MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 1580

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015850	AAAGC	2	10	1899692	1899701	60 %	0 %	20 %	20 %	340782582
1002	NC_015850	ACCGA	2	10	1899967	1899976	40 %	0 %	20 %	40 %	340782582
1003	NC_015850	ATCCA	2	10	1905156	1905165	40 %	20 %	0 %	40 %	340782589
1004	NC_015850	GATAA	2	10	1906532	1906541	60 %	20 %	20 %	0 %	340782590
1005	NC_015850	AAAGA	2	10	1907451	1907460	80 %	0 %	20 %	0 %	340782591
1006	NC_015850	CGGTT	2	10	1908883	1908892	0 %	40 %	40 %	20 %	340782593
1007	NC_015850	CAGGT	2	10	1919863	1919872	20 %	20 %	40 %	20 %	340782604
1008	NC_015850	GACCA	2	10	1925119	1925128	40 %	0 %	20 %	40 %	340782609
1009	NC_015850	CCGAC	2	10	1925446	1925455	20 %	0 %	20 %	60 %	340782609
1010	NC_015850	ATCGG	2	10	1926247	1926256	20 %	20 %	40 %	20 %	340782610
1011	NC_015850	AGAGT	2	10	1936876	1936885	40 %	20 %	40 %	0 %	340782626
1012	NC_015850	CCGTG	2	10	1937146	1937155	0 %	20 %	40 %	40 %	340782626
1013	NC_015850	CCGTA	2	10	1937752	1937761	20 %	20 %	20 %	40 %	340782626
1014	NC_015850	TGGTC	2	10	1938425	1938434	0 %	40 %	40 %	20 %	340782627
1015	NC_015850	GCTGC	2	10	1939157	1939166	0 %	20 %	40 %	40 %	340782627
1016	NC_015850	CACGC	2	10	1946217	1946226	20 %	0 %	20 %	60 %	340782638
1017	NC_015850	TAGCA	2	10	1953346	1953355	40 %	20 %	20 %	20 %	340782650
1018	NC_015850	AAGGA	2	10	1960017	1960026	60 %	0 %	40 %	0 %	340782657
1019	NC_015850	GCCCA	2	10	1960377	1960386	20 %	0 %	20 %	60 %	340782658
1020	NC_015850	TCGAT	2	10	1961795	1961804	20 %	40 %	20 %	20 %	340782659
1021	NC_015850	CCTGC	2	10	1964138	1964147	0 %	20 %	20 %	60 %	340782661
1022	NC_015850	ATGGA	2	10	1964214	1964223	40 %	20 %	40 %	0 %	340782661
1023	NC_015850	ACTGA	2	10	1964648	1964657	40 %	20 %	20 %	20 %	340782662
1024	NC_015850	CCGTG	2	10	1966258	1966267	0 %	20 %	40 %	40 %	340782664
1025	NC_015850	TGACC	2	10	1968307	1968316	20 %	20 %	20 %	40 %	340782668
1026	NC_015850	AAACC	2	10	1978326	1978335	60 %	0 %	0 %	40 %	340782678
1027	NC_015850	GAGTC	2	10	1980150	1980159	20 %	20 %	40 %	20 %	340782679
1028	NC_015850	GGAGT	2	10	1980286	1980295	20 %	20 %	60 %	0 %	340782679
1029	NC_015850	CTGGT	2	10	1981997	1982006	0 %	40 %	40 %	20 %	340782682
1030	NC_015850	GGGTT	2	10	1982576	1982585	0 %	40 %	60 %	0 %	340782682
1031	NC_015850	GGCGG	2	10	1983526	1983535	0 %	0 %	80 %	20 %	340782684
1032	NC_015850	GCGCT	2	10	1985205	1985214	0 %	20 %	40 %	40 %	340782685
1033	NC_015850	GCACG	2	10	1987240	1987249	20 %	0 %	40 %	40 %	340782686
1034	NC_015850	GACCG	2	10	1990196	1990205	20 %	0 %	40 %	40 %	340782689
1035	NC_015850	CTTTT	2	10	1991284	1991293	0 %	80 %	0 %	20 %	340782690
1036	NC_015850	CGATC	2	10	1993678	1993687	20 %	20 %	20 %	40 %	340782691
1037	NC_015850	GCCGC	2	10	1998842	1998851	0 %	0 %	40 %	60 %	340782698
