834	TGTAT	2	10	1550555	1550564	20 %	60 %	20 %	0 %	472336778
1007	NC_020834	ATTCA	2	10	1552857	1552866	40 %	40 %	0 %	20 %	472336780
1008	NC_020834	GCCAA	2	10	1553431	1553440	40 %	0 %	20 %	40 %	472336781
1009	NC_020834	CACTG	2	10	1556411	1556420	20 %	20 %	20 %	40 %	472336783
1010	NC_020834	CTTTT	2	10	1557613	1557622	0 %	80 %	0 %	20 %	472336784
1011	NC_020834	AAATA	2	10	1558096	1558105	80 %	20 %	0 %	0 %	472336784
1012	NC_020834	TGCCT	2	10	1559346	1559355	0 %	40 %	20 %	40 %	472336785
1013	NC_020834	AAAAG	2	10	1565131	1565140	80 %	0 %	20 %	0 %	472336787
1014	NC_020834	GAATG	2	10	1566955	1566964	40 %	20 %	40 %	0 %	472336789
1015	NC_020834	ATTGG	2	10	1570555	1570564	20 %	40 %	40 %	0 %	472336792
1016	NC_020834	GAGTT	2	10	1571875	1571884	20 %	40 %	40 %	0 %	472336794
1017	NC_020834	TGGTT	2	10	1573144	1573153	0 %	60 %	40 %	0 %	472336795
1018	NC_020834	GCATT	2	10	1574539	1574548	20 %	40 %	20 %	20 %	472336796
1019	NC_020834	GGCTA	2	10	1574632	1574641	20 %	20 %	40 %	20 %	472336796
1020	NC_020834	TGTAA	2	10	1576320	1576329	40 %	40 %	20 %	0 %	472336797
1021	NC_020834	CTGCT	2	10	1577506	1577515	0 %	40 %	20 %	40 %	472336799
1022	NC_020834	TGTGA	2	10	1580113	1580122	20 %	40 %	40 %	0 %	472336800
1023	NC_020834	AAGTA	2	10	1580795	1580804	60 %	20 %	20 %	0 %	472336801
1024	NC_020834	ATCAA	2	10	1584624	1584633	60 %	20 %	0 %	20 %	472336805
1025	NC_020834	CCCTG	2	10	1585395	1585404	0 %	20 %	20 %	60 %	472336805
1026	NC_020834	CCAAA	2	10	1586154	1586163	60 %	0 %	0 %	40 %	472336806
1027	NC_020834	ACGTA	2	10	1587096	1587105	40 %	20 %	20 %	20 %	472336806
1028	NC_020834	TCGGC	2	10	1592025	1592034	0 %	20 %	40 %	40 %	472336811
1029	NC_020834	TTTGC	2	10	1592836	1592845	0 %	60 %	20 %	20 %	472336812
1030	NC_020834	TTTAC	2	10	1593115	1593124	20 %	60 %	0 %	20 %	472336813
1031	NC_020834	TTAAA	2	10	1596234	1596243	60 %	40 %	0 %	0 %	472336817
1032	NC_020834	AAAAC	2	10	1598451	1598460	80 %	0 %	0 %	20 %	472336817
1033	NC_020834	ATTTA	2	10	1599901	1599910	40 %	60 %	0 %	0 %	472336817
1034	NC_020834	TGGTA	2	10	1601570	1601579	20 %	40 %	40 %	0 %	472336817
1035	NC_020834	AGCGG	2	10	1603544	1603553	20 %	0 %	60 %	20 %	472336821
1036	NC_020834	AGCTG	2	10	1605580	1605589	20 %	20 %	40 %	20 %	472336824
1037	NC_020834	CATTT	2	10	1607288	1607297	20 %	60 %	0 %	20 %	472336828
1038	NC_020834	TCATT	2	10	1612570	1612579	20 %	60 %	0 %	20 %	472336830
1039	NC_020834	ATCAC	2	10	1613431	1613440	40 %	20 %	0 %	40 %	472336831
1040	NC_020834	AAATC	2	10	1613918	1613927	60 %	20 %	0 %	20 %	472336831
1041	NC_020834	AGTGC	2	10	1614943	1614952	20 %	20 %	40 %	20 %	472336832
1042	NC_020834	TGCCC	2	10	1617598	1617607	0 %	20 %	20 %	60 %	472336835
1043	NC_020834	GTGCC	2	10	1619575	1619584	0 %	20 %	40 %	40 %	472336837
1044	NC_020834	TGGTG	2	10	1621900	1621909	0 %	40 %	60 %	0 %	472336837
1045	NC_020834	GTGCG	2	10	1622265	1622274	0 %	20 %	60 %	20 %	472336837
1046	NC_020834	GGCTT	2	10	1623023	1623032	0 %	40 %	40 %	20 %	472336838
1047	NC_020834	TTTCA	2	10	1624553	1624562	20 %	60 %	0 %	20 %	472336838
