MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 2326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019738	TTCTGC	2	12	4842378	4842389	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428312272
1502	NC_019738	CCAAAG	2	12	4843193	4843204	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428312273
1503	NC_019738	CAGAAG	2	12	4843831	4843842	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428312273
1504	NC_019738	TCGGCA	2	12	4845514	4845525	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428312276
1505	NC_019738	CAATGC	2	12	4847341	4847352	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428312277
1506	NC_019738	ACCTCC	2	12	4847400	4847411	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428312277
1507	NC_019738	AAAATC	2	12	4848453	4848464	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428312277
1508	NC_019738	ATCCCA	2	12	4849331	4849342	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428312277
1509	NC_019738	CTTTAT	2	12	4850293	4850304	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428312278
1510	NC_019738	CGTCAT	2	12	4851401	4851412	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428312279
1511	NC_019738	CACAAT	2	12	4852127	4852138	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428312279
1512	NC_019738	CAGCGC	2	12	4860146	4860157	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	428312284
1513	NC_019738	CTAATT	2	12	4863334	4863345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428312288
1514	NC_019738	CAAATC	2	12	4865060	4865071	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428312289
1515	NC_019738	CGAACG	2	12	4868269	4868280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428312291
1516	NC_019738	GTGATT	2	12	4870689	4870700	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428312293
1517	NC_019738	TAAAGG	2	12	4871453	4871464	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428312293
1518	NC_019738	CTAGTT	2	12	4872877	4872888	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428312294
1519	NC_019738	CGAGAA	2	12	4874369	4874380	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428312296
1520	NC_019738	GGGTGC	2	12	4883330	4883341	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428312305
1521	NC_019738	CAAATA	2	12	4884136	4884147	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428312306
1522	NC_019738	ATTCCA	2	12	4890824	4890835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428312309
1523	NC_019738	GGCGTT	2	12	4894604	4894615	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428312311
1524	NC_019738	TCTTTC	2	12	4898285	4898296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428312313
1525	NC_019738	CTTTCA	2	12	4900039	4900050	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428312314
1526	NC_019738	CGGTTC	2	12	4902713	4902724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428312315
1527	NC_019738	TGGGGC	2	12	4903274	4903285	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428312315
1528	NC_019738	ATGCCA	2	12	4910945	4910956	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428312320
1529	NC_019738	GAGGAT	2	12	4915860	4915871	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428312326
1530	NC_019738	TAGTTC	2	12	4916069	4916080	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428312326
1531	NC_019738	TGGAAG	2	12	4917476	4917487	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428312327
1532	NC_019738	ATCTAA	2	12	4926452	4926463	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428312335
1533	NC_019738	GTCTGT	2	12	4928600	4928611	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428312336
1534	NC_019738	CAACCC	2	12	4929419	4929430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428312338
1535	NC_019738	TGAATG	2	12	4933242	4933253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428312342
1536	NC_019738	CATCTC	2	12	4933409	4933420	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428312342
1537	NC_019738	TGATAT	2	12	4944808	4944819	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428312353
1538	NC_019738	ATTGAT	2	12	4944893	4944904	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428312353
1539	NC_019738	GCGATC	2	12	4950113	4950124	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428312355
1540	NC_019738	CTTCAA	2	12	4952517	4952528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428312358
1541	NC_019738	TGGTCA	2	12	4953532	4953543	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428312359
1542	NC_019738	CGTAAA	2	12	4954439	4954450	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428312360
1543	NC_019738	CGTCAT	2	12	4957096	4957107	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428312363
1544	NC_019738	CCACGG	2	12	4959760	4959771	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	428312364
1545	NC_019738	TCAACC	2	12	4966806	4966817	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428312366
1546	NC_019738	AAAAAT	2	12	4966857	4966868	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	428312366
1547	NC_019738	ATACGA	2	12	4972750	4972761	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428312372
1548	NC_019738	GACACC	2	12	4973533	4973544	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428312373
1549	NC_019738	CCCTAC	2	12	4982974	4982985	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428312380
1550	NC_019738	CAATTC	2	12	4983268	4983279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428312380
1551	NC_019738	GATTTA	2	12	4984233	4984244	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428312380
1552	NC_019738	AGAAAA	2	12	4996309	4996320	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428312394
1553	NC_019738	GCTACA	2	12	5001056	5001067	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428312399
1554	NC_019738	ATTGAG	2	12	5004105	5004116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428312401
1555	NC_019738	TAACCG	2	12	5007649	5007660	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428312405
1556	NC_019738	GACCGA	2	12	5015008	5015019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428312410
1557	NC_019738	AAGCGG	2	12	5015367	5015378	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428312410
1558	NC_019738	AATACC	2	12	5016341	5016352	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428312412
1559	NC_019738	GTCATG	5	30	5020835	5020864	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428312413
1560	NC_019738	CCCTTA	2	12	5025836	5025847	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428312418
1561	NC_019738	CGATTC	2	12	5031331	5031342	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428312420
1562	NC_019738	CACCGG	2	12	5032126	5032137	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	428312420
1563	NC_019738	AAGCCG	2	12	5034042	5034053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428312420
1564	NC_019738	TGGAGT	2	12	5040915	5040926	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428312426
1565	NC_019738	CTGGGA	2	12	5044963	5044974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428312428
