MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 1790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015183	GCGAT	2	10	829922	829931	20 %	20 %	40 %	20 %	325292258
502	NC_015183	GCCTT	2	10	831999	832008	0 %	40 %	20 %	40 %	325292261
503	NC_015183	GCGCG	2	10	832959	832968	0 %	0 %	60 %	40 %	325292263
504	NC_015183	CCGGA	2	10	834427	834436	20 %	0 %	40 %	40 %	325292265
505	NC_015183	GGTTC	2	10	835104	835113	0 %	40 %	40 %	20 %	325292267
506	NC_015183	GGTCG	2	10	837492	837501	0 %	20 %	60 %	20 %	325292269
507	NC_015183	GTAAT	2	10	841208	841217	40 %	40 %	20 %	0 %	325292273
508	NC_015183	CCTTG	2	10	842091	842100	0 %	40 %	20 %	40 %	325292273
509	NC_015183	GTAGG	2	10	842361	842370	20 %	20 %	60 %	0 %	325292273
510	NC_015183	CCTTG	2	10	842767	842776	0 %	40 %	20 %	40 %	325292274
511	NC_015183	CGGCG	2	10	845322	845331	0 %	0 %	60 %	40 %	325292277
512	NC_015183	GCCGG	2	10	846620	846629	0 %	0 %	60 %	40 %	325292278
513	NC_015183	CGCGG	2	10	847993	848002	0 %	0 %	60 %	40 %	325292279
514	NC_015183	GCGCG	2	10	848039	848048	0 %	0 %	60 %	40 %	325292279
515	NC_015183	TCGCA	2	10	848837	848846	20 %	20 %	20 %	40 %	325292280
516	NC_015183	CGTGC	2	10	853382	853391	0 %	20 %	40 %	40 %	325292286
517	NC_015183	GTCTC	2	10	854762	854771	0 %	40 %	20 %	40 %	325292287
518	NC_015183	GGTGC	2	10	855452	855461	0 %	20 %	60 %	20 %	325292289
519	NC_015183	GTCCG	2	10	857069	857078	0 %	20 %	40 %	40 %	325292290
520	NC_015183	TCCTG	2	10	859808	859817	0 %	40 %	20 %	40 %	325292295
521	NC_015183	CCGGC	2	10	860124	860133	0 %	0 %	40 %	60 %	325292295
522	NC_015183	AGGCG	2	10	864099	864108	20 %	0 %	60 %	20 %	325292299
523	NC_015183	GCTGA	2	10	865522	865531	20 %	20 %	40 %	20 %	325292301
524	NC_015183	GCGTC	2	10	865635	865644	0 %	20 %	40 %	40 %	325292301
525	NC_015183	GGCGC	2	10	868083	868092	0 %	0 %	60 %	40 %	325292305
526	NC_015183	GGGGC	2	10	868685	868694	0 %	0 %	80 %	20 %	325292305
527	NC_015183	GGCGG	2	10	871056	871065	0 %	0 %	80 %	20 %	325292307
528	NC_015183	CGCGC	3	15	872309	872323	0 %	0 %	40 %	60 %	325292309
529	NC_015183	CCTGC	2	10	873053	873062	0 %	20 %	20 %	60 %	325292309
530	NC_015183	CAGGT	2	10	873852	873861	20 %	20 %	40 %	20 %	325292309
531	NC_015183	CAACG	2	10	874059	874068	40 %	0 %	20 %	40 %	325292310
532	NC_015183	GGCCG	2	10	876203	876212	0 %	0 %	60 %	40 %	325292313
533	NC_015183	CACCG	2	10	879383	879392	20 %	0 %	20 %	60 %	325292318
534	NC_015183	GGCCG	2	10	879785	879794	0 %	0 %	60 %	40 %	325292318
535	NC_015183	GGAAG	2	10	880223	880232	40 %	0 %	60 %	0 %	325292318
536	NC_015183	GTCCG	2	10	881168	881177	0 %	20 %	40 %	40 %	325292319
537	NC_015183	CGGGC	2	10	883289	883298	0 %	0 %	60 %	40 %	325292320
538	NC_015183	TGCGG	2	10	886917	886926	0 %	20 %	60 %	20 %	325292325
539	NC_015183	GCACA	2	10	888371	888380	40 %	0 %	20 %	40 %	325292325
540	NC_015183	CAGAA	2	10	888429	888438	60 %	0 %	20 %	20 %	325292325
541	NC_015183	AAGCG	2	10	888959	888968	40 %	0 %	40 %	20 %	325292326
542	NC_015183	CAGGG	2	10	890345	890354	20 %	0 %	60 %	20 %	325292327
543	NC_015183	ACGCC	2	10	890356	890365	20 %	0 %	20 %	60 %	325292327
544	NC_015183	GATGT	2	10	890512	890521	20 %	40 %	40 %	0 %	325292327