1048	NC_020834	GATTG	2	10	1624569	1624578	20 %	40 %	40 %	0 %	472336838
1049	NC_020834	TTTAT	2	10	1626545	1626554	20 %	80 %	0 %	0 %	472336841
1050	NC_020834	GCAAT	2	10	1627235	1627244	40 %	20 %	20 %	20 %	472336842
1051	NC_020834	TAAAA	2	10	1627545	1627554	80 %	20 %	0 %	0 %	472336842
1052	NC_020834	TAAAA	2	10	1628227	1628236	80 %	20 %	0 %	0 %	472336843
1053	NC_020834	TATCT	2	10	1635345	1635354	20 %	60 %	0 %	20 %	472336850
1054	NC_020834	AAAAT	2	10	1636100	1636109	80 %	20 %	0 %	0 %	472336851
1055	NC_020834	ATTCC	2	10	1637592	1637601	20 %	40 %	0 %	40 %	472336853
1056	NC_020834	CGCCA	2	10	1638112	1638121	20 %	0 %	20 %	60 %	472336853
1057	NC_020834	TAATG	2	10	1639642	1639651	40 %	40 %	20 %	0 %	472336855
1058	NC_020834	GTTAC	2	10	1642025	1642034	20 %	40 %	20 %	20 %	472336859
1059	NC_020834	CTTTT	2	10	1644120	1644129	0 %	80 %	0 %	20 %	472336861
1060	NC_020834	CCATA	2	10	1646814	1646823	40 %	20 %	0 %	40 %	472336865
1061	NC_020834	TAAAA	2	10	1646917	1646926	80 %	20 %	0 %	0 %	472336865
1062	NC_020834	GCAAG	2	10	1650960	1650969	40 %	0 %	40 %	20 %	472336869
1063	NC_020834	TTTGA	2	10	1651267	1651276	20 %	60 %	20 %	0 %	472336869
1064	NC_020834	CGCCT	2	10	1651522	1651531	0 %	20 %	20 %	60 %	472336869
1065	NC_020834	TGCTC	2	10	1652904	1652913	0 %	40 %	20 %	40 %	472336872
1066	NC_020834	ATTTA	2	10	1656069	1656078	40 %	60 %	0 %	0 %	472336876
1067	NC_020834	CGCTT	2	10	1656588	1656597	0 %	40 %	20 %	40 %	472336876
1068	NC_020834	ATTAA	2	10	1658261	1658270	60 %	40 %	0 %	0 %	472336877
1069	NC_020834	TAATT	2	10	1658683	1658692	40 %	60 %	0 %	0 %	472336878
1070	NC_020834	AAGGA	2	10	1660667	1660676	60 %	0 %	40 %	0 %	472336883
1071	NC_020834	GAAAT	2	10	1661537	1661546	60 %	20 %	20 %	0 %	472336884
1072	NC_020834	AATCA	2	10	1664328	1664337	60 %	20 %	0 %	20 %	472336888
1073	NC_020834	AAATT	2	10	1666241	1666250	60 %	40 %	0 %	0 %	472336889
1074	NC_020834	ATAAA	2	10	1668577	1668586	80 %	20 %	0 %	0 %	472336893
1075	NC_020834	AGAAT	2	10	1669396	1669405	60 %	20 %	20 %	0 %	472336894
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1077	NC_020834	AGCTA	2	10	1675736	1675745	40 %	20 %	20 %	20 %	472336900
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1079	NC_020834	ATATG	2	10	1678414	1678423	40 %	40 %	20 %	0 %	472336903
1080	NC_020834	CCTAT	2	10	1681983	1681992	20 %	40 %	0 %	40 %	472336907
1081	NC_020834	CGTTG	2	10	1684624	1684633	0 %	40 %	40 %	20 %	472336911
1082	NC_020834	TTACC	2	10	1685093	1685102	20 %	40 %	0 %	40 %	472336912
1083	NC_020834	CGGTT	2	10	1685342	1685351	0 %	40 %	40 %	20 %	472336913
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1085	NC_020834	AGCTG	2	10	1690650	1690659	20 %	20 %	40 %	20 %	472336922
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1087	NC_020834	ATTGG	2	10	1692452	1692461	20 %	40 %	40 %	0 %	472336924
1088	NC_020834	GGTTG	2	10	1696687	1696696	0 %	40 %	60 %	0 %	472336932
1089	NC_020834	TGCGT	2	10	1697961	1697970	0 %	40 %	40 %	20 %	472336935
