MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 2107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015183	GCGCC	2	10	2686125	2686134	0 %	0 %	40 %	60 %	325294091
2002	NC_015183	GGGCT	2	10	2687562	2687571	0 %	20 %	60 %	20 %	325294093
2003	NC_015183	GAGCT	2	10	2687719	2687728	20 %	20 %	40 %	20 %	325294093
2004	NC_015183	GTGCT	2	10	2687751	2687760	0 %	40 %	40 %	20 %	325294093
2005	NC_015183	GCCTT	2	10	2689123	2689132	0 %	40 %	20 %	40 %	325294094
2006	NC_015183	GGCAA	2	10	2689182	2689191	40 %	0 %	40 %	20 %	325294094
2007	NC_015183	CGACG	2	10	2689429	2689438	20 %	0 %	40 %	40 %	325294095
2008	NC_015183	GCGTT	2	10	2689459	2689468	0 %	40 %	40 %	20 %	325294095
2009	NC_015183	GACCT	2	10	2697444	2697453	20 %	20 %	20 %	40 %	325294100
2010	NC_015183	TGAAG	2	10	2697932	2697941	40 %	20 %	40 %	0 %	325294100
2011	NC_015183	CTGGA	2	10	2698272	2698281	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2012	NC_015183	TTCGG	2	10	2700662	2700671	0 %	40 %	40 %	20 %	325294102
2013	NC_015183	AGCCA	2	10	2701342	2701351	40 %	0 %	20 %	40 %	325294102
2014	NC_015183	ACTTC	2	10	2705341	2705350	20 %	40 %	0 %	40 %	325294102
2015	NC_015183	CAGAG	2	10	2706078	2706087	40 %	0 %	40 %	20 %	325294102
2016	NC_015183	ACGCA	2	10	2706332	2706341	40 %	0 %	20 %	40 %	325294102
2017	NC_015183	AGGTC	2	10	2706859	2706868	20 %	20 %	40 %	20 %	325294102
2018	NC_015183	GTTCA	2	10	2707193	2707202	20 %	40 %	20 %	20 %	325294102
2019	NC_015183	ATGCG	2	10	2710018	2710027	20 %	20 %	40 %	20 %	325294103
2020	NC_015183	TCCCT	2	10	2710952	2710961	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2021	NC_015183	CGGCT	2	10	2712260	2712269	0 %	20 %	40 %	40 %	325294104
2022	NC_015183	CCCTG	2	10	2712800	2712809	0 %	20 %	20 %	60 %	325294105
2023	NC_015183	CCGCA	2	10	2713207	2713216	20 %	0 %	20 %	60 %	325294105
2024	NC_015183	TGCCC	2	10	2713266	2713275	0 %	20 %	20 %	60 %	325294105
2025	NC_015183	ACGGC	2	10	2714436	2714445	20 %	0 %	40 %	40 %	325294106
2026	NC_015183	CGGGC	2	10	2718931	2718940	0 %	0 %	60 %	40 %	325294110
2027	NC_015183	GATGC	2	10	2719490	2719499	20 %	20 %	40 %	20 %	325294110
2028	NC_015183	ACCTC	2	10	2719898	2719907	20 %	20 %	0 %	60 %	325294111
2029	NC_015183	CGCGC	2	10	2721277	2721286	0 %	0 %	40 %	60 %	325294112
2030	NC_015183	CGTGT	2	10	2721288	2721297	0 %	40 %	40 %	20 %	325294112
2031	NC_015183	AGAAA	2	10	2723962	2723971	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_015183	TGCCC	2	10	2724283	2724292	0 %	20 %	20 %	60 %	325294115
2033	NC_015183	CGACT	2	10	2724356	2724365	20 %	20 %	20 %	40 %	325294115
2034	NC_015183	CGGTG	2	10	2724884	2724893	0 %	20 %	60 %	20 %	325294115