545	NC_015183	GCCGA	2	10	894086	894095	20 %	0 %	40 %	40 %	325292332
546	NC_015183	GTTAC	2	10	898918	898927	20 %	40 %	20 %	20 %	325292339
547	NC_015183	GCGCG	2	10	899122	899131	0 %	0 %	60 %	40 %	325292339
548	NC_015183	GGCGC	2	10	900454	900463	0 %	0 %	60 %	40 %	325292342
549	NC_015183	TCCAT	2	10	900860	900869	20 %	40 %	0 %	40 %	325292342
550	NC_015183	GCAGG	2	10	901311	901320	20 %	0 %	60 %	20 %	325292343
551	NC_015183	ACGGC	2	10	902427	902436	20 %	0 %	40 %	40 %	325292345
552	NC_015183	GGGTG	2	10	903493	903502	0 %	20 %	80 %	0 %	325292345
553	NC_015183	CCTTT	2	10	903564	903573	0 %	60 %	0 %	40 %	325292345
554	NC_015183	GTCGG	2	10	903617	903626	0 %	20 %	60 %	20 %	325292345
555	NC_015183	GCGCG	2	10	904015	904024	0 %	0 %	60 %	40 %	325292345
556	NC_015183	TGATC	2	10	907362	907371	20 %	40 %	20 %	20 %	325292348
557	NC_015183	GCGTC	2	10	907722	907731	0 %	20 %	40 %	40 %	325292349
558	NC_015183	AAGCG	2	10	908635	908644	40 %	0 %	40 %	20 %	325292349
559	NC_015183	GGAAG	2	10	909826	909835	40 %	0 %	60 %	0 %	325292351
560	NC_015183	GCCCG	2	10	910316	910325	0 %	0 %	40 %	60 %	325292351
561	NC_015183	ACGGC	2	10	912883	912892	20 %	0 %	40 %	40 %	325292353
562	NC_015183	CGAAG	2	10	914756	914765	40 %	0 %	40 %	20 %	325292355
563	NC_015183	GTCGC	2	10	914879	914888	0 %	20 %	40 %	40 %	325292355
564	NC_015183	CGCGG	2	10	916315	916324	0 %	0 %	60 %	40 %	325292356
565	NC_015183	TTTCC	2	10	921570	921579	0 %	60 %	0 %	40 %	325292360
566	NC_015183	GCCGG	2	10	922550	922559	0 %	0 %	60 %	40 %	325292360
567	NC_015183	GAGAC	2	10	923611	923620	40 %	0 %	40 %	20 %	325292361
568	NC_015183	GCGAA	2	10	926331	926340	40 %	0 %	40 %	20 %	325292363
569	NC_015183	GCGTC	2	10	928160	928169	0 %	20 %	40 %	40 %	325292363
570	NC_015183	TCCGC	2	10	929030	929039	0 %	20 %	20 %	60 %	325292364
571	NC_015183	CGGCA	2	10	929733	929742	20 %	0 %	40 %	40 %	325292364
572	NC_015183	TGCCA	2	10	930385	930394	20 %	20 %	20 %	40 %	325292366
573	NC_015183	GCCCA	2	10	934609	934618	20 %	0 %	20 %	60 %	325292369
574	NC_015183	CATGG	2	10	935213	935222	20 %	20 %	40 %	20 %	325292370
575	NC_015183	CATAA	2	10	943618	943627	60 %	20 %	0 %	20 %	325292378
576	NC_015183	CTGAA	2	10	944515	944524	40 %	20 %	20 %	20 %	325292379
577	NC_015183	GATGT	2	10	950091	950100	20 %	40 %	40 %	0 %	325292383
578	NC_015183	GAAAT	2	10	950593	950602	60 %	20 %	20 %	0 %	325292384
579	NC_015183	CAGGA	2	10	950605	950614	40 %	0 %	40 %	20 %	325292384
580	NC_015183	TGCGC	2	10	952680	952689	0 %	20 %	40 %	40 %	325292387
581	NC_015183	CGGCC	2	10	959805	959814	0 %	0 %	40 %	60 %	325292397
582	NC_015183	ATCTG	2	10	962801	962810	20 %	40 %	20 %	20 %	325292401
583	NC_015183	GGCCA	2	10	963715	963724	20 %	0 %	40 %	40 %	325292402
584	NC_015183	ATCTG	2	10	964440	964449	20 %	40 %	20 %	20 %	325292402
585	NC_015183	GCCCG	2	10	965453	965462	0 %	0 %	40 %	60 %	325292403
586	NC_015183	CGTGT	2	10	966414	966423	0 %	40 %	40 %	20 %	325292403
587	NC_015183	CGGCA	2	10	966566	966575	20 %	0 %	40 %	40 %	325292403
588	NC_015183	AAGGC	2	10	968230	968239	40 %	0 %	40 %	20 %	325292405
589	NC_015183	GCCGC	2	10	968339	968348	0 %	0 %	40 %	60 %	325292405
590	NC_015183	GAGGT	2	10	969616	969625	20 %	20 %	60 %	0 %	325292406