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1091	NC_020834	CAATG	2	10	1704864	1704873	40 %	20 %	20 %	20 %	472336942
1092	NC_020834	CGTGG	2	10	1704910	1704919	0 %	20 %	60 %	20 %	472336942
1093	NC_020834	GTGAT	2	10	1706150	1706159	20 %	40 %	40 %	0 %	472336944
1094	NC_020834	GGTGC	2	10	1706278	1706287	0 %	20 %	60 %	20 %	472336944
1095	NC_020834	CACGG	2	10	1706558	1706567	20 %	0 %	40 %	40 %	472336945
1096	NC_020834	ACCGC	2	10	1708896	1708905	20 %	0 %	20 %	60 %	472336950
1097	NC_020834	TGGTT	2	10	1709279	1709288	0 %	60 %	40 %	0 %	472336951
1098	NC_020834	CTGAA	2	10	1711498	1711507	40 %	20 %	20 %	20 %	472336954
1099	NC_020834	TGAAT	2	10	1712285	1712294	40 %	40 %	20 %	0 %	472336954
1100	NC_020834	AAATT	2	10	1714185	1714194	60 %	40 %	0 %	0 %	472336954
1101	NC_020834	GAAAA	2	10	1716725	1716734	80 %	0 %	20 %	0 %	472336957
1102	NC_020834	CGTAC	2	10	1718111	1718120	20 %	20 %	20 %	40 %	472336958
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1104	NC_020834	AAGTT	2	10	1718711	1718720	40 %	40 %	20 %	0 %	472336958
1105	NC_020834	ATCCG	2	10	1718844	1718853	20 %	20 %	20 %	40 %	472336958
1106	NC_020834	ATTGG	2	10	1718925	1718934	20 %	40 %	40 %	0 %	472336958
1107	NC_020834	TACAA	2	10	1720615	1720624	60 %	20 %	0 %	20 %	472336958
1108	NC_020834	TACAA	2	10	1721452	1721461	60 %	20 %	0 %	20 %	472336958
1109	NC_020834	GTACG	2	10	1722271	1722280	20 %	20 %	40 %	20 %	472336958
1110	NC_020834	CAAGG	2	10	1722454	1722463	40 %	0 %	40 %	20 %	472336958
1111	NC_020834	AAAAT	2	10	1724317	1724326	80 %	20 %	0 %	0 %	472336961
1112	NC_020834	TTTTA	2	10	1727622	1727631	20 %	80 %	0 %	0 %	472336962
1113	NC_020834	CTTTA	2	10	1729689	1729698	20 %	60 %	0 %	20 %	472336965
1114	NC_020834	ATGAA	2	10	1731413	1731422	60 %	20 %	20 %	0 %	472336966
1115	NC_020834	AAATA	2	10	1736901	1736910	80 %	20 %	0 %	0 %	472336968
1116	NC_020834	ACCAC	2	10	1739528	1739537	40 %	0 %	0 %	60 %	472336971
1117	NC_020834	TTTAC	2	10	1740184	1740193	20 %	60 %	0 %	20 %	472336972
1118	NC_020834	ATCAC	2	10	1741194	1741203	40 %	20 %	0 %	40 %	472336973
1119	NC_020834	TCCGA	2	10	1743301	1743310	20 %	20 %	20 %	40 %	472336974
1120	NC_020834	AGTTG	2	10	1744485	1744494	20 %	40 %	40 %	0 %	472336975
1121	NC_020834	ATGGA	2	10	1744577	1744586	40 %	20 %	40 %	0 %	472336975
1122	NC_020834	ATTTA	2	10	1744977	1744986	40 %	60 %	0 %	0 %	472336975
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1124	NC_020834	GGTGG	2	10	1745632	1745641	0 %	20 %	80 %	0 %	472336976
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1495	NC_020834	TAAGA	2	10	2373027	2373036	60 %	20 %	20 %	0 %	472337607
1496	NC_020834	TAATT	2	10	2373080	2373089	40 %	60 %	0 %	0 %	472337607
1497	NC_020834	ATCAC	2	10	2374207	2374216	40 %	20 %	0 %	40 %	472337608
1498	NC_020834	GCACC	2	10	2374826	2374835	20 %	0 %	20 %	60 %	472337608
1499	NC_020834	TTAAT	2	10	2374952	2374961	40 %	60 %	0 %	0 %	472337608
1500	NC_020834	CGGTA	2	10	2376215	2376224	20 %	20 %	40 %	20 %	472337608

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