MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 23954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015562	TAT	2	6	57	62	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909895
2	NC_015562	TTA	2	6	87	92	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909895
3	NC_015562	TAT	3	9	145	153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909895
4	NC_015562	TGA	2	6	260	265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909896
5	NC_015562	GCA	3	9	396	404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909896
6	NC_015562	GCG	2	6	417	422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333909896
7	NC_015562	AAT	2	6	593	598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909896
8	NC_015562	AAT	2	6	635	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909896
9	NC_015562	ATA	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909896
10	NC_015562	TTG	2	6	787	792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909896
11	NC_015562	TAA	2	6	847	852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909896
12	NC_015562	AAG	2	6	853	858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909896
13	NC_015562	GTT	2	6	1005	1010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909896
14	NC_015562	AGC	2	6	1028	1033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909896
15	NC_015562	ATC	2	6	1055	1060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909896
16	NC_015562	TGG	2	6	1073	1078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333909896
17	NC_015562	TTG	2	6	1084	1089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909896
18	NC_015562	GCA	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909896
19	NC_015562	ACT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909897
20	NC_015562	TAT	2	6	1491	1496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909897
21	NC_015562	TTA	2	6	1505	1510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909897
22	NC_015562	ATT	2	6	1591	1596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909897
23	NC_015562	GTT	2	6	1610	1615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909897
24	NC_015562	TGA	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909897
25	NC_015562	AAG	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
26	NC_015562	AGT	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909897
27	NC_015562	TGT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909897
28	NC_015562	GTT	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909897
29	NC_015562	TGT	2	6	2038	2043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909897
30	NC_015562	AGA	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
31	NC_015562	ATG	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909897
32	NC_015562	AAG	3	9	2312	2320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
33	NC_015562	AGA	2	6	2326	2331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
34	NC_015562	GAA	3	9	2333	2341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
35	NC_015562	GAA	3	9	2480	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
36	NC_015562	ACA	2	6	2511	2516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909897
37	NC_015562	CAA	2	6	2535	2540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909897
38	NC_015562	TAC	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909897
39	NC_015562	AGA	2	6	2575	2580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909897
40	NC_015562	GCA	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909897
41	NC_015562	TCC	2	6	3340	3345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909898
42	NC_015562	TTG	2	6	3428	3433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909898
43	NC_015562	ATC	2	6	3471	3476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909898
44	NC_015562	CTT	2	6	3641	3646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909898
45	NC_015562	TCC	2	6	3690	3695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909898
46	NC_015562	ACA	2	6	3796	3801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909898
47	NC_015562	GAT	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909899
48	NC_015562	TAA	2	6	3870	3875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909899
49	NC_015562	TGA	2	6	4094	4099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909899
50	NC_015562	TCA	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909899
51	NC_015562	CTT	2	6	4132	4137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909899
52	NC_015562	AAC	2	6	4636	4641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909899
53	NC_015562	TCT	2	6	4698	4703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909899
54	NC_015562	ATT	2	6	4783	4788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909899
55	NC_015562	AAG	2	6	4928	4933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909900
56	NC_015562	ACA	2	6	4953	4958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909900
57	NC_015562	AAT	2	6	4994	4999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909900
58	NC_015562	TCA	3	9	5063	5071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909900
59	NC_015562	GAA	2	6	5128	5133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909900
60	NC_015562	GAT	2	6	5177	5182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909900
61	NC_015562	TAT	2	6	5283	5288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909900
62	NC_015562	GGA	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909900
63	NC_015562	GAA	2	6	5342	5347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909900
64	NC_015562	GAA	2	6	5351	5356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909900
65	NC_015562	ATA	2	6	5447	5452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909900
66	NC_015562	TAC	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909900
67	NC_015562	TAA	2	6	5625	5630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909900
68	NC_015562	TTG	2	6	5699	5704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909901
69	NC_015562	ATT	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909901
70	NC_015562	AGA	2	6	5966	5971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909901
71	NC_015562	ATT	2	6	6001	6006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909901
72	NC_015562	AAG	2	6	6011	6016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909901
73	NC_015562	GAA	2	6	6078	6083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909901
74	NC_015562	TAA	2	6	6085	6090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909901
75	NC_015562	AGA	2	6	6127	6132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909901
76	NC_015562	ATT	2	6	6153	6158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909901
77	NC_015562	TGG	2	6	6181	6186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333909901
78	NC_015562	GCA	2	6	6187	6192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909901
79	NC_015562	TTG	2	6	6198	6203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909901
80	NC_015562	AGA	2	6	6265	6270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909901
81	NC_015562	ATT	2	6	6326	6331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909901
82	NC_015562	TCT	2	6	6377	6382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909901
83	NC_015562	GTT	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909901
84	NC_015562	AGA	2	6	6464	6469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909901
85	NC_015562	GTT	2	6	6507	6512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909902
86	NC_015562	TAT	2	6	6528	6533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909902
87	NC_015562	AAT	2	6	6619	6624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909902
88	NC_015562	ATT	2	6	6688	6693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909902
89	NC_015562	AGA	2	6	6724	6729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909902
90	NC_015562	CAA	2	6	6750	6755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909902
91	NC_015562	TGT	2	6	6939	6944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909902
92	NC_015562	GTG	2	6	7152	7157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333909903
93	NC_015562	ATT	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909903