2035	NC_015183	GCCGA	2	10	2727021	2727030	20 %	0 %	40 %	40 %	325294117
2036	NC_015183	TCTTT	2	10	2727448	2727457	0 %	80 %	0 %	20 %	325294117
2037	NC_015183	CTGGA	2	10	2728212	2728221	20 %	20 %	40 %	20 %	325294118
2038	NC_015183	GGTCT	2	10	2728296	2728305	0 %	40 %	40 %	20 %	325294118
2039	NC_015183	CGCTG	2	10	2728549	2728558	0 %	20 %	40 %	40 %	325294118
2040	NC_015183	GCGTA	2	10	2730885	2730894	20 %	20 %	40 %	20 %	325294119
2041	NC_015183	TCGTC	2	10	2731750	2731759	0 %	40 %	20 %	40 %	325294120
2042	NC_015183	TATTC	2	10	2732652	2732661	20 %	60 %	0 %	20 %	325294122
2043	NC_015183	GGCTG	2	10	2732919	2732928	0 %	20 %	60 %	20 %	325294122
2044	NC_015183	CGGCG	2	10	2734938	2734947	0 %	0 %	60 %	40 %	325294123
2045	NC_015183	GATCA	2	10	2735014	2735023	40 %	20 %	20 %	20 %	325294123
2046	NC_015183	GGCGC	2	10	2736647	2736656	0 %	0 %	60 %	40 %	325294124
2047	NC_015183	GACGG	2	10	2737056	2737065	20 %	0 %	60 %	20 %	325294124
2048	NC_015183	AGATG	2	10	2738341	2738350	40 %	20 %	40 %	0 %	325294125
2049	NC_015183	GCGGT	2	10	2740205	2740214	0 %	20 %	60 %	20 %	325294127
2050	NC_015183	GCTTC	2	10	2744070	2744079	0 %	40 %	20 %	40 %	325294130
2051	NC_015183	GCAAA	2	10	2746933	2746942	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2052	NC_015183	GCGCG	2	10	2747839	2747848	0 %	0 %	60 %	40 %	325294135
2053	NC_015183	CTGGA	2	10	2748866	2748875	20 %	20 %	40 %	20 %	325294136
2054	NC_015183	TCCCC	2	10	2753553	2753562	0 %	20 %	0 %	80 %	325294137
2055	NC_015183	TCGCA	2	10	2756329	2756338	20 %	20 %	20 %	40 %	325294139
2056	NC_015183	CGATG	2	10	2757358	2757367	20 %	20 %	40 %	20 %	325294140
2057	NC_015183	GGAAA	2	10	2759816	2759825	60 %	0 %	40 %	0 %	325294144
2058	NC_015183	CCGGG	2	10	2759932	2759941	0 %	0 %	60 %	40 %	325294144
2059	NC_015183	CCGCG	2	10	2761585	2761594	0 %	0 %	40 %	60 %	325294145
2060	NC_015183	GTCTT	2	10	2763214	2763223	0 %	60 %	20 %	20 %	325294146
2061	NC_015183	GCCGG	2	10	2763997	2764006	0 %	0 %	60 %	40 %	325294147
2062	NC_015183	ATCGC	2	10	2766912	2766921	20 %	20 %	20 %	40 %	325294151
2063	NC_015183	CAGCG	2	10	2767733	2767742	20 %	0 %	40 %	40 %	325294151
2064	NC_015183	AGACC	2	10	2771415	2771424	40 %	0 %	20 %	40 %	325294157
2065	NC_015183	TGCTT	2	10	2774804	2774813	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2066	NC_015183	GTCAG	2	10	2776018	2776027	20 %	20 %	40 %	20 %	325294162
2067	NC_015183	GCGCC	2	10	2777178	2777187	0 %	0 %	40 %	60 %	325294163
2068	NC_015183	CATGG	2	10	2777707	2777716	20 %	20 %	40 %	20 %	325294164
2069	NC_015183	ATGAA	2	10	2781440	2781449	60 %	20 %	20 %	0 %	325294167
2070	NC_015183	CACGG	2	10	2782349	2782358	20 %	0 %	40 %	40 %	325294169
2071	NC_015183	GCCGC	2	10	2782732	2782741	0 %	0 %	40 %	60 %	325294169
