MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 2326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_019738	GGGAGT	2	12	6375836	6375847	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	428313513
2002	NC_019738	ATTTGG	2	12	6379935	6379946	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428313516
2003	NC_019738	CTTCAA	2	12	6381925	6381936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428313517
2004	NC_019738	GTTTTG	2	12	6392278	6392289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428313526
2005	NC_019738	CACTGC	2	12	6398940	6398951	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428313536
2006	NC_019738	GCGATC	2	12	6402794	6402805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313539
2007	NC_019738	CAATGC	2	12	6403369	6403380	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428313539
2008	NC_019738	ATGTCC	2	12	6413323	6413334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428313546
2009	NC_019738	AAATTG	2	12	6417034	6417045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428313550
2010	NC_019738	CACCAA	2	12	6419185	6419196	50 %	0 %	0 %	50 %	428313551
2011	NC_019738	ATGCTC	2	12	6424302	6424313	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428313556
2012	NC_019738	GCTCAA	2	12	6424628	6424639	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428313556
2013	NC_019738	TCTTGT	2	12	6425483	6425494	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428313557
2014	NC_019738	CATCGT	3	18	6425553	6425570	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428313557
2015	NC_019738	TGTCAT	2	12	6428752	6428763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428313562
2016	NC_019738	GGTACT	2	12	6428821	6428832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313562
2017	NC_019738	CCCCAG	2	12	6433966	6433977	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428313565
2018	NC_019738	GCTTTT	2	12	6436166	6436177	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428313566
2019	NC_019738	TGTGCT	2	12	6446497	6446508	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428313576
2020	NC_019738	GATCAG	2	12	6461953	6461964	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313589
2021	NC_019738	TCACCA	2	12	6467059	6467070	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428313594
2022	NC_019738	AATCAG	2	12	6467422	6467433	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313594
2023	NC_019738	ACCCGA	2	12	6467522	6467533	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428313594
2024	NC_019738	GCTTGA	2	12	6470165	6470176	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313596
2025	NC_019738	CCATGC	2	12	6474299	6474310	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428313600
2026	NC_019738	TGATTA	2	12	6479664	6479675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428313604
2027	NC_019738	GTTGAC	2	12	6485665	6485676	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313607
2028	NC_019738	TGATTT	2	12	6487774	6487785	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428313608
2029	NC_019738	AGATAA	2	12	6487939	6487950	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428313608
2030	NC_019738	CTATCG	2	12	6502109	6502120	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428313618
2031	NC_019738	ATCTGC	2	12	6506850	6506861	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428313620
2032	NC_019738	AGCTGA	2	12	6513503	6513514	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313623
2033	NC_019738	GGTTGA	2	12	6514542	6514553	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428313625
2034	NC_019738	ATCCAG	2	12	6514862	6514873	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428313625
2035	NC_019738	CCGTCC	2	12	6523342	6523353	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	428313629
2036	NC_019738	AGTAGC	2	12	6523618	6523629	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313629
2037	NC_019738	TCCCCA	2	12	6527263	6527274	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428313632
2038	NC_019738	CAAGAT	2	12	6528685	6528696	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313634
2039	NC_019738	GATATG	2	12	6530842	6530853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428313637
2040	NC_019738	AGCCTC	2	12	6531423	6531434	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428313637
2041	NC_019738	TTATAA	2	12	6534691	6534702	50 %	50 %	0 %	0 %	428313639
2042	NC_019738	GCTGAA	2	12	6535087	6535098	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313640
2043	NC_019738	GATGGG	2	12	6539333	6539344	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	428313644
2044	NC_019738	GGCGAT	2	12	6540654	6540665	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428313645
2045	NC_019738	ACTGAA	2	12	6544833	6544844	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313649
2046	NC_019738	TGGTAG	2	12	6548915	6548926	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428313652
2047	NC_019738	GCTTCT	2	12	6557225	6557236	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428313660
2048	NC_019738	ATTGCT	2	12	6557332	6557343	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428313660
2049	NC_019738	CGGAAT	2	12	6558904	6558915	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313662
2050	NC_019738	CGAAAA	2	12	6567070	6567081	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428313669
2051	NC_019738	AGGCAA	2	12	6569618	6569629	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428313672
2052	NC_019738	CTTAGT	2	12	6570153	6570164	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428313672
2053	NC_019738	TAGCGT	2	12	6570751	6570762	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313672
2054	NC_019738	TGCGCG	2	12	6574616	6574627	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	428313675
2055	NC_019738	TACCGA	2	12	6574713	6574724	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428313675
2056	NC_019738	GCATTA	2	12	6574732	6574743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428313675
2057	NC_019738	ACCTGC	2	12	6579858	6579869	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428313677
2058	NC_019738	TCAAAT	2	12	6584132	6584143	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428313680
2059	NC_019738	CGCGAT	2	12	6590915	6590926	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313686
