MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 7008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020833	ATTT	2	8	183473	183480	25 %	75 %	0 %	0 %	472332688
502	NC_020833	TAAC	2	8	183894	183901	50 %	25 %	0 %	25 %	472332689
503	NC_020833	TGGG	2	8	184098	184105	0 %	25 %	75 %	0 %	472332689
504	NC_020833	CGCC	2	8	185296	185303	0 %	0 %	25 %	75 %	472332690
505	NC_020833	TATT	2	8	186287	186294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020833	TAAA	2	8	186660	186667	75 %	25 %	0 %	0 %	472332692
507	NC_020833	CCAA	2	8	186751	186758	50 %	0 %	0 %	50 %	472332692
508	NC_020833	CAAA	2	8	186973	186980	75 %	0 %	0 %	25 %	472332692
509	NC_020833	GGGA	2	8	187156	187163	25 %	0 %	75 %	0 %	472332692
510	NC_020833	CTTA	2	8	187325	187332	25 %	50 %	0 %	25 %	472332692
511	NC_020833	TGGA	2	8	187748	187755	25 %	25 %	50 %	0 %	472332692
512	NC_020833	ATGG	2	8	187827	187834	25 %	25 %	50 %	0 %	472332692
513	NC_020833	AATT	2	8	187992	187999	50 %	50 %	0 %	0 %	472332692
514	NC_020833	CAAG	2	8	189145	189152	50 %	0 %	25 %	25 %	472332693
515	NC_020833	AAAC	2	8	189263	189270	75 %	0 %	0 %	25 %	472332693
516	NC_020833	GATT	2	8	189276	189283	25 %	50 %	25 %	0 %	472332693
517	NC_020833	TAAA	2	8	189486	189493	75 %	25 %	0 %	0 %	472332693
518	NC_020833	AATT	2	8	189574	189581	50 %	50 %	0 %	0 %	472332693
519	NC_020833	TTGG	2	8	189934	189941	0 %	50 %	50 %	0 %	472332694
520	NC_020833	CATA	2	8	190205	190212	50 %	25 %	0 %	25 %	472332694
521	NC_020833	TCAT	2	8	190530	190537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
522	NC_020833	GTAG	2	8	190666	190673	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020833	ATCA	2	8	190987	190994	50 %	25 %	0 %	25 %	472332695
524	NC_020833	CTGA	2	8	191247	191254	25 %	25 %	25 %	25 %	472332695
525	NC_020833	CGTC	2	8	191450	191457	0 %	25 %	25 %	50 %	472332695
526	NC_020833	TTGC	2	8	192015	192022	0 %	50 %	25 %	25 %	472332696
527	NC_020833	TTGA	2	8	192849	192856	25 %	50 %	25 %	0 %	472332696
528	NC_020833	TAAT	2	8	193827	193834	50 %	50 %	0 %	0 %	472332697
529	NC_020833	AAAT	2	8	194006	194013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020833	TTTC	2	8	195407	195414	0 %	75 %	0 %	25 %	472332699
531	NC_020833	AAAG	2	8	196373	196380	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020833	TGCC	2	8	196630	196637	0 %	25 %	25 %	50 %	472332700
533	NC_020833	CAGA	2	8	197183	197190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
534	NC_020833	TGCC	2	8	197438	197445	0 %	25 %	25 %	50 %	472332701
535	NC_020833	AAAT	2	8	197556	197563	75 %	25 %	0 %	0 %	472332701
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540	NC_020833	CTTG	2	8	199355	199362	0 %	50 %	25 %	25 %	472332701
541	NC_020833	ATTA	2	8	199467	199474	50 %	50 %	0 %	0 %	472332701
542	NC_020833	GTTC	2	8	199640	199647	0 %	50 %	25 %	25 %	472332701
543	NC_020833	ATTG	2	8	199943	199950	25 %	50 %	25 %	0 %	472332701
544	NC_020833	GATT	2	8	200513	200520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020833	ATTT	2	8	200724	200731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020833	GCTT	2	8	201836	201843	0 %	50 %	25 %	25 %	472332703
547	NC_020833	CTTT	2	8	202512	202519	0 %	75 %	0 %	25 %	472332705
548	NC_020833	TCAC	2	8	202946	202953	25 %	25 %	0 %	50 %	472332705
549	NC_020833	GGTG	2	8	203363	203370	0 %	25 %	75 %	0 %	472332705
550	NC_020833	AGTG	2	8	203711	203718	25 %	25 %	50 %	0 %	472332705
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558	NC_020833	AGTG	2	8	207587	207594	25 %	25 %	50 %	0 %	472332709
559	NC_020833	GCAG	2	8	207690	207697	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
560	NC_020833	TAAT	2	8	207933	207940	50 %	50 %	0 %	0 %	472332710
561	NC_020833	CGCC	2	8	207977	207984	0 %	0 %	25 %	75 %	472332710
562	NC_020833	GTGA	2	8	208388	208395	25 %	25 %	50 %	0 %	472332710
563	NC_020833	AGCA	2	8	208495	208502	50 %	0 %	25 %	25 %	472332710
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565	NC_020833	AAAT	2	8	209201	209208	75 %	25 %	0 %	0 %	472332712
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567	NC_020833	TTCT	2	8	209519	209526	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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569	NC_020833	ATTA	2	8	211096	211103	50 %	50 %	0 %	0 %	472332714
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572	NC_020833	AATT	2	8	211699	211706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020833	AGCC	2	8	211847	211854	25 %	0 %	25 %	50 %	472332716
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587	NC_020833	GCAG	2	8	217166	217173	25 %	0 %	50 %	25 %	472332723
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598	NC_020833	GATC	2	8	220289	220296	25 %	25 %	25 %	25 %	472332728
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600	NC_020833	TTCC	2	8	220553	220560	0 %	50 %	0 %	50 %	472332728
601	NC_020833	ACAG	2	8	221203	221210	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_020833	ACAA	2	8	221357	221364	75 %	0 %	0 %	25 %	472332730
603	NC_020833	ACAA	2	8	221641	221648	75 %	0 %	0 %	25 %	472332730
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605	NC_020833	TAAC	2	8	221895	221902	50 %	25 %	0 %	25 %	472332731
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607	NC_020833	AAGA	2	8	222212	222219	75 %	0 %	25 %	0 %	472332731
608	NC_020833	ATTT	2	8	222263	222270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020833	CAAT	2	8	222511	222518	50 %	25 %	0 %	25 %	472332732
610	NC_020833	CTGC	2	8	222742	222749	0 %	25 %	25 %	50 %	472332732
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618	NC_020833	CAGA	2	8	226212	226219	50 %	0 %	25 %	25 %	472332736
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620	NC_020833	TTAT	2	8	226646	226653	25 %	75 %	0 %	0 %	472332737
621	NC_020833	AAGT	2	8	227062	227069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020833	CTGT	2	8	227147	227154	0 %	50 %	25 %	25 %	472332738
623	NC_020833	CTTT	2	8	227210	227217	0 %	75 %	0 %	25 %	472332738
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