MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Actinobacillus suis H91-0380 chromosome

Total Repeats: 1811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018690	CGATG	2	10	1330514	1330523	20 %	20 %	40 %	20 %	407692789
1002	NC_018690	ATTAG	2	10	1332478	1332487	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_018690	GTTCT	2	10	1333734	1333743	0 %	60 %	20 %	20 %	407692793
1004	NC_018690	AAACC	2	10	1333768	1333777	60 %	0 %	0 %	40 %	407692793
1005	NC_018690	CTCTA	2	10	1334297	1334306	20 %	40 %	0 %	40 %	407692793
1006	NC_018690	TAAAT	2	10	1340372	1340381	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_018690	TTGGT	2	10	1341504	1341513	0 %	60 %	40 %	0 %	407692800
1008	NC_018690	TTTAA	2	10	1341630	1341639	40 %	60 %	0 %	0 %	407692801
1009	NC_018690	CATTT	2	10	1343530	1343539	20 %	60 %	0 %	20 %	407692804
1010	NC_018690	ATGCC	2	10	1344420	1344429	20 %	20 %	20 %	40 %	407692804
1011	NC_018690	AGTAC	2	10	1345361	1345370	40 %	20 %	20 %	20 %	407692805
1012	NC_018690	CCAAA	2	10	1346059	1346068	60 %	0 %	0 %	40 %	407692806
1013	NC_018690	CTTGC	2	10	1346397	1346406	0 %	40 %	20 %	40 %	407692806
1014	NC_018690	AATAA	2	10	1347196	1347205	80 %	20 %	0 %	0 %	407692807
1015	NC_018690	ATAAA	2	10	1347295	1347304	80 %	20 %	0 %	0 %	407692807
1016	NC_018690	CCAAG	2	10	1347603	1347612	40 %	0 %	20 %	40 %	407692807
1017	NC_018690	TAAAT	2	10	1347798	1347807	60 %	40 %	0 %	0 %	407692808
1018	NC_018690	ATACG	2	10	1348012	1348021	40 %	20 %	20 %	20 %	407692808
1019	NC_018690	ACTCT	2	10	1348654	1348663	20 %	40 %	0 %	40 %	407692809
1020	NC_018690	ATCAA	2	10	1348890	1348899	60 %	20 %	0 %	20 %	407692809
1021	NC_018690	AATTA	2	10	1351662	1351671	60 %	40 %	0 %	0 %	407692813
1022	NC_018690	TTCTT	2	10	1351809	1351818	0 %	80 %	0 %	20 %	407692813
1023	NC_018690	AGCAA	2	10	1352797	1352806	60 %	0 %	20 %	20 %	407692815
1024	NC_018690	ATTTT	2	10	1353149	1353158	20 %	80 %	0 %	0 %	407692815
1025	NC_018690	TACGG	2	10	1354150	1354159	20 %	20 %	40 %	20 %	407692816
1026	NC_018690	AATTA	2	10	1354542	1354551	60 %	40 %	0 %	0 %	407692816
1027	NC_018690	ATTTT	2	10	1356065	1356074	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_018690	TGAAA	2	10	1362456	1362465	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_018690	ATTAA	2	10	1364825	1364834	60 %	40 %	0 %	0 %	407692825
1030	NC_018690	TTTCG	2	10	1365997	1366006	0 %	60 %	20 %	20 %	407692828
1031	NC_018690	TTTGT	2	10	1366725	1366734	0 %	80 %	20 %	0 %	407692828
1032	NC_018690	CTTTC	2	10	1367079	1367088	0 %	60 %	0 %	40 %	407692829
1033	NC_018690	ATTTT	2	10	1368017	1368026	20 %	80 %	0 %	0 %	407692830
1034	NC_018690	CCCGG	2	10	1370350	1370359	0 %	0 %	40 %	60 %	407692832
1035	NC_018690	ATCGC	2	10	1374254	1374263	20 %	20 %	20 %	40 %	407692837
1036	NC_018690	CCAGC	2	10	1377670	1377679	20 %	0 %	20 %	60 %	407692839
1037	NC_018690	TAAAA	2	10	1378813	1378822	80 %	20 %	0 %	0 %	407692841
1038	NC_018690	AAATT	2	10	1380386	1380395	60 %	40 %	0 %	0 %	407692842
