MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 6182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015850	ACCG	2	8	291	298	25 %	0 %	25 %	50 %	340780745
2	NC_015850	CTGG	2	8	2777	2784	0 %	25 %	50 %	25 %	340780747
3	NC_015850	CCAT	2	8	3043	3050	25 %	25 %	0 %	50 %	340780747
4	NC_015850	GATC	2	8	4168	4175	25 %	25 %	25 %	25 %	340780748
5	NC_015850	CACC	2	8	4606	4613	25 %	0 %	0 %	75 %	340780748
6	NC_015850	ATCT	2	8	5027	5034	25 %	50 %	0 %	25 %	340780748
7	NC_015850	GGAG	2	8	5038	5045	25 %	0 %	75 %	0 %	340780748
8	NC_015850	CGAG	2	8	5128	5135	25 %	0 %	50 %	25 %	340780748
9	NC_015850	CTAC	2	8	5427	5434	25 %	25 %	0 %	50 %	340780748
10	NC_015850	GCTC	2	8	5557	5564	0 %	25 %	25 %	50 %	340780748
11	NC_015850	ATAC	2	8	6192	6199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015850	CGCC	2	8	6347	6354	0 %	0 %	25 %	75 %	340780749
13	NC_015850	CTGG	2	8	6680	6687	0 %	25 %	50 %	25 %	340780749
14	NC_015850	ATCC	2	8	6877	6884	25 %	25 %	0 %	50 %	340780749
15	NC_015850	AAAG	2	8	7016	7023	75 %	0 %	25 %	0 %	340780749
16	NC_015850	ATCT	2	8	7626	7633	25 %	50 %	0 %	25 %	340780749
17	NC_015850	CGTG	2	8	8081	8088	0 %	25 %	50 %	25 %	340780749
18	NC_015850	GCCC	2	8	8378	8385	0 %	0 %	25 %	75 %	340780749
19	NC_015850	GCAG	2	8	8504	8511	25 %	0 %	50 %	25 %	340780749
20	NC_015850	GCGG	2	8	9131	9138	0 %	0 %	75 %	25 %	340780749
21	NC_015850	CAGT	2	8	9674	9681	25 %	25 %	25 %	25 %	340780749
22	NC_015850	ACAG	2	8	10242	10249	50 %	0 %	25 %	25 %	340780751
23	NC_015850	GACG	2	8	10902	10909	25 %	0 %	50 %	25 %	340780752
24	NC_015850	CGAC	2	8	12474	12481	25 %	0 %	25 %	50 %	340780754
25	NC_015850	GGGC	2	8	12513	12520	0 %	0 %	75 %	25 %	340780754
26	NC_015850	CCGA	2	8	12566	12573	25 %	0 %	25 %	50 %	340780754
27	NC_015850	GTCG	2	8	13296	13303	0 %	25 %	50 %	25 %	340780754
28	NC_015850	GACG	2	8	13804	13811	25 %	0 %	50 %	25 %	340780754
29	NC_015850	CGGA	2	8	13886	13893	25 %	0 %	50 %	25 %	340780754
30	NC_015850	GCCA	2	8	14139	14146	25 %	0 %	25 %	50 %	340780754
31	NC_015850	ATCC	2	8	14419	14426	25 %	25 %	0 %	50 %	340780755
32	NC_015850	CGAT	2	8	14522	14529	25 %	25 %	25 %	25 %	340780755
33	NC_015850	TCCA	2	8	14684	14691	25 %	25 %	0 %	50 %	340780755
34	NC_015850	CGCC	2	8	14858	14865	0 %	0 %	25 %	75 %	340780756
35	NC_015850	CGGG	2	8	15953	15960	0 %	0 %	75 %	25 %	340780757
36	NC_015850	CAGG	2	8	16070	16077	25 %	0 %	50 %	25 %	340780757
37	NC_015850	GCAC	2	8	16450	16457	25 %	0 %	25 %	50 %	340780757
38	NC_015850	CAAG	2	8	17093	17100	50 %	0 %	25 %	25 %	340780758
39	NC_015850	CTGT	2	8	17321	17328	0 %	50 %	25 %	25 %	340780758
40	NC_015850	GCCG	2	8	17668	17675	0 %	0 %	50 %	50 %	340780759
41	NC_015850	GTGC	2	8	18229	18236	0 %	25 %	50 %	25 %	340780759
42	NC_015850	CGTG	2	8	18282	18289	0 %	25 %	50 %	25 %	340780759
43	NC_015850	GGGC	2	8	18535	18542	0 %	0 %	75 %	25 %	340780760
44	NC_015850	GCAG	2	8	18581	18588	25 %	0 %	50 %	25 %	340780760
45	NC_015850	TGGG	2	8	18774	18781	0 %	25 %	75 %	0 %	340780760
46	NC_015850	GCGA	2	8	18850	18857	25 %	0 %	50 %	25 %	340780760
47	NC_015850	CGCC	2	8	19015	19022	0 %	0 %	25 %	75 %	340780760
