MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 2210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017167	GATTG	2	10	2107414	2107423	20 %	40 %	40 %	0 %	384135922
1502	NC_017167	CGGGA	2	10	2107768	2107777	20 %	0 %	60 %	20 %	384135922
1503	NC_017167	CGCAC	2	10	2109628	2109637	20 %	0 %	20 %	60 %	384135923
1504	NC_017167	CCCGG	2	10	2109724	2109733	0 %	0 %	40 %	60 %	384135923
1505	NC_017167	GCGCC	2	10	2109765	2109774	0 %	0 %	40 %	60 %	384135923
1506	NC_017167	TGGTC	2	10	2110005	2110014	0 %	40 %	40 %	20 %	384135923
1507	NC_017167	AAGCG	2	10	2110216	2110225	40 %	0 %	40 %	20 %	384135923
1508	NC_017167	ATGGG	2	10	2110437	2110446	20 %	20 %	60 %	0 %	384135923
1509	NC_017167	CGGAT	2	10	2110523	2110532	20 %	20 %	40 %	20 %	384135923
1510	NC_017167	TGCCA	2	10	2110891	2110900	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1511	NC_017167	GTGAA	2	10	2115556	2115565	40 %	20 %	40 %	0 %	384135928
1512	NC_017167	GCCGC	2	10	2120840	2120849	0 %	0 %	40 %	60 %	384135933
1513	NC_017167	TGGCG	2	10	2121172	2121181	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1514	NC_017167	CATCT	2	10	2122399	2122408	20 %	40 %	0 %	40 %	384135935
1515	NC_017167	GGAGC	2	10	2123659	2123668	20 %	0 %	60 %	20 %	384135935
1516	NC_017167	TGCGA	2	10	2125132	2125141	20 %	20 %	40 %	20 %	384135937
1517	NC_017167	TCGTT	2	10	2129231	2129240	0 %	60 %	20 %	20 %	384135942
1518	NC_017167	CACCT	2	10	2129283	2129292	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1519	NC_017167	CCGGA	2	10	2130094	2130103	20 %	0 %	40 %	40 %	384135943
1520	NC_017167	CGCGC	2	10	2135328	2135337	0 %	0 %	40 %	60 %	384135950
1521	NC_017167	CTCCA	2	10	2136974	2136983	20 %	20 %	0 %	60 %	384135952
1522	NC_017167	CGGCC	2	10	2139971	2139980	0 %	0 %	40 %	60 %	384135954
1523	NC_017167	TCCGC	2	10	2142240	2142249	0 %	20 %	20 %	60 %	384135955
1524	NC_017167	TGCTC	2	10	2142693	2142702	0 %	40 %	20 %	40 %	384135955
1525	NC_017167	TCGCA	2	10	2143261	2143270	20 %	20 %	20 %	40 %	384135955
1526	NC_017167	GCGCG	2	10	2143320	2143329	0 %	0 %	60 %	40 %	384135955
1527	NC_017167	GCGCC	2	10	2144686	2144695	0 %	0 %	40 %	60 %	384135957
1528	NC_017167	CGCGG	2	10	2146477	2146486	0 %	0 %	60 %	40 %	384135959
1529	NC_017167	AGCGA	2	10	2146600	2146609	40 %	0 %	40 %	20 %	384135959
1530	NC_017167	CACAA	2	10	2148791	2148800	60 %	0 %	0 %	40 %	384135960
1531	NC_017167	TGCGA	2	10	2150085	2150094	20 %	20 %	40 %	20 %	384135962
1532	NC_017167	GATGG	2	10	2151061	2151070	20 %	20 %	60 %	0 %	384135964
1533	NC_017167	TGGCC	2	10	2151210	2151219	0 %	20 %	40 %	40 %	384135964
1534	NC_017167	GTCAG	2	10	2151221	2151230	20 %	20 %	40 %	20 %	384135964
1535	NC_017167	TGATC	2	10	2151438	2151447	20 %	40 %	20 %	20 %	384135964
1536	NC_017167	GCGAA	2	10	2153138	2153147	40 %	0 %	40 %	20 %	384135966
1537	NC_017167	TCGCG	2	10	2153717	2153726	0 %	20 %	40 %	40 %	384135966
1538	NC_017167	TGGGC	2	10	2153848	2153857	0 %	20 %	60 %	20 %	384135966
1539	NC_017167	GAGAT	2	10	2154267	2154276	40 %	20 %	40 %	0 %	384135966
1540	NC_017167	GACGT	2	10	2154915	2154924	20 %	20 %	40 %	20 %	384135966
1541	NC_017167	TCGTC	2	10	2156109	2156118	0 %	40 %	20 %	40 %	384135967
1542	NC_017167	GCCGC	2	10	2157971	2157980	0 %	0 %	40 %	60 %	384135968
1543	NC_017167	TCGGC	2	10	2160031	2160040	0 %	20 %	40 %	40 %	384135970
1544	NC_017167	CGCGC	2	10	2160539	2160548	0 %	0 %	40 %	60 %	384135971
