MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 7008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020833	CCAA	2	8	142	149	50 %	0 %	0 %	50 %	472332508
2	NC_020833	AATG	2	8	151	158	50 %	25 %	25 %	0 %	472332508
3	NC_020833	GCTC	2	8	322	329	0 %	25 %	25 %	50 %	472332508
4	NC_020833	ATTG	2	8	626	633	25 %	50 %	25 %	0 %	472332508
5	NC_020833	CTCA	2	8	635	642	25 %	25 %	0 %	50 %	472332508
6	NC_020833	TCAA	2	8	810	817	50 %	25 %	0 %	25 %	472332509
7	NC_020833	TGAG	2	8	1104	1111	25 %	25 %	50 %	0 %	472332509
8	NC_020833	CAGG	2	8	1417	1424	25 %	0 %	50 %	25 %	472332509
9	NC_020833	GTTG	2	8	1850	1857	0 %	50 %	50 %	0 %	472332509
10	NC_020833	CTCA	2	8	1949	1956	25 %	25 %	0 %	50 %	472332509
11	NC_020833	AAAT	2	8	2035	2042	75 %	25 %	0 %	0 %	472332509
12	NC_020833	CGAG	2	8	2143	2150	25 %	0 %	50 %	25 %	472332509
13	NC_020833	GGGT	2	8	2308	2315	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020833	CAAA	2	8	2493	2500	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020833	CCCG	2	8	2873	2880	0 %	0 %	25 %	75 %	472332510
16	NC_020833	CAGG	2	8	3361	3368	25 %	0 %	50 %	25 %	472332511
17	NC_020833	TATT	2	8	3629	3636	25 %	75 %	0 %	0 %	472332511
18	NC_020833	TGTT	2	8	5303	5310	0 %	75 %	25 %	0 %	472332513
19	NC_020833	GTAA	2	8	5878	5885	50 %	25 %	25 %	0 %	472332514
20	NC_020833	TAAT	2	8	6255	6262	50 %	50 %	0 %	0 %	472332515
21	NC_020833	GCCA	2	8	6662	6669	25 %	0 %	25 %	50 %	472332515
22	NC_020833	TTCT	2	8	6831	6838	0 %	75 %	0 %	25 %	472332515
23	NC_020833	TTAT	2	8	6938	6945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020833	AGGC	2	8	7893	7900	25 %	0 %	50 %	25 %	472332517
25	NC_020833	TGGT	2	8	7972	7979	0 %	50 %	50 %	0 %	472332517
26	NC_020833	ACTT	2	8	8575	8582	25 %	50 %	0 %	25 %	472332518
27	NC_020833	ATTG	2	8	8867	8874	25 %	50 %	25 %	0 %	472332519
28	NC_020833	TGAA	2	8	9030	9037	50 %	25 %	25 %	0 %	472332519
29	NC_020833	TTGA	2	8	9313	9320	25 %	50 %	25 %	0 %	472332520
30	NC_020833	AGCG	2	8	9785	9792	25 %	0 %	50 %	25 %	472332522
31	NC_020833	CAGC	2	8	10180	10187	25 %	0 %	25 %	50 %	472332522
32	NC_020833	AAGA	2	8	10276	10283	75 %	0 %	25 %	0 %	472332522
33	NC_020833	GGGC	2	8	10513	10520	0 %	0 %	75 %	25 %	472332522
34	NC_020833	TGGC	2	8	11065	11072	0 %	25 %	50 %	25 %	472332523
35	NC_020833	TGAA	2	8	11174	11181	50 %	25 %	25 %	0 %	472332523
36	NC_020833	GTTT	2	8	11615	11622	0 %	75 %	25 %	0 %	472332524
37	NC_020833	AGCA	2	8	11868	11875	50 %	0 %	25 %	25 %	472332524
38	NC_020833	AGAA	2	8	13038	13045	75 %	0 %	25 %	0 %	472332524
39	NC_020833	GCCA	2	8	13276	13283	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020833	AGCA	10	40	13501	13540	50 %	0 %	25 %	25 %	472332525
41	NC_020833	GTTT	2	8	13630	13637	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020833	AAAT	2	8	13700	13707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020833	ATCA	2	8	14606	14613	50 %	25 %	0 %	25 %	472332526
44	NC_020833	ACGC	2	8	18383	18390	25 %	0 %	25 %	50 %	472332532
45	NC_020833	CACT	2	8	18424	18431	25 %	25 %	0 %	50 %	472332532
46	NC_020833	ACCA	2	8	18815	18822	50 %	0 %	0 %	50 %	472332533
47	NC_020833	ATTC	2	8	19914	19921	25 %	50 %	0 %	25 %	472332534
48	NC_020833	CTTG	2	8	19928	19935	0 %	50 %	25 %	25 %	472332534
