MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 23954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015562	CTT	2	6	195148	195153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910081
2502	NC_015562	TTC	2	6	195224	195229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910081
2503	NC_015562	CTT	2	6	195265	195270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910081
2504	NC_015562	AAT	2	6	195435	195440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910081
2505	NC_015562	GCA	2	6	195447	195452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333910081
2506	NC_015562	CCT	2	6	195463	195468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910081
2507	NC_015562	AAT	2	6	195488	195493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910081
2508	NC_015562	TAT	2	6	195694	195699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910082
2509	NC_015562	TCC	2	6	195743	195748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910082
2510	NC_015562	CAG	2	6	195759	195764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333910082
2511	NC_015562	AAC	2	6	195807	195812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910082
2512	NC_015562	CAC	2	6	195830	195835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333910082
2513	NC_015562	TTC	2	6	195902	195907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910082
2514	NC_015562	ATC	2	6	195949	195954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910082
2515	NC_015562	CTC	2	6	196059	196064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910082
2516	NC_015562	TGG	2	6	196162	196167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910082
2517	NC_015562	CCA	2	6	196187	196192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333910082
2518	NC_015562	GTT	2	6	196205	196210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910082
2519	NC_015562	TAT	2	6	196447	196452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910082
2520	NC_015562	TCC	3	9	196507	196515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910082
2521	NC_015562	TAA	2	6	196568	196573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910083
2522	NC_015562	ATA	2	6	196590	196595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910083
2523	NC_015562	TCA	3	9	196605	196613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910083
2524	NC_015562	TCA	2	6	196620	196625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910083
2525	NC_015562	AAT	2	6	196660	196665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910083
2526	NC_015562	TTC	2	6	196898	196903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910083
2527	NC_015562	ATT	2	6	196935	196940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910083
2528	NC_015562	GAA	2	6	197153	197158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910084
2529	NC_015562	CCT	2	6	197199	197204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910084
2530	NC_015562	ATT	2	6	197228	197233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910084
2531	NC_015562	CAT	2	6	197254	197259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910084
2532	NC_015562	TCC	2	6	197298	197303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910084
2533	NC_015562	CTT	2	6	197341	197346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910084
2534	NC_015562	TAA	2	6	197348	197353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910084
2535	NC_015562	TCT	2	6	197406	197411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910084
2536	NC_015562	TTA	2	6	197437	197442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910084
2537	NC_015562	CAA	2	6	197465	197470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910084
2538	NC_015562	CTA	2	6	197580	197585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910084
2539	NC_015562	TGT	2	6	197642	197647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910084
2540	NC_015562	AGC	2	6	197660	197665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333910084
2541	NC_015562	ATC	2	6	197684	197689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910084
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2543	NC_015562	AGA	2	6	198941	198946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910085
2544	NC_015562	ATG	2	6	199030	199035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910085
2545	NC_015562	TTG	2	6	199278	199283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910085
2546	NC_015562	CAA	2	6	199339	199344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910085
2547	NC_015562	ATT	2	6	199389	199394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910085
2548	NC_015562	TAA	2	6	199534	199539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910085
2549	NC_015562	GAG	2	6	199620	199625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910085
2550	NC_015562	TGA	2	6	200727	200732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910086
2551	NC_015562	AGA	2	6	200739	200744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910086
2552	NC_015562	GAA	2	6	200770	200775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910086
2553	NC_015562	TGT	2	6	200868	200873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910086
2554	NC_015562	AAC	2	6	200911	200916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910086
2555	NC_015562	CTG	2	6	201059	201064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910086
2556	NC_015562	ATT	2	6	201213	201218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910086
2557	NC_015562	TTG	2	6	201295	201300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910086
2558	NC_015562	TGG	2	6	201312	201317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910086
2559	NC_015562	AGA	2	6	201375	201380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910086
2560	NC_015562	TGC	3	9	201477	201485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910086
2561	NC_015562	CAT	2	6	201524	201529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910086
2562	NC_015562	TTG	2	6	201650	201655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910086
2563	NC_015562	GAG	2	6	201712	201717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910086
2564	NC_015562	GAG	2	6	201757	201762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910086
2565	NC_015562	TTA	2	6	201884	201889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910086
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2567	NC_015562	TAA	2	6	202228	202233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910087
2568	NC_015562	AGA	2	6	202283	202288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910087
2569	NC_015562	ATT	2	6	202289	202294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910087
2570	NC_015562	GGA	2	6	202343	202348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910087
2571	NC_015562	AGA	2	6	202364	202369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910087
2572	NC_015562	TGA	2	6	202445	202450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910087
2573	NC_015562	GAA	2	6	202486	202491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910087
2574	NC_015562	AAG	2	6	202503	202508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910087
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2579	NC_015562	AAT	2	6	202829	202834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910087
2580	NC_015562	ACT	2	6	202852	202857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910087
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2585	NC_015562	GAG	2	6	203031	203036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910087
2586	NC_015562	AGA	2	6	203150	203155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910087
2587	NC_015562	TAT	2	6	203247	203252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910087
2588	NC_015562	TGA	2	6	203267	203272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910087
2589	NC_015562	AAT	2	6	203300	203305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910087
2590	NC_015562	ACA	2	6	203410	203415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910087
2591	NC_015562	TGG	2	6	203432	203437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910087
2592	NC_015562	GGA	2	6	203474	203479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910087
2593	NC_015562	CCT	2	6	203510	203515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910087
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2595	NC_015562	TAG	2	6	203853	203858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910088
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2602	NC_015562	TGC	2	6	204280	204285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910088
2603	NC_015562	GAT	2	6	204293	204298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910088
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2608	NC_015562	ATA	2	6	205042	205047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910090
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2859	NC_015562	CTG	2	6	222774	222779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910106
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2978	NC_015562	CTG	2	6	231315	231320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910116
2979	NC_015562	ATT	2	6	231336	231341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910116
2980	NC_015562	CTT	2	6	231484	231489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910116
2981	NC_015562	TAA	2	6	231529	231534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910116
2982	NC_015562	TAA	2	6	231597	231602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910116
2983	NC_015562	CAA	2	6	231654	231659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910116
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