MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Actinobacillus suis H91-0380 chromosome

Total Repeats: 1811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018690	ACGAA	2	10	684805	684814	60 %	0 %	20 %	20 %	407692227
502	NC_018690	AGATG	2	10	684956	684965	40 %	20 %	40 %	0 %	407692227
503	NC_018690	GAAGT	2	10	686706	686715	40 %	20 %	40 %	0 %	407692230
504	NC_018690	AAAAG	2	10	687315	687324	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018690	TGCAA	2	10	690765	690774	40 %	20 %	20 %	20 %	407692236
506	NC_018690	CTGAA	2	10	692555	692564	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
507	NC_018690	TCTGA	2	10	693833	693842	20 %	40 %	20 %	20 %	407692243
508	NC_018690	ATCCG	2	10	695275	695284	20 %	20 %	20 %	40 %	407692243
509	NC_018690	ATTTT	2	10	697311	697320	20 %	80 %	0 %	0 %	407692245
510	NC_018690	ATTTG	2	10	700083	700092	20 %	60 %	20 %	0 %	407692248
511	NC_018690	GCTTT	2	10	700323	700332	0 %	60 %	20 %	20 %	407692248
512	NC_018690	ATAGC	2	10	701998	702007	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
513	NC_018690	TACGG	2	10	702245	702254	20 %	20 %	40 %	20 %	407692251
514	NC_018690	GGTGT	2	10	703290	703299	0 %	40 %	60 %	0 %	407692252
515	NC_018690	TTCAT	2	10	704431	704440	20 %	60 %	0 %	20 %	407692253
516	NC_018690	CAAAA	2	10	704727	704736	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
517	NC_018690	GCTTG	2	10	706587	706596	0 %	40 %	40 %	20 %	407692255
518	NC_018690	TGAGT	2	10	707409	707418	20 %	40 %	40 %	0 %	407692256
519	NC_018690	ATTAC	2	10	709249	709258	40 %	40 %	0 %	20 %	407692256
520	NC_018690	ACGGT	2	10	709601	709610	20 %	20 %	40 %	20 %	407692256
521	NC_018690	CCTTT	2	10	710145	710154	0 %	60 %	0 %	40 %	407692257
522	NC_018690	TGGAT	2	10	711448	711457	20 %	40 %	40 %	0 %	407692257
523	NC_018690	CAAGT	2	10	711634	711643	40 %	20 %	20 %	20 %	407692257
524	NC_018690	ATTCT	2	10	712665	712674	20 %	60 %	0 %	20 %	407692257
525	NC_018690	ATTCG	2	10	713307	713316	20 %	40 %	20 %	20 %	407692257
526	NC_018690	CCAAA	2	10	715353	715362	60 %	0 %	0 %	40 %	407692259
527	NC_018690	CACCG	2	10	715910	715919	20 %	0 %	20 %	60 %	407692260
528	NC_018690	TTTTA	2	10	719207	719216	20 %	80 %	0 %	0 %	407692262
529	NC_018690	CAGCC	2	10	719778	719787	20 %	0 %	20 %	60 %	407692263
530	NC_018690	AAATC	2	10	723120	723129	60 %	20 %	0 %	20 %	407692266
531	NC_018690	TATTT	2	10	724272	724281	20 %	80 %	0 %	0 %	407692268
532	NC_018690	GGATT	2	10	726518	726527	20 %	40 %	40 %	0 %	407692271
533	NC_018690	TGAAT	2	10	728353	728362	40 %	40 %	20 %	0 %	407692274
534	NC_018690	CATTT	2	10	728761	728770	20 %	60 %	0 %	20 %	407692275
535	NC_018690	AAAAG	2	10	731258	731267	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018690	ATCCA	2	10	734409	734418	40 %	20 %	0 %	40 %	407692280
537	NC_018690	ACTTT	2	10	734713	734722	20 %	60 %	0 %	20 %	407692281
538	NC_018690	GACAA	2	10	737803	737812	60 %	0 %	20 %	20 %	407692285
539	NC_018690	TTTAT	2	10	737876	737885	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018690	TAAAA	2	10	739247	739256	80 %	20 %	0 %	0 %	407692287
541	NC_018690	CGAAT	2	10	742179	742188	40 %	20 %	20 %	20 %	407692290
542	NC_018690	AATAC	2	10	742928	742937	60 %	20 %	0 %	20 %	407692291
