MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D7S-1 chromosome

Total Repeats: 1773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017846	CTTGG	2	10	371	380	0 %	40 %	40 %	20 %	387119834
2	NC_017846	ATTTT	2	10	1033	1042	20 %	80 %	0 %	0 %	387119834
3	NC_017846	ATCAC	2	10	5155	5164	40 %	20 %	0 %	40 %	387119841
4	NC_017846	CGGAG	2	10	10748	10757	20 %	0 %	60 %	20 %	387119846
5	NC_017846	TTAAT	2	10	10982	10991	40 %	60 %	0 %	0 %	387119846
6	NC_017846	CGGGG	2	10	11807	11816	0 %	0 %	80 %	20 %	387119847
7	NC_017846	CTGAA	2	10	12046	12055	40 %	20 %	20 %	20 %	387119847
8	NC_017846	CGGTG	2	10	13996	14005	0 %	20 %	60 %	20 %	387119848
9	NC_017846	CTTGC	2	10	14388	14397	0 %	40 %	20 %	40 %	387119849
10	NC_017846	CGAAC	2	10	15216	15225	40 %	0 %	20 %	40 %	387119849
11	NC_017846	TTATT	2	10	16306	16315	20 %	80 %	0 %	0 %	387119850
12	NC_017846	TTTGG	2	10	16422	16431	0 %	60 %	40 %	0 %	387119851
13	NC_017846	CAATT	2	10	16718	16727	40 %	40 %	0 %	20 %	387119851
14	NC_017846	TCCAA	2	10	17155	17164	40 %	20 %	0 %	40 %	387119851
15	NC_017846	CGTTA	2	10	17692	17701	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017846	TTGTA	2	10	19169	19178	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017846	AAATT	2	10	20257	20266	60 %	40 %	0 %	0 %	387119854
18	NC_017846	CCAGC	2	10	21181	21190	20 %	0 %	20 %	60 %	387119855
19	NC_017846	AAATT	2	10	22964	22973	60 %	40 %	0 %	0 %	387119856
20	NC_017846	ACGGC	2	10	24083	24092	20 %	0 %	40 %	40 %	387119857
21	NC_017846	CACAA	2	10	24594	24603	60 %	0 %	0 %	40 %	387119858
22	NC_017846	ATCAA	2	10	25557	25566	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017846	GCCTT	2	10	27878	27887	0 %	40 %	20 %	40 %	387119860
24	NC_017846	ACGTT	2	10	27997	28006	20 %	40 %	20 %	20 %	387119860
25	NC_017846	TTTTG	2	10	28379	28388	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017846	CAATT	2	10	28514	28523	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017846	CCGCC	2	10	29477	29486	0 %	0 %	20 %	80 %	387119861
28	NC_017846	TGTGG	2	10	30350	30359	0 %	40 %	60 %	0 %	387119862
29	NC_017846	TTTAT	2	10	33501	33510	20 %	80 %	0 %	0 %	387119866
30	NC_017846	AAAAC	2	10	34161	34170	80 %	0 %	0 %	20 %	387119867
31	NC_017846	AAAAT	2	10	38080	38089	80 %	20 %	0 %	0 %	387119872
32	NC_017846	CACCG	2	10	38310	38319	20 %	0 %	20 %	60 %	387119873
33	NC_017846	GTTTG	2	10	39561	39570	0 %	60 %	40 %	0 %	387119873
34	NC_017846	ACGCC	2	10	40624	40633	20 %	0 %	20 %	60 %	387119875
35	NC_017846	ACACC	2	10	47540	47549	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_017846	GCGGG	2	10	48719	48728	0 %	0 %	80 %	20 %	387119882
37	NC_017846	GATAA	2	10	50505	50514	60 %	20 %	20 %	0 %	387119883
38	NC_017846	AATTG	2	10	50569	50578	40 %	40 %	20 %	0 %	387119883
39	NC_017846	ACCGC	2	10	50730	50739	20 %	0 %	20 %	60 %	387119884
40	NC_017846	TGCAC	2	10	51162	51171	20 %	20 %	20 %	40 %	387119884
41	NC_017846	TTCCC	2	10	51777	51786	0 %	40 %	0 %	60 %	387119884