1566	NC_019738	AGCACG	2	12	5048577	5048588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428312432
1567	NC_019738	CGGTTG	2	12	5049743	5049754	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428312434
1568	NC_019738	AAATTC	2	12	5061703	5061714	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428312444
1569	NC_019738	CCTCGC	2	12	5063369	5063380	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	428312446
1570	NC_019738	CAAGGT	2	12	5063727	5063738	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428312446
1571	NC_019738	AGCCAA	2	12	5066863	5066874	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428312449
1572	NC_019738	TCCAGT	2	12	5072106	5072117	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428312451
1573	NC_019738	AAGATG	2	12	5072200	5072211	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428312451
1574	NC_019738	CTACGG	2	12	5087656	5087667	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428312461
1575	NC_019738	CGATGG	2	12	5088071	5088082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428312462
1576	NC_019738	AGTGAA	2	12	5089970	5089981	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428312463
1577	NC_019738	CTACAC	2	12	5092741	5092752	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428312463
1578	NC_019738	CAAAGG	2	12	5092764	5092775	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428312463
1579	NC_019738	TTGCCA	2	12	5099592	5099603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428312468
1580	NC_019738	TTGAGT	2	12	5099716	5099727	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428312468
1581	NC_019738	CAGATT	2	12	5100901	5100912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428312468
1582	NC_019738	ACCCAT	3	18	5101291	5101308	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428312468
1583	NC_019738	CTCATT	2	12	5101441	5101452	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428312468
1584	NC_019738	AGAGAT	2	12	5104773	5104784	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428312470
1585	NC_019738	TGTTAA	2	12	5105026	5105037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428312470
1586	NC_019738	GCAAGC	2	12	5106824	5106835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428312471
1587	NC_019738	CAATCA	2	12	5107930	5107941	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428312472
1588	NC_019738	TCTGGC	2	12	5110194	5110205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428312475
1589	NC_019738	AACAGC	2	12	5113953	5113964	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428312479
1590	NC_019738	GGCGGG	2	12	5114620	5114631	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	428312480
1591	NC_019738	ATACCG	2	12	5122517	5122528	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428312486
1592	NC_019738	TTGATG	2	12	5126254	5126265	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428312486
1593	NC_019738	CAGTCT	2	12	5126652	5126663	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428312486
1594	NC_019738	GATCCA	2	12	5131645	5131656	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428312492
1595	NC_019738	GGGTTA	2	12	5136901	5136912	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428312493
1596	NC_019738	CTTTGT	2	12	5151054	5151065	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428312508
1597	NC_019738	TTTTGA	2	12	5152385	5152396	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428312509
1598	NC_019738	CTGGAA	2	12	5152734	5152745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428312509
1599	NC_019738	TGGCAA	2	12	5156263	5156274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428312512
1600	NC_019738	GCTTTG	2	12	5157074	5157085	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428312515
1601	NC_019738	AGCGGC	2	12	5160753	5160764	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	428312521
1602	NC_019738	CATTGG	2	12	5165251	5165262	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428312527
1603	NC_019738	CTTTTT	2	12	5165756	5165767	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428312529
1604	NC_019738	CGGCGT	2	12	5165970	5165981	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	428312529
1605	NC_019738	TTTTGC	2	12	5166786	5166797	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428312529
1606	NC_019738	TGGCGG	2	12	5166814	5166825	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428312529
1607	NC_019738	GCCACA	2	12	5167543	5167554	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428312530
1608	NC_019738	GCGATC	2	12	5167885	5167896	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428312530
1609	NC_019738	CGCCGA	2	12	5174667	5174678	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	428312538
1610	NC_019738	ATCAGA	3	18	5174939	5174956	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428312538
1611	NC_019738	AACCAA	2	12	5176806	5176817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428312538
1612	NC_019738	TACGCC	2	12	5190327	5190338	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428312546
1613	NC_019738	ATTAAA	2	12	5193455	5193466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428312550
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1707	NC_019738	TGCAGT	2	12	5525350	5525361	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428312830
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1709	NC_019738	TTACCG	2	12	5527568	5527579	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428312832
1710	NC_019738	CCTGAT	2	12	5535776	5535787	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428312842
1711	NC_019738	GATTGA	2	12	5538297	5538308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428312845
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1713	NC_019738	TGGCAA	2	12	5539041	5539052	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428312846
1714	NC_019738	ATCCTG	2	12	5541161	5541172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428312850
1715	NC_019738	GTTCCC	2	12	5547952	5547963	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428312858
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1717	NC_019738	ATGTAG	2	12	5562936	5562947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428312870
1718	NC_019738	CGGAAC	2	12	5564529	5564540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428312870
1719	NC_019738	GGGTTT	2	12	5570174	5570185	0 %	50 %	50 %	0 %	428312873
1720	NC_019738	GAACCG	2	12	5573134	5573145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428312875
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1722	NC_019738	GTTGAA	2	12	5576684	5576695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428312878
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1724	NC_019738	TTCCTC	2	12	5583829	5583840	0 %	50 %	0 %	50 %	428312885
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1781	NC_019738	ACCGTC	2	12	5736812	5736823	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428312993
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1795	NC_019738	CGTCAG	2	12	5760046	5760057	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313013
