MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 1806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017857	CCTGA	2	10	2544460	2544469	20 %	20 %	20 %	40 %	387128327
1502	NC_017857	GCAAC	2	10	2544546	2544555	40 %	0 %	20 %	40 %	387128327
1503	NC_017857	GTCCA	2	10	2547266	2547275	20 %	20 %	20 %	40 %	387128328
1504	NC_017857	ACATC	2	10	2547510	2547519	40 %	20 %	0 %	40 %	387128328
1505	NC_017857	TTGCA	2	10	2549098	2549107	20 %	40 %	20 %	20 %	387128330
1506	NC_017857	GGAAT	2	10	2551752	2551761	40 %	20 %	40 %	0 %	387128333
1507	NC_017857	CAGTT	2	10	2553811	2553820	20 %	40 %	20 %	20 %	387128336
1508	NC_017857	CACTG	2	10	2554587	2554596	20 %	20 %	20 %	40 %	387128337
1509	NC_017857	AATTC	2	10	2558443	2558452	40 %	40 %	0 %	20 %	387128342
1510	NC_017857	TGATT	2	10	2560292	2560301	20 %	60 %	20 %	0 %	387128343
1511	NC_017857	AACTG	2	10	2562920	2562929	40 %	20 %	20 %	20 %	387128346
1512	NC_017857	TTTGA	2	10	2565105	2565114	20 %	60 %	20 %	0 %	387128348
1513	NC_017857	ATCTG	2	10	2567291	2567300	20 %	40 %	20 %	20 %	387128350
1514	NC_017857	GAGGT	2	10	2578547	2578556	20 %	20 %	60 %	0 %	387128363
1515	NC_017857	GCTTC	2	10	2581167	2581176	0 %	40 %	20 %	40 %	387128365
1516	NC_017857	CCGGA	2	10	2581897	2581906	20 %	0 %	40 %	40 %	387128365
1517	NC_017857	CAAGC	2	10	2585507	2585516	40 %	0 %	20 %	40 %	387128369
1518	NC_017857	ACTGG	2	10	2587804	2587813	20 %	20 %	40 %	20 %	387128371
1519	NC_017857	GCAGA	2	10	2590376	2590385	40 %	0 %	40 %	20 %	387128375
1520	NC_017857	GGGTT	2	10	2595875	2595884	0 %	40 %	60 %	0 %	387128378
1521	NC_017857	TGAAT	2	10	2598872	2598881	40 %	40 %	20 %	0 %	387128379
1522	NC_017857	GGATT	2	10	2599490	2599499	20 %	40 %	40 %	0 %	387128380
1523	NC_017857	GCATT	2	10	2600707	2600716	20 %	40 %	20 %	20 %	387128381
1524	NC_017857	CAGCA	2	10	2607332	2607341	40 %	0 %	20 %	40 %	387128386
1525	NC_017857	TGACA	2	10	2617142	2617151	40 %	20 %	20 %	20 %	387128396
1526	NC_017857	CCCTG	2	10	2622893	2622902	0 %	20 %	20 %	60 %	387128404
1527	NC_017857	ACCAA	2	10	2623015	2623024	60 %	0 %	0 %	40 %	387128404
1528	NC_017857	AATAC	2	10	2625684	2625693	60 %	20 %	0 %	20 %	387128407
1529	NC_017857	TGACC	2	10	2625901	2625910	20 %	20 %	20 %	40 %	387128407
1530	NC_017857	TGACC	2	10	2628846	2628855	20 %	20 %	20 %	40 %	387128410
1531	NC_017857	GCATC	2	10	2628909	2628918	20 %	20 %	20 %	40 %	387128410
1532	NC_017857	ATAGC	2	10	2629112	2629121	40 %	20 %	20 %	20 %	387128410
1533	NC_017857	ATCCC	2	10	2631158	2631167	20 %	20 %	0 %	60 %	387128412
1534	NC_017857	TCATG	2	10	2632356	2632365	20 %	40 %	20 %	20 %	387128412
1535	NC_017857	CACTG	2	10	2633112	2633121	20 %	20 %	20 %	40 %	387128412
1536	NC_017857	GAAAA	2	10	2633239	2633248	80 %	0 %	20 %	0 %	387128412
1537	NC_017857	CATTT	2	10	2634620	2634629	20 %	60 %	0 %	20 %	387128413
1538	NC_017857	GTTCA	2	10	2635055	2635064	20 %	40 %	20 %	20 %	387128413
1539	NC_017857	AAGGT	2	10	2636152	2636161	40 %	20 %	40 %	0 %	387128414
1540	NC_017857	GTTCA	2	10	2636184	2636193	20 %	40 %	20 %	20 %	387128414
