MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 2210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017167	CACGT	2	10	726667	726676	20 %	20 %	20 %	40 %	384134478
502	NC_017167	GCGCG	2	10	728477	728486	0 %	0 %	60 %	40 %	384134479
503	NC_017167	AACGC	2	10	729474	729483	40 %	0 %	20 %	40 %	384134481
504	NC_017167	ATCTC	2	10	729951	729960	20 %	40 %	0 %	40 %	384134481
505	NC_017167	TCCGG	2	10	732302	732311	0 %	20 %	40 %	40 %	384134483
506	NC_017167	GAAAA	2	10	734673	734682	80 %	0 %	20 %	0 %	384134486
507	NC_017167	AGCGC	2	10	736393	736402	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
508	NC_017167	AGCCG	2	10	737029	737038	20 %	0 %	40 %	40 %	384134488
509	NC_017167	TGGGC	2	10	737119	737128	0 %	20 %	60 %	20 %	384134489
510	NC_017167	TGCCC	2	10	737691	737700	0 %	20 %	20 %	60 %	384134489
511	NC_017167	GCCGC	2	10	741579	741588	0 %	0 %	40 %	60 %	384134494
512	NC_017167	ACGGG	2	10	744239	744248	20 %	0 %	60 %	20 %	384134496
513	NC_017167	CGGCC	2	10	745039	745048	0 %	0 %	40 %	60 %	384134497
514	NC_017167	CTCGA	2	10	746060	746069	20 %	20 %	20 %	40 %	384134498
515	NC_017167	GGATC	2	10	746524	746533	20 %	20 %	40 %	20 %	384134499
516	NC_017167	CGATG	2	10	746536	746545	20 %	20 %	40 %	20 %	384134499
517	NC_017167	GGGAT	2	10	748780	748789	20 %	20 %	60 %	0 %	384134500
518	NC_017167	CGCAT	2	10	750942	750951	20 %	20 %	20 %	40 %	384134501
519	NC_017167	GCTGC	2	10	751278	751287	0 %	20 %	40 %	40 %	384134501
520	NC_017167	CGGCT	2	10	751554	751563	0 %	20 %	40 %	40 %	384134502
521	NC_017167	CGGCG	2	10	752111	752120	0 %	0 %	60 %	40 %	384134502
522	NC_017167	CATTC	2	10	752710	752719	20 %	40 %	0 %	40 %	384134503
523	NC_017167	TTCGT	2	10	753762	753771	0 %	60 %	20 %	20 %	384134504
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525	NC_017167	CCGGC	2	10	759956	759965	0 %	0 %	40 %	60 %	384134507
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527	NC_017167	CGCGG	2	10	766963	766972	0 %	0 %	60 %	40 %	384134515
528	NC_017167	CGAGA	2	10	767170	767179	40 %	0 %	40 %	20 %	384134515
529	NC_017167	CGCGC	2	10	768443	768452	0 %	0 %	40 %	60 %	384134516
530	NC_017167	GCGAA	2	10	768750	768759	40 %	0 %	40 %	20 %	384134516
531	NC_017167	GACAT	2	10	769086	769095	40 %	20 %	20 %	20 %	384134516
532	NC_017167	CGGGA	2	10	769894	769903	20 %	0 %	60 %	20 %	384134518
533	NC_017167	GCTTC	2	10	770695	770704	0 %	40 %	20 %	40 %	384134519
534	NC_017167	CGAGC	2	10	773728	773737	20 %	0 %	40 %	40 %	384134522
535	NC_017167	AGACG	2	10	773738	773747	40 %	0 %	40 %	20 %	384134522
536	NC_017167	GCGTC	2	10	773929	773938	0 %	20 %	40 %	40 %	384134522
537	NC_017167	TCGCG	2	10	774077	774086	0 %	20 %	40 %	40 %	384134522
538	NC_017167	GGGGC	2	10	775466	775475	0 %	0 %	80 %	20 %	384134523
539	NC_017167	CGGCG	2	10	775735	775744	0 %	0 %	60 %	40 %	384134523
540	NC_017167	CCGCG	2	10	776400	776409	0 %	0 %	40 %	60 %	384134523
541	NC_017167	TTCGC	2	10	776512	776521	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
542	NC_017167	AGTGG	2	10	776609	776618	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017167	AGCGA	2	10	777327	777336	40 %	0 %	40 %	20 %	384134525
544	NC_017167	CCGGC	2	10	778479	778488	0 %	0 %	40 %	60 %	384134526
