MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D7S-1 chromosome

Total Repeats: 1773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017846	AAACC	2	10	1296379	1296388	60 %	0 %	0 %	40 %	387121094
1002	NC_017846	TAAAC	2	10	1299997	1300006	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_017846	CAAGC	2	10	1301313	1301322	40 %	0 %	20 %	40 %	387121098
1004	NC_017846	GCCAT	2	10	1307477	1307486	20 %	20 %	20 %	40 %	387121103
1005	NC_017846	CAATA	2	10	1309882	1309891	60 %	20 %	0 %	20 %	387121107
1006	NC_017846	GCACC	2	10	1312895	1312904	20 %	0 %	20 %	60 %	387121109
1007	NC_017846	TTATT	2	10	1313452	1313461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017846	GGAAA	2	10	1315299	1315308	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017846	GGATT	2	10	1318627	1318636	20 %	40 %	40 %	0 %	387121113
1010	NC_017846	CATCA	2	10	1319527	1319536	40 %	20 %	0 %	40 %	387121114
1011	NC_017846	CAAAT	2	10	1320369	1320378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1012	NC_017846	TAGAT	2	10	1323288	1323297	40 %	40 %	20 %	0 %	387121120
1013	NC_017846	GTTGA	2	10	1323563	1323572	20 %	40 %	40 %	0 %	387121121
1014	NC_017846	ATGCC	2	10	1326270	1326279	20 %	20 %	20 %	40 %	387121128
1015	NC_017846	TCGGT	2	10	1328776	1328785	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1016	NC_017846	GGCTT	2	10	1330074	1330083	0 %	40 %	40 %	20 %	387121133
1017	NC_017846	ATTTA	2	10	1330537	1330546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017846	ATATC	2	10	1330852	1330861	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1019	NC_017846	TGATT	2	10	1331650	1331659	20 %	60 %	20 %	0 %	387121135
1020	NC_017846	TTCAA	2	10	1332450	1332459	40 %	40 %	0 %	20 %	387121135
1021	NC_017846	GATCG	2	10	1332827	1332836	20 %	20 %	40 %	20 %	387121135
1022	NC_017846	CCTTG	2	10	1332988	1332997	0 %	40 %	20 %	40 %	387121135
1023	NC_017846	CAATT	2	10	1333743	1333752	40 %	40 %	0 %	20 %	387121135
1024	NC_017846	TTAAC	2	10	1334795	1334804	40 %	40 %	0 %	20 %	387121137
1025	NC_017846	AAATG	2	10	1334925	1334934	60 %	20 %	20 %	0 %	387121137
1026	NC_017846	AATCA	2	10	1338205	1338214	60 %	20 %	0 %	20 %	387121139
1027	NC_017846	GGTTA	2	10	1341600	1341609	20 %	40 %	40 %	0 %	387121142
1028	NC_017846	TTGAA	2	10	1342584	1342593	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017846	ATGAG	2	10	1342808	1342817	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017846	TTTAA	2	10	1344595	1344604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017846	AGTCG	2	10	1345793	1345802	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_017846	AGGTT	2	10	1346245	1346254	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017846	ATTAA	2	10	1347781	1347790	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017846	GGAAG	2	10	1347889	1347898	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017846	CAAGA	4	20	1348692	1348711	60 %	0 %	20 %	20 %	387121143
1036	NC_017846	ATTTT	2	10	1349038	1349047	20 %	80 %	0 %	0 %	387121143
1037	NC_017846	AGCCA	2	10	1349305	1349314	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1038	NC_017846	TACAT	2	10	1349571	1349580	40 %	40 %	0 %	20 %	387121144
1039	NC_017846	ATTGA	2	10	1351998	1352007	40 %	40 %	20 %	0 %	387121146