49	NC_020833	TTTC	2	8	20430	20437	0 %	75 %	0 %	25 %	472332534
50	NC_020833	TAAA	2	8	20457	20464	75 %	25 %	0 %	0 %	472332534
51	NC_020833	ACGC	2	8	21409	21416	25 %	0 %	25 %	50 %	472332535
52	NC_020833	TAGA	2	8	21434	21441	50 %	25 %	25 %	0 %	472332535
53	NC_020833	TGCT	2	8	21512	21519	0 %	50 %	25 %	25 %	472332535
54	NC_020833	GTTG	2	8	21754	21761	0 %	50 %	50 %	0 %	472332535
55	NC_020833	TCAC	2	8	22242	22249	25 %	25 %	0 %	50 %	472332535
56	NC_020833	ATCA	2	8	22376	22383	50 %	25 %	0 %	25 %	472332536
57	NC_020833	CTAT	2	8	22425	22432	25 %	50 %	0 %	25 %	472332536
58	NC_020833	CATA	2	8	23966	23973	50 %	25 %	0 %	25 %	472332539
59	NC_020833	GAAT	2	8	24047	24054	50 %	25 %	25 %	0 %	472332539
60	NC_020833	AACC	2	8	24718	24725	50 %	0 %	0 %	50 %	472332540
61	NC_020833	TTTA	2	8	25128	25135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020833	AGCC	2	8	26498	26505	25 %	0 %	25 %	50 %	472332541
63	NC_020833	TATT	2	8	26526	26533	25 %	75 %	0 %	0 %	472332541
64	NC_020833	GACC	2	8	26837	26844	25 %	0 %	25 %	50 %	472332542
65	NC_020833	GGGC	2	8	26942	26949	0 %	0 %	75 %	25 %	472332542
66	NC_020833	CAAA	2	8	29084	29091	75 %	0 %	0 %	25 %	472332542
67	NC_020833	AGCC	2	8	29189	29196	25 %	0 %	25 %	50 %	472332542
68	NC_020833	CTAA	2	8	29872	29879	50 %	25 %	0 %	25 %	472332542
69	NC_020833	TGTT	2	8	32651	32658	0 %	75 %	25 %	0 %	472332546
70	NC_020833	ATTA	2	8	32922	32929	50 %	50 %	0 %	0 %	472332546
71	NC_020833	CTTG	2	8	33006	33013	0 %	50 %	25 %	25 %	472332547
72	NC_020833	TGTT	2	8	33737	33744	0 %	75 %	25 %	0 %	472332547
73	NC_020833	GGCT	2	8	33844	33851	0 %	25 %	50 %	25 %	472332547
74	NC_020833	AGGC	2	8	34025	34032	25 %	0 %	50 %	25 %	472332547
75	NC_020833	TGAT	2	8	34670	34677	25 %	50 %	25 %	0 %	472332548
76	NC_020833	ACCA	2	8	34870	34877	50 %	0 %	0 %	50 %	472332548
77	NC_020833	AACC	2	8	35046	35053	50 %	0 %	0 %	50 %	472332548
78	NC_020833	CTCC	2	8	35369	35376	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_020833	TGAT	2	8	35727	35734	25 %	50 %	25 %	0 %	472332549
80	NC_020833	TTGA	2	8	36852	36859	25 %	50 %	25 %	0 %	472332550
81	NC_020833	AGTC	2	8	37998	38005	25 %	25 %	25 %	25 %	472332550
82	NC_020833	CTCC	2	8	38130	38137	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_020833	CAAA	2	8	38219	38226	75 %	0 %	0 %	25 %	472332551
84	NC_020833	TATC	2	8	38256	38263	25 %	50 %	0 %	25 %	472332551
85	NC_020833	TGGT	2	8	38804	38811	0 %	50 %	50 %	0 %	472332551
86	NC_020833	TGTA	2	8	38837	38844	25 %	50 %	25 %	0 %	472332551
87	NC_020833	TTGG	2	8	39017	39024	0 %	50 %	50 %	0 %	472332551
88	NC_020833	GGAC	2	8	39418	39425	25 %	0 %	50 %	25 %	472332552
89	NC_020833	CAAC	2	8	39583	39590	50 %	0 %	0 %	50 %	472332552
90	NC_020833	AAAT	2	8	40394	40401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020833	GGTC	2	8	40809	40816	0 %	25 %	50 %	25 %	472332553
92	NC_020833	AACA	2	8	41321	41328	75 %	0 %	0 %	25 %	472332553
93	NC_020833	ACAA	2	8	41437	41444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020833	ATTG	2	8	41478	41485	25 %	50 %	25 %	0 %	472332554
95	NC_020833	CAGG	2	8	41574	41581	25 %	0 %	50 %	25 %	472332554
96	NC_020833	AAGC	2	8	42352	42359	50 %	0 %	25 %	25 %	472332554
