MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D7S-1 chromosome

Total Repeats: 1773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017846	GCCCG	2	10	639066	639075	0 %	0 %	40 %	60 %	387120424
502	NC_017846	CTGTT	2	10	639849	639858	0 %	60 %	20 %	20 %	387120425
503	NC_017846	TTTTC	2	10	640164	640173	0 %	80 %	0 %	20 %	387120426
504	NC_017846	ATTTT	2	10	640218	640227	20 %	80 %	0 %	0 %	387120426
505	NC_017846	CAAAG	2	10	641283	641292	60 %	0 %	20 %	20 %	387120427
506	NC_017846	TACCG	2	10	641360	641369	20 %	20 %	20 %	40 %	387120427
507	NC_017846	ATTTT	2	10	641819	641828	20 %	80 %	0 %	0 %	387120428
508	NC_017846	AAATA	2	10	643185	643194	80 %	20 %	0 %	0 %	387120429
509	NC_017846	ATAAA	2	10	643848	643857	80 %	20 %	0 %	0 %	387120430
510	NC_017846	TTTTG	2	10	644918	644927	0 %	80 %	20 %	0 %	387120432
511	NC_017846	GTAAA	2	10	646732	646741	60 %	20 %	20 %	0 %	387120435
512	NC_017846	ATGGC	2	10	647381	647390	20 %	20 %	40 %	20 %	387120436
513	NC_017846	TCGTT	2	10	647999	648008	0 %	60 %	20 %	20 %	387120437
514	NC_017846	CTTGG	2	10	648108	648117	0 %	40 %	40 %	20 %	387120437
515	NC_017846	TGAAA	2	10	650009	650018	60 %	20 %	20 %	0 %	387120439
516	NC_017846	GCCAA	2	10	650171	650180	40 %	0 %	20 %	40 %	387120439
517	NC_017846	TTTGC	2	10	652964	652973	0 %	60 %	20 %	20 %	387120442
518	NC_017846	GTTTT	2	10	653078	653087	0 %	80 %	20 %	0 %	387120442
519	NC_017846	AATTT	2	10	657443	657452	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017846	ATGCA	2	10	657515	657524	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
521	NC_017846	TAAAA	2	10	658083	658092	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017846	ATGTA	2	10	658144	658153	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017846	TAAAT	2	10	661351	661360	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017846	TCGGT	2	10	661644	661653	0 %	40 %	40 %	20 %	387120452
525	NC_017846	TTCGG	2	10	662786	662795	0 %	40 %	40 %	20 %	387120452
526	NC_017846	GGTGT	2	10	662936	662945	0 %	40 %	60 %	0 %	387120452
527	NC_017846	CGATT	2	10	663685	663694	20 %	40 %	20 %	20 %	387120452
528	NC_017846	AACGC	2	10	664460	664469	40 %	0 %	20 %	40 %	387120452
529	NC_017846	ACGTT	2	10	665867	665876	20 %	40 %	20 %	20 %	387120454
530	NC_017846	TGTAA	2	10	670171	670180	40 %	40 %	20 %	0 %	387120461
531	NC_017846	GACAA	2	10	672000	672009	60 %	0 %	20 %	20 %	387120462
532	NC_017846	ATTCT	2	10	672444	672453	20 %	60 %	0 %	20 %	387120462
533	NC_017846	TGCAA	2	10	673362	673371	40 %	20 %	20 %	20 %	387120462
534	NC_017846	TAACT	2	10	674466	674475	40 %	40 %	0 %	20 %	387120463
535	NC_017846	CCTGT	2	10	675428	675437	0 %	40 %	20 %	40 %	387120463
536	NC_017846	GGCAA	2	10	675495	675504	40 %	0 %	40 %	20 %	387120463
537	NC_017846	AGGAA	2	10	680887	680896	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017846	AAATA	2	10	681410	681419	80 %	20 %	0 %	0 %	387120473
539	NC_017846	ATTTG	2	10	681774	681783	20 %	60 %	20 %	0 %	387120474
540	NC_017846	AATGG	2	10	682044	682053	40 %	20 %	40 %	0 %	387120474
541	NC_017846	CCGCA	2	10	682333	682342	20 %	0 %	20 %	60 %	387120475
542	NC_017846	AAATT	2	10	683113	683122	60 %	40 %	0 %	0 %	387120475
543	NC_017846	GCGCA	2	10	683689	683698	20 %	0 %	40 %	40 %	387120475
544	NC_017846	AAGGC	2	10	686851	686860	40 %	0 %	40 %	20 %	387120478
545	NC_017846	TTAAC	2	10	686997	687006	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