2060	NC_019738	GTCAAG	2	12	6595548	6595559	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313690
2061	NC_019738	GTATTA	2	12	6595650	6595661	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428313690
2062	NC_019738	GTTTGT	2	12	6599781	6599792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428313694
2063	NC_019738	TGTGCA	2	12	6600492	6600503	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313694
2064	NC_019738	TCGTAA	2	12	6602411	6602422	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428313695
2065	NC_019738	TGGGCG	2	12	6608596	6608607	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428313704
2066	NC_019738	ATATAG	2	12	6608642	6608653	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428313704
2067	NC_019738	GCAATG	2	12	6612520	6612531	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313707
2068	NC_019738	GGTAGG	2	12	6613893	6613904	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	428313708
2069	NC_019738	AACATT	2	12	6616002	6616013	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428313711
2070	NC_019738	TGGGCT	2	12	6622297	6622308	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428313717
2071	NC_019738	CTAGAA	2	12	6625979	6625990	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313720
2072	NC_019738	AGAACG	2	12	6626359	6626370	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428313720
2073	NC_019738	GCTTGA	2	12	6626524	6626535	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313720
2074	NC_019738	CTGGGA	2	12	6628192	6628203	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428313720
2075	NC_019738	TGGGAT	2	12	6630069	6630080	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428313720
2076	NC_019738	TTTATC	2	12	6632895	6632906	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428313724
2077	NC_019738	TTTGTC	2	12	6632907	6632918	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428313724
2078	NC_019738	TCTCAT	2	12	6635624	6635635	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428313726
2079	NC_019738	GGATTA	2	12	6638855	6638866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428313727
2080	NC_019738	GACAAA	2	12	6656734	6656745	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428313738
2081	NC_019738	TAATCC	2	12	6660039	6660050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428313739
2082	NC_019738	GCGATC	2	12	6662825	6662836	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313741
2083	NC_019738	CTGCGG	2	12	6672860	6672871	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	428313751
2084	NC_019738	GATATT	2	12	6677122	6677133	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428313757
2085	NC_019738	GGCTTC	2	12	6677534	6677545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313757
2086	NC_019738	TTTGCC	2	12	6681335	6681346	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428313761
2087	NC_019738	CTAAGA	2	12	6684089	6684100	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313764
2088	NC_019738	TGGGGA	2	12	6684411	6684422	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	428313764
2089	NC_019738	ACAAGA	2	12	6688350	6688361	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428313768
2090	NC_019738	TCAAGC	2	12	6688822	6688833	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428313768
2091	NC_019738	ATCGAA	2	12	6690752	6690763	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313769
2092	NC_019738	GGGTCT	2	12	6691564	6691575	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428313769
2093	NC_019738	ATGTAG	2	12	6696120	6696131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428313775
2094	NC_019738	TCCGGT	2	12	6696330	6696341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313776
2095	NC_019738	CCAGAA	2	12	6704312	6704323	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428313779
2096	NC_019738	TTTATT	2	12	6706824	6706835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	428313781
2097	NC_019738	CACCAA	2	12	6707732	6707743	50 %	0 %	0 %	50 %	428313782
2098	NC_019738	AAGTGA	2	12	6711731	6711742	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428313785
2099	NC_019738	TAACTT	2	12	6713192	6713203	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428313787
2100	NC_019738	CCCCTA	2	12	6715997	6716008	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428313789
2101	NC_019738	ATCTTC	2	12	6726706	6726717	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428313800
2102	NC_019738	ACTGAC	2	12	6736458	6736469	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428313810
2103	NC_019738	ATCCGC	2	12	6742423	6742434	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428313814
2104	NC_019738	AAAGCC	2	12	6748834	6748845	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428313820
2105	NC_019738	ATGGGG	2	12	6749342	6749353	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	428313821
2106	NC_019738	CAGCAT	2	12	6755627	6755638	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428313827
2107	NC_019738	CGACAT	2	12	6758401	6758412	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428313830
2108	NC_019738	CCAAAT	2	12	6764875	6764886	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428313835
2109	NC_019738	AGTGCT	2	12	6780783	6780794	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313850
2110	NC_019738	TCAAAT	2	12	6786636	6786647	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428313854
2111	NC_019738	GGAGAG	2	12	6788497	6788508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428313856
2112	NC_019738	AAGTTC	2	12	6789614	6789625	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428313857
2113	NC_019738	GTTCAG	2	12	6794618	6794629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313862
2114	NC_019738	CAGTGC	2	12	6799128	6799139	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313865
2115	NC_019738	TAAGGG	2	12	6804793	6804804	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428313868
2116	NC_019738	AGCCTT	2	12	6807352	6807363	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428313869
2117	NC_019738	GCTGTG	2	12	6817359	6817370	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428313879
2118	NC_019738	AACTCA	2	12	6822387	6822398	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428313883
2119	NC_019738	TGCCTG	4	24	6824581	6824604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313885