1038	NC_015850	CGTGG	2	10	2001324	2001333	0 %	20 %	60 %	20 %	340782701
1039	NC_015850	TGGCC	2	10	2002951	2002960	0 %	20 %	40 %	40 %	340782703
1040	NC_015850	CGCTG	2	10	2005934	2005943	0 %	20 %	40 %	40 %	340782706
1041	NC_015850	CGCCC	2	10	2006999	2007008	0 %	0 %	20 %	80 %	340782707
1042	NC_015850	GACCA	2	10	2007567	2007576	40 %	0 %	20 %	40 %	340782707
1043	NC_015850	AAGGT	2	10	2007950	2007959	40 %	20 %	40 %	0 %	340782707
1044	NC_015850	ATCGC	2	10	2010993	2011002	20 %	20 %	20 %	40 %	340782710
1045	NC_015850	GTAGC	2	10	2013132	2013141	20 %	20 %	40 %	20 %	340782713
1046	NC_015850	CCAGC	2	10	2013195	2013204	20 %	0 %	20 %	60 %	340782713
1047	NC_015850	GCGCA	2	10	2014778	2014787	20 %	0 %	40 %	40 %	340782714
1048	NC_015850	CCATC	2	10	2015420	2015429	20 %	20 %	0 %	60 %	340782714
1049	NC_015850	GGCCC	2	10	2016068	2016077	0 %	0 %	40 %	60 %	340782714
1050	NC_015850	CCACG	2	10	2016194	2016203	20 %	0 %	20 %	60 %	340782714
1051	NC_015850	CAACA	2	10	2016324	2016333	60 %	0 %	0 %	40 %	340782714
1052	NC_015850	GCCCC	2	10	2020539	2020548	0 %	0 %	20 %	80 %	340782718
1053	NC_015850	CTGGA	2	10	2030581	2030590	20 %	20 %	40 %	20 %	340782729
1054	NC_015850	CCGAT	2	10	2032860	2032869	20 %	20 %	20 %	40 %	340782732
1055	NC_015850	CGAAG	2	10	2034218	2034227	40 %	0 %	40 %	20 %	340782733
1056	NC_015850	TCCGT	2	10	2034810	2034819	0 %	40 %	20 %	40 %	340782734
1057	NC_015850	GGTGG	2	10	2036357	2036366	0 %	20 %	80 %	0 %	340782734
1058	NC_015850	AAGGC	2	10	2036567	2036576	40 %	0 %	40 %	20 %	340782734
1059	NC_015850	GCCAC	2	10	2037548	2037557	20 %	0 %	20 %	60 %	340782734
1060	NC_015850	TTCAG	2	10	2040519	2040528	20 %	40 %	20 %	20 %	340782739
1061	NC_015850	AACGC	2	10	2046460	2046469	40 %	0 %	20 %	40 %	340782745
1062	NC_015850	GCCAC	2	10	2047427	2047436	20 %	0 %	20 %	60 %	340782747
1063	NC_015850	GAGCC	2	10	2048469	2048478	20 %	0 %	40 %	40 %	340782748
1064	NC_015850	CCCAG	2	10	2049083	2049092	20 %	0 %	20 %	60 %	340782748
1065	NC_015850	GGTGG	2	10	2052125	2052134	0 %	20 %	80 %	0 %	340782750
1066	NC_015850	CCAGA	2	10	2054903	2054912	40 %	0 %	20 %	40 %	340782753
1067	NC_015850	TCTGG	2	10	2060305	2060314	0 %	40 %	40 %	20 %	340782758
1068	NC_015850	GTCCA	2	10	2062344	2062353	20 %	20 %	20 %	40 %	340782760
1069	NC_015850	GCTCC	2	10	2063937	2063946	0 %	20 %	20 %	60 %	340782761
1070	NC_015850	ATCGC	2	10	2065655	2065664	20 %	20 %	20 %	40 %	340782762
1071	NC_015850	GGCCA	2	10	2066695	2066704	20 %	0 %	40 %	40 %	340782762
1072	NC_015850	TCGGG	2	10	2067047	2067056	0 %	20 %	60 %	20 %	340782762
1073	NC_015850	CTGCC	2	10	2067503	2067512	0 %	20 %	20 %	60 %	340782763
1074	NC_015850	GACCA	2	10	2067575	2067584	40 %	0 %	20 %	40 %	340782763
1075	NC_015850	TTCCT	2	10	2068211	2068220	0 %	60 %	0 %	40 %	340782764
1076	NC_015850	CCTTT	2	10	2074224	2074233	0 %	60 %	0 %	40 %	340782769
