MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 6182

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 1213Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015850	CGCT	2	8	2835888	2835895	0 %	25 %	25 %	50 %	340783521
6002	NC_015850	CAAA	2	8	2836805	2836812	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6003	NC_015850	CGGG	2	8	2836999	2837006	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6004	NC_015850	CCGT	2	8	2837209	2837216	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_015850	GTCT	2	8	2837586	2837593	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_015850	CACT	2	8	2837620	2837627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_015850	CTTT	2	8	2838842	2838849	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6008	NC_015850	CTGT	2	8	2838882	2838889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_015850	GTCT	2	8	2838985	2838992	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6010	NC_015850	AAGT	2	8	2839337	2839344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_015850	TCGG	2	8	2839481	2839488	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6012	NC_015850	TCGC	2	8	2839675	2839682	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6013	NC_015850	GCAG	2	8	2842520	2842527	25 %	0 %	50 %	25 %	340783523
6014	NC_015850	GGAG	2	8	2842796	2842803	25 %	0 %	75 %	0 %	340783524
6015	NC_015850	CAAC	2	8	2843208	2843215	50 %	0 %	0 %	50 %	340783524
6016	NC_015850	GTCC	2	8	2843230	2843237	0 %	25 %	25 %	50 %	340783524
6017	NC_015850	CCAT	2	8	2843801	2843808	25 %	25 %	0 %	50 %	340783524
6018	NC_015850	ATTC	2	8	2844096	2844103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6019	NC_015850	CCAC	2	8	2844242	2844249	25 %	0 %	0 %	75 %	340783525
6020	NC_015850	ATCA	2	8	2844419	2844426	50 %	25 %	0 %	25 %	340783525
6021	NC_015850	GGTC	2	8	2844553	2844560	0 %	25 %	50 %	25 %	340783525
6022	NC_015850	CAAT	2	8	2844850	2844857	50 %	25 %	0 %	25 %	340783525
6023	NC_015850	TACC	2	8	2845756	2845763	25 %	25 %	0 %	50 %	340783526
6024	NC_015850	TCCA	2	8	2846153	2846160	25 %	25 %	0 %	50 %	340783527
6025	NC_015850	ATGG	2	8	2846231	2846238	25 %	25 %	50 %	0 %	340783527
6026	NC_015850	CTGC	2	8	2847202	2847209	0 %	25 %	25 %	50 %	340783527
6027	NC_015850	CAGG	2	8	2847705	2847712	25 %	0 %	50 %	25 %	340783528
6028	NC_015850	GACC	2	8	2847864	2847871	25 %	0 %	25 %	50 %	340783528
6029	NC_015850	GGGA	2	8	2848161	2848168	25 %	0 %	75 %	0 %	340783528
6030	NC_015850	AGGT	2	8	2848426	2848433	25 %	25 %	50 %	0 %	340783528
6031	NC_015850	TCGT	2	8	2848767	2848774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6032	NC_015850	CGTC	2	8	2848887	2848894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_015850	AGCA	2	8	2849451	2849458	50 %	0 %	25 %	25 %	340783529