1040	NC_017846	AAGTA	2	10	1354748	1354757	60 %	20 %	20 %	0 %	387121149
1041	NC_017846	TAACA	2	10	1355312	1355321	60 %	20 %	0 %	20 %	387121150
1042	NC_017846	AAACA	2	10	1356430	1356439	80 %	0 %	0 %	20 %	387121151
1043	NC_017846	AAAAC	2	10	1356518	1356527	80 %	0 %	0 %	20 %	387121151
1044	NC_017846	ACTTC	2	10	1357990	1357999	20 %	40 %	0 %	40 %	387121152
1045	NC_017846	TAAAG	2	10	1358820	1358829	60 %	20 %	20 %	0 %	387121153
1046	NC_017846	AACAC	2	10	1358884	1358893	60 %	0 %	0 %	40 %	387121153
1047	NC_017846	CAATG	2	10	1359652	1359661	40 %	20 %	20 %	20 %	387121154
1048	NC_017846	AAAGT	2	10	1361918	1361927	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017846	AAACA	2	10	1362265	1362274	80 %	0 %	0 %	20 %	387121157
1050	NC_017846	CTATT	2	10	1362667	1362676	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1051	NC_017846	AAAAT	2	10	1362968	1362977	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017846	GGCTT	2	10	1364120	1364129	0 %	40 %	40 %	20 %	387121161
1053	NC_017846	AATCG	2	10	1366097	1366106	40 %	20 %	20 %	20 %	387121164
1054	NC_017846	TTTCC	2	10	1366466	1366475	0 %	60 %	0 %	40 %	387121164
1055	NC_017846	TTTGC	2	10	1366776	1366785	0 %	60 %	20 %	20 %	387121164
1056	NC_017846	TATCG	2	10	1367301	1367310	20 %	40 %	20 %	20 %	387121166
1057	NC_017846	GTGCG	2	10	1368645	1368654	0 %	20 %	60 %	20 %	387121167
1058	NC_017846	GCGCG	2	10	1368997	1369006	0 %	0 %	60 %	40 %	387121167
1059	NC_017846	ATCAA	2	10	1372061	1372070	60 %	20 %	0 %	20 %	387121168
1060	NC_017846	TTAAC	2	10	1372837	1372846	40 %	40 %	0 %	20 %	387121169
1061	NC_017846	TATTT	2	10	1376187	1376196	20 %	80 %	0 %	0 %	387121173
1062	NC_017846	CGGTG	2	10	1376417	1376426	0 %	20 %	60 %	20 %	387121173
1063	NC_017846	CGGTG	2	10	1382441	1382450	0 %	20 %	60 %	20 %	387121178
1064	NC_017846	AGAGA	2	10	1388213	1388222	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017846	GTCCG	2	10	1388532	1388541	0 %	20 %	40 %	40 %	387121183
1066	NC_017846	TGATG	2	10	1391575	1391584	20 %	40 %	40 %	0 %	387121185
1067	NC_017846	AAATT	2	10	1391798	1391807	60 %	40 %	0 %	0 %	387121185
1068	NC_017846	AAAAC	2	10	1392370	1392379	80 %	0 %	0 %	20 %	387121185
1069	NC_017846	GGCTT	2	10	1393084	1393093	0 %	40 %	40 %	20 %	387121186
1070	NC_017846	GGTAA	2	10	1393753	1393762	40 %	20 %	40 %	0 %	387121186
1071	NC_017846	TTATT	2	10	1396264	1396273	20 %	80 %	0 %	0 %	387121189
1072	NC_017846	CATGC	2	10	1397020	1397029	20 %	20 %	20 %	40 %	387121189
1073	NC_017846	TGAAT	2	10	1399523	1399532	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017846	AATTT	2	10	1400799	1400808	40 %	60 %	0 %	0 %	387121192
1075	NC_017846	ATTCA	2	10	1403443	1403452	40 %	40 %	0 %	20 %	387121195
1076	NC_017846	AATTG	2	10	1403505	1403514	40 %	40 %	20 %	0 %	387121195
1077	NC_017846	AAAAG	2	10	1403748	1403757	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017846	TTGCA	2	10	1404223	1404232	20 %	40 %	20 %	20 %	387121196
1079	NC_017846	CATTT	2	10	1405149	1405158	20 %	60 %	0 %	20 %	387121197
1080	NC_017846	TTCAA	2	10	1406440	1406449	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1081	NC_017846	TTTAA	2	10	1406503	1406512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017846	AACGA	2	10	1407261	1407270	60 %	0 %	20 %	20 %	387121199