42	NC_017846	GTACC	2	10	53254	53263	20 %	20 %	20 %	40 %	387119884
43	NC_017846	GTTCA	2	10	54334	54343	20 %	40 %	20 %	20 %	387119885
44	NC_017846	GGGTC	2	10	55811	55820	0 %	20 %	60 %	20 %	387119887
45	NC_017846	TTTGG	2	10	57526	57535	0 %	60 %	40 %	0 %	387119888
46	NC_017846	TTGCC	2	10	58972	58981	0 %	40 %	20 %	40 %	387119888
47	NC_017846	TTTGC	2	10	59047	59056	0 %	60 %	20 %	20 %	387119888
48	NC_017846	CAAGG	2	10	59938	59947	40 %	0 %	40 %	20 %	387119889
49	NC_017846	AACTT	2	10	62982	62991	40 %	40 %	0 %	20 %	387119891
50	NC_017846	CTGAA	2	10	65524	65533	40 %	20 %	20 %	20 %	387119893
51	NC_017846	AACGA	2	10	67660	67669	60 %	0 %	20 %	20 %	387119896
52	NC_017846	TCCTT	2	10	68416	68425	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_017846	TTTAA	2	10	68531	68540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017846	ACGCA	2	10	70299	70308	40 %	0 %	20 %	40 %	387119898
55	NC_017846	CGCTA	2	10	71582	71591	20 %	20 %	20 %	40 %	387119899
56	NC_017846	CGGCA	2	10	71911	71920	20 %	0 %	40 %	40 %	387119900
57	NC_017846	ACGCA	2	10	72639	72648	40 %	0 %	20 %	40 %	387119900
58	NC_017846	ATTGT	2	10	73059	73068	20 %	60 %	20 %	0 %	387119900
59	NC_017846	AACAC	2	10	76630	76639	60 %	0 %	0 %	40 %	387119901
60	NC_017846	TTTTC	2	10	82035	82044	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017846	CAAAA	2	10	84965	84974	80 %	0 %	0 %	20 %	387119908
62	NC_017846	GTCCG	2	10	85163	85172	0 %	20 %	40 %	40 %	387119909
63	NC_017846	GCAAT	2	10	86049	86058	40 %	20 %	20 %	20 %	387119909
64	NC_017846	ATACC	2	10	87110	87119	40 %	20 %	0 %	40 %	387119909
65	NC_017846	GTGCG	2	10	88134	88143	0 %	20 %	60 %	20 %	387119910
66	NC_017846	ACCCA	2	10	88786	88795	40 %	0 %	0 %	60 %	387119910
67	NC_017846	AAGGC	2	10	89051	89060	40 %	0 %	40 %	20 %	387119910
68	NC_017846	CTCTA	2	10	89174	89183	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017846	TTTTA	2	10	89264	89273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017846	GGTTA	2	10	90995	91004	20 %	40 %	40 %	0 %	387119912
71	NC_017846	TAAAT	2	10	95344	95353	60 %	40 %	0 %	0 %	387119914
72	NC_017846	ATTTA	2	10	95886	95895	40 %	60 %	0 %	0 %	387119915
73	NC_017846	AAATA	2	10	97189	97198	80 %	20 %	0 %	0 %	387119916
74	NC_017846	GGCAA	2	10	98250	98259	40 %	0 %	40 %	20 %	387119916
75	NC_017846	ATTTT	2	10	99962	99971	20 %	80 %	0 %	0 %	387119917
76	NC_017846	TCGAA	2	10	100613	100622	40 %	20 %	20 %	20 %	387119919
77	NC_017846	CACTA	2	10	103700	103709	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017846	AGAAA	2	10	103712	103721	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017846	TGCAA	2	10	104808	104817	40 %	20 %	20 %	20 %	387119924
80	NC_017846	TGATG	2	10	105092	105101	20 %	40 %	40 %	0 %	387119924
81	NC_017846	AAAAT	2	10	105719	105728	80 %	20 %	0 %	0 %	387119926
82	NC_017846	CTTGT	3	15	106056	106070	0 %	60 %	20 %	20 %	387119926
83	NC_017846	AAAAT	2	10	107891	107900	80 %	20 %	0 %	0 %	387119929
84	NC_017846	CATTT	2	10	109531	109540	20 %	60 %	0 %	20 %	387119930
