MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 1790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015183	GAAAG	2	10	2370652	2370661	60 %	0 %	40 %	0 %	325293809
1502	NC_015183	TACCG	2	10	2372759	2372768	20 %	20 %	20 %	40 %	325293811
1503	NC_015183	CCGCG	2	10	2374835	2374844	0 %	0 %	40 %	60 %	325293814
1504	NC_015183	TCGCT	2	10	2377232	2377241	0 %	40 %	20 %	40 %	325293817
1505	NC_015183	GCCCG	2	10	2382479	2382488	0 %	0 %	40 %	60 %	325293822
1506	NC_015183	CGACC	2	10	2382830	2382839	20 %	0 %	20 %	60 %	325293822
1507	NC_015183	TCACC	2	10	2382847	2382856	20 %	20 %	0 %	60 %	325293822
1508	NC_015183	CAGCG	2	10	2389200	2389209	20 %	0 %	40 %	40 %	325293830
1509	NC_015183	ACGTG	2	10	2389427	2389436	20 %	20 %	40 %	20 %	325293830
1510	NC_015183	GAGTT	2	10	2390143	2390152	20 %	40 %	40 %	0 %	325293830
1511	NC_015183	CGACA	2	10	2394554	2394563	40 %	0 %	20 %	40 %	325293834
1512	NC_015183	CGCGG	2	10	2395151	2395160	0 %	0 %	60 %	40 %	325293834
1513	NC_015183	TCGCC	2	10	2398070	2398079	0 %	20 %	20 %	60 %	325293837
1514	NC_015183	ACGAC	2	10	2398561	2398570	40 %	0 %	20 %	40 %	325293837
1515	NC_015183	CGCAC	2	10	2401734	2401743	20 %	0 %	20 %	60 %	325293839
1516	NC_015183	TGCCA	2	10	2401765	2401774	20 %	20 %	20 %	40 %	325293839
1517	NC_015183	AGGCG	2	10	2402949	2402958	20 %	0 %	60 %	20 %	325293840
1518	NC_015183	TCGCC	2	10	2403228	2403237	0 %	20 %	20 %	60 %	325293840
1519	NC_015183	GCGGA	2	10	2403545	2403554	20 %	0 %	60 %	20 %	325293840
1520	NC_015183	CGCCA	2	10	2404362	2404371	20 %	0 %	20 %	60 %	325293841
1521	NC_015183	CGGCA	2	10	2410882	2410891	20 %	0 %	40 %	40 %	325293846
1522	NC_015183	GCCCT	2	10	2414958	2414967	0 %	20 %	20 %	60 %	325293850
1523	NC_015183	CGGCC	2	10	2415457	2415466	0 %	0 %	40 %	60 %	325293850
1524	NC_015183	GCTTG	2	10	2417666	2417675	0 %	40 %	40 %	20 %	325293853
1525	NC_015183	TCGCA	2	10	2420521	2420530	20 %	20 %	20 %	40 %	325293856
1526	NC_015183	CGCAA	2	10	2420630	2420639	40 %	0 %	20 %	40 %	325293856
1527	NC_015183	GTGAG	2	10	2424098	2424107	20 %	20 %	60 %	0 %	325293860
1528	NC_015183	TGTGC	2	10	2425042	2425051	0 %	40 %	40 %	20 %	325293861
1529	NC_015183	GGCAT	2	10	2425148	2425157	20 %	20 %	40 %	20 %	325293861
1530	NC_015183	GCCGC	2	10	2425824	2425833	0 %	0 %	40 %	60 %	325293861
1531	NC_015183	CACCG	2	10	2428047	2428056	20 %	0 %	20 %	60 %	325293863
1532	NC_015183	AAGGC	2	10	2432934	2432943	40 %	0 %	40 %	20 %	325293868
1533	NC_015183	CAGCG	2	10	2433826	2433835	20 %	0 %	40 %	40 %	325293869
1534	NC_015183	AGGTC	2	10	2434973	2434982	20 %	20 %	40 %	20 %	325293870
1535	NC_015183	CTCGG	2	10	2436874	2436883	0 %	20 %	40 %	40 %	325293871
1536	NC_015183	GACCA	2	10	2437156	2437165	40 %	0 %	20 %	40 %	325293872
1537	NC_015183	TCTGG	2	10	2439473	2439482	0 %	40 %	40 %	20 %	325293873
1538	NC_015183	GGCCA	2	10	2442782	2442791	20 %	0 %	40 %	40 %	325293875
1539	NC_015183	GCGTC	2	10	2444318	2444327	0 %	20 %	40 %	40 %	325293876
