MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 1580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015850	GGGGC	2	10	2798105	2798114	0 %	0 %	80 %	20 %	340783482
1502	NC_015850	ACCAG	2	10	2800719	2800728	40 %	0 %	20 %	40 %	340783485
1503	NC_015850	ACCGA	2	10	2800878	2800887	40 %	0 %	20 %	40 %	340783485
1504	NC_015850	CCGCA	2	10	2801524	2801533	20 %	0 %	20 %	60 %	340783485
1505	NC_015850	TGCCG	2	10	2802505	2802514	0 %	20 %	40 %	40 %	340783486
1506	NC_015850	CCGCC	2	10	2803210	2803219	0 %	0 %	20 %	80 %	340783487
1507	NC_015850	GTCGA	2	10	2803944	2803953	20 %	20 %	40 %	20 %	340783488
1508	NC_015850	CGCTG	2	10	2806507	2806516	0 %	20 %	40 %	40 %	340783490
1509	NC_015850	CGGCG	2	10	2806665	2806674	0 %	0 %	60 %	40 %	340783490
1510	NC_015850	GCTGA	2	10	2807488	2807497	20 %	20 %	40 %	20 %	340783491
1511	NC_015850	GAGCG	2	10	2809995	2810004	20 %	0 %	60 %	20 %	340783494
1512	NC_015850	CGATC	2	10	2810216	2810225	20 %	20 %	20 %	40 %	340783494
1513	NC_015850	TCCGC	2	10	2811807	2811816	0 %	20 %	20 %	60 %	340783496
1514	NC_015850	CAGGA	2	10	2812814	2812823	40 %	0 %	40 %	20 %	340783496
1515	NC_015850	CCTGC	2	10	2815790	2815799	0 %	20 %	20 %	60 %	340783501
1516	NC_015850	CGGCA	2	10	2819195	2819204	20 %	0 %	40 %	40 %	340783503
1517	NC_015850	TGGCG	2	10	2819331	2819340	0 %	20 %	60 %	20 %	340783503
1518	NC_015850	CCTCG	2	10	2820396	2820405	0 %	20 %	20 %	60 %	340783505
1519	NC_015850	CCCCG	2	10	2823682	2823691	0 %	0 %	20 %	80 %	340783508
1520	NC_015850	CCTAC	2	10	2824546	2824555	20 %	20 %	0 %	60 %	340783508
1521	NC_015850	CGTAG	2	10	2825714	2825723	20 %	20 %	40 %	20 %	340783510
1522	NC_015850	AGCCC	2	10	2831840	2831849	20 %	0 %	20 %	60 %	340783516
1523	NC_015850	ATCGC	2	10	2832418	2832427	20 %	20 %	20 %	40 %	340783516
1524	NC_015850	ACCCG	2	10	2833890	2833899	20 %	0 %	20 %	60 %	340783519
1525	NC_015850	GCGCT	2	10	2835023	2835032	0 %	20 %	40 %	40 %	340783521
1526	NC_015850	AGGGC	2	10	2835414	2835423	20 %	0 %	60 %	20 %	340783521
1527	NC_015850	CGGCG	2	10	2835739	2835748	0 %	0 %	60 %	40 %	340783521
1528	NC_015850	CCGGG	2	10	2842653	2842662	0 %	0 %	60 %	40 %	340783524
1529	NC_015850	ACCCA	2	10	2842754	2842763	40 %	0 %	0 %	60 %	340783524
1530	NC_015850	GTGCC	2	10	2845526	2845535	0 %	20 %	40 %	40 %	340783526
1531	NC_015850	TGCGC	2	10	2846332	2846341	0 %	20 %	40 %	40 %	340783527
1532	NC_015850	CCAGT	2	10	2847944	2847953	20 %	20 %	20 %	40 %	340783528
1533	NC_015850	CTTTG	2	10	2850767	2850776	0 %	60 %	20 %	20 %	340783531
1534	NC_015850	CCGCG	2	10	2851130	2851139	0 %	0 %	40 %	60 %	340783531
1535	NC_015850	TTCTT	2	10	2851381	2851390	0 %	80 %	0 %	20 %	340783531
1536	NC_015850	AAGGT	2	10	2853205	2853214	40 %	20 %	40 %	0 %	340783533
1537	NC_015850	CAAGC	2	10	2859387	2859396	40 %	0 %	20 %	40 %	340783542
1538	NC_015850	AGCAC	2	10	2864915	2864924	40 %	0 %	20 %	40 %	340783548
1539	NC_015850	AGGGC	2	10	2867500	2867509	20 %	0 %	60 %	20 %	340783552
1540	NC_015850	GCGGT	2	10	2870604	2870613	0 %	20 %	60 %	20 %	340783554
