MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Actinobacillus suis H91-0380 chromosome

Total Repeats: 1811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018690	GGTGT	2	10	2090	2099	0 %	40 %	60 %	0 %	407691596
2	NC_018690	ACTGA	2	10	6338	6347	40 %	20 %	20 %	20 %	407691600
3	NC_018690	TTTAA	2	10	7291	7300	40 %	60 %	0 %	0 %	407691601
4	NC_018690	TGGTG	2	10	8804	8813	0 %	40 %	60 %	0 %	407691602
5	NC_018690	AAAGT	2	10	11570	11579	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018690	TACGA	2	10	12511	12520	40 %	20 %	20 %	20 %	407691606
7	NC_018690	CATTG	2	10	13021	13030	20 %	40 %	20 %	20 %	407691606
8	NC_018690	TTGTT	2	10	20553	20562	0 %	80 %	20 %	0 %	407691615
9	NC_018690	ATGAA	2	10	20691	20700	60 %	20 %	20 %	0 %	407691616
10	NC_018690	CCATT	2	10	21772	21781	20 %	40 %	0 %	40 %	407691617
11	NC_018690	CGCTT	2	10	22883	22892	0 %	40 %	20 %	40 %	407691619
12	NC_018690	AATAA	2	10	24889	24898	80 %	20 %	0 %	0 %	407691620
13	NC_018690	TAAAA	2	10	25394	25403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018690	TTTGC	2	10	25549	25558	0 %	60 %	20 %	20 %	407691621
15	NC_018690	GAATT	2	10	26350	26359	40 %	40 %	20 %	0 %	407691622
16	NC_018690	AAAGT	2	10	27112	27121	60 %	20 %	20 %	0 %	407691623
17	NC_018690	TTTGA	2	10	27297	27306	20 %	60 %	20 %	0 %	407691623
18	NC_018690	AAACT	2	10	30695	30704	60 %	20 %	0 %	20 %	407691626
19	NC_018690	TGGGC	2	10	31121	31130	0 %	20 %	60 %	20 %	407691626
20	NC_018690	AAATT	2	10	34941	34950	60 %	40 %	0 %	0 %	407691630
21	NC_018690	GTAAA	2	10	35765	35774	60 %	20 %	20 %	0 %	407691631
22	NC_018690	ACAGC	2	10	35790	35799	40 %	0 %	20 %	40 %	407691631
23	NC_018690	TTCTT	2	10	36179	36188	0 %	80 %	0 %	20 %	407691632
24	NC_018690	AAGCG	2	10	38079	38088	40 %	0 %	40 %	20 %	407691633
25	NC_018690	ACGGT	2	10	38112	38121	20 %	20 %	40 %	20 %	407691633
26	NC_018690	ATCGT	2	10	38931	38940	20 %	40 %	20 %	20 %	407691633
27	NC_018690	CGGTT	2	10	39139	39148	0 %	40 %	40 %	20 %	407691633
28	NC_018690	AATAC	2	10	42645	42654	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_018690	AACTA	2	10	43670	43679	60 %	20 %	0 %	20 %	407691636
30	NC_018690	TAGAA	2	10	43908	43917	60 %	20 %	20 %	0 %	407691637
31	NC_018690	TTAAT	2	10	48563	48572	40 %	60 %	0 %	0 %	407691643
32	NC_018690	AAAAT	2	10	49776	49785	80 %	20 %	0 %	0 %	407691644
33	NC_018690	AAAAG	2	10	50702	50711	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018690	CTTTA	2	10	50891	50900	20 %	60 %	0 %	20 %	407691645
35	NC_018690	TATCG	2	10	51192	51201	20 %	40 %	20 %	20 %	407691645
36	NC_018690	GCAAT	2	10	51822	51831	40 %	20 %	20 %	20 %	407691645
37	NC_018690	CGTAA	2	10	52959	52968	40 %	20 %	20 %	20 %	407691646
38	NC_018690	ATTTA	2	10	53677	53686	40 %	60 %	0 %	0 %	407691646
39	NC_018690	ATTGT	2	10	54237	54246	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018690	TAAAA	2	10	56480	56489	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018690	GAGAT	2	10	56637	56646	40 %	20 %	40 %	0 %	407691650
42	NC_018690	GCTGT	2	10	58332	58341	0 %	40 %	40 %	20 %	407691652
43	NC_018690	GGTAT	2	10	60711	60720	20 %	40 %	40 %	0 %	407691654
44	NC_018690	ATTTT	2	10	61258	61267	20 %	80 %	0 %	0 %	407691654
45	NC_018690	ATATG	2	10	62404	62413	40 %	40 %	20 %	0 %	407691656
46	NC_018690	TTTCA	2	10	64926	64935	20 %	60 %	0 %	20 %	407691660
47	NC_018690	GCAAC	2	10	67341	67350	40 %	0 %	20 %	40 %	407691662