85	NC_017846	GCCGC	2	10	110656	110665	0 %	0 %	40 %	60 %	387119931
86	NC_017846	GAAAT	2	10	111441	111450	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017846	CAAAC	2	10	112412	112421	60 %	0 %	0 %	40 %	387119932
88	NC_017846	CAACG	2	10	112673	112682	40 %	0 %	20 %	40 %	387119932
89	NC_017846	CCGGC	2	10	112974	112983	0 %	0 %	40 %	60 %	387119933
90	NC_017846	CGGCG	2	10	113332	113341	0 %	0 %	60 %	40 %	387119933
91	NC_017846	TTCTA	2	10	116126	116135	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017846	GATTT	2	10	117223	117232	20 %	60 %	20 %	0 %	387119935
93	NC_017846	CGGCG	2	10	122816	122825	0 %	0 %	60 %	40 %	387119942
94	NC_017846	TGCCG	2	10	123811	123820	0 %	20 %	40 %	40 %	387119943
95	NC_017846	AACCA	2	10	124493	124502	60 %	0 %	0 %	40 %	387119943
96	NC_017846	CGCTT	2	10	124636	124645	0 %	40 %	20 %	40 %	387119943
97	NC_017846	TTAAA	2	10	125403	125412	60 %	40 %	0 %	0 %	387119943
98	NC_017846	AATCG	2	10	127109	127118	40 %	20 %	20 %	20 %	387119944
99	NC_017846	AACAG	2	10	127123	127132	60 %	0 %	20 %	20 %	387119944
100	NC_017846	ATTTA	2	10	127262	127271	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017846	TACGA	2	10	128070	128079	40 %	20 %	20 %	20 %	387119945
102	NC_017846	AAGCG	2	10	128800	128809	40 %	0 %	40 %	20 %	387119946
103	NC_017846	CCCTG	2	10	131824	131833	0 %	20 %	20 %	60 %	387119950
104	NC_017846	GCCAC	2	10	133421	133430	20 %	0 %	20 %	60 %	387119952
105	NC_017846	AATCG	2	10	133583	133592	40 %	20 %	20 %	20 %	387119952
106	NC_017846	GCTAC	2	10	133964	133973	20 %	20 %	20 %	40 %	387119952
107	NC_017846	ACACC	2	10	135316	135325	40 %	0 %	0 %	60 %	387119953
108	NC_017846	AAGGC	2	10	138478	138487	40 %	0 %	40 %	20 %	387119958
109	NC_017846	GAAAA	2	10	144008	144017	80 %	0 %	20 %	0 %	387119962
110	NC_017846	TGATG	2	10	144523	144532	20 %	40 %	40 %	0 %	387119963
111	NC_017846	AAATC	2	10	146379	146388	60 %	20 %	0 %	20 %	387119965
112	NC_017846	TTCGC	2	10	147188	147197	0 %	40 %	20 %	40 %	387119965
113	NC_017846	ATCAA	2	10	147890	147899	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017846	ATTTT	2	10	149510	149519	20 %	80 %	0 %	0 %	387119967
115	NC_017846	AATTA	2	10	150013	150022	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017846	AATTA	2	10	150081	150090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017846	GTTAG	2	10	150333	150342	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017846	ATTAA	2	10	154533	154542	60 %	40 %	0 %	0 %	387119973
119	NC_017846	TAAAC	2	10	154664	154673	60 %	20 %	0 %	20 %	387119973
120	NC_017846	AAAAT	2	10	155131	155140	80 %	20 %	0 %	0 %	387119973
121	NC_017846	ATAAA	2	10	155488	155497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017846	ATAAA	2	10	155524	155533	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017846	TATAA	2	10	156074	156083	60 %	40 %	0 %	0 %	387119974
124	NC_017846	GGCAT	2	10	158246	158255	20 %	20 %	40 %	20 %	387119976
125	NC_017846	GTTCT	2	10	158503	158512	0 %	60 %	20 %	20 %	387119976