546	NC_017846	ACCCT	2	10	687145	687154	20 %	20 %	0 %	60 %	387120479
547	NC_017846	GCACC	2	10	687537	687546	20 %	0 %	20 %	60 %	387120479
548	NC_017846	GCAGT	2	10	689312	689321	20 %	20 %	40 %	20 %	387120480
549	NC_017846	TCCAA	2	10	691478	691487	40 %	20 %	0 %	40 %	387120481
550	NC_017846	ACAGG	2	10	692116	692125	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
551	NC_017846	AGAAA	2	10	694076	694085	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017846	CCTGC	2	10	696394	696403	0 %	20 %	20 %	60 %	387120486
553	NC_017846	CATTG	2	10	699488	699497	20 %	40 %	20 %	20 %	387120490
554	NC_017846	GCGCG	2	10	702601	702610	0 %	0 %	60 %	40 %	387120493
555	NC_017846	TTCGC	2	10	704154	704163	0 %	40 %	20 %	40 %	387120494
556	NC_017846	GAATG	2	10	705205	705214	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017846	TGCCA	2	10	705447	705456	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
558	NC_017846	ACGCA	2	10	706097	706106	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
559	NC_017846	GTTTG	2	10	706192	706201	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017846	CAAAT	2	10	706433	706442	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
561	NC_017846	CGGCG	2	10	707511	707520	0 %	0 %	60 %	40 %	387120496
562	NC_017846	CGGGC	2	10	710828	710837	0 %	0 %	60 %	40 %	387120498
563	NC_017846	TGCAG	2	10	711305	711314	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
564	NC_017846	TTTTC	2	10	711380	711389	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
565	NC_017846	GCACT	2	10	721824	721833	20 %	20 %	20 %	40 %	387120504
566	NC_017846	AAACA	2	10	725507	725516	80 %	0 %	0 %	20 %	387120505
567	NC_017846	AGGCA	2	10	732879	732888	40 %	0 %	40 %	20 %	387120508
568	NC_017846	GTGCG	2	10	734299	734308	0 %	20 %	60 %	20 %	387120512
569	NC_017846	GATGT	2	10	734754	734763	20 %	40 %	40 %	0 %	387120512
570	NC_017846	AATTA	2	10	735235	735244	60 %	40 %	0 %	0 %	387120512
571	NC_017846	TGAAC	2	10	735425	735434	40 %	20 %	20 %	20 %	387120512
572	NC_017846	GCAAC	2	10	735590	735599	40 %	0 %	20 %	40 %	387120512
573	NC_017846	CCCAA	2	10	737571	737580	40 %	0 %	0 %	60 %	387120514
574	NC_017846	TAATT	2	10	738318	738327	40 %	60 %	0 %	0 %	387120514
575	NC_017846	GTCTT	2	10	738975	738984	0 %	60 %	20 %	20 %	387120514
576	NC_017846	TGGCT	2	10	741443	741452	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
577	NC_017846	CTTCC	2	10	741782	741791	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
578	NC_017846	TTTAA	2	10	741889	741898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017846	CTAAC	2	10	743424	743433	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
580	NC_017846	CGACT	2	10	743878	743887	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
581	NC_017846	TCGGT	2	10	744253	744262	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
582	NC_017846	TTAAA	2	10	745076	745085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017846	CTCAT	2	10	746675	746684	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
584	NC_017846	TTCAA	2	10	746899	746908	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
585	NC_017846	GCAAA	2	10	748338	748347	60 %	0 %	20 %	20 %	387120518
586	NC_017846	ATAAA	2	10	748829	748838	80 %	20 %	0 %	0 %	387120518
587	NC_017846	GTTGA	2	10	749662	749671	20 %	40 %	40 %	0 %	387120521
