MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Francisella cf. novicida 3523 chromosome

Total Repeats: 26568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017449	TAA	2	6	264	269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823584
2	NC_017449	CAA	2	6	320	325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823584
3	NC_017449	TAA	2	6	366	371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823584
4	NC_017449	TTA	2	6	401	406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823584
5	NC_017449	AGA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823584
6	NC_017449	GAA	2	6	501	506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823584
7	NC_017449	TGA	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823584
8	NC_017449	AGA	2	6	579	584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823584
9	NC_017449	AGC	3	9	669	677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823584
10	NC_017449	TGG	2	6	729	734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387823584
11	NC_017449	TTA	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823584
12	NC_017449	TTC	2	6	908	913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823584
13	NC_017449	GAT	2	6	919	924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823584
14	NC_017449	AAG	2	6	944	949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823584
15	NC_017449	GAA	2	6	1051	1056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823584
16	NC_017449	CAG	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823584
17	NC_017449	CTA	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823584
18	NC_017449	ATA	2	6	1346	1351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823584
19	NC_017449	GTT	2	6	1360	1365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387823584
20	NC_017449	AAG	2	6	1410	1415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823584
21	NC_017449	TGG	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387823584
22	NC_017449	ACA	2	6	1519	1524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823584
23	NC_017449	GAT	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823584
24	NC_017449	TAT	2	6	1742	1747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823585
25	NC_017449	TAT	2	6	1754	1759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823585
26	NC_017449	ATA	3	9	1769	1777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823585
27	NC_017449	TAA	2	6	1956	1961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823585
28	NC_017449	TCA	2	6	2061	2066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823585
29	NC_017449	TAT	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823585
30	NC_017449	ATG	2	6	2099	2104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823585
31	NC_017449	ATA	2	6	2242	2247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823585
32	NC_017449	AGA	2	6	2292	2297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823585
33	NC_017449	ATA	2	6	2414	2419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823585
34	NC_017449	TAA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823585
35	NC_017449	GAA	2	6	2659	2664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823585
36	NC_017449	ATA	2	6	2723	2728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823585
37	NC_017449	TAT	3	9	2736	2744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823585
38	NC_017449	AGT	3	9	2896	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823586
39	NC_017449	TAA	2	6	2908	2913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
40	NC_017449	GCA	2	6	2927	2932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823586
41	NC_017449	TCC	2	6	2935	2940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387823586
42	NC_017449	CAC	2	6	3042	3047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823586
43	NC_017449	ATA	2	6	3098	3103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
44	NC_017449	ACC	2	6	3166	3171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823586
45	NC_017449	GAA	2	6	3203	3208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823586
46	NC_017449	TAT	2	6	3220	3225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823586
47	NC_017449	AAT	2	6	3270	3275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
48	NC_017449	ATG	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823586
49	NC_017449	TAA	2	6	3348	3353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
50	NC_017449	ATT	2	6	3358	3363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823586
51	NC_017449	TGA	2	6	3445	3450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823586
52	NC_017449	AAT	2	6	3478	3483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
53	NC_017449	ATT	2	6	3532	3537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823586
54	NC_017449	CAA	2	6	3541	3546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823586
55	NC_017449	TAA	2	6	3550	3555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
56	NC_017449	GAA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823586
57	NC_017449	TTA	2	6	3638	3643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823586
58	NC_017449	GCT	2	6	3665	3670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823586
59	NC_017449	CCA	2	6	3671	3676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823586
60	NC_017449	CCA	2	6	3683	3688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823586
61	NC_017449	TAA	2	6	3799	3804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
62	NC_017449	AAT	2	6	3812	3817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
63	NC_017449	AGA	2	6	3855	3860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823586
64	NC_017449	TAA	2	6	3876	3881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823586
65	NC_017449	TTG	2	6	3934	3939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387823586
66	NC_017449	GCA	2	6	3968	3973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823586