126	NC_017846	ATCAA	2	10	159338	159347	60 %	20 %	0 %	20 %	387119976
127	NC_017846	CTTCA	2	10	159744	159753	20 %	40 %	0 %	40 %	387119977
128	NC_017846	TGCGG	2	10	160718	160727	0 %	20 %	60 %	20 %	387119978
129	NC_017846	CTGCC	2	10	161480	161489	0 %	20 %	20 %	60 %	387119979
130	NC_017846	CAAGC	2	10	161625	161634	40 %	0 %	20 %	40 %	387119979
131	NC_017846	TGGCA	2	10	162656	162665	20 %	20 %	40 %	20 %	387119980
132	NC_017846	AATGT	2	10	164969	164978	40 %	40 %	20 %	0 %	387119982
133	NC_017846	ACCAC	2	10	165258	165267	40 %	0 %	0 %	60 %	387119982
134	NC_017846	AATCC	2	10	166057	166066	40 %	20 %	0 %	40 %	387119982
135	NC_017846	ATTTG	2	10	168445	168454	20 %	60 %	20 %	0 %	387119983
136	NC_017846	TCTGC	2	10	168533	168542	0 %	40 %	20 %	40 %	387119983
137	NC_017846	GTAAA	2	10	168544	168553	60 %	20 %	20 %	0 %	387119983
138	NC_017846	GATTG	2	10	168563	168572	20 %	40 %	40 %	0 %	387119983
139	NC_017846	AAATA	2	10	168649	168658	80 %	20 %	0 %	0 %	387119983
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151	NC_017846	CAAAC	2	10	181939	181948	60 %	0 %	0 %	40 %	387119998
152	NC_017846	ACGCC	2	10	182381	182390	20 %	0 %	20 %	60 %	387119998
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262	NC_017846	GCCGT	2	10	324465	324474	0 %	20 %	40 %	40 %	387120131
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266	NC_017846	TTTAT	2	10	329020	329029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_017846	GGCAT	2	10	329313	329322	20 %	20 %	40 %	20 %	387120135
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269	NC_017846	ATTTT	2	10	332431	332440	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017846	TTGCC	2	10	333320	333329	0 %	40 %	20 %	40 %	387120139
271	NC_017846	CAAGG	2	10	336765	336774	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
272	NC_017846	AGCCA	2	10	337037	337046	40 %	0 %	20 %	40 %	387120141
273	NC_017846	AAGCC	2	10	341711	341720	40 %	0 %	20 %	40 %	387120145
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278	NC_017846	TGATT	2	10	347996	348005	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_017846	TTTAA	2	10	364319	364328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_017846	CTAAC	2	10	365854	365863	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
294	NC_017846	CGACT	2	10	366308	366317	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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297	NC_017846	CTCAT	2	10	369293	369302	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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392	NC_017846	CCGAG	2	10	498444	498453	20 %	0 %	40 %	40 %	387120288
393	NC_017846	CGGCA	2	10	500181	500190	20 %	0 %	40 %	40 %	387120290
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399	NC_017846	TAAAA	2	10	505099	505108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_017846	TCAAA	2	10	505500	505509	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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