MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 1806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017857	TTTCA	2	10	815941	815950	20 %	60 %	0 %	20 %	387126690
502	NC_017857	ATCTG	2	10	818213	818222	20 %	40 %	20 %	20 %	387126691
503	NC_017857	CTTTT	2	10	818700	818709	0 %	80 %	0 %	20 %	387126692
504	NC_017857	CTCGC	2	10	821809	821818	0 %	20 %	20 %	60 %	387126697
505	NC_017857	AGTGG	2	10	822336	822345	20 %	20 %	60 %	0 %	387126697
506	NC_017857	AAATG	2	10	827267	827276	60 %	20 %	20 %	0 %	387126701
507	NC_017857	CCAGA	2	10	829172	829181	40 %	0 %	20 %	40 %	387126703
508	NC_017857	CATCA	2	10	829486	829495	40 %	20 %	0 %	40 %	387126703
509	NC_017857	CTGGT	2	10	837565	837574	0 %	40 %	40 %	20 %	387126712
510	NC_017857	TGACC	2	10	838970	838979	20 %	20 %	20 %	40 %	387126713
511	NC_017857	TTGAT	2	10	840089	840098	20 %	60 %	20 %	0 %	387126714
512	NC_017857	TTGGT	2	10	840147	840156	0 %	60 %	40 %	0 %	387126714
513	NC_017857	TGATT	2	10	841172	841181	20 %	60 %	20 %	0 %	387126714
514	NC_017857	CGTGA	2	10	843188	843197	20 %	20 %	40 %	20 %	387126715
515	NC_017857	CCATG	2	10	845644	845653	20 %	20 %	20 %	40 %	387126719
516	NC_017857	TTTAG	2	10	852475	852484	20 %	60 %	20 %	0 %	387126722
517	NC_017857	ATACT	2	10	852593	852602	40 %	40 %	0 %	20 %	387126722
518	NC_017857	TTCTT	2	10	854281	854290	0 %	80 %	0 %	20 %	387126724
519	NC_017857	TTTGT	2	10	855597	855606	0 %	80 %	20 %	0 %	387126725
520	NC_017857	TAAAA	2	10	855771	855780	80 %	20 %	0 %	0 %	387126725
521	NC_017857	TGTAA	2	10	856353	856362	40 %	40 %	20 %	0 %	387126726
522	NC_017857	GCCGT	2	10	857469	857478	0 %	20 %	40 %	40 %	387126727
523	NC_017857	GATCA	2	10	858998	859007	40 %	20 %	20 %	20 %	387126728
524	NC_017857	ATGTC	2	10	859441	859450	20 %	40 %	20 %	20 %	387126729
525	NC_017857	TTCTG	2	10	864656	864665	0 %	60 %	20 %	20 %	387126734
526	NC_017857	AGTGG	2	10	864680	864689	20 %	20 %	60 %	0 %	387126734
527	NC_017857	TTGCT	2	10	865361	865370	0 %	60 %	20 %	20 %	387126734
528	NC_017857	AGTTT	2	10	865665	865674	20 %	60 %	20 %	0 %	387126735
529	NC_017857	GATCC	2	10	866775	866784	20 %	20 %	20 %	40 %	387126735
530	NC_017857	TCATT	2	10	869543	869552	20 %	60 %	0 %	20 %	387126738
531	NC_017857	ATTGC	2	10	869796	869805	20 %	40 %	20 %	20 %	387126739
532	NC_017857	TCAGC	2	10	870737	870746	20 %	20 %	20 %	40 %	387126739
533	NC_017857	ACCGT	2	10	872904	872913	20 %	20 %	20 %	40 %	387126742
534	NC_017857	TAATT	2	10	873332	873341	40 %	60 %	0 %	0 %	387126742
535	NC_017857	TACCA	2	10	873650	873659	40 %	20 %	0 %	40 %	387126742
536	NC_017857	GAATG	2	10	874967	874976	40 %	20 %	40 %	0 %	387126744
537	NC_017857	CAGTC	2	10	876142	876151	20 %	20 %	20 %	40 %	387126745
538	NC_017857	CAAAA	2	10	877031	877040	80 %	0 %	0 %	20 %	387126746
539	NC_017857	TGGAT	2	10	879119	879128	20 %	40 %	40 %	0 %	387126747
540	NC_017857	ACACA	2	10	879492	879501	60 %	0 %	0 %	40 %	387126747
541	NC_017857	GTGTT	2	10	881405	881414	0 %	60 %	40 %	0 %	387126750
542	NC_017857	TTGAT	2	10	882739	882748	20 %	60 %	20 %	0 %	387126751
