MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 1806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017857	CCGAA	2	10	1677942	1677951	40 %	0 %	20 %	40 %	387127521
1002	NC_017857	TTAAA	2	10	1678426	1678435	60 %	40 %	0 %	0 %	387127521
1003	NC_017857	GGCTT	2	10	1681836	1681845	0 %	40 %	40 %	20 %	387127525
1004	NC_017857	TATAT	2	10	1690026	1690035	40 %	60 %	0 %	0 %	387127533
1005	NC_017857	CCATT	2	10	1693092	1693101	20 %	40 %	0 %	40 %	387127537
1006	NC_017857	TTTGG	2	10	1695186	1695195	0 %	60 %	40 %	0 %	387127539
1007	NC_017857	TGTGA	2	10	1698709	1698718	20 %	40 %	40 %	0 %	387127543
1008	NC_017857	GGCAT	2	10	1698760	1698769	20 %	20 %	40 %	20 %	387127543
1009	NC_017857	TGATT	2	10	1701985	1701994	20 %	60 %	20 %	0 %	387127546
1010	NC_017857	TTTAA	2	10	1704864	1704873	40 %	60 %	0 %	0 %	387127551
1011	NC_017857	AGGCA	2	10	1704980	1704989	40 %	0 %	40 %	20 %	387127551
1012	NC_017857	ATGAA	2	10	1705526	1705535	60 %	20 %	20 %	0 %	387127552
1013	NC_017857	CAGTC	2	10	1709516	1709525	20 %	20 %	20 %	40 %	387127558
1014	NC_017857	AAAAT	2	10	1711040	1711049	80 %	20 %	0 %	0 %	387127560
1015	NC_017857	AACAG	2	10	1715864	1715873	60 %	0 %	20 %	20 %	387127566
1016	NC_017857	TCTGC	2	10	1717575	1717584	0 %	40 %	20 %	40 %	387127569
1017	NC_017857	TTAAT	2	10	1723242	1723251	40 %	60 %	0 %	0 %	387127574
1018	NC_017857	TGTGC	2	10	1723543	1723552	0 %	40 %	40 %	20 %	387127575
1019	NC_017857	AAATG	2	10	1723859	1723868	60 %	20 %	20 %	0 %	387127575
1020	NC_017857	TGATT	2	10	1731292	1731301	20 %	60 %	20 %	0 %	387127583
1021	NC_017857	ATGCC	2	10	1733595	1733604	20 %	20 %	20 %	40 %	387127584
1022	NC_017857	GCTGA	2	10	1734628	1734637	20 %	20 %	40 %	20 %	387127587
1023	NC_017857	GCGAA	2	10	1735732	1735741	40 %	0 %	40 %	20 %	387127587
1024	NC_017857	TAATT	2	10	1736586	1736595	40 %	60 %	0 %	0 %	387127588
1025	NC_017857	TTCAA	2	10	1736768	1736777	40 %	40 %	0 %	20 %	387127589
1026	NC_017857	TTGCA	2	10	1737199	1737208	20 %	40 %	20 %	20 %	387127589
1027	NC_017857	ATTTC	2	10	1737541	1737550	20 %	60 %	0 %	20 %	387127589
1028	NC_017857	CTGAT	2	10	1737950	1737959	20 %	40 %	20 %	20 %	387127590
1029	NC_017857	ATTCA	2	10	1739100	1739109	40 %	40 %	0 %	20 %	387127591
1030	NC_017857	AGCAA	2	10	1740293	1740302	60 %	0 %	20 %	20 %	387127592
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1032	NC_017857	AACAG	2	10	1741946	1741955	60 %	0 %	20 %	20 %	387127594
1033	NC_017857	TGCTG	2	10	1742098	1742107	0 %	40 %	40 %	20 %	387127594
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1035	NC_017857	TACCT	2	10	1744999	1745008	20 %	40 %	0 %	40 %	387127597
1036	NC_017857	GCCAC	2	10	1745204	1745213	20 %	0 %	20 %	60 %	387127597
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1039	NC_017857	AACAG	2	10	1748551	1748560	60 %	0 %	20 %	20 %	387127601
1040	NC_017857	CCGAG	2	10	1750453	1750462	20 %	0 %	40 %	40 %	387127603