543	NC_018690	ATTCA	2	10	743919	743928	40 %	40 %	0 %	20 %	407692292
544	NC_018690	TAGGT	2	10	744039	744048	20 %	40 %	40 %	0 %	407692292
545	NC_018690	TAAAG	2	10	744285	744294	60 %	20 %	20 %	0 %	407692292
546	NC_018690	CGTAT	2	10	744977	744986	20 %	40 %	20 %	20 %	407692293
547	NC_018690	ATTTA	2	10	746093	746102	40 %	60 %	0 %	0 %	407692294
548	NC_018690	AATTA	2	10	751687	751696	60 %	40 %	0 %	0 %	407692300
549	NC_018690	AATGC	2	10	753414	753423	40 %	20 %	20 %	20 %	407692301
550	NC_018690	ATTAA	2	10	756801	756810	60 %	40 %	0 %	0 %	407692304
551	NC_018690	ATTTT	2	10	757971	757980	20 %	80 %	0 %	0 %	407692305
552	NC_018690	CTTTG	2	10	759302	759311	0 %	60 %	20 %	20 %	407692306
553	NC_018690	TGCGG	2	10	760894	760903	0 %	20 %	60 %	20 %	407692306
554	NC_018690	CAGAT	2	10	766382	766391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
555	NC_018690	TGTGT	2	10	766659	766668	0 %	60 %	40 %	0 %	407692313
556	NC_018690	TAACT	2	10	767908	767917	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
557	NC_018690	TACGT	2	10	768618	768627	20 %	40 %	20 %	20 %	407692314
558	NC_018690	AAAAC	2	10	770424	770433	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
559	NC_018690	GGCTG	2	10	770967	770976	0 %	20 %	60 %	20 %	407692315
560	NC_018690	TACCG	2	10	771759	771768	20 %	20 %	20 %	40 %	407692316
561	NC_018690	AACCC	2	10	773615	773624	40 %	0 %	0 %	60 %	407692318
562	NC_018690	GGTGC	2	10	774176	774185	0 %	20 %	60 %	20 %	407692318
563	NC_018690	TTGCG	2	10	774231	774240	0 %	40 %	40 %	20 %	407692318
564	NC_018690	AAGTA	2	10	775025	775034	60 %	20 %	20 %	0 %	407692319
565	NC_018690	AAGCA	2	10	775387	775396	60 %	0 %	20 %	20 %	407692320
566	NC_018690	AGTTA	2	10	777795	777804	40 %	40 %	20 %	0 %	407692322
567	NC_018690	GGCTC	2	10	777899	777908	0 %	20 %	40 %	40 %	407692322
568	NC_018690	TATTG	2	10	782153	782162	20 %	60 %	20 %	0 %	407692325
569	NC_018690	GCCCC	2	10	782631	782640	0 %	0 %	20 %	80 %	407692326
570	NC_018690	GATAG	2	10	783342	783351	40 %	20 %	40 %	0 %	407692326
571	NC_018690	GGAAT	2	10	783479	783488	40 %	20 %	40 %	0 %	407692327
572	NC_018690	CAACC	2	10	784541	784550	40 %	0 %	0 %	60 %	407692327
573	NC_018690	GGATC	2	10	784700	784709	20 %	20 %	40 %	20 %	407692327
574	NC_018690	ATAAA	2	10	785134	785143	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018690	GGGTG	2	10	788084	788093	0 %	20 %	80 %	0 %	407692330
576	NC_018690	CATTT	2	10	789641	789650	20 %	60 %	0 %	20 %	407692332
577	NC_018690	AAAGC	2	10	791021	791030	60 %	0 %	20 %	20 %	407692333
578	NC_018690	TTTTA	2	10	791248	791257	20 %	80 %	0 %	0 %	407692334
579	NC_018690	CTCAA	2	10	791397	791406	40 %	20 %	0 %	40 %	407692334
580	NC_018690	AGAAA	2	10	792305	792314	80 %	0 %	20 %	0 %	407692334
581	NC_018690	AAATT	2	10	793765	793774	60 %	40 %	0 %	0 %	407692335
582	NC_018690	ATATA	2	10	794042	794051	60 %	40 %	0 %	0 %	407692335
583	NC_018690	TTAAA	2	10	794788	794797	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018690	TTGTA	2	10	794814	794823	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018690	TTTAA	2	10	794832	794841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_018690	TTGCC	2	10	796072	796081	0 %	40 %	20 %	40 %	407692336