6034	NC_015850	CCGC	2	8	2849564	2849571	0 %	0 %	25 %	75 %	340783529
6035	NC_015850	GTAT	2	8	2849890	2849897	25 %	50 %	25 %	0 %	340783530
6036	NC_015850	CTGG	2	8	2850027	2850034	0 %	25 %	50 %	25 %	340783530
6037	NC_015850	CCAG	2	8	2850752	2850759	25 %	0 %	25 %	50 %	340783531
6038	NC_015850	GCCT	2	8	2851164	2851171	0 %	25 %	25 %	50 %	340783531
6039	NC_015850	CCAC	2	8	2851546	2851553	25 %	0 %	0 %	75 %	340783531
6040	NC_015850	CTGC	2	8	2851892	2851899	0 %	25 %	25 %	50 %	340783531
6041	NC_015850	CCGC	2	8	2852280	2852287	0 %	0 %	25 %	75 %	340783532
6042	NC_015850	CGGC	2	8	2852505	2852512	0 %	0 %	50 %	50 %	340783533
6043	NC_015850	GCCT	2	8	2855782	2855789	0 %	25 %	25 %	50 %	340783537
6044	NC_015850	GGGT	2	8	2855864	2855871	0 %	25 %	75 %	0 %	340783537
6045	NC_015850	GACG	2	8	2856003	2856010	25 %	0 %	50 %	25 %	340783537
6046	NC_015850	GCAG	2	8	2856948	2856955	25 %	0 %	50 %	25 %	340783538
6047	NC_015850	CGTA	2	8	2857074	2857081	25 %	25 %	25 %	25 %	340783538
6048	NC_015850	CATC	2	8	2858019	2858026	25 %	25 %	0 %	50 %	340783540
6049	NC_015850	GCCC	2	8	2858921	2858928	0 %	0 %	25 %	75 %	340783542
6050	NC_015850	AGCA	2	8	2859025	2859032	50 %	0 %	25 %	25 %	340783542
6051	NC_015850	TCAG	2	8	2859469	2859476	25 %	25 %	25 %	25 %	340783542
6052	NC_015850	CGTG	2	8	2859532	2859539	0 %	25 %	50 %	25 %	340783542
6053	NC_015850	AGAA	2	8	2860049	2860056	75 %	0 %	25 %	0 %	340783543
6054	NC_015850	CGCC	2	8	2862184	2862191	0 %	0 %	25 %	75 %	340783545
6055	NC_015850	CTCG	2	8	2863130	2863137	0 %	25 %	25 %	50 %	340783546
6056	NC_015850	AGAA	2	8	2863904	2863911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_015850	CCTG	2	8	2865938	2865945	0 %	25 %	25 %	50 %	340783550
6058	NC_015850	CTGG	2	8	2866728	2866735	0 %	25 %	50 %	25 %	340783550
6059	NC_015850	CGGG	2	8	2867554	2867561	0 %	0 %	75 %	25 %	340783552
6060	NC_015850	GGTC	2	8	2867707	2867714	0 %	25 %	50 %	25 %	340783552
6061	NC_015850	GCTG	2	8	2868106	2868113	0 %	25 %	50 %	25 %	340783552
6062	NC_015850	GATC	2	8	2868313	2868320	25 %	25 %	25 %	25 %	340783552
6063	NC_015850	GGCC	2	8	2869075	2869082	0 %	0 %	50 %	50 %	340783553
6064	NC_015850	CGCC	2	8	2869088	2869095	0 %	0 %	25 %	75 %	340783553
6065	NC_015850	CGAC	2	8	2869278	2869285	25 %	0 %	25 %	50 %	340783553
6066	NC_015850	CACC	3	12	2870000	2870011	25 %	0 %	0 %	75 %	340783553
6067	NC_015850	CATC	2	8	2870308	2870315	25 %	25 %	0 %	50 %	340783554
6068	NC_015850	AGCC	2	8	2870421	2870428	25 %	0 %	25 %	50 %	340783554
6069	NC_015850	GGGC	2	8	2870947	2870954	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6070	NC_015850	GGGA	2	8	2871606	2871613	25 %	0 %	75 %	0 %	340783555
6071	NC_015850	TGGC	2	8	2871633	2871640	0 %	25 %	50 %	25 %	340783555