1541	NC_015850	GTTCC	2	10	2872598	2872607	0 %	40 %	20 %	40 %	340783555
1542	NC_015850	GCCCG	2	10	2874756	2874765	0 %	0 %	40 %	60 %	340783558
1543	NC_015850	GCCCA	2	10	2875016	2875025	20 %	0 %	20 %	60 %	340783558
1544	NC_015850	CTGCG	2	10	2877390	2877399	0 %	20 %	40 %	40 %	340783560
1545	NC_015850	CCGCG	2	10	2877490	2877499	0 %	0 %	40 %	60 %	340783560
1546	NC_015850	GTGCC	2	10	2878621	2878630	0 %	20 %	40 %	40 %	340783561
1547	NC_015850	TCCCT	2	10	2882092	2882101	0 %	40 %	0 %	60 %	340783567
1548	NC_015850	GGCGC	2	10	2885775	2885784	0 %	0 %	60 %	40 %	340783570
1549	NC_015850	CTCGG	2	10	2886720	2886729	0 %	20 %	40 %	40 %	340783571
1550	NC_015850	GCCAA	2	10	2887976	2887985	40 %	0 %	20 %	40 %	340783573
1551	NC_015850	CGGGC	2	10	2888665	2888674	0 %	0 %	60 %	40 %	340783575
1552	NC_015850	GGTCC	2	10	2889564	2889573	0 %	20 %	40 %	40 %	340783576
1553	NC_015850	GCGCC	2	10	2892841	2892850	0 %	0 %	40 %	60 %	340783582
1554	NC_015850	CACGG	2	10	2893598	2893607	20 %	0 %	40 %	40 %	340783582
1555	NC_015850	CGGCA	2	10	2894947	2894956	20 %	0 %	40 %	40 %	340783584
1556	NC_015850	CTGCG	2	10	2895868	2895877	0 %	20 %	40 %	40 %	340783586
1557	NC_015850	GCGAG	2	10	2896482	2896491	20 %	0 %	60 %	20 %	340783587
1558	NC_015850	CGGGC	2	10	2899207	2899216	0 %	0 %	60 %	40 %	340783588
1559	NC_015850	GCCCA	2	10	2899818	2899827	20 %	0 %	20 %	60 %	340783588
1560	NC_015850	TCGGG	2	10	2902898	2902907	0 %	20 %	60 %	20 %	340783591
1561	NC_015850	GCCGC	2	10	2904082	2904091	0 %	0 %	40 %	60 %	340783593
1562	NC_015850	ACGCC	2	10	2904650	2904659	20 %	0 %	20 %	60 %	340783594
1563	NC_015850	GCCCG	2	10	2906180	2906189	0 %	0 %	40 %	60 %	340783596
1564	NC_015850	GCGTG	2	10	2908672	2908681	0 %	20 %	60 %	20 %	340783598
1565	NC_015850	GCGAT	2	10	2911177	2911186	20 %	20 %	40 %	20 %	340783600
1566	NC_015850	TTGCC	2	10	2912175	2912184	0 %	40 %	20 %	40 %	340783601
1567	NC_015850	GCGAC	2	10	2912214	2912223	20 %	0 %	40 %	40 %	340783601
1568	NC_015850	GCCAC	2	10	2912322	2912331	20 %	0 %	20 %	60 %	340783601
1569	NC_015850	CGCTG	2	10	2913957	2913966	0 %	20 %	40 %	40 %	340783602
1570	NC_015850	TCCTT	2	10	2916281	2916290	0 %	60 %	0 %	40 %	340783605
1571	NC_015850	GCGCG	2	10	2916680	2916689	0 %	0 %	60 %	40 %	340783606
1572	NC_015850	TGGAC	3	15	2916787	2916801	20 %	20 %	40 %	20 %	340783606
1573	NC_015850	GGTAT	2	10	2916810	2916819	20 %	40 %	40 %	0 %	340783606
1574	NC_015850	GCTCC	2	10	2917843	2917852	0 %	20 %	20 %	60 %	340783607
1575	NC_015850	ACGAT	2	10	2918105	2918114	40 %	20 %	20 %	20 %	340783607
1576	NC_015850	TGAAT	2	10	2923234	2923243	40 %	40 %	20 %	0 %	340783614
1577	NC_015850	CGGCA	2	10	2927552	2927561	20 %	0 %	40 %	40 %	340783620
1578	NC_015850	GCGCC	2	10	2929979	2929988	0 %	0 %	40 %	60 %	340783622
1579	NC_015850	CTGTC	2	10	2930821	2930830	0 %	40 %	20 %	40 %	340783623
1580	NC_015850	GGCGA	2	10	2931701	2931710	20 %	0 %	60 %	20 %	340783624

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.