587	NC_018690	GCCGA	2	10	796704	796713	20 %	0 %	40 %	40 %	407692337
588	NC_018690	TACCA	2	10	799465	799474	40 %	20 %	0 %	40 %	407692339
589	NC_018690	CAAGT	2	10	799577	799586	40 %	20 %	20 %	20 %	407692339
590	NC_018690	TCACA	2	10	799801	799810	40 %	20 %	0 %	40 %	407692339
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592	NC_018690	ATTCA	2	10	802415	802424	40 %	40 %	0 %	20 %	407692342
593	NC_018690	AAATG	2	10	803917	803926	60 %	20 %	20 %	0 %	407692344
594	NC_018690	AAGAT	2	10	804423	804432	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018690	AAAGA	2	10	805001	805010	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_018690	GTAGC	2	10	807491	807500	20 %	20 %	40 %	20 %	407692346
598	NC_018690	GTTTT	2	10	812093	812102	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018690	AAATA	2	10	812535	812544	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_018690	GCTCT	2	10	813127	813136	0 %	40 %	20 %	40 %	407692351
601	NC_018690	TACTC	2	10	814624	814633	20 %	40 %	0 %	40 %	407692352
602	NC_018690	GCACT	2	10	814729	814738	20 %	20 %	20 %	40 %	407692352
603	NC_018690	CATTT	2	10	816566	816575	20 %	60 %	0 %	20 %	407692353
604	NC_018690	ATCGT	2	10	816722	816731	20 %	40 %	20 %	20 %	407692353
605	NC_018690	CAATT	2	10	816800	816809	40 %	40 %	0 %	20 %	407692353
606	NC_018690	AAGCG	2	10	817935	817944	40 %	0 %	40 %	20 %	407692354
607	NC_018690	GCTTA	2	10	818739	818748	20 %	40 %	20 %	20 %	407692354
608	NC_018690	ATGCG	2	10	820604	820613	20 %	20 %	40 %	20 %	407692356
609	NC_018690	TAACT	2	10	822384	822393	40 %	40 %	0 %	20 %	407692357
610	NC_018690	TTCAC	2	10	825386	825395	20 %	40 %	0 %	40 %	407692360
611	NC_018690	AAGAT	2	10	825658	825667	60 %	20 %	20 %	0 %	407692360
612	NC_018690	CGCAC	2	10	829821	829830	20 %	0 %	20 %	60 %	407692363
613	NC_018690	GGTTG	2	10	831776	831785	0 %	40 %	60 %	0 %	407692363
614	NC_018690	TTTCA	2	10	833348	833357	20 %	60 %	0 %	20 %	407692364
615	NC_018690	CCCAC	2	10	834793	834802	20 %	0 %	0 %	80 %	407692366
616	NC_018690	TTGGC	2	10	836117	836126	0 %	40 %	40 %	20 %	407692367
617	NC_018690	TCTTT	2	10	839968	839977	0 %	80 %	0 %	20 %	407692370
618	NC_018690	TCGAT	2	10	840218	840227	20 %	40 %	20 %	20 %	407692371
619	NC_018690	TTTGC	2	10	840541	840550	0 %	60 %	20 %	20 %	407692371
620	NC_018690	TTATT	2	10	841147	841156	20 %	80 %	0 %	0 %	407692372
621	NC_018690	AATGC	2	10	843111	843120	40 %	20 %	20 %	20 %	407692373
622	NC_018690	ACGGG	2	10	844279	844288	20 %	0 %	60 %	20 %	407692374
623	NC_018690	AATTC	2	10	845753	845762	40 %	40 %	0 %	20 %	407692375
624	NC_018690	CAATT	2	10	847470	847479	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
625	NC_018690	AAAAG	2	10	847504	847513	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
626	NC_018690	TGCTA	2	10	848023	848032	20 %	40 %	20 %	20 %	407692377
627	NC_018690	ATAAG	2	10	848371	848380	60 %	20 %	20 %	0 %	407692378
628	NC_018690	AAAAG	2	10	849551	849560	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
629	NC_018690	GTAAT	2	10	849762	849771	40 %	40 %	20 %	0 %	407692379
630	NC_018690	TTGTT	2	10	850311	850320	0 %	80 %	20 %	0 %	407692379
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