MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 2326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019738	CATGAA	2	12	1608254	1608265	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428309709
502	NC_019738	CACCCG	2	12	1612671	1612682	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428309711
503	NC_019738	GTCCCC	2	12	1615306	1615317	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	428309715
504	NC_019738	TGAGAT	2	12	1620908	1620919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428309719
505	NC_019738	CACCAA	2	12	1621815	1621826	50 %	0 %	0 %	50 %	428309720
506	NC_019738	ACCTCA	2	12	1625201	1625212	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428309722
507	NC_019738	TGATTT	2	12	1631952	1631963	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428309728
508	NC_019738	ACTGTT	2	12	1647475	1647486	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428309739
509	NC_019738	AATCAG	2	12	1649022	1649033	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428309741
510	NC_019738	TACGAT	2	12	1652946	1652957	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428309745
511	NC_019738	GCTCTT	2	12	1655001	1655012	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428309746
512	NC_019738	CAATGG	2	12	1656958	1656969	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428309749
513	NC_019738	CATTCG	2	12	1667597	1667608	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428309757
514	NC_019738	GGGTTT	2	12	1668887	1668898	0 %	50 %	50 %	0 %	428309757
515	NC_019738	GGGTTT	2	12	1674048	1674059	0 %	50 %	50 %	0 %	428309760
516	NC_019738	GGTAAG	2	12	1675906	1675917	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428309761
517	NC_019738	GAGTGG	2	12	1676385	1676396	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	428309761
518	NC_019738	GTTGAA	2	12	1679504	1679515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428309763
519	NC_019738	CTGAGG	2	12	1682833	1682844	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428309766
520	NC_019738	GGTGCG	2	12	1685590	1685601	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428309768
521	NC_019738	TTGGCG	2	12	1688418	1688429	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428309769
522	NC_019738	TCAACC	2	12	1693893	1693904	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428309776
523	NC_019738	AAGGCA	2	12	1698060	1698071	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428309781
524	NC_019738	TTCCGC	2	12	1709398	1709409	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428309786
525	NC_019738	TTTAGG	2	12	1710531	1710542	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428309787
526	NC_019738	GAAATT	2	12	1715255	1715266	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428309788
527	NC_019738	GCACCC	2	12	1715288	1715299	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428309788
528	NC_019738	CTAATT	2	12	1719203	1719214	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428309789
529	NC_019738	ACATCA	2	12	1720718	1720729	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428309790
530	NC_019738	CGATGT	2	12	1720935	1720946	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428309790
531	NC_019738	ACCATC	2	12	1721884	1721895	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428309790
532	NC_019738	GGTAAC	2	12	1722226	1722237	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428309790
533	NC_019738	CGCTTG	2	12	1722298	1722309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428309790
534	NC_019738	AGCAAC	2	12	1726044	1726055	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428309792
535	NC_019738	GGAAAG	2	12	1732265	1732276	50 %	0 %	50 %	0 %	428309796
536	NC_019738	TTGGGT	2	12	1733506	1733517	0 %	50 %	50 %	0 %	428309799
537	NC_019738	AACCGG	2	12	1735673	1735684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428309801
538	NC_019738	CGATGC	2	12	1738393	1738404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428309804
539	NC_019738	TGGCGA	2	12	1740382	1740393	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428309808
540	NC_019738	TCGCCG	2	12	1740994	1741005	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	428309808
541	NC_019738	CCAACA	2	12	1747387	1747398	50 %	0 %	0 %	50 %	428309811
542	NC_019738	CCAACA	2	12	1747576	1747587	50 %	0 %	0 %	50 %	428309811
543	NC_019738	CCAACA	2	12	1747603	1747614	50 %	0 %	0 %	50 %	428309811
544	NC_019738	CCAACA	2	12	1747630	1747641	50 %	0 %	0 %	50 %	428309811
545	NC_019738	CCAACA	2	12	1747657	1747668	50 %	0 %	0 %	50 %	428309811
546	NC_019738	CCAACA	2	12	1747711	1747722	50 %	0 %	0 %	50 %	428309811
547	NC_019738	CAGCAT	2	12	1770141	1770152	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428309829
548	NC_019738	GGAAGA	2	12	1774994	1775005	50 %	0 %	50 %	0 %	428309833
549	NC_019738	GTTCGC	2	12	1776863	1776874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428309835
550	NC_019738	GGTGCA	2	12	1777562	1777573	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428309835
551	NC_019738	TAGAAG	2	12	1779890	1779901	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428309838
552	NC_019738	GTTGCA	2	12	1782227	1782238	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428309839
553	NC_019738	CCCCGA	2	12	1782407	1782418	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428309839
554	NC_019738	TGGCAA	2	12	1786396	1786407	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428309840
555	NC_019738	ACTATG	2	12	1792780	1792791	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428309847
556	NC_019738	GTCAAA	2	12	1795143	1795154	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428309851
557	NC_019738	TCGATC	2	12	1796874	1796885	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428309852
558	NC_019738	GATTCT	2	12	1799107	1799118	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428309853
559	NC_019738	AACTGT	2	12	1804606	1804617	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428309857
560	NC_019738	TATGGA	2	12	1805461	1805472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428309858
561	NC_019738	GATGGA	2	12	1811900	1811911	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428309863
