MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 1790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015183	CCGGG	2	10	1627887	1627896	0 %	0 %	60 %	40 %	325293063
1002	NC_015183	AACCG	2	10	1628840	1628849	40 %	0 %	20 %	40 %	325293064
1003	NC_015183	GCTGG	2	10	1628981	1628990	0 %	20 %	60 %	20 %	325293064
1004	NC_015183	GCATG	2	10	1629216	1629225	20 %	20 %	40 %	20 %	325293064
1005	NC_015183	CGAAG	2	10	1630421	1630430	40 %	0 %	40 %	20 %	325293066
1006	NC_015183	ATTGG	2	10	1630491	1630500	20 %	40 %	40 %	0 %	325293066
1007	NC_015183	CGCCT	2	10	1632226	1632235	0 %	20 %	20 %	60 %	325293071
1008	NC_015183	GATCA	2	10	1633459	1633468	40 %	20 %	20 %	20 %	325293071
1009	NC_015183	GGCGA	2	10	1634891	1634900	20 %	0 %	60 %	20 %	325293072
1010	NC_015183	CTCGC	2	10	1635570	1635579	0 %	20 %	20 %	60 %	325293073
1011	NC_015183	TGCGC	2	10	1636512	1636521	0 %	20 %	40 %	40 %	325293075
1012	NC_015183	TACGG	2	10	1638939	1638948	20 %	20 %	40 %	20 %	325293076
1013	NC_015183	GCACG	2	10	1640283	1640292	20 %	0 %	40 %	40 %	325293078
1014	NC_015183	ACCGA	2	10	1641593	1641602	40 %	0 %	20 %	40 %	325293078
1015	NC_015183	GGCCC	2	10	1642137	1642146	0 %	0 %	40 %	60 %	325293079
1016	NC_015183	CCGGC	2	10	1644043	1644052	0 %	0 %	40 %	60 %	325293081
1017	NC_015183	CCGTT	2	10	1644344	1644353	0 %	40 %	20 %	40 %	325293081
1018	NC_015183	TCTGT	2	10	1645680	1645689	0 %	60 %	20 %	20 %	325293082
1019	NC_015183	ACGGT	2	10	1647574	1647583	20 %	20 %	40 %	20 %	325293085
1020	NC_015183	TCTGG	2	10	1647931	1647940	0 %	40 %	40 %	20 %	325293085
1021	NC_015183	ATCCG	2	10	1648590	1648599	20 %	20 %	20 %	40 %	325293085
1022	NC_015183	TGCCC	2	10	1649901	1649910	0 %	20 %	20 %	60 %	325293087
1023	NC_015183	GCGCC	2	10	1650858	1650867	0 %	0 %	40 %	60 %	325293088
1024	NC_015183	GCGAC	2	10	1651794	1651803	20 %	0 %	40 %	40 %	325293088
1025	NC_015183	GCGCC	2	10	1651879	1651888	0 %	0 %	40 %	60 %	325293088
1026	NC_015183	GCGCC	2	10	1652458	1652467	0 %	0 %	40 %	60 %	325293089
1027	NC_015183	GCGAT	2	10	1652485	1652494	20 %	20 %	40 %	20 %	325293089
1028	NC_015183	CATCG	2	10	1653262	1653271	20 %	20 %	20 %	40 %	325293090
1029	NC_015183	TGCAA	2	10	1655778	1655787	40 %	20 %	20 %	20 %	325293094
1030	NC_015183	ACCGA	2	10	1657027	1657036	40 %	0 %	20 %	40 %	325293095
1031	NC_015183	TGCGG	2	10	1658395	1658404	0 %	20 %	60 %	20 %	325293095
1032	NC_015183	GGAAT	2	10	1658839	1658848	40 %	20 %	40 %	0 %	325293095
1033	NC_015183	GGAAC	2	10	1660767	1660776	40 %	0 %	40 %	20 %	325293096
1034	NC_015183	TGCCC	2	10	1661375	1661384	0 %	20 %	20 %	60 %	325293096
1035	NC_015183	AGCGA	2	10	1663264	1663273	40 %	0 %	40 %	20 %	325293098
1036	NC_015183	CCGCA	2	10	1666211	1666220	20 %	0 %	20 %	60 %	325293102
1037	NC_015183	ACCGA	2	10	1666561	1666570	40 %	0 %	20 %	40 %	325293102
1038	NC_015183	GGTCA	2	10	1666731	1666740	20 %	20 %	40 %	20 %	325293102
1039	NC_015183	TCACG	2	10	1668823	1668832	20 %	20 %	20 %	40 %	325293103