67	NC_017449	TTA	2	6	4349	4354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823587
68	NC_017449	AGC	2	6	4373	4378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823587
69	NC_017449	TAT	2	6	4432	4437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823587
70	NC_017449	CAA	2	6	4459	4464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823587
71	NC_017449	ATT	2	6	4469	4474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823587
72	NC_017449	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387823588
73	NC_017449	TAG	2	6	4660	4665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823588
74	NC_017449	GCA	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823588
75	NC_017449	AAC	2	6	4731	4736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823588
76	NC_017449	GCA	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823588
77	NC_017449	CAG	2	6	4930	4935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823588
78	NC_017449	TAC	2	6	5011	5016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823588
79	NC_017449	TGG	2	6	5030	5035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387823588
80	NC_017449	CTT	2	6	5353	5358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823588
81	NC_017449	AGA	2	6	5429	5434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823588
82	NC_017449	TGA	2	6	5509	5514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823588
83	NC_017449	TTC	2	6	5562	5567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823588
84	NC_017449	AGA	2	6	5594	5599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823588
85	NC_017449	CTT	2	6	5695	5700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823588
86	NC_017449	ATT	2	6	5705	5710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823588
87	NC_017449	AAT	2	6	5940	5945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823589
88	NC_017449	TTG	2	6	6034	6039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387823589
89	NC_017449	GAA	2	6	6054	6059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823589
90	NC_017449	GAT	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823589
91	NC_017449	TAA	2	6	6097	6102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823589
92	NC_017449	TGA	2	6	6218	6223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823589
93	NC_017449	AAC	2	6	6278	6283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823589
94	NC_017449	AGA	2	6	6353	6358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823589
95	NC_017449	AAT	2	6	6371	6376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823589
96	NC_017449	AAT	2	6	6422	6427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823589
97	NC_017449	AGA	2	6	6432	6437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823589
98	NC_017449	AAC	2	6	6466	6471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823589
99	NC_017449	AGT	2	6	6480	6485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823589
100	NC_017449	TAG	2	6	6520	6525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823589
101	NC_017449	TAA	2	6	6629	6634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823589
102	NC_017449	TTA	2	6	6696	6701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823589
103	NC_017449	ATT	2	6	6767	6772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823589
104	NC_017449	CAT	2	6	6903	6908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823590
105	NC_017449	TGC	2	6	6952	6957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823590
106	NC_017449	TAA	2	6	6958	6963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823590
107	NC_017449	ACA	2	6	6998	7003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823590
108	NC_017449	CAT	2	6	7215	7220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823590
109	NC_017449	TTA	2	6	7241	7246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823590
110	NC_017449	TTC	2	6	7252	7257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823590
111	NC_017449	CAG	2	6	7820	7825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823591
112	NC_017449	AAT	2	6	7830	7835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823591
113	NC_017449	AAG	2	6	7928	7933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823591
114	NC_017449	AGA	2	6	8034	8039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823591
115	NC_017449	TAA	2	6	8073	8078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823591
116	NC_017449	TAG	2	6	8093	8098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823591
117	NC_017449	AAT	2	6	8124	8129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823591
118	NC_017449	TAA	2	6	8163	8168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823591
119	NC_017449	ATA	2	6	8258	8263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823591
120	NC_017449	TAA	2	6	8340	8345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823591
121	NC_017449	TAG	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823591
122	NC_017449	AAC	2	6	8529	8534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823591
123	NC_017449	CTT	2	6	8591	8596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823591
124	NC_017449	CTT	2	6	9442	9447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823592
125	NC_017449	ATC	2	6	9561	9566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823592
126	NC_017449	ATA	2	6	9844	9849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823593
127	NC_017449	ACA	2	6	9935	9940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823593
128	NC_017449	AAG	2	6	10060	10065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823594
129	NC_017449	TGC	2	6	10153	10158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823594
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131	NC_017449	CTA	2	6	10258	10263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823595
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