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1798	NC_019738	CGTCAG	2	12	5760856	5760867	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313013
1799	NC_019738	CGTCAG	2	12	5761108	5761119	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313013
1800	NC_019738	GATGCT	2	12	5768163	5768174	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313024
1801	NC_019738	GCGATC	2	12	5778152	5778163	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313032
1802	NC_019738	TTAGAA	2	12	5779204	5779215	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428313035
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1804	NC_019738	AGAACA	2	12	5779359	5779370	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428313035
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1806	NC_019738	GGCAGG	2	12	5788686	5788697	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	428313041
1807	NC_019738	TTCATG	2	12	5789063	5789074	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428313042
1808	NC_019738	TAGCGA	2	12	5789161	5789172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313042
1809	NC_019738	TGAGGT	2	12	5789287	5789298	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428313042
1810	NC_019738	TGGAAC	2	12	5804779	5804790	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313057
1811	NC_019738	TATGGG	2	12	5808726	5808737	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428313061
1812	NC_019738	CTAGCA	2	12	5810322	5810333	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428313062
1813	NC_019738	ATTCAA	2	12	5810379	5810390	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428313062
1814	NC_019738	TAGCCC	2	12	5821013	5821024	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428313069
1815	NC_019738	TAATCC	2	12	5822776	5822787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428313071
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1817	NC_019738	TTCTTG	2	12	5829816	5829827	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428313072
1818	NC_019738	GTCGCT	2	12	5834816	5834827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313076
1819	NC_019738	CCTTTG	2	12	5839591	5839602	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428313080
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1821	NC_019738	ATCGCG	2	12	5841859	5841870	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313081
1822	NC_019738	GGTTTT	2	12	5842885	5842896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428313082
1823	NC_019738	ACGGCT	2	12	5842974	5842985	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313082
1824	NC_019738	TGCGGT	2	12	5845619	5845630	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428313084
1825	NC_019738	TTGGTT	2	12	5849100	5849111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428313088
1826	NC_019738	ATCGCG	2	12	5852469	5852480	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313090
1827	NC_019738	AAATCG	2	12	5852993	5853004	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313090
1828	NC_019738	GCAACC	2	12	5862590	5862601	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428313097
1829	NC_019738	ATGACA	2	12	5867001	5867012	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313102
1830	NC_019738	CAAAAT	2	12	5869150	5869161	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428313104
1831	NC_019738	TTGAGT	2	12	5869650	5869661	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428313105
1832	NC_019738	TTGCTC	2	12	5869915	5869926	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428313106
1833	NC_019738	GCATTG	2	12	5870106	5870117	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313106
1834	NC_019738	GACATG	2	12	5871655	5871666	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313109
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1839	NC_019738	TGGCAT	2	12	5883461	5883472	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313124
1840	NC_019738	GTAGAT	2	12	5883725	5883736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428313124
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1842	NC_019738	GGACTG	2	12	5895913	5895924	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428313132
1843	NC_019738	AGTGCG	2	12	5896963	5896974	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428313133
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1859	NC_019738	GGCTTC	2	12	5946910	5946921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313163
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1886	NC_019738	AGTTCC	2	12	6058688	6058699	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428313244
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1890	NC_019738	CTGTCG	2	12	6075941	6075952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313263
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1895	NC_019738	TTGAGG	2	12	6094839	6094850	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428313282
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1906	NC_019738	AATCGA	2	12	6119539	6119550	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313301
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1910	NC_019738	AAGCCG	2	12	6129772	6129783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428313310
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1919	NC_019738	ACTTTT	2	12	6152297	6152308	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428313327
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1921	NC_019738	TCACAC	3	18	6155482	6155499	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428313330
1922	NC_019738	CTAGTT	2	12	6156793	6156804	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428313331
1923	NC_019738	TTGGCG	2	12	6157708	6157719	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428313332
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1925	NC_019738	CATCAA	2	12	6160656	6160667	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428313334
1926	NC_019738	GAGCAA	2	12	6168567	6168578	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428313341
1927	NC_019738	CTGTCA	2	12	6170482	6170493	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428313342
1928	NC_019738	CCGTTG	2	12	6171470	6171481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313343
1929	NC_019738	TCGGAA	2	12	6172921	6172932	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313345
1930	NC_019738	TATCGA	2	12	6175678	6175689	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428313346
1931	NC_019738	TGTTAA	2	12	6178397	6178408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428313347
1932	NC_019738	TCTGAA	2	12	6179503	6179514	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428313348
1933	NC_019738	CATTAC	2	12	6182389	6182400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428313351
1934	NC_019738	CATTGC	2	12	6183478	6183489	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428313351
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2000	NC_019738	AGTAGC	2	12	6375163	6375174	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313512

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