588	NC_017846	GCCAT	2	10	752579	752588	20 %	20 %	20 %	40 %	387120528
589	NC_017846	TCCGC	2	10	753162	753171	0 %	20 %	20 %	60 %	387120528
590	NC_017846	TAAAA	2	10	758018	758027	80 %	20 %	0 %	0 %	387120535
591	NC_017846	CGTAG	2	10	759034	759043	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
592	NC_017846	TTACC	2	10	762086	762095	20 %	40 %	0 %	40 %	387120543
593	NC_017846	TTAAA	2	10	762556	762565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017846	AGCAG	2	10	763244	763253	40 %	0 %	40 %	20 %	387120546
595	NC_017846	TAACA	2	10	766041	766050	60 %	20 %	0 %	20 %	387120550
596	NC_017846	AATAA	2	10	767364	767373	80 %	20 %	0 %	0 %	387120552
597	NC_017846	ATTTT	2	10	767665	767674	20 %	80 %	0 %	0 %	387120553
598	NC_017846	ATAAA	2	10	770846	770855	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017846	TAAAT	2	10	771159	771168	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017846	GAAAA	2	10	771192	771201	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017846	GGTAT	2	10	773388	773397	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017846	CCGCA	2	10	777406	777415	20 %	0 %	20 %	60 %	387120562
603	NC_017846	TGCGG	2	10	777621	777630	0 %	20 %	60 %	20 %	387120562
604	NC_017846	TCTTG	2	10	778392	778401	0 %	60 %	20 %	20 %	387120563
605	NC_017846	GCGTT	2	10	780333	780342	0 %	40 %	40 %	20 %	387120565
606	NC_017846	GCGAC	2	10	780655	780664	20 %	0 %	40 %	40 %	387120565
607	NC_017846	AAAGC	2	10	781675	781684	60 %	0 %	20 %	20 %	387120566
608	NC_017846	AAATT	2	10	782273	782282	60 %	40 %	0 %	0 %	387120567
609	NC_017846	GGACG	2	10	784251	784260	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
610	NC_017846	AAATT	2	10	784403	784412	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017846	AATTC	2	10	786171	786180	40 %	40 %	0 %	20 %	387120570
612	NC_017846	TTTTA	2	10	786374	786383	20 %	80 %	0 %	0 %	387120570
613	NC_017846	CCGCC	2	10	786868	786877	0 %	0 %	20 %	80 %	387120571
614	NC_017846	CGATG	2	10	788529	788538	20 %	20 %	40 %	20 %	387120573
615	NC_017846	CCGCG	2	10	789496	789505	0 %	0 %	40 %	60 %	387120573
616	NC_017846	ACTTT	2	10	789541	789550	20 %	60 %	0 %	20 %	387120573
617	NC_017846	AAATA	2	10	790232	790241	80 %	20 %	0 %	0 %	387120574
618	NC_017846	AATTT	2	10	793635	793644	40 %	60 %	0 %	0 %	387120579
619	NC_017846	ATTTT	2	10	795169	795178	20 %	80 %	0 %	0 %	387120581
620	NC_017846	GCTTG	2	10	797647	797656	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
621	NC_017846	CAATC	2	10	798071	798080	40 %	20 %	0 %	40 %	387120584
622	NC_017846	TTAAA	2	10	798422	798431	60 %	40 %	0 %	0 %	387120585
623	NC_017846	AAAAC	2	10	799635	799644	80 %	0 %	0 %	20 %	387120587
624	NC_017846	GTACG	2	10	801441	801450	20 %	20 %	40 %	20 %	387120589
625	NC_017846	TTAAA	2	10	801683	801692	60 %	40 %	0 %	0 %	387120590
626	NC_017846	TGAAT	2	10	802760	802769	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017846	GAAAA	2	10	805291	805300	80 %	0 %	20 %	0 %	387120591
628	NC_017846	GTGCG	2	10	805820	805829	0 %	20 %	60 %	20 %	387120592
629	NC_017846	CAAAC	2	10	805947	805956	60 %	0 %	0 %	40 %	387120592
630	NC_017846	AGTGA	2	10	807344	807353	40 %	20 %	40 %	0 %	387120594
631	NC_017846	CTTTT	2	10	812851	812860	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
632	NC_017846	CTTTC	2	10	812879	812888	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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