48	NC_015850	CGTC	2	8	19508	19515	0 %	25 %	25 %	50 %	340780760
49	NC_015850	CCCA	2	8	19663	19670	25 %	0 %	0 %	75 %	340780760
50	NC_015850	CAGC	2	8	20098	20105	25 %	0 %	25 %	50 %	340780761
51	NC_015850	ATCG	2	8	20267	20274	25 %	25 %	25 %	25 %	340780761
52	NC_015850	CCGG	2	8	21099	21106	0 %	0 %	50 %	50 %	340780761
53	NC_015850	GGCC	2	8	21796	21803	0 %	0 %	50 %	50 %	340780761
54	NC_015850	GTCA	2	8	22462	22469	25 %	25 %	25 %	25 %	340780762
55	NC_015850	GGAC	2	8	22695	22702	25 %	0 %	50 %	25 %	340780762
56	NC_015850	CGAG	2	8	23283	23290	25 %	0 %	50 %	25 %	340780762
57	NC_015850	GGCG	2	8	23452	23459	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015850	GGCC	2	8	23683	23690	0 %	0 %	50 %	50 %	340780763
59	NC_015850	GGCG	2	8	23938	23945	0 %	0 %	75 %	25 %	340780763
60	NC_015850	GCGT	2	8	23991	23998	0 %	25 %	50 %	25 %	340780763
61	NC_015850	CTGC	2	8	24452	24459	0 %	25 %	25 %	50 %	340780764
62	NC_015850	TCCT	2	8	25355	25362	0 %	50 %	0 %	50 %	340780766
63	NC_015850	TTCA	2	8	25472	25479	25 %	50 %	0 %	25 %	340780766
64	NC_015850	CGAG	2	8	26089	26096	25 %	0 %	50 %	25 %	340780766
65	NC_015850	GGCC	2	8	26110	26117	0 %	0 %	50 %	50 %	340780766
66	NC_015850	GCCC	2	8	27668	27675	0 %	0 %	25 %	75 %	340780768
67	NC_015850	GGCG	2	8	28112	28119	0 %	0 %	75 %	25 %	340780769
68	NC_015850	CGTG	2	8	28253	28260	0 %	25 %	50 %	25 %	340780769
69	NC_015850	GCCC	2	8	28622	28629	0 %	0 %	25 %	75 %	340780769
70	NC_015850	AAAC	2	8	28979	28986	75 %	0 %	0 %	25 %	340780770
71	NC_015850	CCGG	2	8	29175	29182	0 %	0 %	50 %	50 %	340780770
72	NC_015850	ACCT	2	8	29828	29835	25 %	25 %	0 %	50 %	340780771
73	NC_015850	CAAT	2	8	30477	30484	50 %	25 %	0 %	25 %	340780773
74	NC_015850	GCGG	2	8	30649	30656	0 %	0 %	75 %	25 %	340780773
75	NC_015850	GGCG	2	8	31422	31429	0 %	0 %	75 %	25 %	340780774
76	NC_015850	AGGA	2	8	31761	31768	50 %	0 %	50 %	0 %	340780775
77	NC_015850	CAGG	2	8	32510	32517	25 %	0 %	50 %	25 %	340780775
78	NC_015850	TGCG	2	8	33180	33187	0 %	25 %	50 %	25 %	340780776
79	NC_015850	GCCC	2	8	33188	33195	0 %	0 %	25 %	75 %	340780776
80	NC_015850	GCGA	2	8	34154	34161	25 %	0 %	50 %	25 %	340780777
81	NC_015850	CATC	2	8	34306	34313	25 %	25 %	0 %	50 %	340780777
82	NC_015850	TCCC	2	8	34897	34904	0 %	25 %	0 %	75 %	340780777
83	NC_015850	GCCT	2	8	35885	35892	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015850	CTGG	2	8	36050	36057	0 %	25 %	50 %	25 %	340780779
85	NC_015850	TTGG	2	8	36517	36524	0 %	50 %	50 %	0 %	340780779
86	NC_015850	TGCG	2	8	39424	39431	0 %	25 %	50 %	25 %	340780781
87	NC_015850	CTGG	2	8	39692	39699	0 %	25 %	50 %	25 %	340780782
88	NC_015850	GCCA	2	8	39945	39952	25 %	0 %	25 %	50 %	340780782
89	NC_015850	GGGT	2	8	40273	40280	0 %	25 %	75 %	0 %	340780782
90	NC_015850	ATCC	2	8	40387	40394	25 %	25 %	0 %	50 %	340780783
91	NC_015850	TGGC	2	8	40703	40710	0 %	25 %	50 %	25 %	340780783
92	NC_015850	TTGA	2	8	40957	40964	25 %	50 %	25 %	0 %	340780783
93	NC_015850	CGCC	2	8	41424	41431	0 %	0 %	25 %	75 %	340780783
94	NC_015850	ATGA	2	8	41894	41901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015850	TTTC	2	8	42373	42380	0 %	75 %	0 %	25 %	340780784
