MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Francisella cf. novicida 3523 chromosome

Total Repeats: 26568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26501	NC_017449	TGT	2	6	1939548	1939553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825433
26502	NC_017449	CTT	2	6	1939678	1939683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825433
26503	NC_017449	ATC	2	6	1939838	1939843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825433
26504	NC_017449	GCT	2	6	1940232	1940237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825433
26505	NC_017449	AGC	2	6	1940243	1940248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825433
26506	NC_017449	TGT	2	6	1940249	1940254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387825433
26507	NC_017449	CCA	2	6	1940283	1940288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825433
26508	NC_017449	TAT	2	6	1940338	1940343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825433
26509	NC_017449	GCT	2	6	1940364	1940369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825433
26510	NC_017449	AAT	2	6	1940452	1940457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825433
26511	NC_017449	TCT	2	6	1940490	1940495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825433
26512	NC_017449	CTT	2	6	1940520	1940525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825433
26513	NC_017449	TAT	2	6	1940556	1940561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825434
26514	NC_017449	ATT	2	6	1940588	1940593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825434
26515	NC_017449	ATC	2	6	1940632	1940637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825434
26516	NC_017449	TAC	2	6	1940638	1940643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825434
26517	NC_017449	CTA	2	6	1940703	1940708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825434
26518	NC_017449	ACC	2	6	1940824	1940829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825434
26519	NC_017449	TAT	2	6	1940839	1940844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825434
26520	NC_017449	CTA	2	6	1940907	1940912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825434
26521	NC_017449	AAC	2	6	1940953	1940958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825434
26522	NC_017449	TAA	2	6	1940989	1940994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825434
26523	NC_017449	TTA	2	6	1941032	1941037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825434
26524	NC_017449	TCA	2	6	1941053	1941058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825434
26525	NC_017449	ATA	2	6	1941098	1941103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825434
26526	NC_017449	TCA	2	6	1941173	1941178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825435
26527	NC_017449	TCT	2	6	1941242	1941247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825435
26528	NC_017449	CCA	2	6	1941314	1941319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825435
26529	NC_017449	ATC	2	6	1941436	1941441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825435
26530	NC_017449	AGA	2	6	1941503	1941508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825435
26531	NC_017449	CAT	2	6	1941549	1941554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825435
26532	NC_017449	CAT	2	6	1941574	1941579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825435
26533	NC_017449	TAG	2	6	1941711	1941716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825435
26534	NC_017449	ATA	2	6	1941896	1941901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825435
26535	NC_017449	CTA	2	6	1941918	1941923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825435
26536	NC_017449	ATT	3	9	1941997	1942005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825435
26537	NC_017449	TGA	2	6	1942055	1942060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825435
26538	NC_017449	TGA	2	6	1942097	1942102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825435
26539	NC_017449	CAA	2	6	1942191	1942196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825435
26540	NC_017449	CAT	2	6	1942197	1942202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825435
26541	NC_017449	TTA	2	6	1942358	1942363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825435
26542	NC_017449	CTG	2	6	1942530	1942535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825435
26543	NC_017449	TAA	2	6	1942540	1942545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825435
26544	NC_017449	TCT	2	6	1942595	1942600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825435
26545	NC_017449	TAT	2	6	1942611	1942616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825435
26546	NC_017449	CTT	2	6	1942850	1942855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825436
26547	NC_017449	TAA	2	6	1942860	1942865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825436
26548	NC_017449	TGC	2	6	1942927	1942932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825436
26549	NC_017449	ATT	2	6	1942938	1942943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825436
26550	NC_017449	TTC	2	6	1943580	1943585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825437
26551	NC_017449	ATT	2	6	1943602	1943607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825437
26552	NC_017449	AGA	2	6	1943613	1943618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825437
26553	NC_017449	CAT	2	6	1943895	1943900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825437
26554	NC_017449	ACC	2	6	1944024	1944029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387825437
26555	NC_017449	CCT	2	6	1944082	1944087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387825437
26556	NC_017449	TTC	2	6	1944144	1944149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825437
26557	NC_017449	TAT	2	6	1944242	1944247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825437
26558	NC_017449	ATT	2	6	1944298	1944303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825437
26559	NC_017449	ACA	2	6	1944322	1944327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825437
26560	NC_017449	ATT	2	6	1944375	1944380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825437
26561	NC_017449	TTC	2	6	1944405	1944410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825437
26562	NC_017449	CAG	2	6	1944425	1944430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387825437
26563	NC_017449	ACT	2	6	1944631	1944636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825437
26564	NC_017449	TCA	2	6	1944712	1944717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825437
26565	NC_017449	TCA	2	6	1944724	1944729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825437
26566	NC_017449	GCT	2	6	1944799	1944804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387825437
26567	NC_017449	CAA	2	6	1944851	1944856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825437
26568	NC_017449	ATT	2	6	1944900	1944905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825437

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.