1040	NC_015183	AGCGC	2	10	1668862	1668871	20 %	0 %	40 %	40 %	325293103
1041	NC_015183	CGGGC	2	10	1672694	1672703	0 %	0 %	60 %	40 %	325293105
1042	NC_015183	ACGTC	2	10	1672821	1672830	20 %	20 %	20 %	40 %	325293105
1043	NC_015183	AAGAA	2	10	1673559	1673568	80 %	0 %	20 %	0 %	325293106
1044	NC_015183	ACCGC	2	10	1674579	1674588	20 %	0 %	20 %	60 %	325293108
1045	NC_015183	GCCGA	2	10	1675689	1675698	20 %	0 %	40 %	40 %	325293111
1046	NC_015183	TGCGC	2	10	1676486	1676495	0 %	20 %	40 %	40 %	325293112
1047	NC_015183	CCTGC	2	10	1676582	1676591	0 %	20 %	20 %	60 %	325293112
1048	NC_015183	TGCCC	2	10	1677694	1677703	0 %	20 %	20 %	60 %	325293113
1049	NC_015183	CCCTG	2	10	1680329	1680338	0 %	20 %	20 %	60 %	325293115
1050	NC_015183	GCCGC	2	10	1681150	1681159	0 %	0 %	40 %	60 %	325293115
1051	NC_015183	AAGCC	2	10	1684791	1684800	40 %	0 %	20 %	40 %	325293118
1052	NC_015183	CACGC	2	10	1686269	1686278	20 %	0 %	20 %	60 %	325293120
1053	NC_015183	AACGA	2	10	1689105	1689114	60 %	0 %	20 %	20 %	325293121
1054	NC_015183	GCTTG	2	10	1696136	1696145	0 %	40 %	40 %	20 %	325293129
1055	NC_015183	GGCGT	2	10	1696999	1697008	0 %	20 %	60 %	20 %	325293131
1056	NC_015183	TGCAA	2	10	1699362	1699371	40 %	20 %	20 %	20 %	325293134
1057	NC_015183	CGAAG	2	10	1700919	1700928	40 %	0 %	40 %	20 %	325293136
1058	NC_015183	GGCGC	2	10	1701966	1701975	0 %	0 %	60 %	40 %	325293137
1059	NC_015183	GGCTG	2	10	1707216	1707225	0 %	20 %	60 %	20 %	325293144
1060	NC_015183	CTACG	2	10	1708286	1708295	20 %	20 %	20 %	40 %	325293146
1061	NC_015183	TCCGG	2	10	1710120	1710129	0 %	20 %	40 %	40 %	325293148
1062	NC_015183	AGACG	2	10	1710853	1710862	40 %	0 %	40 %	20 %	325293149
1063	NC_015183	GCCTC	2	10	1712290	1712299	0 %	20 %	20 %	60 %	325293151
1064	NC_015183	GTCAT	2	10	1712316	1712325	20 %	40 %	20 %	20 %	325293151
1065	NC_015183	CGGCG	2	10	1713572	1713581	0 %	0 %	60 %	40 %	325293152
1066	NC_015183	CGGCG	2	10	1713992	1714001	0 %	0 %	60 %	40 %	325293152
1067	NC_015183	TCCGC	2	10	1714297	1714306	0 %	20 %	20 %	60 %	325293152
1068	NC_015183	CCTGC	2	10	1714714	1714723	0 %	20 %	20 %	60 %	325293152
1069	NC_015183	TGAAG	2	10	1715228	1715237	40 %	20 %	40 %	0 %	325293154
1070	NC_015183	GACCC	2	10	1716686	1716695	20 %	0 %	20 %	60 %	325293155
1071	NC_015183	GGATC	2	10	1717253	1717262	20 %	20 %	40 %	20 %	325293156
1072	NC_015183	CGCGG	2	10	1717659	1717668	0 %	0 %	60 %	40 %	325293156
1073	NC_015183	CACCG	2	10	1718001	1718010	20 %	0 %	20 %	60 %	325293156
1074	NC_015183	CGGAA	2	10	1718943	1718952	40 %	0 %	40 %	20 %	325293158
1075	NC_015183	GCACG	2	10	1719654	1719663	20 %	0 %	40 %	40 %	325293159
1076	NC_015183	GCAAG	2	10	1721498	1721507	40 %	0 %	40 %	20 %	325293160
1077	NC_015183	GCCCT	2	10	1722304	1722313	0 %	20 %	20 %	60 %	325293161
1078	NC_015183	CGGCG	2	10	1723255	1723264	0 %	0 %	60 %	40 %	325293162
1079	NC_015183	ACCAG	2	10	1723454	1723463	40 %	0 %	20 %	40 %	325293162
