MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Francisella cf. novicida 3523 chromosome

Total Repeats: 26568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017449	ATA	2	6	39383	39388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823619
502	NC_017449	AAT	2	6	39448	39453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823619
503	NC_017449	GAT	2	6	39469	39474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823619
504	NC_017449	ATT	2	6	39566	39571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823619
505	NC_017449	TTA	2	6	39632	39637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823619
506	NC_017449	GTT	2	6	39639	39644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387823619
507	NC_017449	TTC	2	6	39667	39672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823619
508	NC_017449	ACC	2	6	39766	39771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823619
509	NC_017449	CTA	2	6	40053	40058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823619
510	NC_017449	TAA	2	6	40170	40175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823619
511	NC_017449	TGC	2	6	40177	40182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823619
512	NC_017449	ATA	2	6	40358	40363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823620
513	NC_017449	TTC	2	6	40405	40410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823620
514	NC_017449	TTA	2	6	40415	40420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823620
515	NC_017449	AAG	2	6	40448	40453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823620
516	NC_017449	ATT	2	6	40540	40545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823620
517	NC_017449	TTA	2	6	40604	40609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823620
518	NC_017449	TAT	2	6	40737	40742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823620
519	NC_017449	TCC	2	6	40811	40816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387823620
520	NC_017449	ATA	2	6	41085	41090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823620
521	NC_017449	CAT	2	6	41115	41120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823620
522	NC_017449	TAA	2	6	41177	41182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823620
523	NC_017449	TCA	2	6	41195	41200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823620
524	NC_017449	TTA	2	6	41253	41258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823620
525	NC_017449	TTA	2	6	41298	41303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823620
526	NC_017449	TCA	2	6	41378	41383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823620
527	NC_017449	CAC	2	6	41412	41417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823620
528	NC_017449	TAT	2	6	41658	41663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823620
529	NC_017449	CCT	2	6	41714	41719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387823620
530	NC_017449	ATC	2	6	41734	41739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823620
531	NC_017449	CTA	2	6	41811	41816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823620
532	NC_017449	CAA	2	6	41877	41882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823620
533	NC_017449	TAT	2	6	41979	41984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823620
534	NC_017449	TAG	2	6	42114	42119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823621
535	NC_017449	ATC	2	6	42163	42168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823621
536	NC_017449	ATA	2	6	42252	42257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823621
537	NC_017449	ACC	2	6	42307	42312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823621
538	NC_017449	ATA	2	6	42404	42409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823621
539	NC_017449	TCA	2	6	42656	42661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823621
540	NC_017449	TTC	2	6	42907	42912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823621
541	NC_017449	TCT	2	6	42986	42991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823621
542	NC_017449	CCA	2	6	43025	43030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823621
543	NC_017449	TAT	2	6	43190	43195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823622
544	NC_017449	TCA	2	6	43224	43229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823622
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546	NC_017449	ATT	2	6	43415	43420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823622
547	NC_017449	GAA	2	6	43421	43426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823622
548	NC_017449	ATG	2	6	43438	43443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823622
549	NC_017449	TTA	2	6	43560	43565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823622
550	NC_017449	TGT	2	6	43628	43633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387823622
551	NC_017449	AAT	2	6	43655	43660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823622
552	NC_017449	GCA	2	6	43787	43792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823623
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554	NC_017449	ATC	2	6	43894	43899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823623
555	NC_017449	TCT	2	6	44081	44086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823623
556	NC_017449	CAA	2	6	44109	44114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823623
557	NC_017449	CCT	2	6	44127	44132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387823623
558	NC_017449	TTG	2	6	44179	44184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387823623
559	NC_017449	TGA	2	6	44198	44203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823623
560	NC_017449	TCA	2	6	44333	44338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823623
561	NC_017449	TGA	2	6	44340	44345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823623
562	NC_017449	CAC	2	6	44553	44558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823623
563	NC_017449	ATA	2	6	44588	44593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823623
564	NC_017449	CAA	2	6	44625	44630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823623
565	NC_017449	TAG	2	6	44673	44678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823623
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570	NC_017449	TTG	2	6	45277	45282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387823624
571	NC_017449	TCA	2	6	45543	45548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823624
572	NC_017449	GCT	2	6	45600	45605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823624
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574	NC_017449	AAT	2	6	45641	45646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823624
575	NC_017449	ATT	2	6	45740	45745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387823624
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578	NC_017449	TGA	2	6	46102	46107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823624
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587	NC_017449	CAG	2	6	46868	46873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823625
588	NC_017449	TCA	2	6	46894	46899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823625
589	NC_017449	GTT	2	6	47014	47019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387823625
590	NC_017449	AAG	2	6	47088	47093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387823625
591	NC_017449	ACC	2	6	47157	47162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823625
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593	NC_017449	CTC	2	6	47312	47317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387823625
594	NC_017449	TCA	2	6	47401	47406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823625
595	NC_017449	ATC	2	6	48020	48025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823626
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599	NC_017449	CAT	2	6	48308	48313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823626
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601	NC_017449	CAC	2	6	48407	48412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823626
602	NC_017449	GCA	2	6	48589	48594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823626
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608	NC_017449	TCT	2	6	49211	49216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823626
609	NC_017449	TCA	2	6	49222	49227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823626
610	NC_017449	CAA	2	6	49277	49282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387823626
611	NC_017449	CAG	2	6	49283	49288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823626
612	NC_017449	ACC	2	6	49302	49307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823626
613	NC_017449	GCA	2	6	49450	49455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823626
614	NC_017449	TCA	2	6	49510	49515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823626
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616	NC_017449	TAA	2	6	49539	49544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387823626
617	NC_017449	CAT	2	6	49557	49562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387823626
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619	NC_017449	CTT	2	6	49589	49594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823626
620	NC_017449	GCT	2	6	49621	49626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823626
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622	NC_017449	TCT	2	6	49819	49824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823626
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