6072	NC_015850	GGAC	2	8	2872163	2872170	25 %	0 %	50 %	25 %	340783555
6073	NC_015850	TCAG	2	8	2872477	2872484	25 %	25 %	25 %	25 %	340783555
6074	NC_015850	CCAT	2	8	2872975	2872982	25 %	25 %	0 %	50 %	340783555
6075	NC_015850	GGCA	2	8	2873108	2873115	25 %	0 %	50 %	25 %	340783555
6076	NC_015850	GCAA	2	8	2873118	2873125	50 %	0 %	25 %	25 %	340783555
6077	NC_015850	GCCC	2	8	2873602	2873609	0 %	0 %	25 %	75 %	340783555
6078	NC_015850	TGGG	2	8	2873961	2873968	0 %	25 %	75 %	0 %	340783557
6079	NC_015850	CCAT	2	8	2874212	2874219	25 %	25 %	0 %	50 %	340783557
6080	NC_015850	GAAA	2	8	2875097	2875104	75 %	0 %	25 %	0 %	340783558
6081	NC_015850	GCGG	2	8	2875582	2875589	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6082	NC_015850	CTGC	2	8	2875727	2875734	0 %	25 %	25 %	50 %	340783559
6083	NC_015850	CGAC	2	8	2876215	2876222	25 %	0 %	25 %	50 %	340783559
6084	NC_015850	GCGG	2	8	2876357	2876364	0 %	0 %	75 %	25 %	340783559
6085	NC_015850	GCGG	2	8	2877645	2877652	0 %	0 %	75 %	25 %	340783560
6086	NC_015850	TGCT	2	8	2878169	2878176	0 %	50 %	25 %	25 %	340783561
6087	NC_015850	GGGC	2	8	2878893	2878900	0 %	0 %	75 %	25 %	340783562
6088	NC_015850	GCCC	2	8	2878946	2878953	0 %	0 %	25 %	75 %	340783562
6089	NC_015850	GCCG	2	8	2880465	2880472	0 %	0 %	50 %	50 %	340783565
6090	NC_015850	TATT	2	8	2880743	2880750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_015850	TGCT	2	8	2880831	2880838	0 %	50 %	25 %	25 %	340783566
6092	NC_015850	GGTC	2	8	2881276	2881283	0 %	25 %	50 %	25 %	340783566
6093	NC_015850	CATC	2	8	2881936	2881943	25 %	25 %	0 %	50 %	340783566
6094	NC_015850	GAAT	2	8	2882210	2882217	50 %	25 %	25 %	0 %	340783567
6095	NC_015850	GGCA	2	8	2882381	2882388	25 %	0 %	50 %	25 %	340783567
6096	NC_015850	GCAG	2	8	2882729	2882736	25 %	0 %	50 %	25 %	340783567
6097	NC_015850	TCCT	2	8	2882856	2882863	0 %	50 %	0 %	50 %	340783567
6098	NC_015850	CGCC	2	8	2883233	2883240	0 %	0 %	25 %	75 %	340783568
6099	NC_015850	AAGG	2	8	2883597	2883604	50 %	0 %	50 %	0 %	340783568
6100	NC_015850	GCGG	2	8	2884857	2884864	0 %	0 %	75 %	25 %	340783570
6101	NC_015850	CTTC	2	8	2885948	2885955	0 %	50 %	0 %	50 %	340783571
6102	NC_015850	GGCG	2	8	2887986	2887993	0 %	0 %	75 %	25 %	340783573
6103	NC_015850	GCCG	2	8	2888620	2888627	0 %	0 %	50 %	50 %	340783575
6104	NC_015850	GCCC	2	8	2892446	2892453	0 %	0 %	25 %	75 %	340783580
6105	NC_015850	CAGC	2	8	2894394	2894401	25 %	0 %	25 %	50 %	340783584
6106	NC_015850	CGGT	2	8	2894425	2894432	0 %	25 %	50 %	25 %	340783584
6107	NC_015850	GCAC	2	8	2895336	2895343	25 %	0 %	25 %	50 %	340783585
6108	NC_015850	CACC	2	8	2895835	2895842	25 %	0 %	0 %	75 %	340783586
6109	NC_015850	GCCA	2	8	2896182	2896189	25 %	0 %	25 %	50 %	340783586