1083	NC_017846	TTGAT	2	10	1407556	1407565	20 %	60 %	20 %	0 %	387121199
1084	NC_017846	TTTGA	2	10	1410996	1411005	20 %	60 %	20 %	0 %	387121201
1085	NC_017846	GGAAT	2	10	1411925	1411934	40 %	20 %	40 %	0 %	387121203
1086	NC_017846	GCGAC	2	10	1413496	1413505	20 %	0 %	40 %	40 %	387121205
1087	NC_017846	TAGTG	2	10	1413641	1413650	20 %	40 %	40 %	0 %	387121205
1088	NC_017846	TGTGG	2	10	1416444	1416453	0 %	40 %	60 %	0 %	387121207
1089	NC_017846	ACCGG	2	10	1418041	1418050	20 %	0 %	40 %	40 %	387121209
1090	NC_017846	CATTA	2	10	1423911	1423920	40 %	40 %	0 %	20 %	387121214
1091	NC_017846	CGCAC	2	10	1425872	1425881	20 %	0 %	20 %	60 %	387121219
1092	NC_017846	TGCCG	2	10	1426564	1426573	0 %	20 %	40 %	40 %	387121221
1093	NC_017846	ATTAA	2	10	1431900	1431909	60 %	40 %	0 %	0 %	387121227
1094	NC_017846	AAATT	2	10	1432000	1432009	60 %	40 %	0 %	0 %	387121227
1095	NC_017846	GTATT	2	10	1434039	1434048	20 %	60 %	20 %	0 %	387121229
1096	NC_017846	ACCAA	2	10	1434723	1434732	60 %	0 %	0 %	40 %	387121229
1097	NC_017846	GAAAG	2	10	1435576	1435585	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017846	TTAAA	2	10	1436068	1436077	60 %	40 %	0 %	0 %	387121232
1099	NC_017846	GAGAG	2	10	1438657	1438666	40 %	0 %	60 %	0 %	387121232
1100	NC_017846	CTGAC	2	10	1439445	1439454	20 %	20 %	20 %	40 %	387121233
1101	NC_017846	ACGCC	2	10	1440076	1440085	20 %	0 %	20 %	60 %	387121233
1102	NC_017846	AAAGG	2	10	1440605	1440614	60 %	0 %	40 %	0 %	387121233
1103	NC_017846	GTCTT	2	10	1440902	1440911	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1104	NC_017846	TTGCG	2	10	1443243	1443252	0 %	40 %	40 %	20 %	387121235
1105	NC_017846	TCAAT	2	10	1443886	1443895	40 %	40 %	0 %	20 %	387121235
1106	NC_017846	TTAAG	2	10	1445250	1445259	40 %	40 %	20 %	0 %	387121236
1107	NC_017846	TTCCT	2	10	1445374	1445383	0 %	60 %	0 %	40 %	387121237
1108	NC_017846	GAATT	2	10	1445812	1445821	40 %	40 %	20 %	0 %	387121237
1109	NC_017846	AAAAT	2	10	1446680	1446689	80 %	20 %	0 %	0 %	387121237
1110	NC_017846	ATGGT	2	10	1449384	1449393	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017846	GGCCT	2	10	1450135	1450144	0 %	20 %	40 %	40 %	387121240
1112	NC_017846	ACGGC	2	10	1450711	1450720	20 %	0 %	40 %	40 %	387121241
1113	NC_017846	AATAC	2	10	1451224	1451233	60 %	20 %	0 %	20 %	387121241
1114	NC_017846	AGCCA	2	10	1452382	1452391	40 %	0 %	20 %	40 %	387121242
1115	NC_017846	ACCAA	2	10	1456761	1456770	60 %	0 %	0 %	40 %	387121246
1116	NC_017846	CCGCA	2	10	1457161	1457170	20 %	0 %	20 %	60 %	387121246
1117	NC_017846	GCATT	2	10	1459276	1459285	20 %	40 %	20 %	20 %	387121247
1118	NC_017846	TTCCG	2	10	1462254	1462263	0 %	40 %	20 %	40 %	387121252
1119	NC_017846	CTTAT	2	10	1463084	1463093	20 %	60 %	0 %	20 %	387121253
1120	NC_017846	CAACT	2	10	1463686	1463695	40 %	20 %	0 %	40 %	387121253
1121	NC_017846	TCGGT	2	10	1464113	1464122	0 %	40 %	40 %	20 %	387121253
1122	NC_017846	TTAAT	2	10	1466929	1466938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017846	CGGTG	2	10	1469149	1469158	0 %	20 %	60 %	20 %	387121261
1124	NC_017846	GTAAT	2	10	1470473	1470482	40 %	40 %	20 %	0 %	387121263
1125	NC_017846	ACATC	2	10	1470609	1470618	40 %	20 %	0 %	40 %	387121263
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