1077	NC_015850	TCGCC	2	10	2074434	2074443	0 %	20 %	20 %	60 %	340782769
1078	NC_015850	ATCGA	2	10	2077225	2077234	40 %	20 %	20 %	20 %	340782772
1079	NC_015850	CGGTG	2	10	2077922	2077931	0 %	20 %	60 %	20 %	340782772
1080	NC_015850	ATTAC	2	10	2078228	2078237	40 %	40 %	0 %	20 %	340782772
1081	NC_015850	CATCG	2	10	2078662	2078671	20 %	20 %	20 %	40 %	340782772
1082	NC_015850	TTTTC	2	10	2081837	2081846	0 %	80 %	0 %	20 %	340782775
1083	NC_015850	TCTGC	2	10	2085027	2085036	0 %	40 %	20 %	40 %	340782779
1084	NC_015850	AGCGC	2	10	2088301	2088310	20 %	0 %	40 %	40 %	340782782
1085	NC_015850	CTGCC	2	10	2090175	2090184	0 %	20 %	20 %	60 %	340782784
1086	NC_015850	GCCCA	2	10	2090563	2090572	20 %	0 %	20 %	60 %	340782785
1087	NC_015850	TCGGT	2	10	2091659	2091668	0 %	40 %	40 %	20 %	340782785
1088	NC_015850	GAAAG	2	10	2092556	2092565	60 %	0 %	40 %	0 %	340782786
1089	NC_015850	GGTCT	2	10	2095451	2095460	0 %	40 %	40 %	20 %	340782788
1090	NC_015850	ATCCA	2	10	2098628	2098637	40 %	20 %	0 %	40 %	340782790
1091	NC_015850	ATCGC	2	10	2099933	2099942	20 %	20 %	20 %	40 %	340782791
1092	NC_015850	CTGCG	2	10	2102058	2102067	0 %	20 %	40 %	40 %	340782794
1093	NC_015850	AAAGG	2	10	2102182	2102191	60 %	0 %	40 %	0 %	340782794
1094	NC_015850	GCCGG	2	10	2104940	2104949	0 %	0 %	60 %	40 %	340782797
1095	NC_015850	GCATC	2	10	2105151	2105160	20 %	20 %	20 %	40 %	340782797
1096	NC_015850	CAGTC	2	10	2107980	2107989	20 %	20 %	20 %	40 %	340782800
1097	NC_015850	CAGCG	2	10	2108618	2108627	20 %	0 %	40 %	40 %	340782800
1098	NC_015850	AGGCA	2	10	2109246	2109255	40 %	0 %	40 %	20 %	340782801
1099	NC_015850	AACGC	2	10	2111024	2111033	40 %	0 %	20 %	40 %	340782802
1100	NC_015850	CGATG	2	10	2113842	2113851	20 %	20 %	40 %	20 %	340782808
1101	NC_015850	GAATT	2	10	2116718	2116727	40 %	40 %	20 %	0 %	340782811
1102	NC_015850	TGACG	2	10	2120639	2120648	20 %	20 %	40 %	20 %	340782817
1103	NC_015850	GGCCG	2	10	2122528	2122537	0 %	0 %	60 %	40 %	340782819
1104	NC_015850	ATGGA	2	10	2123963	2123972	40 %	20 %	40 %	0 %	340782820
1105	NC_015850	ATTGC	2	10	2126463	2126472	20 %	40 %	20 %	20 %	340782823
1106	NC_015850	CCGTG	2	10	2132332	2132341	0 %	20 %	40 %	40 %	340782829
1107	NC_015850	GGGAA	2	10	2134926	2134935	40 %	0 %	60 %	0 %	340782830
1108	NC_015850	GGGCA	2	10	2135854	2135863	20 %	0 %	60 %	20 %	340782832
1109	NC_015850	GAGTG	2	10	2136980	2136989	20 %	20 %	60 %	0 %	340782833
1110	NC_015850	GGTCG	2	10	2145811	2145820	0 %	20 %	60 %	20 %	340782845
1111	NC_015850	TCCGC	2	10	2147206	2147215	0 %	20 %	20 %	60 %	340782846
1112	NC_015850	GGACA	2	10	2150463	2150472	40 %	0 %	40 %	20 %	340782849
1113	NC_015850	CACGG	2	10	2150682	2150691	20 %	0 %	40 %	40 %	340782849
1114	NC_015850	CCTTC	2	10	2151399	2151408	0 %	40 %	0 %	60 %	340782849
1115	NC_015850	CTGTG	2	10	2151931	2151940	0 %	40 %	40 %	20 %	340782850