1541	NC_017857	GTGGC	2	10	2637079	2637088	0 %	20 %	60 %	20 %	387128414
1542	NC_017857	TCTAA	2	10	2637225	2637234	40 %	40 %	0 %	20 %	387128414
1543	NC_017857	TATCG	2	10	2638210	2638219	20 %	40 %	20 %	20 %	387128417
1544	NC_017857	CCTGG	2	10	2638645	2638654	0 %	20 %	40 %	40 %	387128417
1545	NC_017857	TCATA	2	10	2638904	2638913	40 %	40 %	0 %	20 %	387128417
1546	NC_017857	TAAGC	2	10	2653306	2653315	40 %	20 %	20 %	20 %	387128440
1547	NC_017857	TCAAT	2	10	2653367	2653376	40 %	40 %	0 %	20 %	387128440
1548	NC_017857	ATCTG	2	10	2654366	2654375	20 %	40 %	20 %	20 %	387128441
1549	NC_017857	CAAAT	2	10	2654974	2654983	60 %	20 %	0 %	20 %	387128441
1550	NC_017857	TTCGT	2	10	2655478	2655487	0 %	60 %	20 %	20 %	387128442
1551	NC_017857	TGAAC	2	10	2655537	2655546	40 %	20 %	20 %	20 %	387128442
1552	NC_017857	CTTGT	2	10	2656264	2656273	0 %	60 %	20 %	20 %	387128442
1553	NC_017857	GGGTT	2	10	2660472	2660481	0 %	40 %	60 %	0 %	387128445
1554	NC_017857	CGTGG	2	10	2664847	2664856	0 %	20 %	60 %	20 %	387128448
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1556	NC_017857	TTCCA	2	10	2669480	2669489	20 %	40 %	0 %	40 %	387128451
1557	NC_017857	TTCAC	2	10	2669543	2669552	20 %	40 %	0 %	40 %	387128451
1558	NC_017857	ATCAG	2	10	2670455	2670464	40 %	20 %	20 %	20 %	387128451
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1560	NC_017857	CAAAT	2	10	2673320	2673329	60 %	20 %	0 %	20 %	387128453
1561	NC_017857	GTTTT	2	10	2674113	2674122	0 %	80 %	20 %	0 %	387128453
1562	NC_017857	CAGGA	2	10	2677509	2677518	40 %	0 %	40 %	20 %	387128456
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1564	NC_017857	TTTCT	2	10	2680336	2680345	0 %	80 %	0 %	20 %	387128458
1565	NC_017857	ATGCA	2	10	2680437	2680446	40 %	20 %	20 %	20 %	387128458
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1570	NC_017857	ATTCA	2	10	2687562	2687571	40 %	40 %	0 %	20 %	387128464
1571	NC_017857	AGTTT	2	10	2687907	2687916	20 %	60 %	20 %	0 %	387128465
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1582	NC_017857	GTTGA	2	10	2715671	2715680	20 %	40 %	40 %	0 %	387128493
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1595	NC_017857	TGATT	2	10	2753560	2753569	20 %	60 %	20 %	0 %	387128536
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1598	NC_017857	TGTCC	2	10	2757652	2757661	0 %	40 %	20 %	40 %	387128540
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1603	NC_017857	CCGTG	2	10	2772669	2772678	0 %	20 %	40 %	40 %	387128551
1604	NC_017857	AGATG	2	10	2773179	2773188	40 %	20 %	40 %	0 %	387128551
1605	NC_017857	TTCCA	2	10	2774017	2774026	20 %	40 %	0 %	40 %	387128551
1606	NC_017857	CTCAA	2	10	2775056	2775065	40 %	20 %	0 %	40 %	387128553
1607	NC_017857	TCAAA	2	10	2776639	2776648	60 %	20 %	0 %	20 %	387128555
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1619	NC_017857	TGCCT	2	10	2798779	2798788	0 %	40 %	20 %	40 %	387128588
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1621	NC_017857	GATGA	2	10	2799831	2799840	40 %	20 %	40 %	0 %	387128589
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