97	NC_020833	TTTA	2	8	42984	42991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020833	TTAA	2	8	43002	43009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020833	TTAA	2	8	43104	43111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020833	AAAC	2	8	43340	43347	75 %	0 %	0 %	25 %	472332555
101	NC_020833	AATT	2	8	43627	43634	50 %	50 %	0 %	0 %	472332556
102	NC_020833	AAAC	2	8	44038	44045	75 %	0 %	0 %	25 %	472332557
103	NC_020833	GCTT	2	8	44270	44277	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020833	AATA	2	8	44314	44321	75 %	25 %	0 %	0 %	472332558
105	NC_020833	GGAT	2	8	44545	44552	25 %	25 %	50 %	0 %	472332558
106	NC_020833	CGTC	2	8	45064	45071	0 %	25 %	25 %	50 %	472332558
107	NC_020833	TCAT	2	8	45193	45200	25 %	50 %	0 %	25 %	472332558
108	NC_020833	TAAA	2	8	45599	45606	75 %	25 %	0 %	0 %	472332558
109	NC_020833	AGCT	2	8	45858	45865	25 %	25 %	25 %	25 %	472332558
110	NC_020833	TTCT	2	8	46018	46025	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020833	TTGA	2	8	46401	46408	25 %	50 %	25 %	0 %	472332559
112	NC_020833	GTAT	2	8	46414	46421	25 %	50 %	25 %	0 %	472332559
113	NC_020833	ACCG	2	8	46529	46536	25 %	0 %	25 %	50 %	472332559
114	NC_020833	TATG	2	8	46555	46562	25 %	50 %	25 %	0 %	472332559
115	NC_020833	AAAC	2	8	47030	47037	75 %	0 %	0 %	25 %	472332559
116	NC_020833	AGGA	2	8	47701	47708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020833	AGTT	2	8	48445	48452	25 %	50 %	25 %	0 %	472332560
118	NC_020833	TGAT	2	8	49183	49190	25 %	50 %	25 %	0 %	472332561
119	NC_020833	ACTT	2	8	49851	49858	25 %	50 %	0 %	25 %	472332561
120	NC_020833	AGTG	2	8	50491	50498	25 %	25 %	50 %	0 %	472332562
121	NC_020833	TTCA	2	8	50575	50582	25 %	50 %	0 %	25 %	472332562
122	NC_020833	CAGC	2	8	51543	51550	25 %	0 %	25 %	50 %	472332563
123	NC_020833	GAAT	2	8	51658	51665	50 %	25 %	25 %	0 %	472332563
124	NC_020833	TTTC	2	8	51681	51688	0 %	75 %	0 %	25 %	472332563
125	NC_020833	GTGA	2	8	51855	51862	25 %	25 %	50 %	0 %	472332563
126	NC_020833	TAGT	2	8	51869	51876	25 %	50 %	25 %	0 %	472332563
127	NC_020833	CAAT	2	8	52002	52009	50 %	25 %	0 %	25 %	472332563
128	NC_020833	CCAC	2	8	52180	52187	25 %	0 %	0 %	75 %	472332564
129	NC_020833	ACCA	2	8	52253	52260	50 %	0 %	0 %	50 %	472332564
130	NC_020833	TAGT	2	8	52795	52802	25 %	50 %	25 %	0 %	472332564
131	NC_020833	ACCA	2	8	52846	52853	50 %	0 %	0 %	50 %	472332564
132	NC_020833	AAGA	2	8	52871	52878	75 %	0 %	25 %	0 %	472332564
133	NC_020833	ATAG	2	8	53586	53593	50 %	25 %	25 %	0 %	472332565
134	NC_020833	AAAC	2	8	54066	54073	75 %	0 %	0 %	25 %	472332565
135	NC_020833	GCTT	2	8	54333	54340	0 %	50 %	25 %	25 %	472332565
136	NC_020833	TAAG	2	8	54445	54452	50 %	25 %	25 %	0 %	472332565
137	NC_020833	AAAT	2	8	54700	54707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020833	GCAG	2	8	54782	54789	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_020833	AACT	2	8	55384	55391	50 %	25 %	0 %	25 %	472332566
140	NC_020833	ATTT	2	8	55414	55421	25 %	75 %	0 %	0 %	472332566
141	NC_020833	AGCA	2	8	55429	55436	50 %	0 %	25 %	25 %	472332566
142	NC_020833	AACC	2	8	55771	55778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020833	TGCC	2	8	55880	55887	0 %	25 %	25 %	50 %	472332568
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