1116	NC_015850	GGAGA	2	10	2156629	2156638	40 %	0 %	60 %	0 %	340782854
1117	NC_015850	AAAGC	2	10	2157417	2157426	60 %	0 %	20 %	20 %	340782855
1118	NC_015850	ATGGA	2	10	2159908	2159917	40 %	20 %	40 %	0 %	340782857
1119	NC_015850	AACGG	2	10	2163966	2163975	40 %	0 %	40 %	20 %	340782863
1120	NC_015850	TGGAC	2	10	2164304	2164313	20 %	20 %	40 %	20 %	340782863
1121	NC_015850	AATCA	2	10	2164617	2164626	60 %	20 %	0 %	20 %	340782863
1122	NC_015850	CCTGG	2	10	2166024	2166033	0 %	20 %	40 %	40 %	340782864
1123	NC_015850	AACGG	2	10	2166204	2166213	40 %	0 %	40 %	20 %	340782864
1124	NC_015850	TATGG	2	10	2171882	2171891	20 %	40 %	40 %	0 %	340782871
1125	NC_015850	GGTGT	2	10	2173336	2173345	0 %	40 %	60 %	0 %	340782872
1126	NC_015850	AACCG	2	10	2175605	2175614	40 %	0 %	20 %	40 %	340782873
1127	NC_015850	ACCAA	2	10	2177055	2177064	60 %	0 %	0 %	40 %	340782875
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1129	NC_015850	GGCCT	2	10	2180406	2180415	0 %	20 %	40 %	40 %	340782879
1130	NC_015850	ATTTG	2	10	2181248	2181257	20 %	60 %	20 %	0 %	340782881
1131	NC_015850	ACGAT	2	10	2181930	2181939	40 %	20 %	20 %	20 %	340782882
1132	NC_015850	ATTTC	2	10	2188281	2188290	20 %	60 %	0 %	20 %	340782887
1133	NC_015850	TCAAC	2	10	2190043	2190052	40 %	20 %	0 %	40 %	340782887
1134	NC_015850	ACTGC	2	10	2195737	2195746	20 %	20 %	20 %	40 %	340782891
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1138	NC_015850	GCCAG	2	10	2202885	2202894	20 %	0 %	40 %	40 %	340782896
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1141	NC_015850	TGCTG	2	10	2205728	2205737	0 %	40 %	40 %	20 %	340782898
1142	NC_015850	GCCGG	2	10	2206393	2206402	0 %	0 %	60 %	40 %	340782899
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1161	NC_015850	CCCTG	2	10	2232092	2232101	0 %	20 %	20 %	60 %	340782924
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1166	NC_015850	CGGCG	2	10	2244515	2244524	0 %	0 %	60 %	40 %	340782936
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1234	NC_015850	CCCAG	2	10	2356532	2356541	20 %	0 %	20 %	60 %	340783040
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1237	NC_015850	GCCCT	2	10	2359352	2359361	0 %	20 %	20 %	60 %	340783044
1238	NC_015850	TGACC	2	10	2360367	2360376	20 %	20 %	20 %	40 %	340783045
1239	NC_015850	CGATA	2	10	2364462	2364471	40 %	20 %	20 %	20 %	340783048
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1241	NC_015850	GAGCA	2	10	2367688	2367697	40 %	0 %	40 %	20 %	340783050
1242	NC_015850	AGCAC	2	10	2367776	2367785	40 %	0 %	20 %	40 %	340783050
1243	NC_015850	CGGGC	2	10	2368266	2368275	0 %	0 %	60 %	40 %	340783052
1244	NC_015850	TCCAC	2	10	2368754	2368763	20 %	20 %	0 %	60 %	340783052
1245	NC_015850	TGCGC	2	10	2372292	2372301	0 %	20 %	40 %	40 %	340783054
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1247	NC_015850	CGCCA	2	10	2376772	2376781	20 %	0 %	20 %	60 %	340783060