2072	NC_015183	ACCGA	2	10	2783961	2783970	40 %	0 %	20 %	40 %	325294171
2073	NC_015183	GGCCA	2	10	2786225	2786234	20 %	0 %	40 %	40 %	325294174
2074	NC_015183	ATCAT	2	10	2787255	2787264	40 %	40 %	0 %	20 %	325294174
2075	NC_015183	ATGCG	2	10	2787286	2787295	20 %	20 %	40 %	20 %	325294174
2076	NC_015183	CCGTC	2	10	2789840	2789849	0 %	20 %	20 %	60 %	325294175
2077	NC_015183	GCTGA	2	10	2790439	2790448	20 %	20 %	40 %	20 %	325294175
2078	NC_015183	GGGCA	2	10	2791455	2791464	20 %	0 %	60 %	20 %	325294176
2079	NC_015183	GGCAA	2	10	2792003	2792012	40 %	0 %	40 %	20 %	325294177
2080	NC_015183	GACGA	2	10	2793043	2793052	40 %	0 %	40 %	20 %	325294178
2081	NC_015183	CGGGG	2	10	2793788	2793797	0 %	0 %	80 %	20 %	325294179
2082	NC_015183	CCGGC	2	10	2794011	2794020	0 %	0 %	40 %	60 %	325294179
2083	NC_015183	TCTGC	2	10	2794174	2794183	0 %	40 %	20 %	40 %	325294179
2084	NC_015183	CGGCC	2	10	2794890	2794899	0 %	0 %	40 %	60 %	325294180
2085	NC_015183	TGGCG	2	10	2795116	2795125	0 %	20 %	60 %	20 %	325294180
2086	NC_015183	ATGGC	2	10	2796320	2796329	20 %	20 %	40 %	20 %	325294181
2087	NC_015183	CGCAC	2	10	2798544	2798553	20 %	0 %	20 %	60 %	325294184
2088	NC_015183	GGCGT	2	10	2799662	2799671	0 %	20 %	60 %	20 %	325294185
2089	NC_015183	TCACC	2	10	2799960	2799969	20 %	20 %	0 %	60 %	325294185
2090	NC_015183	GGGAA	2	10	2800528	2800537	40 %	0 %	60 %	0 %	325294186
2091	NC_015183	GCAGC	2	10	2801521	2801530	20 %	0 %	40 %	40 %	325294187
2092	NC_015183	AAGGC	2	10	2801703	2801712	40 %	0 %	40 %	20 %	325294187
2093	NC_015183	ACGGC	2	10	2802318	2802327	20 %	0 %	40 %	40 %	325294187
2094	NC_015183	GGCTG	2	10	2803727	2803736	0 %	20 %	60 %	20 %	325294189
2095	NC_015183	GCCAC	2	10	2804081	2804090	20 %	0 %	20 %	60 %	325294189
2096	NC_015183	CGGCC	2	10	2804534	2804543	0 %	0 %	40 %	60 %	325294190
2097	NC_015183	TCAGT	2	10	2807357	2807366	20 %	40 %	20 %	20 %	325294192
2098	NC_015183	GGACA	2	10	2810215	2810224	40 %	0 %	40 %	20 %	325294193
2099	NC_015183	TGTTT	2	10	2812191	2812200	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_015183	TGCGC	2	10	2813289	2813298	0 %	20 %	40 %	40 %	325294195
2101	NC_015183	TTTTC	2	10	2813497	2813506	0 %	80 %	0 %	20 %	325294195
2102	NC_015183	ATCGC	2	10	2816951	2816960	20 %	20 %	20 %	40 %	325294200
2103	NC_015183	GAACG	2	10	2818566	2818575	40 %	0 %	40 %	20 %	325294201
2104	NC_015183	CAACA	2	10	2818788	2818797	60 %	0 %	0 %	40 %	325294201
2105	NC_015183	GAATT	2	10	2819004	2819013	40 %	40 %	20 %	0 %	325294201
2106	NC_015183	TGCTC	2	10	2820181	2820190	0 %	40 %	20 %	40 %	325294202
2107	NC_015183	TAATG	2	10	2822004	2822013	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.