MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 6182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015850	AGGC	2	8	2362167	2362174	25 %	0 %	50 %	25 %	340783046
5002	NC_015850	AGCC	2	8	2362447	2362454	25 %	0 %	25 %	50 %	340783046
5003	NC_015850	GAAA	2	8	2363425	2363432	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_015850	CTGC	2	8	2363708	2363715	0 %	25 %	25 %	50 %	340783047
5005	NC_015850	CCCG	2	8	2363768	2363775	0 %	0 %	25 %	75 %	340783047
5006	NC_015850	GCCG	2	8	2363938	2363945	0 %	0 %	50 %	50 %	340783047
5007	NC_015850	CTCC	2	8	2365989	2365996	0 %	25 %	0 %	75 %	340783049
5008	NC_015850	CCGC	2	8	2366012	2366019	0 %	0 %	25 %	75 %	340783049
5009	NC_015850	CCAC	2	8	2366027	2366034	25 %	0 %	0 %	75 %	340783049
5010	NC_015850	CTGG	2	8	2366035	2366042	0 %	25 %	50 %	25 %	340783049
5011	NC_015850	CAAC	2	8	2366776	2366783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_015850	CCAG	2	8	2366833	2366840	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_015850	TCCT	2	8	2366923	2366930	0 %	50 %	0 %	50 %	340783050
5014	NC_015850	TCGC	2	8	2369410	2369417	0 %	25 %	25 %	50 %	340783052
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5016	NC_015850	GGCC	2	8	2369523	2369530	0 %	0 %	50 %	50 %	340783052
5017	NC_015850	CGTG	2	8	2369703	2369710	0 %	25 %	50 %	25 %	340783052
5018	NC_015850	CCAG	2	8	2369721	2369728	25 %	0 %	25 %	50 %	340783052
5019	NC_015850	GCCA	2	8	2369818	2369825	25 %	0 %	25 %	50 %	340783052
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5021	NC_015850	CCAC	2	8	2372453	2372460	25 %	0 %	0 %	75 %	340783054
5022	NC_015850	CCAT	2	8	2372997	2373004	25 %	25 %	0 %	50 %	340783055
5023	NC_015850	CCCG	2	8	2373030	2373037	0 %	0 %	25 %	75 %	340783055
5024	NC_015850	GTCG	2	8	2373229	2373236	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5032	NC_015850	CTGG	2	8	2377335	2377342	0 %	25 %	50 %	25 %	340783060
5033	NC_015850	CTCC	2	8	2377429	2377436	0 %	25 %	0 %	75 %	340783060
5034	NC_015850	AGCC	3	12	2378577	2378588	25 %	0 %	25 %	50 %	340783060
5035	NC_015850	GGCT	2	8	2379352	2379359	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_015850	TGGC	2	8	2381073	2381080	0 %	25 %	50 %	25 %	340783062
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5041	NC_015850	CGCC	2	8	2384257	2384264	0 %	0 %	25 %	75 %	340783066
5042	NC_015850	ATCT	2	8	2385259	2385266	25 %	50 %	0 %	25 %	340783067
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5056	NC_015850	CCTC	2	8	2391150	2391157	0 %	25 %	0 %	75 %	340783074
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5058	NC_015850	CGGG	2	8	2392151	2392158	0 %	0 %	75 %	25 %	340783075
5059	NC_015850	CATC	2	8	2392247	2392254	25 %	25 %	0 %	50 %	340783075
5060	NC_015850	GCTG	2	8	2393179	2393186	0 %	25 %	50 %	25 %	340783075
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5071	NC_015850	CCGT	2	8	2398583	2398590	0 %	25 %	25 %	50 %	340783082
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5073	NC_015850	TGGG	2	8	2398879	2398886	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_015850	CCCG	2	8	2399126	2399133	0 %	0 %	25 %	75 %	340783083
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5124	NC_015850	GCGG	2	8	2420094	2420101	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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