1248	NC_015850	GGGCT	2	10	2377419	2377428	0 %	20 %	60 %	20 %	340783060
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1251	NC_015850	CAGGG	2	10	2385879	2385888	20 %	0 %	60 %	20 %	340783068
1252	NC_015850	CAGGC	2	10	2386070	2386079	20 %	0 %	40 %	40 %	340783068
1253	NC_015850	GCGCC	2	10	2388876	2388885	0 %	0 %	40 %	60 %	340783073
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1260	NC_015850	TCCGG	2	10	2400390	2400399	0 %	20 %	40 %	40 %	340783084
1261	NC_015850	GGCTG	2	10	2401263	2401272	0 %	20 %	60 %	20 %	340783085
1262	NC_015850	TACCG	2	10	2403620	2403629	20 %	20 %	20 %	40 %	340783087
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1264	NC_015850	TTCGA	2	10	2405962	2405971	20 %	40 %	20 %	20 %	340783091
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1280	NC_015850	GCGCA	2	10	2436013	2436022	20 %	0 %	40 %	40 %	340783122
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1283	NC_015850	TCCCG	2	10	2444837	2444846	0 %	20 %	20 %	60 %	340783132
1284	NC_015850	GTCGA	2	10	2446960	2446969	20 %	20 %	40 %	20 %	340783133
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1357	NC_015850	CTGGG	2	10	2592277	2592286	0 %	20 %	60 %	20 %	340783276
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1360	NC_015850	GCTCT	2	10	2595819	2595828	0 %	40 %	20 %	40 %	340783281
1361	NC_015850	GCGTC	2	10	2596394	2596403	0 %	20 %	40 %	40 %	340783282
1362	NC_015850	GGCAG	2	10	2597042	2597051	20 %	0 %	60 %	20 %	340783283
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1364	NC_015850	GGCAC	2	10	2601438	2601447	20 %	0 %	40 %	40 %	340783286
1365	NC_015850	CGCGG	2	10	2601640	2601649	0 %	0 %	60 %	40 %	340783286
1366	NC_015850	GTGGC	2	10	2601780	2601789	0 %	20 %	60 %	20 %	340783286
1367	NC_015850	GATCA	2	10	2602770	2602779	40 %	20 %	20 %	20 %	340783287
1368	NC_015850	TACCC	2	10	2605733	2605742	20 %	20 %	0 %	60 %	340783291
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1489	NC_015850	GTACC	2	10	2779599	2779608	20 %	20 %	20 %	40 %	340783463
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1492	NC_015850	GCGGT	2	10	2784256	2784265	0 %	20 %	60 %	20 %	340783466
1493	NC_015850	ACCGC	2	10	2784758	2784767	20 %	0 %	20 %	60 %	340783466
1494	NC_015850	CGGTT	2	10	2787070	2787079	0 %	40 %	40 %	20 %	340783470
1495	NC_015850	CGCTT	2	10	2791414	2791423	0 %	40 %	20 %	40 %	340783475
1496	NC_015850	AGTTG	2	10	2793841	2793850	20 %	40 %	40 %	0 %	340783477
1497	NC_015850	CAGCG	2	10	2794621	2794630	20 %	0 %	40 %	40 %	340783479
1498	NC_015850	TTCCC	2	10	2796468	2796477	0 %	40 %	0 %	60 %	340783481
1499	NC_015850	CCCGG	2	10	2796880	2796889	0 %	0 %	40 %	60 %	340783481
1500	NC_015850	GCCCA	2	10	2797993	2798002	20 %	0 %	20 %	60 %	340783482

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