1041	NC_017857	AGAAA	2	10	1750699	1750708	80 %	0 %	20 %	0 %	387127603
1042	NC_017857	CCAAG	2	10	1752992	1753001	40 %	0 %	20 %	40 %	387127604
1043	NC_017857	GCATG	2	10	1753781	1753790	20 %	20 %	40 %	20 %	387127605
1044	NC_017857	TGGGG	2	10	1755949	1755958	0 %	20 %	80 %	0 %	387127608
1045	NC_017857	TTATT	2	10	1757671	1757680	20 %	80 %	0 %	0 %	387127608
1046	NC_017857	GCTGA	2	10	1760125	1760134	20 %	20 %	40 %	20 %	387127610
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1048	NC_017857	TGGTC	2	10	1766684	1766693	0 %	40 %	40 %	20 %	387127617
1049	NC_017857	AAGGT	2	10	1768543	1768552	40 %	20 %	40 %	0 %	387127619
1050	NC_017857	GGGGC	2	10	1768874	1768883	0 %	0 %	80 %	20 %	387127619
1051	NC_017857	GATGC	2	10	1775678	1775687	20 %	20 %	40 %	20 %	387127626
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1054	NC_017857	GTGAT	2	10	1784825	1784834	20 %	40 %	40 %	0 %	387127632
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1056	NC_017857	TGGCA	2	10	1785476	1785485	20 %	20 %	40 %	20 %	387127633
1057	NC_017857	GGCAC	2	10	1786310	1786319	20 %	0 %	40 %	40 %	387127635
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1059	NC_017857	AACAA	2	10	1789158	1789167	80 %	0 %	0 %	20 %	387127640
1060	NC_017857	TGGCA	2	10	1789845	1789854	20 %	20 %	40 %	20 %	387127640
1061	NC_017857	GTGCT	2	10	1790028	1790037	0 %	40 %	40 %	20 %	387127640
1062	NC_017857	TTACT	2	10	1792858	1792867	20 %	60 %	0 %	20 %	387127642
1063	NC_017857	TTTTA	2	10	1797112	1797121	20 %	80 %	0 %	0 %	387127647
1064	NC_017857	GCCAA	2	10	1797743	1797752	40 %	0 %	20 %	40 %	387127647
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1097	NC_017857	AATCA	2	10	1858499	1858508	60 %	20 %	0 %	20 %	387127702
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1106	NC_017857	TTTCT	2	10	1871249	1871258	0 %	80 %	0 %	20 %	387127705
1107	NC_017857	AAATC	2	10	1872436	1872445	60 %	20 %	0 %	20 %	387127706
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1120	NC_017857	GTTTT	2	10	1885689	1885698	0 %	80 %	20 %	0 %	387127716
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1122	NC_017857	TGTTT	2	10	1887165	1887174	0 %	80 %	20 %	0 %	387127717
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1493	NC_017857	GGAAC	2	10	2516814	2516823	40 %	0 %	40 %	20 %	387128300
1494	NC_017857	AAATA	2	10	2518359	2518368	80 %	20 %	0 %	0 %	387128302
1495	NC_017857	GCAAA	2	10	2521621	2521630	60 %	0 %	20 %	20 %	387128305
1496	NC_017857	AAGAA	2	10	2527152	2527161	80 %	0 %	20 %	0 %	387128313
1497	NC_017857	GATGG	2	10	2527373	2527382	20 %	20 %	60 %	0 %	387128314
1498	NC_017857	CCAAC	2	10	2537762	2537771	40 %	0 %	0 %	60 %	387128322
1499	NC_017857	CAGTG	2	10	2540563	2540572	20 %	20 %	40 %	20 %	387128325
1500	NC_017857	TGCCC	2	10	2541792	2541801	0 %	20 %	20 %	60 %	387128326

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