1540	NC_015183	CCCTG	2	10	2448988	2448997	0 %	20 %	20 %	60 %	325293880
1541	NC_015183	GGCGC	2	10	2450599	2450608	0 %	0 %	60 %	40 %	325293881
1542	NC_015183	CCTTG	2	10	2450826	2450835	0 %	40 %	20 %	40 %	325293881
1543	NC_015183	CACCG	2	10	2451281	2451290	20 %	0 %	20 %	60 %	325293882
1544	NC_015183	GTCGT	2	10	2452210	2452219	0 %	40 %	40 %	20 %	325293883
1545	NC_015183	TTGCG	2	10	2454360	2454369	0 %	40 %	40 %	20 %	325293886
1546	NC_015183	GCGAA	2	10	2455974	2455983	40 %	0 %	40 %	20 %	325293887
1547	NC_015183	CACGG	2	10	2458907	2458916	20 %	0 %	40 %	40 %	325293889
1548	NC_015183	GCCGG	2	10	2459382	2459391	0 %	0 %	60 %	40 %	325293890
1549	NC_015183	TCGCC	2	10	2459488	2459497	0 %	20 %	20 %	60 %	325293890
1550	NC_015183	ACCCA	2	10	2461714	2461723	40 %	0 %	0 %	60 %	325293891
1551	NC_015183	GCAGA	2	10	2463457	2463466	40 %	0 %	40 %	20 %	325293892
1552	NC_015183	GCCGA	2	10	2464069	2464078	20 %	0 %	40 %	40 %	325293893
1553	NC_015183	GCCAT	2	10	2464627	2464636	20 %	20 %	20 %	40 %	325293893
1554	NC_015183	CACGG	2	10	2465229	2465238	20 %	0 %	40 %	40 %	325293894
1555	NC_015183	CGCGG	2	10	2465579	2465588	0 %	0 %	60 %	40 %	325293894
1556	NC_015183	GATCT	2	10	2466420	2466429	20 %	40 %	20 %	20 %	325293895
1557	NC_015183	TCGCT	2	10	2466472	2466481	0 %	40 %	20 %	40 %	325293895
1558	NC_015183	TCGAT	2	10	2466507	2466516	20 %	40 %	20 %	20 %	325293895
1559	NC_015183	TGGCA	2	10	2470367	2470376	20 %	20 %	40 %	20 %	325293897
1560	NC_015183	CCGCC	2	10	2477709	2477718	0 %	0 %	20 %	80 %	325293905
1561	NC_015183	GCCGA	2	10	2480504	2480513	20 %	0 %	40 %	40 %	325293907
1562	NC_015183	AACGC	2	10	2483819	2483828	40 %	0 %	20 %	40 %	325293911
1563	NC_015183	ACGAA	2	10	2484057	2484066	60 %	0 %	20 %	20 %	325293911
1564	NC_015183	AAAGG	2	10	2485522	2485531	60 %	0 %	40 %	0 %	325293911
1565	NC_015183	AGTCT	2	10	2486622	2486631	20 %	40 %	20 %	20 %	325293913
1566	NC_015183	TTCTT	2	10	2486846	2486855	0 %	80 %	0 %	20 %	325293913
1567	NC_015183	TGTCA	2	10	2488157	2488166	20 %	40 %	20 %	20 %	325293915
1568	NC_015183	CAGCG	2	10	2490539	2490548	20 %	0 %	40 %	40 %	325293916
1569	NC_015183	AGCGA	2	10	2496449	2496458	40 %	0 %	40 %	20 %	325293918
1570	NC_015183	TATCA	2	10	2499229	2499238	40 %	40 %	0 %	20 %	325293919
1571	NC_015183	CGATC	2	10	2501574	2501583	20 %	20 %	20 %	40 %	325293921
1572	NC_015183	ATGCG	2	10	2502742	2502751	20 %	20 %	40 %	20 %	325293922
1573	NC_015183	ACGAC	2	10	2503177	2503186	40 %	0 %	20 %	40 %	325293922
1574	NC_015183	TGGCA	2	10	2504755	2504764	20 %	20 %	40 %	20 %	325293922
1575	NC_015183	AACAA	2	10	2505289	2505298	80 %	0 %	0 %	20 %	325293922
1576	NC_015183	CGATC	2	10	2509096	2509105	20 %	20 %	20 %	40 %	325293926
1577	NC_015183	CGGCG	2	10	2509344	2509353	0 %	0 %	60 %	40 %	325293926
1578	NC_015183	CATGC	2	10	2511418	2511427	20 %	20 %	20 %	40 %	325293930
1579	NC_015183	CTGCA	2	10	2512275	2512284	20 %	20 %	20 %	40 %	325293931
1580	NC_015183	AGGCG	2	10	2512285	2512294	20 %	0 %	60 %	20 %	325293931