545	NC_017167	GCGCG	2	10	778679	778688	0 %	0 %	60 %	40 %	384134526
546	NC_017167	GGCGA	2	10	778809	778818	20 %	0 %	60 %	20 %	384134526
547	NC_017167	CCATC	2	10	779790	779799	20 %	20 %	0 %	60 %	384134527
548	NC_017167	GCACG	2	10	782562	782571	20 %	0 %	40 %	40 %	384134529
549	NC_017167	TCGCC	2	10	786221	786230	0 %	20 %	20 %	60 %	384134532
550	NC_017167	TCCCA	2	10	786532	786541	20 %	20 %	0 %	60 %	384134532
551	NC_017167	GCGCC	2	10	789424	789433	0 %	0 %	40 %	60 %	384134534
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553	NC_017167	GCGCG	2	10	792725	792734	0 %	0 %	60 %	40 %	384134534
554	NC_017167	GGCGC	2	10	793613	793622	0 %	0 %	60 %	40 %	384134534
555	NC_017167	GAGTC	2	10	794266	794275	20 %	20 %	40 %	20 %	384134534
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557	NC_017167	CTGGC	2	10	795025	795034	0 %	20 %	40 %	40 %	384134534
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559	NC_017167	CTGCC	2	10	795243	795252	0 %	20 %	20 %	60 %	384134534
560	NC_017167	CGAGC	2	10	797486	797495	20 %	0 %	40 %	40 %	384134536
561	NC_017167	GCGAC	2	10	798870	798879	20 %	0 %	40 %	40 %	384134537
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563	NC_017167	TGCGC	2	10	799315	799324	0 %	20 %	40 %	40 %	384134537
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569	NC_017167	AGGGC	2	10	807327	807336	20 %	0 %	60 %	20 %	384134545
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574	NC_017167	CGAAT	2	10	816042	816051	40 %	20 %	20 %	20 %	384134554
575	NC_017167	GCTCT	2	10	822679	822688	0 %	40 %	20 %	40 %	384134562
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579	NC_017167	GGCCA	2	10	824450	824459	20 %	0 %	40 %	40 %	384134563
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602	NC_017167	AAGGT	2	10	864250	864259	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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610	NC_017167	CGACG	2	10	875898	875907	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
611	NC_017167	CGAAT	2	10	876594	876603	40 %	20 %	20 %	20 %	384134614
612	NC_017167	GATCT	2	10	876826	876835	20 %	40 %	20 %	20 %	384134614
613	NC_017167	AAGCG	2	10	876853	876862	40 %	0 %	40 %	20 %	384134614
614	NC_017167	ACGCG	2	10	877537	877546	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
615	NC_017167	AGGCG	2	10	877578	877587	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
616	NC_017167	CCGAG	2	10	879735	879744	20 %	0 %	40 %	40 %	384134617
617	NC_017167	GAAAT	2	10	880700	880709	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017167	AGCGG	2	10	881484	881493	20 %	0 %	60 %	20 %	384134619
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620	NC_017167	GAGGC	2	10	882453	882462	20 %	0 %	60 %	20 %	384134620
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623	NC_017167	GGGGA	2	10	886639	886648	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017167	CACGT	2	10	889025	889034	20 %	20 %	20 %	40 %	384134627
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626	NC_017167	GGCGA	2	10	890870	890879	20 %	0 %	60 %	20 %	384134630
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629	NC_017167	CGGCC	2	10	895574	895583	0 %	0 %	40 %	60 %	384134634
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