1545	NC_017167	GCCTT	2	10	2161432	2161441	0 %	40 %	20 %	40 %	384135971
1546	NC_017167	CAAAC	2	10	2163612	2163621	60 %	0 %	0 %	40 %	384135972
1547	NC_017167	GCGAC	2	10	2164477	2164486	20 %	0 %	40 %	40 %	384135973
1548	NC_017167	GGAGC	2	10	2165999	2166008	20 %	0 %	60 %	20 %	384135974
1549	NC_017167	AGGCG	2	10	2166590	2166599	20 %	0 %	60 %	20 %	384135974
1550	NC_017167	GCCAT	2	10	2167081	2167090	20 %	20 %	20 %	40 %	384135974
1551	NC_017167	CTTCG	2	10	2167344	2167353	0 %	40 %	20 %	40 %	384135974
1552	NC_017167	GCCCA	2	10	2170673	2170682	20 %	0 %	20 %	60 %	384135977
1553	NC_017167	GCCCA	2	10	2171203	2171212	20 %	0 %	20 %	60 %	384135977
1554	NC_017167	GCAGC	2	10	2171688	2171697	20 %	0 %	40 %	40 %	384135978
1555	NC_017167	ACGTC	2	10	2172999	2173008	20 %	20 %	20 %	40 %	384135979
1556	NC_017167	GCCGA	2	10	2173693	2173702	20 %	0 %	40 %	40 %	384135980
1557	NC_017167	CGAGG	2	10	2175125	2175134	20 %	0 %	60 %	20 %	384135981
1558	NC_017167	CGAAG	2	10	2175658	2175667	40 %	0 %	40 %	20 %	384135982
1559	NC_017167	GAAAC	2	10	2175682	2175691	60 %	0 %	20 %	20 %	384135982
1560	NC_017167	TCGGA	2	10	2175951	2175960	20 %	20 %	40 %	20 %	384135982
1561	NC_017167	TCGAA	2	10	2177802	2177811	40 %	20 %	20 %	20 %	384135983
1562	NC_017167	GGCGT	2	10	2180065	2180074	0 %	20 %	60 %	20 %	384135986
1563	NC_017167	AAGCC	2	10	2180260	2180269	40 %	0 %	20 %	40 %	384135986
1564	NC_017167	GCCGC	2	10	2183556	2183565	0 %	0 %	40 %	60 %	384135991
1565	NC_017167	GCTTG	2	10	2188811	2188820	0 %	40 %	40 %	20 %	384135998
1566	NC_017167	CACGC	2	10	2189620	2189629	20 %	0 %	20 %	60 %	384135999
1567	NC_017167	TGCTC	2	10	2191237	2191246	0 %	40 %	20 %	40 %	384136002
1568	NC_017167	CGGTC	2	10	2192170	2192179	0 %	20 %	40 %	40 %	384136004
1569	NC_017167	GCCGA	2	10	2195606	2195615	20 %	0 %	40 %	40 %	384136006
1570	NC_017167	TCCGC	2	10	2196129	2196138	0 %	20 %	20 %	60 %	384136007
1571	NC_017167	CAATG	2	10	2196649	2196658	40 %	20 %	20 %	20 %	384136007
1572	NC_017167	CCGCA	2	10	2196957	2196966	20 %	0 %	20 %	60 %	384136007
1573	NC_017167	TCGGG	2	10	2197077	2197086	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1574	NC_017167	ACTTC	2	10	2198906	2198915	20 %	40 %	0 %	40 %	384136008
1575	NC_017167	CCGCG	2	10	2200981	2200990	0 %	0 %	40 %	60 %	384136010
1576	NC_017167	TGGCC	2	10	2201568	2201577	0 %	20 %	40 %	40 %	384136010
1577	NC_017167	GCGAA	2	10	2202139	2202148	40 %	0 %	40 %	20 %	384136011
1578	NC_017167	GCGTG	2	10	2202176	2202185	0 %	20 %	60 %	20 %	384136011
1579	NC_017167	ATGCG	2	10	2202956	2202965	20 %	20 %	40 %	20 %	384136011
1580	NC_017167	ACGCC	2	10	2204026	2204035	20 %	0 %	20 %	60 %	384136012
1581	NC_017167	TCACG	2	10	2204550	2204559	20 %	20 %	20 %	40 %	384136012
1582	NC_017167	GTTCC	2	10	2205214	2205223	0 %	40 %	20 %	40 %	384136013
1583	NC_017167	GCTGC	2	10	2207275	2207284	0 %	20 %	40 %	40 %	384136016
1584	NC_017167	ACGCG	2	10	2208044	2208053	20 %	0 %	40 %	40 %	384136017
1585	NC_017167	TGTCG	2	10	2209177	2209186	0 %	40 %	40 %	20 %	384136019
1586	NC_017167	AAGAA	2	10	2209983	2209992	80 %	0 %	20 %	0 %	384136019
1587	NC_017167	CCAGG	2	10	2211127	2211136	20 %	0 %	40 %	40 %	384136021
1588	NC_017167	TTGCG	2	10	2212176	2212185	0 %	40 %	40 %	20 %	384136022
1589	NC_017167	AAGAC	2	10	2212750	2212759	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1590	NC_017167	CACCT	2	10	2216365	2216374	20 %	20 %	0 %	60 %	384136027