94	NC_015562	TAA	2	6	7392	7397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909903
95	NC_015562	ACC	2	6	7455	7460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333909903
96	NC_015562	CAA	2	6	7533	7538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909903
97	NC_015562	TGT	2	6	7675	7680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909903
98	NC_015562	ATG	2	6	7722	7727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909903
99	NC_015562	TAA	2	6	7767	7772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909903
100	NC_015562	AGG	2	6	7812	7817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909903
101	NC_015562	GAA	2	6	7889	7894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333909903
102	NC_015562	ATA	2	6	7910	7915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909903
103	NC_015562	TTG	2	6	9429	9434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909904
104	NC_015562	GTT	2	6	9443	9448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909904
105	NC_015562	CAA	2	6	9583	9588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909904
106	NC_015562	CAC	2	6	9660	9665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333909904
107	NC_015562	AGG	2	6	9680	9685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909904
108	NC_015562	CTC	2	6	9692	9697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909904
109	NC_015562	TTA	2	6	9730	9735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909904
110	NC_015562	CAA	3	9	9851	9859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909904
111	NC_015562	CCA	2	6	9879	9884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333909904
112	NC_015562	TCT	2	6	9959	9964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909904
113	NC_015562	ACA	3	9	10074	10082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909904
114	NC_015562	ACA	2	6	10137	10142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909904
115	NC_015562	ATA	2	6	10173	10178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909904
116	NC_015562	AAC	2	6	10280	10285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909904
117	NC_015562	CTT	2	6	10317	10322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909904
118	NC_015562	AAT	2	6	10391	10396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909904
119	NC_015562	TCA	2	6	10432	10437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909904
120	NC_015562	TCT	2	6	10461	10466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909904
121	NC_015562	ATT	2	6	10909	10914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909905
122	NC_015562	GAT	2	6	11027	11032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909905
123	NC_015562	AAT	2	6	11050	11055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909905
124	NC_015562	TGT	2	6	11071	11076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909905
125	NC_015562	TGA	2	6	11083	11088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909905
126	NC_015562	TGT	2	6	11089	11094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909905
127	NC_015562	GGA	2	6	11138	11143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909905
128	NC_015562	TTC	2	6	11330	11335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909906
129	NC_015562	TTC	2	6	11403	11408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909906
130	NC_015562	GAT	2	6	11419	11424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909906
131	NC_015562	CTT	2	6	11435	11440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909906
132	NC_015562	CTT	2	6	11507	11512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909906
133	NC_015562	TTC	2	6	11543	11548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909906
134	NC_015562	TGT	2	6	11553	11558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909906
135	NC_015562	ATA	2	6	11712	11717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909906
136	NC_015562	CTC	2	6	11730	11735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909906
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139	NC_015562	ATT	2	6	11919	11924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909906
140	NC_015562	CCT	2	6	11966	11971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909906
141	NC_015562	CAT	2	6	12008	12013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909906
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143	NC_015562	AAT	2	6	12234	12239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909906
144	NC_015562	TGA	2	6	12297	12302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909906
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146	NC_015562	TGT	2	6	12441	12446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909906
147	NC_015562	GTT	2	6	12498	12503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909906
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150	NC_015562	AAT	2	6	12607	12612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909906
151	NC_015562	GTA	2	6	12615	12620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909906
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155	NC_015562	TTC	2	6	12900	12905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909907
156	NC_015562	CTT	2	6	12921	12926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909907
157	NC_015562	TCT	2	6	12932	12937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909907
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161	NC_015562	TAA	2	6	13938	13943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909908
162	NC_015562	GGA	2	6	14002	14007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333909908
163	NC_015562	TGA	2	6	14041	14046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333909908
164	NC_015562	TAT	2	6	14047	14052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909908
165	NC_015562	TGG	2	6	14077	14082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333909908
166	NC_015562	ATA	2	6	14097	14102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909908
167	NC_015562	TTA	2	6	14121	14126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333909908
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242	NC_015562	ATC	2	6	20701	20706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909912
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244	NC_015562	CTA	2	6	21205	21210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909913
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247	NC_015562	CAA	2	6	21619	21624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909914
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249	NC_015562	TCA	2	6	21846	21851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909914
250	NC_015562	CAC	2	6	21925	21930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333909914
251	NC_015562	GTT	2	6	21975	21980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909914
252	NC_015562	CTT	2	6	22021	22026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909914
253	NC_015562	GTT	2	6	22130	22135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333909914
254	NC_015562	ACA	2	6	22242	22247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333909914
255	NC_015562	TCA	2	6	22251	22256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909914
256	NC_015562	CTA	2	6	22290	22295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909914
257	NC_015562	TCC	2	6	22338	22343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333909914
258	NC_015562	ATA	2	6	22344	22349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909914
259	NC_015562	TGC	2	6	22361	22366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333909914
260	NC_015562	AAT	2	6	22458	22463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909915
261	NC_015562	ATC	2	6	22476	22481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333909915
262	NC_015562	ATA	2	6	22485	22490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333909915
263	NC_015562	GCA	2	6	22506	22511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333909915
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289	NC_015562	TTC	2	6	24886	24891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333909917
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