2120	NC_019738	GTGCCT	3	18	6824622	6824639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313885
2121	NC_019738	TGCCTG	2	12	6824782	6824793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313885
2122	NC_019738	CCTGTG	2	12	6824841	6824852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313885
2123	NC_019738	TGCCTG	2	12	6824941	6824952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313885
2124	NC_019738	GTGCCC	2	12	6824958	6824969	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	428313885
2125	NC_019738	TGCCCG	2	12	6825004	6825015	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	428313885
2126	NC_019738	CGTGAT	2	12	6827869	6827880	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313886
2127	NC_019738	GATTCG	2	12	6833390	6833401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313889
2128	NC_019738	GCGTCG	2	12	6835384	6835395	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	428313890
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2130	NC_019738	CTAGAA	2	12	6851403	6851414	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313906
2131	NC_019738	GACTCC	2	12	6856841	6856852	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428313907
2132	NC_019738	CTGAAC	2	12	6859328	6859339	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428313908
2133	NC_019738	TAAATT	2	12	6863444	6863455	50 %	50 %	0 %	0 %	428313912
2134	NC_019738	TTGCAG	2	12	6864421	6864432	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313913
2135	NC_019738	GACGAT	2	12	6874398	6874409	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313919
2136	NC_019738	CGAGAA	2	12	6875890	6875901	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428313920
2137	NC_019738	AACCCT	2	12	6881234	6881245	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428313924
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2140	NC_019738	CACGAA	2	12	6897826	6897837	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428313932
2141	NC_019738	AGATGC	2	12	6905079	6905090	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313937
2142	NC_019738	AATGAG	2	12	6906516	6906527	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428313939
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2144	NC_019738	TAGTCG	2	12	6909846	6909857	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313943
2145	NC_019738	CACCGA	2	12	6911093	6911104	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428313945
2146	NC_019738	TCAGAA	2	12	6914510	6914521	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313948
2147	NC_019738	AAATTT	2	12	6917033	6917044	50 %	50 %	0 %	0 %	428313951
2148	NC_019738	CTGTAA	2	12	6918678	6918689	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428313953
2149	NC_019738	AGTGCT	2	12	6919411	6919422	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313953
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2152	NC_019738	TTTACG	2	12	6928146	6928157	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428313960
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2155	NC_019738	AGTCGC	2	12	6947356	6947367	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313981
2156	NC_019738	TTCTGG	2	12	6947645	6947656	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428313981
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2184	NC_019738	AACCTG	2	12	7031077	7031088	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428314032
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2198	NC_019738	GCCGGT	2	12	7092773	7092784	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	428314093
2199	NC_019738	GCTTGC	2	12	7094269	7094280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314095
2200	NC_019738	CTAAAT	2	12	7096235	7096246	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428314096
2201	NC_019738	GGGGGC	2	12	7102709	7102720	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	428314103
2202	NC_019738	TATTGT	2	12	7111596	7111607	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428314114
2203	NC_019738	AACAGC	2	12	7111691	7111702	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428314114
2204	NC_019738	GGCATT	2	12	7113049	7113060	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428314114
2205	NC_019738	ATCACT	2	12	7116294	7116305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314116
2206	NC_019738	GCCTGT	2	12	7117475	7117486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314117
2207	NC_019738	GGGCTT	2	12	7117931	7117942	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428314118
2208	NC_019738	ACTGCC	2	12	7119179	7119190	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428314118
2209	NC_019738	GAGGTA	2	12	7119607	7119618	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428314118
2210	NC_019738	AGGTAT	2	12	7125375	7125386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314123
2211	NC_019738	ACTACA	2	12	7129551	7129562	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428314126
2212	NC_019738	GGGTTA	2	12	7129762	7129773	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428314126
2213	NC_019738	GTCCAT	2	12	7130756	7130767	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428314127
2214	NC_019738	GGACGA	2	12	7134446	7134457	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428314130
2215	NC_019738	AGCAAA	2	12	7136870	7136881	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428314132
2216	NC_019738	CACCCA	2	12	7141652	7141663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314138
2217	NC_019738	CAGATT	2	12	7145901	7145912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428314142
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2320	NC_019738	TTTCGT	2	12	7430944	7430955	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428314380
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2322	NC_019738	GTCCCA	2	12	7447421	7447432	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428314392
2323	NC_019738	TCTTCC	2	12	7451678	7451689	0 %	50 %	0 %	50 %	428314394
2324	NC_019738	TTTATT	2	12	7454826	7454837	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	428314396
2325	NC_019738	ACCCGC	2	12	7457301	7457312	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428314399
2326	NC_019738	GATGAC	2	12	7460332	7460343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428314400

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