1080	NC_015183	TGCCG	2	10	1723687	1723696	0 %	20 %	40 %	40 %	325293163
1081	NC_015183	GGCAG	2	10	1723816	1723825	20 %	0 %	60 %	20 %	325293163
1082	NC_015183	CCGCG	2	10	1725899	1725908	0 %	0 %	40 %	60 %	325293164
1083	NC_015183	CCGCA	2	10	1726320	1726329	20 %	0 %	20 %	60 %	325293164
1084	NC_015183	CCAGT	2	10	1727669	1727678	20 %	20 %	20 %	40 %	325293165
1085	NC_015183	TCTGC	2	10	1730586	1730595	0 %	40 %	20 %	40 %	325293169
1086	NC_015183	AGCGA	2	10	1732729	1732738	40 %	0 %	40 %	20 %	325293172
1087	NC_015183	AAGGA	2	10	1734733	1734742	60 %	0 %	40 %	0 %	325293173
1088	NC_015183	AAAGC	2	10	1736600	1736609	60 %	0 %	20 %	20 %	325293174
1089	NC_015183	ACCGG	2	10	1736818	1736827	20 %	0 %	40 %	40 %	325293175
1090	NC_015183	GCCCG	2	10	1739236	1739245	0 %	0 %	40 %	60 %	325293177
1091	NC_015183	GCGCC	2	10	1740205	1740214	0 %	0 %	40 %	60 %	325293178
1092	NC_015183	GCCCT	2	10	1743686	1743695	0 %	20 %	20 %	60 %	325293180
1093	NC_015183	AGGAC	2	10	1744971	1744980	40 %	0 %	40 %	20 %	325293182
1094	NC_015183	CGCGG	2	10	1745283	1745292	0 %	0 %	60 %	40 %	325293182
1095	NC_015183	ATCGA	2	10	1746571	1746580	40 %	20 %	20 %	20 %	325293183
1096	NC_015183	AGGCA	2	10	1748329	1748338	40 %	0 %	40 %	20 %	325293185
1097	NC_015183	TGTCC	2	10	1749153	1749162	0 %	40 %	20 %	40 %	325293186
1098	NC_015183	CGGCA	2	10	1749417	1749426	20 %	0 %	40 %	40 %	325293186
1099	NC_015183	GCAAG	2	10	1753424	1753433	40 %	0 %	40 %	20 %	325293192
1100	NC_015183	TGGTG	2	10	1757205	1757214	0 %	40 %	60 %	0 %	325293196
1101	NC_015183	GCCAA	2	10	1758060	1758069	40 %	0 %	20 %	40 %	325293198
1102	NC_015183	CCACG	2	10	1759613	1759622	20 %	0 %	20 %	60 %	325293200
1103	NC_015183	GCACG	2	10	1763818	1763827	20 %	0 %	40 %	40 %	325293201
1104	NC_015183	TCTGT	2	10	1764067	1764076	0 %	60 %	20 %	20 %	325293202
1105	NC_015183	TCAGA	2	10	1765586	1765595	40 %	20 %	20 %	20 %	325293206
1106	NC_015183	CTGCT	2	10	1765647	1765656	0 %	40 %	20 %	40 %	325293206
1107	NC_015183	AGCCA	2	10	1767059	1767068	40 %	0 %	20 %	40 %	325293209
1108	NC_015183	TCTGC	2	10	1768526	1768535	0 %	40 %	20 %	40 %	325293210
1109	NC_015183	TCGGG	2	10	1769315	1769324	0 %	20 %	60 %	20 %	325293211
1110	NC_015183	CACGC	2	10	1771458	1771467	20 %	0 %	20 %	60 %	325293213
1111	NC_015183	GCGCA	2	10	1772906	1772915	20 %	0 %	40 %	40 %	325293214
1112	NC_015183	AGACC	2	10	1773368	1773377	40 %	0 %	20 %	40 %	325293215
1113	NC_015183	CCCGC	2	10	1776149	1776158	0 %	0 %	20 %	80 %	325293218
1114	NC_015183	CAGCG	2	10	1776342	1776351	20 %	0 %	40 %	40 %	325293218
1115	NC_015183	TGCGC	2	10	1776394	1776403	0 %	20 %	40 %	40 %	325293219
1116	NC_015183	GCTCC	2	10	1776421	1776430	0 %	20 %	20 %	60 %	325293219
1117	NC_015183	TCGCC	2	10	1777306	1777315	0 %	20 %	20 %	60 %	325293219
1118	NC_015183	CGGCG	2	10	1777527	1777536	0 %	0 %	60 %	40 %	325293219
1119	NC_015183	ACCTG	2	10	1780860	1780869	20 %	20 %	20 %	40 %	325293224
1120	NC_015183	ACCGA	2	10	1783152	1783161	40 %	0 %	20 %	40 %	325293226
