MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 23954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015562	CCT	2	6	268046	268051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910153
3502	NC_015562	CCA	2	6	268255	268260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333910153
3503	NC_015562	CAT	2	6	268277	268282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910153
3504	NC_015562	TTA	2	6	268318	268323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910153
3505	NC_015562	TGT	2	6	268376	268381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910153
3506	NC_015562	CTG	2	6	268526	268531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910153
3507	NC_015562	AAT	2	6	269053	269058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910154
3508	NC_015562	CTC	3	9	269318	269326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910154
3509	NC_015562	GCA	2	6	269334	269339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333910154
3510	NC_015562	CAT	2	6	269340	269345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910154
3511	NC_015562	TTG	2	6	269402	269407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910154
3512	NC_015562	AAG	2	6	269449	269454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910154
3513	NC_015562	TGC	2	6	269649	269654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910154
3514	NC_015562	AAT	2	6	269659	269664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910154
3515	NC_015562	TTA	2	6	269690	269695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910154
3516	NC_015562	TTC	2	6	269709	269714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910154
3517	NC_015562	TGC	2	6	269733	269738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910154
3518	NC_015562	TTG	2	6	269849	269854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910154
3519	NC_015562	TCA	2	6	269912	269917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910154
3520	NC_015562	TCT	2	6	270088	270093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910155
3521	NC_015562	CTG	2	6	270158	270163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910155
3522	NC_015562	AGC	2	6	270249	270254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333910155
3523	NC_015562	TAA	2	6	270272	270277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910155
3524	NC_015562	ATC	2	6	270345	270350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910155
3525	NC_015562	TTC	2	6	270416	270421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910155
3526	NC_015562	TTC	2	6	270486	270491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910155
3527	NC_015562	TTA	2	6	270557	270562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910155
3528	NC_015562	GTT	2	6	270931	270936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910156
3529	NC_015562	TAA	2	6	270971	270976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910156
3530	NC_015562	ATT	2	6	270993	270998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910156
3531	NC_015562	TGT	2	6	271011	271016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910156
3532	NC_015562	TGA	2	6	271050	271055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910156
3533	NC_015562	AAG	2	6	271083	271088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910156
3534	NC_015562	TCT	2	6	271129	271134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910156
3535	NC_015562	TTG	2	6	271178	271183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910156
3536	NC_015562	AAC	2	6	271197	271202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910156
3537	NC_015562	TTG	2	6	271211	271216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910156
3538	NC_015562	TAG	2	6	271259	271264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910156
3539	NC_015562	ATC	2	6	271295	271300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910156
3540	NC_015562	GTT	2	6	271453	271458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910156
3541	NC_015562	TTG	2	6	271592	271597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910156
3542	NC_015562	AAC	2	6	271603	271608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910156
3543	NC_015562	TGA	2	6	271641	271646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910156
3544	NC_015562	TGG	2	6	271803	271808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910156
3545	NC_015562	TTG	2	6	271817	271822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910156
3546	NC_015562	ATT	2	6	271847	271852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910156
3547	NC_015562	TTG	2	6	271871	271876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910156
3548	NC_015562	CAA	2	6	271922	271927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910156
3549	NC_015562	AAT	2	6	272082	272087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910156
3550	NC_015562	AAC	2	6	272093	272098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910156
3551	NC_015562	GTA	2	6	272516	272521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910157
3552	NC_015562	TAG	2	6	272537	272542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910157
3553	NC_015562	GTA	2	6	272549	272554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910157
3554	NC_015562	TTG	2	6	272624	272629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910157
3555	NC_015562	ATG	2	6	272638	272643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910157
3556	NC_015562	CAA	2	6	272657	272662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910157
3557	NC_015562	AAG	2	6	272677	272682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910157
3558	NC_015562	GAT	2	6	272785	272790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910157
3559	NC_015562	CAT	3	9	272797	272805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910157
3560	NC_015562	CAT	2	6	272821	272826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910157
3561	NC_015562	CAC	2	6	272833	272838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333910157
3562	NC_015562	CAT	3	9	272839	272847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910157
3563	NC_015562	GAT	2	6	272872	272877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910157
3564	NC_015562	ATA	2	6	272884	272889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910157
3565	NC_015562	TTG	2	6	272921	272926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910157
3566	NC_015562	ATT	2	6	272958	272963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910157
3567	NC_015562	TAA	3	9	273257	273265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910158
3568	NC_015562	ACT	2	6	273301	273306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910158
3569	NC_015562	ATG	2	6	273325	273330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910158
3570	NC_015562	ATA	2	6	273417	273422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910158
3571	NC_015562	GAT	2	6	273441	273446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910158
3572	NC_015562	AAT	2	6	273447	273452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910158
3573	NC_015562	TAA	2	6	273455	273460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910158
3574	NC_015562	TAA	2	6	273547	273552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910158
3575	NC_015562	TAA	2	6	273596	273601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910158
3576	NC_015562	GAT	2	6	273606	273611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910158
3577	NC_015562	TAT	2	6	273612	273617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910158
3578	NC_015562	GTT	3	9	273618	273626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910158
3579	NC_015562	TGA	2	6	273701	273706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910158
3580	NC_015562	TAA	2	6	273712	273717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910158
3581	NC_015562	ATA	2	6	273796	273801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910158
3582	NC_015562	TGT	2	6	274014	274019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910159
3583	NC_015562	TCC	2	6	274045	274050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910159
3584	NC_015562	CTT	2	6	274096	274101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910159
3585	NC_015562	ATA	2	6	274226	274231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910159
3586	NC_015562	GAA	2	6	274263	274268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910159
3587	NC_015562	GTT	2	6	274283	274288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910159
3588	NC_015562	ACT	2	6	274295	274300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910159
3589	NC_015562	CCA	2	6	274401	274406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333910159
3590	NC_015562	GAA	2	6	274481	274486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910159
3591	NC_015562	AGC	2	6	274537	274542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333910159
3592	NC_015562	TGA	2	6	274588	274593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910159
3593	NC_015562	AGG	2	6	274597	274602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910159
3594	NC_015562	ATT	2	6	274744	274749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910159
3595	NC_015562	AAT	2	6	274905	274910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910160
3596	NC_015562	ATT	2	6	274951	274956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910160
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3598	NC_015562	ACA	2	6	275006	275011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910160
3599	NC_015562	TGA	2	6	275046	275051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910160
3600	NC_015562	ATT	2	6	275146	275151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910160
3601	NC_015562	GGA	2	6	275155	275160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910160
3602	NC_015562	GGA	2	6	275259	275264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910160
3603	NC_015562	GTG	2	6	275342	275347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910160
3604	NC_015562	GAG	2	6	275365	275370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910160
3605	NC_015562	TTA	2	6	275396	275401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910160
3606	NC_015562	GTT	2	6	275443	275448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910160
3607	NC_015562	TAA	2	6	275539	275544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910160
3608	NC_015562	TGA	2	6	275812	275817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910161
3609	NC_015562	TTA	2	6	275888	275893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910161
3610	NC_015562	GAA	2	6	276196	276201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910162
3611	NC_015562	CTC	2	6	276243	276248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910162
3612	NC_015562	CCA	2	6	276257	276262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333910162
3613	NC_015562	AAT	2	6	276268	276273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910162
3614	NC_015562	TTC	2	6	276475	276480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910162
3615	NC_015562	ATC	2	6	276490	276495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910162
3616	NC_015562	TGG	2	6	276527	276532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910162
3617	NC_015562	ACA	3	9	276542	276550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910162
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3619	NC_015562	TTG	2	6	277225	277230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910163
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