1039	NC_018690	CCCCT	2	10	1384148	1384157	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1040	NC_018690	ATTTT	2	10	1384170	1384179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018690	CTTTT	2	10	1386658	1386667	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1042	NC_018690	TGCAA	2	10	1389206	1389215	40 %	20 %	20 %	20 %	407692849
1043	NC_018690	TCGCT	2	10	1389807	1389816	0 %	40 %	20 %	40 %	407692850
1044	NC_018690	CTACG	2	10	1390068	1390077	20 %	20 %	20 %	40 %	407692850
1045	NC_018690	ATTTT	2	10	1390211	1390220	20 %	80 %	0 %	0 %	407692850
1046	NC_018690	AGTTT	2	10	1392921	1392930	20 %	60 %	20 %	0 %	407692852
1047	NC_018690	TTGCA	2	10	1394207	1394216	20 %	40 %	20 %	20 %	407692854
1048	NC_018690	AAAAT	2	10	1395887	1395896	80 %	20 %	0 %	0 %	407692855
1049	NC_018690	AAATT	2	10	1402248	1402257	60 %	40 %	0 %	0 %	407692862
1050	NC_018690	TAAAA	2	10	1403279	1403288	80 %	20 %	0 %	0 %	407692863
1051	NC_018690	ATTGG	2	10	1403932	1403941	20 %	40 %	40 %	0 %	407692863
1052	NC_018690	GCTTT	2	10	1405913	1405922	0 %	60 %	20 %	20 %	407692865
1053	NC_018690	ATGCA	2	10	1408849	1408858	40 %	20 %	20 %	20 %	407692867
1054	NC_018690	AATTA	2	10	1409917	1409926	60 %	40 %	0 %	0 %	407692868
1055	NC_018690	GAACC	2	10	1411139	1411148	40 %	0 %	20 %	40 %	407692869
1056	NC_018690	GCGGT	2	10	1411878	1411887	0 %	20 %	60 %	20 %	407692870
1057	NC_018690	ATAAA	2	10	1412714	1412723	80 %	20 %	0 %	0 %	407692871
1058	NC_018690	AATTA	2	10	1417404	1417413	60 %	40 %	0 %	0 %	407692873
1059	NC_018690	TTTAT	2	10	1418064	1418073	20 %	80 %	0 %	0 %	407692875
1060	NC_018690	TACGT	2	10	1419973	1419982	20 %	40 %	20 %	20 %	407692877
1061	NC_018690	TTCAC	2	10	1420592	1420601	20 %	40 %	0 %	40 %	407692877
1062	NC_018690	TACCG	2	10	1420717	1420726	20 %	20 %	20 %	40 %	407692877
1063	NC_018690	TAAAA	2	10	1421206	1421215	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_018690	CCAAA	2	10	1422457	1422466	60 %	0 %	0 %	40 %	407692878
1065	NC_018690	GATCA	2	10	1423616	1423625	40 %	20 %	20 %	20 %	407692880
1066	NC_018690	ACTAG	2	10	1426008	1426017	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1067	NC_018690	TAGTT	2	10	1427736	1427745	20 %	60 %	20 %	0 %	407692884
1068	NC_018690	TTTGC	2	10	1428737	1428746	0 %	60 %	20 %	20 %	407692885
1069	NC_018690	GCGAT	2	10	1428936	1428945	20 %	20 %	40 %	20 %	407692886
1070	NC_018690	AGTCT	2	10	1429569	1429578	20 %	40 %	20 %	20 %	407692886
1071	NC_018690	GCTTG	2	10	1430454	1430463	0 %	40 %	40 %	20 %	407692889
1072	NC_018690	ATTTT	2	10	1431391	1431400	20 %	80 %	0 %	0 %	407692890
1073	NC_018690	CCACG	2	10	1431849	1431858	20 %	0 %	20 %	60 %	407692891
1074	NC_018690	TATTT	2	10	1436997	1437006	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_018690	TTCAA	2	10	1437320	1437329	40 %	40 %	0 %	20 %	407692895
1076	NC_018690	ATCGT	2	10	1439334	1439343	20 %	40 %	20 %	20 %	407692898
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1078	NC_018690	CACCT	2	10	1444589	1444598	20 %	20 %	0 %	60 %	407692905
1079	NC_018690	TTCGG	2	10	1446900	1446909	0 %	40 %	40 %	20 %	407692906
1080	NC_018690	TAAAA	2	10	1447174	1447183	80 %	20 %	0 %	0 %	407692906
1081	NC_018690	TGAAG	2	10	1449272	1449281	40 %	20 %	40 %	0 %	407692907
1082	NC_018690	AGCGG	2	10	1449504	1449513	20 %	0 %	60 %	20 %	407692907