591	NC_015183	ATGCA	2	10	972031	972040	40 %	20 %	20 %	20 %	325292409
592	NC_015183	ACGAT	2	10	972160	972169	40 %	20 %	20 %	20 %	325292409
593	NC_015183	GGACC	2	10	973725	973734	20 %	0 %	40 %	40 %	325292409
594	NC_015183	GGCGT	2	10	975132	975141	0 %	20 %	60 %	20 %	325292411
595	NC_015183	CGGAT	2	10	977218	977227	20 %	20 %	40 %	20 %	325292414
596	NC_015183	CCGGA	2	10	977463	977472	20 %	0 %	40 %	40 %	325292414
597	NC_015183	GCCGC	2	10	977949	977958	0 %	0 %	40 %	60 %	325292415
598	NC_015183	GCGGA	2	10	980694	980703	20 %	0 %	60 %	20 %	325292418
599	NC_015183	AGACA	2	10	982440	982449	60 %	0 %	20 %	20 %	325292420
600	NC_015183	GCCGC	2	10	982550	982559	0 %	0 %	40 %	60 %	325292420
601	NC_015183	CGGGC	2	10	983189	983198	0 %	0 %	60 %	40 %	325292421
602	NC_015183	AGAGG	2	10	987198	987207	40 %	0 %	60 %	0 %	325292423
603	NC_015183	GTGCC	2	10	987603	987612	0 %	20 %	40 %	40 %	325292424
604	NC_015183	GTCGC	2	10	988534	988543	0 %	20 %	40 %	40 %	325292424
605	NC_015183	ATCGA	2	10	989944	989953	40 %	20 %	20 %	20 %	325292425
606	NC_015183	TGCTG	2	10	990114	990123	0 %	40 %	40 %	20 %	325292425
607	NC_015183	CCGGC	2	10	990352	990361	0 %	0 %	40 %	60 %	325292425
608	NC_015183	GGCCG	2	10	991218	991227	0 %	0 %	60 %	40 %	325292426
609	NC_015183	CTGAA	2	10	992442	992451	40 %	20 %	20 %	20 %	325292428
610	NC_015183	CGTCA	2	10	993232	993241	20 %	20 %	20 %	40 %	325292429
611	NC_015183	ACGCC	2	10	995217	995226	20 %	0 %	20 %	60 %	325292431
612	NC_015183	TGCCG	2	10	995490	995499	0 %	20 %	40 %	40 %	325292432
613	NC_015183	GGCAT	2	10	996070	996079	20 %	20 %	40 %	20 %	325292432
614	NC_015183	GGCGG	2	10	998416	998425	0 %	0 %	80 %	20 %	325292436
615	NC_015183	GGACC	2	10	1002632	1002641	20 %	0 %	40 %	40 %	325292442
616	NC_015183	TCAGG	2	10	1005563	1005572	20 %	20 %	40 %	20 %	325292444
617	NC_015183	TGATC	2	10	1005578	1005587	20 %	40 %	20 %	20 %	325292444
618	NC_015183	TTGCC	2	10	1006667	1006676	0 %	40 %	20 %	40 %	325292444
619	NC_015183	TGCCT	2	10	1006824	1006833	0 %	40 %	20 %	40 %	325292444
620	NC_015183	CAGGG	2	10	1008512	1008521	20 %	0 %	60 %	20 %	325292446
621	NC_015183	TCCCG	2	10	1008695	1008704	0 %	20 %	20 %	60 %	325292446
622	NC_015183	GCCAG	2	10	1010560	1010569	20 %	0 %	40 %	40 %	325292447
623	NC_015183	CGGAA	2	10	1010582	1010591	40 %	0 %	40 %	20 %	325292447
624	NC_015183	GGGCA	2	10	1011530	1011539	20 %	0 %	60 %	20 %	325292448
625	NC_015183	CCAGT	2	10	1011901	1011910	20 %	20 %	20 %	40 %	325292448
626	NC_015183	GCCAT	2	10	1013502	1013511	20 %	20 %	20 %	40 %	325292451
627	NC_015183	AGGCG	2	10	1016070	1016079	20 %	0 %	60 %	20 %	325292454
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629	NC_015183	GGGTA	2	10	1016954	1016963	20 %	20 %	60 %	0 %	325292455
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755	NC_015183	GGCCG	2	10	1233767	1233776	0 %	0 %	60 %	40 %	325292664
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998	NC_015183	CGAAG	2	10	1626684	1626693	40 %	0 %	40 %	20 %	325293062
999	NC_015183	CGGCG	2	10	1626789	1626798	0 %	0 %	60 %	40 %	325293062
1000	NC_015183	CAGCG	2	10	1627595	1627604	20 %	0 %	40 %	40 %	325293063

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