48	NC_018690	GTTTT	2	10	72359	72368	0 %	80 %	20 %	0 %	407691668
49	NC_018690	CTTTT	2	10	73629	73638	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018690	GCTCG	2	10	75666	75675	0 %	20 %	40 %	40 %	407691672
51	NC_018690	GTAAT	2	10	75834	75843	40 %	40 %	20 %	0 %	407691673
52	NC_018690	ATTGC	2	10	76199	76208	20 %	40 %	20 %	20 %	407691673
53	NC_018690	GCTTC	2	10	76585	76594	0 %	40 %	20 %	40 %	407691674
54	NC_018690	GCAAG	2	10	76614	76623	40 %	0 %	40 %	20 %	407691674
55	NC_018690	TGTAT	2	10	78696	78705	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018690	AACGG	2	10	80896	80905	40 %	0 %	40 %	20 %	407691680
57	NC_018690	CATCG	2	10	80954	80963	20 %	20 %	20 %	40 %	407691680
58	NC_018690	GTTTG	2	10	81952	81961	0 %	60 %	40 %	0 %	407691680
59	NC_018690	TTTTA	2	10	82682	82691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018690	CCATT	2	10	84714	84723	20 %	40 %	0 %	40 %	407691683
61	NC_018690	TTTTG	2	10	90519	90528	0 %	80 %	20 %	0 %	407691688
62	NC_018690	GTTTT	2	10	92429	92438	0 %	80 %	20 %	0 %	407691689
63	NC_018690	TGCCG	2	10	93650	93659	0 %	20 %	40 %	40 %	407691690
64	NC_018690	TTGAT	2	10	95460	95469	20 %	60 %	20 %	0 %	407691692
65	NC_018690	TAAAT	2	10	96594	96603	60 %	40 %	0 %	0 %	407691692
66	NC_018690	TCTTT	2	10	96957	96966	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018690	AAATG	2	10	97679	97688	60 %	20 %	20 %	0 %	407691694
68	NC_018690	GTGAA	2	10	98028	98037	40 %	20 %	40 %	0 %	407691695
69	NC_018690	CGGTA	2	10	98656	98665	20 %	20 %	40 %	20 %	407691696
70	NC_018690	AATCG	2	10	100046	100055	40 %	20 %	20 %	20 %	407691697
71	NC_018690	GCTTG	2	10	100736	100745	0 %	40 %	40 %	20 %	407691698
72	NC_018690	ATTTA	2	10	101413	101422	40 %	60 %	0 %	0 %	407691698
73	NC_018690	TTACC	2	10	101771	101780	20 %	40 %	0 %	40 %	407691699
74	NC_018690	TGGAT	2	10	103508	103517	20 %	40 %	40 %	0 %	407691701
75	NC_018690	CGTGA	2	10	104619	104628	20 %	20 %	40 %	20 %	407691702
76	NC_018690	AGTTT	2	10	105286	105295	20 %	60 %	20 %	0 %	407691702
77	NC_018690	AAGCG	2	10	106087	106096	40 %	0 %	40 %	20 %	407691703
78	NC_018690	AAATG	2	10	108877	108886	60 %	20 %	20 %	0 %	407691704
79	NC_018690	ATTTT	2	10	109279	109288	20 %	80 %	0 %	0 %	407691705
80	NC_018690	AGCGT	2	10	110620	110629	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018690	TTCTC	2	10	114018	114027	0 %	60 %	0 %	40 %	407691708
82	NC_018690	TTTTA	2	10	118102	118111	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018690	AACAC	2	10	119293	119302	60 %	0 %	0 %	40 %	407691714
84	NC_018690	CAGAG	2	10	119708	119717	40 %	0 %	40 %	20 %	407691715
85	NC_018690	GGTTT	2	10	121079	121088	0 %	60 %	40 %	0 %	407691717
86	NC_018690	TGCGT	2	10	122515	122524	0 %	40 %	40 %	20 %	407691718
87	NC_018690	TTTAC	2	10	125390	125399	20 %	60 %	0 %	20 %	407691719
88	NC_018690	AAGTT	2	10	127930	127939	40 %	40 %	20 %	0 %	407691721
89	NC_018690	GGTAT	2	10	130058	130067	20 %	40 %	40 %	0 %	407691723
90	NC_018690	GTGAA	2	10	131349	131358	40 %	20 %	40 %	0 %	407691724
91	NC_018690	GTTCA	2	10	131360	131369	20 %	40 %	20 %	20 %	407691724
92	NC_018690	ATCTT	2	10	134387	134396	20 %	60 %	0 %	20 %	407691726
93	NC_018690	TTTAA	2	10	135555	135564	40 %	60 %	0 %	0 %	407691726
94	NC_018690	CAAGA	2	10	140761	140770	60 %	0 %	20 %	20 %	407691731
95	NC_018690	AAAGT	2	10	140888	140897	60 %	20 %	20 %	0 %	407691731
96	NC_018690	AAGCA	2	10	141370	141379	60 %	0 %	20 %	20 %	407691732
