MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 7008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020833	GGCT	2	8	578522	578529	0 %	25 %	50 %	25 %	472333095
1503	NC_020833	CAAA	2	8	578631	578638	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_020833	GTGA	2	8	579030	579037	25 %	25 %	50 %	0 %	472333097
1505	NC_020833	CCAA	2	8	579254	579261	50 %	0 %	0 %	50 %	472333097
1506	NC_020833	TAAC	2	8	579462	579469	50 %	25 %	0 %	25 %	472333097
1507	NC_020833	TGCT	2	8	579487	579494	0 %	50 %	25 %	25 %	472333097
1508	NC_020833	ATTT	2	8	580596	580603	25 %	75 %	0 %	0 %	472333098
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1510	NC_020833	GAGC	2	8	581209	581216	25 %	0 %	50 %	25 %	472333100
1511	NC_020833	TCTT	2	8	581471	581478	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_020833	TTAG	2	8	581558	581565	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020833	ATTT	2	8	582900	582907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020833	ATAA	2	8	582910	582917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020833	AGAT	2	8	582972	582979	50 %	25 %	25 %	0 %	472333102
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1517	NC_020833	ATTG	2	8	583718	583725	25 %	50 %	25 %	0 %	472333103
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1519	NC_020833	TGAT	2	8	585081	585088	25 %	50 %	25 %	0 %	472333104
1520	NC_020833	TTGC	2	8	585131	585138	0 %	50 %	25 %	25 %	472333104
1521	NC_020833	AATT	2	8	585312	585319	50 %	50 %	0 %	0 %	472333104
1522	NC_020833	GCAA	2	8	585742	585749	50 %	0 %	25 %	25 %	472333104
1523	NC_020833	GTTA	2	8	585961	585968	25 %	50 %	25 %	0 %	472333104
1524	NC_020833	TAAA	2	8	586684	586691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020833	CCAA	2	8	587418	587425	50 %	0 %	0 %	50 %	472333105
1526	NC_020833	TGCG	2	8	587691	587698	0 %	25 %	50 %	25 %	472333105
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1529	NC_020833	ATTC	2	8	588701	588708	25 %	50 %	0 %	25 %	472333106
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1533	NC_020833	TATT	2	8	589994	590001	25 %	75 %	0 %	0 %	472333109
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1535	NC_020833	ATTC	2	8	590329	590336	25 %	50 %	0 %	25 %	472333110
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1540	NC_020833	TGCT	2	8	592096	592103	0 %	50 %	25 %	25 %	472333112
1541	NC_020833	TTGC	2	8	592821	592828	0 %	50 %	25 %	25 %	472333112
1542	NC_020833	CATT	2	8	592972	592979	25 %	50 %	0 %	25 %	472333113
1543	NC_020833	AGTG	2	8	593203	593210	25 %	25 %	50 %	0 %	472333113
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1547	NC_020833	CCTT	2	8	595655	595662	0 %	50 %	0 %	50 %	472333115
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1549	NC_020833	AATT	2	8	596401	596408	50 %	50 %	0 %	0 %	472333115
1550	NC_020833	TGAT	2	8	596804	596811	25 %	50 %	25 %	0 %	472333116
1551	NC_020833	ACGT	2	8	597748	597755	25 %	25 %	25 %	25 %	472333117
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1553	NC_020833	TTTA	2	8	598350	598357	25 %	75 %	0 %	0 %	472333118
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1555	NC_020833	ATTA	2	8	598757	598764	50 %	50 %	0 %	0 %	472333118
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1557	NC_020833	ACTC	2	8	599551	599558	25 %	25 %	0 %	50 %	472333119
1558	NC_020833	CTTT	2	8	599833	599840	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_020833	AAAG	2	8	599849	599856	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020833	AAAG	2	8	599862	599869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020833	AATT	2	8	600225	600232	50 %	50 %	0 %	0 %	472333120
1562	NC_020833	TGAT	2	8	600738	600745	25 %	50 %	25 %	0 %	472333120
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1570	NC_020833	GCCA	2	8	603321	603328	25 %	0 %	25 %	50 %	472333123
1571	NC_020833	ACAA	2	8	603850	603857	75 %	0 %	0 %	25 %	472333123
1572	NC_020833	TTTA	2	8	604267	604274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020833	TCGA	2	8	604656	604663	25 %	25 %	25 %	25 %	472333124
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1594	NC_020833	AATT	2	8	612607	612614	50 %	50 %	0 %	0 %	472333131
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1598	NC_020833	TGAC	2	8	613688	613695	25 %	25 %	25 %	25 %	472333131
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1601	NC_020833	GATC	2	8	614414	614421	25 %	25 %	25 %	25 %	472333132
1602	NC_020833	AACC	2	8	614868	614875	50 %	0 %	0 %	50 %	472333133
1603	NC_020833	AAGC	2	8	615684	615691	50 %	0 %	25 %	25 %	472333133
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1605	NC_020833	AAGT	2	8	616763	616770	50 %	25 %	25 %	0 %	472333134
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1609	NC_020833	TTGC	2	8	619353	619360	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_020833	TTTC	2	8	619478	619485	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_020833	CTAT	2	8	619515	619522	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1612	NC_020833	AATT	2	8	619689	619696	50 %	50 %	0 %	0 %	472333138
1613	NC_020833	AATA	2	8	619754	619761	75 %	25 %	0 %	0 %	472333138
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1615	NC_020833	GTTT	2	8	620417	620424	0 %	75 %	25 %	0 %	472333138
1616	NC_020833	ATCA	2	8	620922	620929	50 %	25 %	0 %	25 %	472333139
1617	NC_020833	GATT	2	8	620956	620963	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020833	ATTT	2	8	621004	621011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_020833	TATT	2	8	621255	621262	25 %	75 %	0 %	0 %	472333140
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