543	NC_017857	ATCTG	2	10	887680	887689	20 %	40 %	20 %	20 %	387126758
544	NC_017857	AGATC	2	10	888011	888020	40 %	20 %	20 %	20 %	387126758
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549	NC_017857	AAGCT	2	10	893771	893780	40 %	20 %	20 %	20 %	387126762
550	NC_017857	AATTT	2	10	894179	894188	40 %	60 %	0 %	0 %	387126763
551	NC_017857	GGTAC	2	10	895266	895275	20 %	20 %	40 %	20 %	387126764
552	NC_017857	CTATT	2	10	896176	896185	20 %	60 %	0 %	20 %	387126764
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557	NC_017857	TCCGG	2	10	905690	905699	0 %	20 %	40 %	40 %	387126774
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561	NC_017857	CCATT	2	10	914811	914820	20 %	40 %	0 %	40 %	387126780
562	NC_017857	AATGC	2	10	915044	915053	40 %	20 %	20 %	20 %	387126781
563	NC_017857	CTGTC	2	10	915198	915207	0 %	40 %	20 %	40 %	387126781
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569	NC_017857	ATTGG	2	10	922364	922373	20 %	40 %	40 %	0 %	387126786
570	NC_017857	TATTT	2	10	926127	926136	20 %	80 %	0 %	0 %	387126792
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585	NC_017857	TGGCT	2	10	960477	960486	0 %	40 %	40 %	20 %	387126829
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594	NC_017857	GCGAT	2	10	989160	989169	20 %	20 %	40 %	20 %	387126863
595	NC_017857	TAATT	2	10	991589	991598	40 %	60 %	0 %	0 %	387126865
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599	NC_017857	GTATT	2	10	999971	999980	20 %	60 %	20 %	0 %	387126876
600	NC_017857	TTAGT	2	10	1002167	1002176	20 %	60 %	20 %	0 %	387126880
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606	NC_017857	CAATT	2	10	1018741	1018750	40 %	40 %	0 %	20 %	387126893
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610	NC_017857	AAAAT	2	10	1026592	1026601	80 %	20 %	0 %	0 %	387126899
611	NC_017857	TCCAC	2	10	1028077	1028086	20 %	20 %	0 %	60 %	387126901
612	NC_017857	TGGTC	2	10	1029023	1029032	0 %	40 %	40 %	20 %	387126902
613	NC_017857	ATCAA	2	10	1029322	1029331	60 %	20 %	0 %	20 %	387126902
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615	NC_017857	GGTAT	2	10	1034652	1034661	20 %	40 %	40 %	0 %	387126908
616	NC_017857	TCCGG	2	10	1035057	1035066	0 %	20 %	40 %	40 %	387126908
617	NC_017857	ATCGG	2	10	1043126	1043135	20 %	20 %	40 %	20 %	387126915
618	NC_017857	GGGGC	2	10	1048274	1048283	0 %	0 %	80 %	20 %	387126921
619	NC_017857	TTATG	2	10	1054160	1054169	20 %	60 %	20 %	0 %	387126924
620	NC_017857	CAGAA	2	10	1054738	1054747	60 %	0 %	20 %	20 %	387126925
621	NC_017857	TTTCA	2	10	1055328	1055337	20 %	60 %	0 %	20 %	387126925
622	NC_017857	AGCAG	2	10	1057091	1057100	40 %	0 %	40 %	20 %	387126926
623	NC_017857	GGCAA	2	10	1065581	1065590	40 %	0 %	40 %	20 %	387126933
624	NC_017857	AAAAC	2	10	1067242	1067251	80 %	0 %	0 %	20 %	387126934
625	NC_017857	GGGTT	2	10	1070438	1070447	0 %	40 %	60 %	0 %	387126938
626	NC_017857	AACAG	2	10	1071599	1071608	60 %	0 %	20 %	20 %	387126939
627	NC_017857	TTGAA	2	10	1071917	1071926	40 %	40 %	20 %	0 %	387126940
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