97	NC_018690	ATAAA	2	10	141657	141666	80 %	20 %	0 %	0 %	407691733
98	NC_018690	TTCCG	2	10	141755	141764	0 %	40 %	20 %	40 %	407691733
99	NC_018690	GCCGG	2	10	142035	142044	0 %	0 %	60 %	40 %	407691733
100	NC_018690	GCAAA	2	10	146175	146184	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018690	ATTTA	2	10	148930	148939	40 %	60 %	0 %	0 %	407691741
102	NC_018690	AATTT	2	10	150072	150081	40 %	60 %	0 %	0 %	407691741
103	NC_018690	AAGCG	2	10	150856	150865	40 %	0 %	40 %	20 %	407691742
104	NC_018690	GTGAT	2	10	151652	151661	20 %	40 %	40 %	0 %	407691743
105	NC_018690	AAATT	2	10	152273	152282	60 %	40 %	0 %	0 %	407691743
106	NC_018690	TGGTG	2	10	154974	154983	0 %	40 %	60 %	0 %	407691746
107	NC_018690	TAAAG	2	10	158093	158102	60 %	20 %	20 %	0 %	407691749
108	NC_018690	AAATC	2	10	158494	158503	60 %	20 %	0 %	20 %	407691749
109	NC_018690	AGATG	2	10	160338	160347	40 %	20 %	40 %	0 %	407691752
110	NC_018690	ATTCC	2	10	161951	161960	20 %	40 %	0 %	40 %	407691753
111	NC_018690	GTGTT	2	10	163529	163538	0 %	60 %	40 %	0 %	407691754
112	NC_018690	TATCG	2	10	165500	165509	20 %	40 %	20 %	20 %	407691756
113	NC_018690	AATTT	2	10	166333	166342	40 %	60 %	0 %	0 %	407691756
114	NC_018690	CGACT	2	10	168143	168152	20 %	20 %	20 %	40 %	407691758
115	NC_018690	TACTT	2	10	168949	168958	20 %	60 %	0 %	20 %	407691759
116	NC_018690	TTATT	2	10	171836	171845	20 %	80 %	0 %	0 %	407691764
117	NC_018690	GCAGT	2	10	175113	175122	20 %	20 %	40 %	20 %	407691768
118	NC_018690	TACAA	2	10	176945	176954	60 %	20 %	0 %	20 %	407691770
119	NC_018690	TAAAG	2	10	177756	177765	60 %	20 %	20 %	0 %	407691771
120	NC_018690	GGCAA	2	10	177842	177851	40 %	0 %	40 %	20 %	407691771
121	NC_018690	TAAGG	2	10	181850	181859	40 %	20 %	40 %	0 %	407691775
122	NC_018690	TATAA	2	10	182630	182639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018690	ATTTA	2	10	182691	182700	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018690	AAAGA	2	10	183934	183943	80 %	0 %	20 %	0 %	407691777
125	NC_018690	CACAT	2	10	184128	184137	40 %	20 %	0 %	40 %	407691777
126	NC_018690	CATAA	2	10	184276	184285	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018690	GCTTT	2	10	185958	185967	0 %	60 %	20 %	20 %	407691778
128	NC_018690	CCGGT	2	10	186117	186126	0 %	20 %	40 %	40 %	407691778
129	NC_018690	AGATG	2	10	186823	186832	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018690	TGTAA	2	10	187001	187010	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018690	ATTGT	2	10	187481	187490	20 %	60 %	20 %	0 %	407691779
132	NC_018690	AGAAT	2	10	187976	187985	60 %	20 %	20 %	0 %	407691779
133	NC_018690	TATCA	2	10	188336	188345	40 %	40 %	0 %	20 %	407691779
134	NC_018690	TCGAT	2	10	189118	189127	20 %	40 %	20 %	20 %	407691780
135	NC_018690	CTGGG	2	10	192287	192296	0 %	20 %	60 %	20 %	407691781
136	NC_018690	AACCG	2	10	193688	193697	40 %	0 %	20 %	40 %	407691782
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262	NC_018690	AATAA	2	10	385712	385721	80 %	20 %	0 %	0 %	407691939
263	NC_018690	TTATG	2	10	386153	386162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_018690	TGCTT	2	10	389069	389078	0 %	60 %	20 %	20 %	407691942
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400	NC_018690	TGCTC	2	10	553196	553205	0 %	40 %	20 %	40 %	407692091
401	NC_018690	CGAAA	2	10	553322	553331	60 %	0 %	20 %	20 %	407692091
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