1083	NC_018690	TTTTC	2	10	1450970	1450979	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1084	NC_018690	TCAGT	2	10	1451776	1451785	20 %	40 %	20 %	20 %	407692908
1085	NC_018690	TTACT	2	10	1453487	1453496	20 %	60 %	0 %	20 %	407692910
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1087	NC_018690	CTCTG	2	10	1459106	1459115	0 %	40 %	20 %	40 %	407692915
1088	NC_018690	TTTGA	2	10	1464340	1464349	20 %	60 %	20 %	0 %	407692915
1089	NC_018690	ATCCG	2	10	1464417	1464426	20 %	20 %	20 %	40 %	407692915
1090	NC_018690	TTTAC	2	10	1467236	1467245	20 %	60 %	0 %	20 %	407692915
1091	NC_018690	GGAAT	2	10	1468792	1468801	40 %	20 %	40 %	0 %	407692916
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1093	NC_018690	AAGAA	2	10	1469679	1469688	80 %	0 %	20 %	0 %	407692916
1094	NC_018690	GTACC	2	10	1470368	1470377	20 %	20 %	20 %	40 %	407692917
1095	NC_018690	AAGTT	2	10	1474286	1474295	40 %	40 %	20 %	0 %	407692917
1096	NC_018690	AGTTA	2	10	1477689	1477698	40 %	40 %	20 %	0 %	407692917
1097	NC_018690	AATTT	2	10	1479955	1479964	40 %	60 %	0 %	0 %	407692917
1098	NC_018690	GCCTT	2	10	1483165	1483174	0 %	40 %	20 %	40 %	407692917
1099	NC_018690	AATTA	2	10	1483659	1483668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018690	ATAAA	2	10	1483759	1483768	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_018690	AAGCA	2	10	1484332	1484341	60 %	0 %	20 %	20 %	407692918
1102	NC_018690	GCACC	2	10	1485158	1485167	20 %	0 %	20 %	60 %	407692918
1103	NC_018690	TGGAA	2	10	1485232	1485241	40 %	20 %	40 %	0 %	407692918
1104	NC_018690	CTTTG	2	10	1485943	1485952	0 %	60 %	20 %	20 %	407692920
1105	NC_018690	TAAAA	2	10	1491563	1491572	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_018690	CGATG	2	10	1492682	1492691	20 %	20 %	40 %	20 %	407692926
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1108	NC_018690	GGTGC	2	10	1494150	1494159	0 %	20 %	60 %	20 %	407692926
1109	NC_018690	TTAAT	2	10	1495313	1495322	40 %	60 %	0 %	0 %	407692928
1110	NC_018690	CAATG	2	10	1495460	1495469	40 %	20 %	20 %	20 %	407692928
1111	NC_018690	TTCGC	2	10	1495711	1495720	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1112	NC_018690	CCCAG	2	10	1495774	1495783	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1113	NC_018690	TTTAA	2	10	1495839	1495848	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_018690	AAACT	2	10	1495870	1495879	60 %	20 %	0 %	20 %	407692929
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1116	NC_018690	CAAAA	2	10	1502202	1502211	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_018690	GCCGG	2	10	1504563	1504572	0 %	0 %	60 %	40 %	407692940
1118	NC_018690	TCAAT	2	10	1504792	1504801	40 %	40 %	0 %	20 %	407692941
1119	NC_018690	GTACC	2	10	1505359	1505368	20 %	20 %	20 %	40 %	407692941
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1121	NC_018690	TTCAC	2	10	1507056	1507065	20 %	40 %	0 %	40 %	407692944
1122	NC_018690	GTGTT	2	10	1508451	1508460	0 %	60 %	40 %	0 %	407692946
1123	NC_018690	TAATG	2	10	1509393	1509402	40 %	40 %	20 %	0 %	407692948
1124	NC_018690	AATGT	2	10	1510285	1510294	40 %	40 %	20 %	0 %	407692949
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