6110	NC_015850	GGTG	2	8	2898671	2898678	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_015850	GCAT	2	8	2898703	2898710	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6112	NC_015850	GGGA	2	8	2899040	2899047	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_015850	GATC	2	8	2899375	2899382	25 %	25 %	25 %	25 %	340783588
6114	NC_015850	CCAA	2	8	2899864	2899871	50 %	0 %	0 %	50 %	340783588
6115	NC_015850	AGGC	3	12	2900080	2900091	25 %	0 %	50 %	25 %	340783588
6116	NC_015850	CGCC	2	8	2900117	2900124	0 %	0 %	25 %	75 %	340783588
6117	NC_015850	GCCA	2	8	2900196	2900203	25 %	0 %	25 %	50 %	340783588
6118	NC_015850	GGCC	2	8	2900213	2900220	0 %	0 %	50 %	50 %	340783588
6119	NC_015850	CAGC	2	8	2900335	2900342	25 %	0 %	25 %	50 %	340783588
6120	NC_015850	TTTC	2	8	2900753	2900760	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6121	NC_015850	GCCA	2	8	2901247	2901254	25 %	0 %	25 %	50 %	340783589
6122	NC_015850	CCGC	2	8	2902399	2902406	0 %	0 %	25 %	75 %	340783590
6123	NC_015850	CCCG	2	8	2904615	2904622	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6124	NC_015850	GCTG	2	8	2905614	2905621	0 %	25 %	50 %	25 %	340783595
6125	NC_015850	GCCG	2	8	2905756	2905763	0 %	0 %	50 %	50 %	340783595
6126	NC_015850	CAGC	2	8	2906247	2906254	25 %	0 %	25 %	50 %	340783596
6127	NC_015850	GCGT	2	8	2906549	2906556	0 %	25 %	50 %	25 %	340783596
6128	NC_015850	GGCG	2	8	2906793	2906800	0 %	0 %	75 %	25 %	340783596
6129	NC_015850	AGGC	2	8	2906894	2906901	25 %	0 %	50 %	25 %	340783596
6130	NC_015850	GGGC	2	8	2907017	2907024	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6131	NC_015850	GGCC	2	8	2907251	2907258	0 %	0 %	50 %	50 %	340783597
6132	NC_015850	CTGC	2	8	2907859	2907866	0 %	25 %	25 %	50 %	340783598
6133	NC_015850	ACCG	2	8	2907918	2907925	25 %	0 %	25 %	50 %	340783598
6134	NC_015850	GCCC	2	8	2909175	2909182	0 %	0 %	25 %	75 %	340783599
6135	NC_015850	ATCA	2	8	2910723	2910730	50 %	25 %	0 %	25 %	340783600
6136	NC_015850	AACG	2	8	2910741	2910748	50 %	0 %	25 %	25 %	340783600
6137	NC_015850	TTCC	2	8	2910779	2910786	0 %	50 %	0 %	50 %	340783600
6138	NC_015850	GGCC	2	8	2911268	2911275	0 %	0 %	50 %	50 %	340783600
6139	NC_015850	GAGG	2	8	2912138	2912145	25 %	0 %	75 %	0 %	340783601
6140	NC_015850	CTCC	2	8	2912368	2912375	0 %	25 %	0 %	75 %	340783601
6141	NC_015850	ACGA	2	8	2912561	2912568	50 %	0 %	25 %	25 %	340783601
6142	NC_015850	AGCG	2	8	2913340	2913347	25 %	0 %	50 %	25 %	340783602
6143	NC_015850	CATT	2	8	2913503	2913510	25 %	50 %	0 %	25 %	340783602
6144	NC_015850	CCAC	2	8	2913767	2913774	25 %	0 %	0 %	75 %	340783602
6145	NC_015850	ACGT	2	8	2913998	2914005	25 %	25 %	25 %	25 %	340783602
6146	NC_015850	GCTG	2	8	2914455	2914462	0 %	25 %	50 %	25 %	340783603
6147	NC_015850	GATC	2	8	2914630	2914637	25 %	25 %	25 %	25 %	340783603