562	NC_019738	TCCTCA	2	12	1814349	1814360	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428309865
563	NC_019738	TAGTGG	2	12	1820695	1820706	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428309869
564	NC_019738	TGATTA	2	12	1821382	1821393	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428309870
565	NC_019738	TTTGTC	2	12	1822552	1822563	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428309872
566	NC_019738	AATGGC	2	12	1825454	1825465	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428309874
567	NC_019738	GTTGGG	2	12	1828330	1828341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428309875
568	NC_019738	GTGGTA	2	12	1830505	1830516	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428309875
569	NC_019738	AGGGCG	2	12	1831540	1831551	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	428309875
570	NC_019738	AATTTG	2	12	1834737	1834748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428309878
571	NC_019738	TTTCTA	2	12	1840541	1840552	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428309882
572	NC_019738	CCACTT	2	12	1841762	1841773	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428309882
573	NC_019738	CAATGC	2	12	1844723	1844734	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428309884
574	NC_019738	ACTTCA	2	12	1848597	1848608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428309886
575	NC_019738	ACGTCT	2	12	1853319	1853330	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428309888
576	NC_019738	ATCAAA	2	12	1855277	1855288	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428309890
577	NC_019738	ACCCGA	2	12	1870652	1870663	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428309907
578	NC_019738	TGAATC	2	12	1875586	1875597	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428309914
579	NC_019738	CCTCAT	2	12	1876074	1876085	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428309914
580	NC_019738	TAAGAG	2	12	1876462	1876473	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428309914
581	NC_019738	GCACTG	2	12	1877456	1877467	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428309916
582	NC_019738	TGCACT	2	12	1877833	1877844	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428309916
583	NC_019738	GCGTTG	2	12	1880029	1880040	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428309917
584	NC_019738	CCGAAC	2	12	1893393	1893404	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428309930
585	NC_019738	AGCCGT	2	12	1899421	1899432	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428309935
586	NC_019738	TTGTAA	2	12	1903742	1903753	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428309937
587	NC_019738	GAGGGC	2	12	1907433	1907444	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	428309939
588	NC_019738	TGTAGA	2	12	1912573	1912584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428309944
589	NC_019738	TACATT	2	12	1913255	1913266	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428309946
590	NC_019738	CAAGGT	2	12	1923085	1923096	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428309954
591	NC_019738	TTTAAT	2	12	1925493	1925504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428309956
592	NC_019738	CCGCAA	2	12	1926030	1926041	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428309956
593	NC_019738	GTCCTT	2	12	1927347	1927358	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428309958
594	NC_019738	ACCGAC	2	12	1931558	1931569	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428309961
595	NC_019738	GTTTAT	2	12	1933116	1933127	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428309963
596	NC_019738	AGCTTC	2	12	1935933	1935944	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428309965
597	NC_019738	AATGCC	2	12	1946573	1946584	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428309976
598	NC_019738	CATCTC	2	12	1947928	1947939	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428309977
599	NC_019738	ACTCTG	2	12	1948177	1948188	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428309978
600	NC_019738	TCTTTT	2	12	1950006	1950017	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428309980
601	NC_019738	CATCGG	2	12	1956529	1956540	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428309986
602	NC_019738	TCAAAC	2	12	1965234	1965245	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428309996
603	NC_019738	TATGGT	2	12	1971016	1971027	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428310002
604	NC_019738	GATTGA	2	12	1972437	1972448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428310003
605	NC_019738	CCTGCA	2	12	1975698	1975709	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428310005
606	NC_019738	ATGACA	2	12	1982184	1982195	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428310013
607	NC_019738	AAGCAG	2	12	1989874	1989885	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428310018
608	NC_019738	TGGGTG	2	12	1996922	1996933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428310025
609	NC_019738	CAATAA	2	12	2000984	2000995	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428310030
610	NC_019738	TCTTTA	2	12	2001340	2001351	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428310031
611	NC_019738	TGTCTT	2	12	2007679	2007690	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428310034
612	NC_019738	ATGAAG	2	12	2009609	2009620	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428310034
613	NC_019738	TGTTTA	2	12	2010577	2010588	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428310034
614	NC_019738	GTTCCG	2	12	2010748	2010759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428310034
615	NC_019738	AATCTG	2	12	2011854	2011865	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428310035
616	NC_019738	TCAGTT	2	12	2012053	2012064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428310035
617	NC_019738	TGAACC	2	12	2013833	2013844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428310036
618	NC_019738	GTACTT	2	12	2015334	2015345	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428310036
619	NC_019738	CTCTGC	2	12	2018196	2018207	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428310037
620	NC_019738	GGCGAT	2	12	2020787	2020798	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428310037