1591	NC_017167	GCGCT	2	10	2217382	2217391	0 %	20 %	40 %	40 %	384136027
1592	NC_017167	CCCGC	2	10	2219522	2219531	0 %	0 %	20 %	80 %	384136030
1593	NC_017167	GAGAT	2	10	2222044	2222053	40 %	20 %	40 %	0 %	384136032
1594	NC_017167	TCATC	2	10	2223693	2223702	20 %	40 %	0 %	40 %	384136034
1595	NC_017167	GGGAT	2	10	2223711	2223720	20 %	20 %	60 %	0 %	384136035
1596	NC_017167	CAGGC	2	10	2228593	2228602	20 %	0 %	40 %	40 %	384136041
1597	NC_017167	TGACG	2	10	2230347	2230356	20 %	20 %	40 %	20 %	384136043
1598	NC_017167	ATCCG	2	10	2231601	2231610	20 %	20 %	20 %	40 %	384136045
1599	NC_017167	CGAGC	2	10	2231882	2231891	20 %	0 %	40 %	40 %	384136045
1600	NC_017167	TTTCG	2	10	2237659	2237668	0 %	60 %	20 %	20 %	384136053
1601	NC_017167	TTCGC	2	10	2239384	2239393	0 %	40 %	20 %	40 %	384136055
1602	NC_017167	GATGC	2	10	2239479	2239488	20 %	20 %	40 %	20 %	384136055
1603	NC_017167	GGACA	2	10	2239542	2239551	40 %	0 %	40 %	20 %	384136055
1604	NC_017167	CATGA	2	10	2240612	2240621	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1605	NC_017167	CACGC	2	10	2241958	2241967	20 %	0 %	20 %	60 %	384136057
1606	NC_017167	CAGGC	2	10	2243005	2243014	20 %	0 %	40 %	40 %	384136058
1607	NC_017167	CGTCT	2	10	2243647	2243656	0 %	40 %	20 %	40 %	384136058
1608	NC_017167	GGACA	2	10	2245553	2245562	40 %	0 %	40 %	20 %	384136060
1609	NC_017167	CGGCG	2	10	2249256	2249265	0 %	0 %	60 %	40 %	384136063
1610	NC_017167	CCCGG	2	10	2252008	2252017	0 %	0 %	40 %	60 %	384136065
1611	NC_017167	GCCGA	2	10	2252603	2252612	20 %	0 %	40 %	40 %	384136065
1612	NC_017167	CCAGT	2	10	2256474	2256483	20 %	20 %	20 %	40 %	384136070
1613	NC_017167	GAAAG	2	10	2257871	2257880	60 %	0 %	40 %	0 %	384136071
1614	NC_017167	GAGGC	2	10	2260893	2260902	20 %	0 %	60 %	20 %	384136074
1615	NC_017167	CTCCA	2	10	2264048	2264057	20 %	20 %	0 %	60 %	384136083
1616	NC_017167	TGGAA	2	10	2267282	2267291	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017167	GATTT	2	10	2267593	2267602	20 %	60 %	20 %	0 %	384136087
1618	NC_017167	CGCTC	2	10	2269631	2269640	0 %	20 %	20 %	60 %	384136091
1619	NC_017167	GATCT	2	10	2269876	2269885	20 %	40 %	20 %	20 %	384136092
1620	NC_017167	GAAGC	2	10	2269888	2269897	40 %	0 %	40 %	20 %	384136092
1621	NC_017167	GCGGG	2	10	2271775	2271784	0 %	0 %	80 %	20 %	384136093
1622	NC_017167	CTCGA	2	10	2274371	2274380	20 %	20 %	20 %	40 %	384136096
1623	NC_017167	CGCGC	2	10	2275866	2275875	0 %	0 %	40 %	60 %	384136098
1624	NC_017167	GCTGT	2	10	2279960	2279969	0 %	40 %	40 %	20 %	384136102
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1989	NC_017167	TGCCC	2	10	2782140	2782149	0 %	20 %	20 %	60 %	384136622
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1993	NC_017167	GGCGC	2	10	2790050	2790059	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1995	NC_017167	CGGCG	2	10	2791340	2791349	0 %	0 %	60 %	40 %	384136633
1996	NC_017167	TGGCG	2	10	2797324	2797333	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1997	NC_017167	CGATG	2	10	2797801	2797810	20 %	20 %	40 %	20 %	384136640
1998	NC_017167	TACGG	2	10	2798277	2798286	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1999	NC_017167	GTATA	2	10	2798288	2798297	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2000	NC_017167	TCGCT	2	10	2798975	2798984	0 %	40 %	20 %	40 %	384136642

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