6148	NC_015850	CTGG	2	8	2914873	2914880	0 %	25 %	50 %	25 %	340783603
6149	NC_015850	AGCG	2	8	2915636	2915643	25 %	0 %	50 %	25 %	340783604
6150	NC_015850	GGCC	2	8	2916965	2916972	0 %	0 %	50 %	50 %	340783606
6151	NC_015850	TGGG	2	8	2917275	2917282	0 %	25 %	75 %	0 %	340783606
6152	NC_015850	CGCC	2	8	2918325	2918332	0 %	0 %	25 %	75 %	340783607
6153	NC_015850	ACCC	2	8	2918857	2918864	25 %	0 %	0 %	75 %	340783608
6154	NC_015850	GCGG	2	8	2918915	2918922	0 %	0 %	75 %	25 %	340783608
6155	NC_015850	CCAA	2	8	2920689	2920696	50 %	0 %	0 %	50 %	340783612
6156	NC_015850	GCCG	2	8	2921083	2921090	0 %	0 %	50 %	50 %	340783612
6157	NC_015850	CCCA	2	8	2921124	2921131	25 %	0 %	0 %	75 %	340783612
6158	NC_015850	CGCC	2	8	2922251	2922258	0 %	0 %	25 %	75 %	340783613
6159	NC_015850	GGCG	2	8	2923028	2923035	0 %	0 %	75 %	25 %	340783614
6160	NC_015850	TTCC	2	8	2923251	2923258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6161	NC_015850	AGCC	2	8	2923600	2923607	25 %	0 %	25 %	50 %	340783615
6162	NC_015850	TCGT	2	8	2923655	2923662	0 %	50 %	25 %	25 %	340783615
6163	NC_015850	ACCC	2	8	2923881	2923888	25 %	0 %	0 %	75 %	340783616
6164	NC_015850	TGGT	2	8	2924467	2924474	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6165	NC_015850	AATA	2	8	2924580	2924587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6166	NC_015850	GGTC	2	8	2924932	2924939	0 %	25 %	50 %	25 %	340783617
6167	NC_015850	ACGC	2	8	2924984	2924991	25 %	0 %	25 %	50 %	340783617
6168	NC_015850	TTCA	2	8	2925203	2925210	25 %	50 %	0 %	25 %	340783617
6169	NC_015850	CGCC	2	8	2925345	2925352	0 %	0 %	25 %	75 %	340783617
6170	NC_015850	CGTC	2	8	2925669	2925676	0 %	25 %	25 %	50 %	340783617
6171	NC_015850	TTTA	2	8	2926176	2926183	25 %	75 %	0 %	0 %	340783617
6172	NC_015850	GGGC	2	8	2926583	2926590	0 %	0 %	75 %	25 %	340783618
6173	NC_015850	GGCG	2	8	2927638	2927645	0 %	0 %	75 %	25 %	340783620
6174	NC_015850	TGCC	2	8	2927707	2927714	0 %	25 %	25 %	50 %	340783620
6175	NC_015850	CCCG	2	8	2929735	2929742	0 %	0 %	25 %	75 %	340783622
6176	NC_015850	GCAG	2	8	2930099	2930106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6177	NC_015850	AGGG	2	8	2930155	2930162	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6178	NC_015850	GGTA	2	8	2931331	2931338	25 %	25 %	50 %	0 %	340783624
6179	NC_015850	GCCG	2	8	2931808	2931815	0 %	0 %	50 %	50 %	340783624
6180	NC_015850	TGGG	2	8	2931997	2932004	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6181	NC_015850	CAGC	2	8	2932021	2932028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6182	NC_015850	GGGT	2	8	2932113	2932120	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding

< Previous 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 1213Next >