621	NC_019738	AGTTGT	2	12	2021326	2021337	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428310037
622	NC_019738	GGCATC	2	12	2022780	2022791	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428310037
623	NC_019738	TTGACA	2	12	2026456	2026467	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428310039
624	NC_019738	AAAACC	2	12	2026641	2026652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428310039
625	NC_019738	AACACT	2	12	2032801	2032812	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428310042
626	NC_019738	AAGGTT	2	12	2035664	2035675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428310043
627	NC_019738	CCAACT	2	12	2039868	2039879	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428310045
628	NC_019738	TGAGAT	2	12	2043441	2043452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428310049
629	NC_019738	CCTGAG	2	12	2044186	2044197	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428310050
630	NC_019738	GAATTG	2	12	2045676	2045687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428310050
631	NC_019738	AATGAT	2	12	2047063	2047074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428310051
632	NC_019738	GATTGC	2	12	2051170	2051181	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428310053
633	NC_019738	ATAGCT	2	12	2053385	2053396	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428310056
634	NC_019738	TTGATT	2	12	2056013	2056024	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428310056
635	NC_019738	AGCTTT	2	12	2056143	2056154	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428310056
636	NC_019738	CAAATC	2	12	2059461	2059472	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428310061
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638	NC_019738	GCTGAA	2	12	2065568	2065579	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428310062
639	NC_019738	AGTTGG	2	12	2067763	2067774	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428310064
640	NC_019738	ATTAAA	2	12	2069901	2069912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428310064
641	NC_019738	GACGGG	2	12	2073943	2073954	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	428310068
642	NC_019738	TGTCAA	2	12	2076813	2076824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428310070
643	NC_019738	CAATCC	2	12	2083405	2083416	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428310074
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645	NC_019738	GCAGGA	2	12	2106385	2106396	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428310092
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650	NC_019738	AGATTG	2	12	2118995	2119006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428310105
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660	NC_019738	CATAGT	2	12	2143160	2143171	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428310124
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662	NC_019738	AGTTGA	2	12	2153901	2153912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428310133
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692	NC_019738	TTGTGG	2	12	2224774	2224785	0 %	50 %	50 %	0 %	428310184
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708	NC_019738	CATCGG	2	12	2275625	2275636	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428310222
709	NC_019738	ACCACA	2	12	2282040	2282051	50 %	0 %	0 %	50 %	428310225
710	NC_019738	GTTCTT	2	12	2284606	2284617	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428310227
711	NC_019738	CAGTGC	2	12	2285801	2285812	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428310229
712	NC_019738	CTTGCT	2	12	2288729	2288740	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428310232
713	NC_019738	TCATGA	2	12	2297018	2297029	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428310238
714	NC_019738	TCCATA	2	12	2299840	2299851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428310240
715	NC_019738	CTAAAA	2	12	2307138	2307149	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428310249
716	NC_019738	CCCAAT	2	12	2311163	2311174	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428310251
717	NC_019738	GGCTTT	2	12	2312757	2312768	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428310253
718	NC_019738	CAACTA	2	12	2314207	2314218	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428310254
719	NC_019738	CGTGTG	2	12	2315405	2315416	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428310255
720	NC_019738	TCCTAC	2	12	2328508	2328519	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428310271
721	NC_019738	CAAAGC	2	12	2333083	2333094	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428310276
722	NC_019738	TAGATG	2	12	2336013	2336024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428310279
723	NC_019738	CTCGGA	2	12	2337246	2337257	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428310279
724	NC_019738	TTGATT	2	12	2338933	2338944	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428310280
725	NC_019738	TGTGGT	2	12	2340568	2340579	0 %	50 %	50 %	0 %	428310281
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733	NC_019738	ATCAGC	2	12	2356174	2356185	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428310293
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744	NC_019738	ATTCCA	2	12	2392785	2392796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428310334
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750	NC_019738	CACCAA	4	24	2414604	2414627	50 %	0 %	0 %	50 %	428310359
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753	NC_019738	CCAACT	3	18	2414732	2414749	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428310359
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832	NC_019738	AACTCT	2	12	2689412	2689423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428310580
833	NC_019738	AGGAAT	2	12	2693461	2693472	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428310583
834	NC_019738	GACTTG	2	12	2693645	2693656	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428310583
835	NC_019738	GCTCGT	2	12	2696624	2696635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428310584
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