1581	NC_015183	CATTG	2	10	2512590	2512599	20 %	40 %	20 %	20 %	325293931
1582	NC_015183	TCCTC	2	10	2513067	2513076	0 %	40 %	0 %	60 %	325293931
1583	NC_015183	TGCCG	2	10	2513251	2513260	0 %	20 %	40 %	40 %	325293931
1584	NC_015183	TTCCG	2	10	2514074	2514083	0 %	40 %	20 %	40 %	325293932
1585	NC_015183	GAACC	2	10	2517499	2517508	40 %	0 %	20 %	40 %	325293936
1586	NC_015183	GCGCC	3	15	2519568	2519582	0 %	0 %	40 %	60 %	325293939
1587	NC_015183	CGGGA	2	10	2525790	2525799	20 %	0 %	60 %	20 %	325293945
1588	NC_015183	AGCGA	2	10	2528321	2528330	40 %	0 %	40 %	20 %	325293946
1589	NC_015183	TGATC	2	10	2533780	2533789	20 %	40 %	20 %	20 %	325293949
1590	NC_015183	CGGCT	2	10	2535253	2535262	0 %	20 %	40 %	40 %	325293950
1591	NC_015183	GCGAA	2	10	2535855	2535864	40 %	0 %	40 %	20 %	325293950
1592	NC_015183	ATGAC	2	10	2536942	2536951	40 %	20 %	20 %	20 %	325293952
1593	NC_015183	CCGGG	2	10	2537069	2537078	0 %	0 %	60 %	40 %	325293952
1594	NC_015183	CGCCC	2	10	2541564	2541573	0 %	0 %	20 %	80 %	325293956
1595	NC_015183	TATCA	2	10	2545592	2545601	40 %	40 %	0 %	20 %	325293958
1596	NC_015183	CCCCA	2	10	2546070	2546079	20 %	0 %	0 %	80 %	325293959
1597	NC_015183	CTGGA	2	10	2546588	2546597	20 %	20 %	40 %	20 %	325293959
1598	NC_015183	GCGCC	2	10	2553162	2553171	0 %	0 %	40 %	60 %	325293965
1599	NC_015183	TCCGC	2	10	2554043	2554052	0 %	20 %	20 %	60 %	325293965
1600	NC_015183	CCGCG	2	10	2554092	2554101	0 %	0 %	40 %	60 %	325293965
1601	NC_015183	CCTGC	2	10	2556201	2556210	0 %	20 %	20 %	60 %	325293967
1602	NC_015183	GCTTC	2	10	2556333	2556342	0 %	40 %	20 %	40 %	325293967
1603	NC_015183	GTCGT	2	10	2556644	2556653	0 %	40 %	40 %	20 %	325293967
1604	NC_015183	TCCTG	2	10	2556930	2556939	0 %	40 %	20 %	40 %	325293967
1605	NC_015183	GAGGT	2	10	2557674	2557683	20 %	20 %	60 %	0 %	325293968
1606	NC_015183	GCACC	2	10	2561838	2561847	20 %	0 %	20 %	60 %	325293972
1607	NC_015183	GCGCG	2	10	2563889	2563898	0 %	0 %	60 %	40 %	325293974
1608	NC_015183	TTGCG	2	10	2567316	2567325	0 %	40 %	40 %	20 %	325293978
1609	NC_015183	GGCCC	2	10	2567336	2567345	0 %	0 %	40 %	60 %	325293978
1610	NC_015183	TCGCC	2	10	2568399	2568408	0 %	20 %	20 %	60 %	325293979
1611	NC_015183	CATGG	2	10	2568974	2568983	20 %	20 %	40 %	20 %	325293980
1612	NC_015183	CGGCG	2	10	2571153	2571162	0 %	0 %	60 %	40 %	325293982
1613	NC_015183	GCTCG	2	10	2571590	2571599	0 %	20 %	40 %	40 %	325293982
1614	NC_015183	CCATG	2	10	2573236	2573245	20 %	20 %	20 %	40 %	325293983
1615	NC_015183	CTCCG	2	10	2574472	2574481	0 %	20 %	20 %	60 %	325293985
1616	NC_015183	CCCGG	2	10	2574506	2574515	0 %	0 %	40 %	60 %	325293985
1617	NC_015183	CCGCA	2	10	2577840	2577849	20 %	0 %	20 %	60 %	325293986
1618	NC_015183	ACGGC	2	10	2577924	2577933	20 %	0 %	40 %	40 %	325293986
1619	NC_015183	ACGGC	2	10	2578482	2578491	20 %	0 %	40 %	40 %	325293986
1620	NC_015183	ACGGC	2	10	2578542	2578551	20 %	0 %	40 %	40 %	325293986
1621	NC_015183	AGGCC	2	10	2579983	2579992	20 %	0 %	40 %	40 %	325293986