1121	NC_015183	CGGGC	2	10	1783397	1783406	0 %	0 %	60 %	40 %	325293226
1122	NC_015183	GCCGC	2	10	1784550	1784559	0 %	0 %	40 %	60 %	325293227
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1124	NC_015183	GCTTC	2	10	1789186	1789195	0 %	40 %	20 %	40 %	325293231
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1233	NC_015183	GGTTC	2	10	1950314	1950323	0 %	40 %	40 %	20 %	325293405
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1235	NC_015183	CGCAT	2	10	1952344	1952353	20 %	20 %	20 %	40 %	325293406
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1242	NC_015183	TCCTC	2	10	1965544	1965553	0 %	40 %	0 %	60 %	325293420
1243	NC_015183	CGAAG	2	10	1965632	1965641	40 %	0 %	40 %	20 %	325293420
1244	NC_015183	CGACG	2	10	1966297	1966306	20 %	0 %	40 %	40 %	325293421
1245	NC_015183	AAGAT	2	10	1966449	1966458	60 %	20 %	20 %	0 %	325293421
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1352	NC_015183	CGAAA	2	10	2128921	2128930	60 %	0 %	20 %	20 %	325293567
1353	NC_015183	AAAGC	2	10	2129184	2129193	60 %	0 %	20 %	20 %	325293567
1354	NC_015183	CGTTC	2	10	2130478	2130487	0 %	40 %	20 %	40 %	325293570
1355	NC_015183	CGCCT	2	10	2130882	2130891	0 %	20 %	20 %	60 %	325293571
1356	NC_015183	TTGCC	2	10	2131666	2131675	0 %	40 %	20 %	40 %	325293572
1357	NC_015183	CGATG	2	10	2133140	2133149	20 %	20 %	40 %	20 %	325293573
1358	NC_015183	CCGAC	2	10	2133916	2133925	20 %	0 %	20 %	60 %	325293574
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1360	NC_015183	GTCCA	2	10	2136037	2136046	20 %	20 %	20 %	40 %	325293576
1361	NC_015183	ACCGC	2	10	2136770	2136779	20 %	0 %	20 %	60 %	325293576
1362	NC_015183	GCCCG	2	10	2137958	2137967	0 %	0 %	40 %	60 %	325293578
1363	NC_015183	TTCCG	2	10	2138294	2138303	0 %	40 %	20 %	40 %	325293578
1364	NC_015183	CGGCG	2	10	2139095	2139104	0 %	0 %	60 %	40 %	325293578
1365	NC_015183	CGCCA	2	10	2141100	2141109	20 %	0 %	20 %	60 %	325293581
1366	NC_015183	CGGTG	2	10	2141429	2141438	0 %	20 %	60 %	20 %	325293581
1367	NC_015183	CGCGC	2	10	2145020	2145029	0 %	0 %	40 %	60 %	325293583
1368	NC_015183	GCGTT	2	10	2146669	2146678	0 %	40 %	40 %	20 %	325293584
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1492	NC_015183	GAACG	2	10	2348358	2348367	40 %	0 %	40 %	20 %	325293785
1493	NC_015183	CGCAG	2	10	2353399	2353408	20 %	0 %	40 %	40 %	325293790
1494	NC_015183	GCACC	2	10	2353999	2354008	20 %	0 %	20 %	60 %	325293791
1495	NC_015183	GCCTC	2	10	2355762	2355771	0 %	20 %	20 %	60 %	325293793
1496	NC_015183	CGGCG	2	10	2361508	2361517	0 %	0 %	60 %	40 %	325293798
1497	NC_015183	GGCCG	2	10	2361740	2361749	0 %	0 %	60 %	40 %	325293798
1498	NC_015183	CCTCG	2	10	2367247	2367256	0 %	20 %	20 %	60 %	325293805
1499	NC_015183	AAAGC	2	10	2368796	2368805	60 %	0 %	20 %	20 %	325293806
1500	NC_015183	TCGTC	2	10	2370228	2370237	0 %	40 %	20 %	40 %	325293809

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