96	NC_015850	AGCA	2	8	43087	43094	50 %	0 %	25 %	25 %	340780784
97	NC_015850	CGCT	2	8	43881	43888	0 %	25 %	25 %	50 %	340780785
98	NC_015850	GAGC	2	8	44271	44278	25 %	0 %	50 %	25 %	340780785
99	NC_015850	TGGT	2	8	45031	45038	0 %	50 %	50 %	0 %	340780785
100	NC_015850	TCCC	2	8	45170	45177	0 %	25 %	0 %	75 %	340780785
101	NC_015850	GGCC	2	8	45386	45393	0 %	0 %	50 %	50 %	340780785
102	NC_015850	GATC	2	8	45525	45532	25 %	25 %	25 %	25 %	340780785
103	NC_015850	ATGG	2	8	46111	46118	25 %	25 %	50 %	0 %	340780785
104	NC_015850	AGTA	2	8	48208	48215	50 %	25 %	25 %	0 %	340780787
105	NC_015850	GAGC	2	8	48481	48488	25 %	0 %	50 %	25 %	340780787
106	NC_015850	GGCA	2	8	49372	49379	25 %	0 %	50 %	25 %	340780788
107	NC_015850	TCAG	2	8	49510	49517	25 %	25 %	25 %	25 %	340780788
108	NC_015850	GCCG	2	8	49764	49771	0 %	0 %	50 %	50 %	340780788
109	NC_015850	CAGC	2	8	49805	49812	25 %	0 %	25 %	50 %	340780788
110	NC_015850	GCTG	2	8	49902	49909	0 %	25 %	50 %	25 %	340780788
111	NC_015850	CATC	2	8	50945	50952	25 %	25 %	0 %	50 %	340780790
112	NC_015850	GCTG	2	8	50969	50976	0 %	25 %	50 %	25 %	340780790
113	NC_015850	CCTG	2	8	51108	51115	0 %	25 %	25 %	50 %	340780790
114	NC_015850	TTTC	2	8	51768	51775	0 %	75 %	0 %	25 %	340780790
115	NC_015850	GGCC	2	8	52834	52841	0 %	0 %	50 %	50 %	340780791
116	NC_015850	GCCG	2	8	52862	52869	0 %	0 %	50 %	50 %	340780791
117	NC_015850	GCCT	2	8	53429	53436	0 %	25 %	25 %	50 %	340780792
118	NC_015850	GCGT	2	8	54777	54784	0 %	25 %	50 %	25 %	340780793
119	NC_015850	TATC	2	8	55927	55934	25 %	50 %	0 %	25 %	340780793
120	NC_015850	CGCA	2	8	56921	56928	25 %	0 %	25 %	50 %	340780794
121	NC_015850	GACC	2	8	57707	57714	25 %	0 %	25 %	50 %	340780795
122	NC_015850	GAGG	2	8	57865	57872	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015850	TGCT	2	8	57932	57939	0 %	50 %	25 %	25 %	340780796
124	NC_015850	CCCG	2	8	58504	58511	0 %	0 %	25 %	75 %	340780796
125	NC_015850	ATCT	2	8	58737	58744	25 %	50 %	0 %	25 %	340780797
126	NC_015850	CGCC	2	8	58751	58758	0 %	0 %	25 %	75 %	340780797
127	NC_015850	GCAC	2	8	60269	60276	25 %	0 %	25 %	50 %	340780797
128	NC_015850	CTGC	2	8	60835	60842	0 %	25 %	25 %	50 %	340780798
129	NC_015850	GGCC	2	8	61601	61608	0 %	0 %	50 %	50 %	340780799
130	NC_015850	GTGA	2	8	61928	61935	25 %	25 %	50 %	0 %	340780800
131	NC_015850	GGGC	2	8	62007	62014	0 %	0 %	75 %	25 %	340780800
132	NC_015850	GGTC	2	8	62404	62411	0 %	25 %	50 %	25 %	340780800
133	NC_015850	ACGG	2	8	62628	62635	25 %	0 %	50 %	25 %	340780800
134	NC_015850	GGCA	2	8	63222	63229	25 %	0 %	50 %	25 %	340780800
135	NC_015850	ACGC	2	8	63363	63370	25 %	0 %	25 %	50 %	340780800
136	NC_015850	TGGC	2	8	64034	64041	0 %	25 %	50 %	25 %	340780800
137	NC_015850	ACCC	2	8	64663	64670	25 %	0 %	0 %	75 %	340780802
138	NC_015850	CTGG	2	8	64869	64876	0 %	25 %	50 %	25 %	340780802
139	NC_015850	CATC	2	8	64925	64932	25 %	25 %	0 %	50 %	340780802
140	NC_015850	GCCA	2	8	65393	65400	25 %	0 %	25 %	50 %	340780802
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