1622	NC_015183	CGGTT	2	10	2580513	2580522	0 %	40 %	40 %	20 %	325293987
1623	NC_015183	TCGCA	2	10	2581376	2581385	20 %	20 %	20 %	40 %	325293988
1624	NC_015183	TCAGG	2	10	2581502	2581511	20 %	20 %	40 %	20 %	325293988
1625	NC_015183	CGAAC	2	10	2582149	2582158	40 %	0 %	20 %	40 %	325293988
1626	NC_015183	GCGTT	2	10	2586221	2586230	0 %	40 %	40 %	20 %	325293992
1627	NC_015183	GCCTT	2	10	2587117	2587126	0 %	40 %	20 %	40 %	325293993
1628	NC_015183	TTTGA	2	10	2588499	2588508	20 %	60 %	20 %	0 %	325293993
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1637	NC_015183	TCCAG	2	10	2597996	2598005	20 %	20 %	20 %	40 %	325294003
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1639	NC_015183	GGCTG	2	10	2602126	2602135	0 %	20 %	60 %	20 %	325294005
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1662	NC_015183	CTGCG	2	10	2637460	2637469	0 %	20 %	40 %	40 %	325294042
1663	NC_015183	GCCGC	2	10	2643825	2643834	0 %	0 %	40 %	60 %	325294051
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1689	NC_015183	TTGCG	2	10	2683132	2683141	0 %	40 %	40 %	20 %	325294089
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1693	NC_015183	GAGCT	2	10	2687719	2687728	20 %	20 %	40 %	20 %	325294093
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1722	NC_015183	GCCGA	2	10	2727021	2727030	20 %	0 %	40 %	40 %	325294117
1723	NC_015183	TCTTT	2	10	2727448	2727457	0 %	80 %	0 %	20 %	325294117
1724	NC_015183	CTGGA	2	10	2728212	2728221	20 %	20 %	40 %	20 %	325294118
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1735	NC_015183	AGATG	2	10	2738341	2738350	40 %	20 %	40 %	0 %	325294125
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1743	NC_015183	GGAAA	2	10	2759816	2759825	60 %	0 %	40 %	0 %	325294144
1744	NC_015183	CCGGG	2	10	2759932	2759941	0 %	0 %	60 %	40 %	325294144
1745	NC_015183	CCGCG	2	10	2761585	2761594	0 %	0 %	40 %	60 %	325294145
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1747	NC_015183	GCCGG	2	10	2763997	2764006	0 %	0 %	60 %	40 %	325294147
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1780	NC_015183	GCCAC	2	10	2804081	2804090	20 %	0 %	20 %	60 %	325294189
1781	NC_015183	CGGCC	2	10	2804534	2804543	0 %	0 %	40 %	60 %	325294190
1782	NC_015183	TCAGT	2	10	2807357	2807366	20 %	40 %	20 %	20 %	325294192
1783	NC_015183	GGACA	2	10	2810215	2810224	40 %	0 %	40 %	20 %	325294193
1784	NC_015183	TGCGC	2	10	2813289	2813298	0 %	20 %	40 %	40 %	325294195
1785	NC_015183	TTTTC	2	10	2813497	2813506	0 %	80 %	0 %	20 %	325294195
1786	NC_015183	ATCGC	2	10	2816951	2816960	20 %	20 %	20 %	40 %	325294200
1787	NC_015183	GAACG	2	10	2818566	2818575	40 %	0 %	40 %	20 %	325294201
1788	NC_015183	CAACA	2	10	2818788	2818797	60 %	0 %	0 %	40 %	325294201
1789	NC_015183	GAATT	2	10	2819004	2819013	40 %	40 %	20 %	0 %	325294201
1790	NC_015183	TGCTC	2	10	2820181	2820190	0 %	40 %	20 %	40 %	325294202

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.